Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F342 I0 R1
|
1331 |
225.9 |
7641038 |
95.8% |
7320114 |
147.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
253,855 |
G→T |
100% |
R281L (CGT→CTT) |
frsA → |
fermentation‑respiration switch protein; PTS Enzyme IIA(Glc)‑binding protein; pNP‑butyrate esterase activity |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 253,855 | 0 | G | T | 96.8%
| 669.4
/ 12.1
| 219 | R281L (CGT→CTT) | frsA | fermentation‑respiration switch protein; PTS Enzyme IIA(Glc)‑binding protein; pNP‑butyrate esterase activity |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (3/4); new base T (103/108); total (107/112) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.34e-01 |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 219 total aligned reads displayed.
GTGGGCTTTTCTTCAAAATGGAAGCTCACCCAGGACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCGTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCGGAAATGTATCTTGACGTTCTGGCCAGTCGTTTGGGGATGCATGA > CP009273/253710‑253999
|
tGGGCTTTTCTTCAAAATGGAAGCTCACCCAGGACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCt > 2:2730157/1‑148 (MQ=255)
ggCTTTTCTTCAAAATGGAAGCTCACCCAGGACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTgg > 2:1737401/1‑148 (MQ=255)
ggCTTTTCTTCAAAATGGAAGCTCACCCAGGACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTgg > 1:3468040/1‑148 (MQ=255)
gCTTTTCTTCAAAATGGAAGCTCACCCAGGACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGc < 2:1336349/148‑1 (MQ=255)
gCTTTTCTTCAAAATGGAAGCTCACCCAGGACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGc > 2:3427323/1‑148 (MQ=255)
gCTTTTCTTCAAAATGGAAGCTCACCCAGGACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGc < 1:2034989/148‑1 (MQ=255)
ttcttcAAAATGGAAGCTCACCCAGGACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATAc < 2:1068826/148‑1 (MQ=255)
tcttcAAAATGGAAGCTCACCCAGGACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATAcc < 2:856661/148‑1 (MQ=255)
cAAAATGGAAGCTCACCCAGGACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGa < 1:3048417/148‑1 (MQ=255)
cAAAATGGAAGCTCACCCAGGACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGa > 1:816409/1‑148 (MQ=255)
cAAAATGGAAGCTCACCCAGGACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGa < 2:3390043/148‑1 (MQ=255)
cAAAATGGAAGCTCACCCAGGACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGa < 1:1142690/148‑1 (MQ=255)
aaaTGGAAGCTCACCCAGGACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAAt < 2:2236742/148‑1 (MQ=255)
aaTGGAAGCTCACCCAGGACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATc > 2:260057/1‑148 (MQ=255)
aaTGGAAGCTCACCCAGGACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATc > 1:2316004/1‑148 (MQ=255)
aTGGAAGCTCACCCAGGACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATcg > 1:42821/1‑148 (MQ=255)
tGGAAGCTCACCCAGGACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATcgc > 1:210085/1‑148 (MQ=255)
ggAAGCTCACCCAGGACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATcgcc > 1:903458/1‑148 (MQ=255)
gCTCACCCAGGACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGt < 1:690140/148‑1 (MQ=255)
tCACCCAGGACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCt < 2:601116/148‑1 (MQ=255)
cccAGGACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGaa < 1:3219944/148‑1 (MQ=255)
cccAGGACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGaa < 1:2779042/148‑1 (MQ=255)
cccAGGACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGaa < 1:2840909/148‑1 (MQ=255)
cccAGGACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGaa < 1:1316599/148‑1 (MQ=255)
cccAGGACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGaa < 1:3491477/148‑1 (MQ=255)
aGGACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGc > 1:1020380/1‑148 (MQ=255)
aGGACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCGTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGc > 2:3212834/1‑148 (MQ=255)
ggACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCg > 1:2069918/1‑148 (MQ=255)
gACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGGTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCgg < 2:2561631/148‑1 (MQ=255)
gACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCGTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCgg > 2:1776050/1‑148 (MQ=255)
tCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTg > 2:3163496/1‑148 (MQ=255)
ccAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGc < 2:3540953/148‑1 (MQ=255)
gCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTg > 1:1694444/1‑148 (MQ=255)
ccTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGt > 2:664612/1‑148 (MQ=255)
ccTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTCGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGAGGTTGCCAGt > 1:2285843/1‑148 (MQ=255)
cTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTc < 1:1852867/148‑1 (MQ=255)
tGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCt < 2:955129/148‑1 (MQ=255)
tGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCt > 1:983225/1‑148 (MQ=255)
tGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCt > 1:2849773/1‑148 (MQ=255)
ttGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTg < 1:800064/148‑1 (MQ=255)
cATCAGCACGTCTTACAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGTGTGTATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCGGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTATTGGTc < 2:1215596/148‑1 (MQ=255)
tCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCg > 1:335437/1‑148 (MQ=255)
cACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGACGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAg > 2:2002344/1‑148 (MQ=255)
gTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTc < 2:1936339/148‑1 (MQ=255)
tCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCa < 1:3028809/148‑1 (MQ=255)
tCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCa < 2:1108827/148‑1 (MQ=255)
ttAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATa < 2:1739345/148‑1 (MQ=255)
aaaGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATAcc < 1:3777048/148‑1 (MQ=255)
aaaGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATAcc < 1:3705785/148‑1 (MQ=255)
aGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCAGAAAGCGGTAGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATAACCt > 2:1415053/1‑148 (MQ=255)
ggCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTg > 1:2915998/1‑148 (MQ=255)
gcgcTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGt > 2:962378/1‑148 (MQ=255)
cTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGa < 2:3001765/148‑1 (MQ=255)
cTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGa > 2:2493931/1‑148 (MQ=255)
cTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGa > 1:2310157/1‑148 (MQ=255)
cTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGa > 2:653717/1‑148 (MQ=255)
aaCGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGAtt < 2:1523187/148‑1 (MQ=255)
cGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGAtttt > 1:1224842/1‑148 (MQ=255)
gTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCTGCGATAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTa < 1:1964243/148‑1 (MQ=255)
tACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTaa < 2:903458/148‑1 (MQ=255)
aCCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAg < 1:3185880/148‑1 (MQ=255)
ccGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGt < 1:572873/148‑1 (MQ=255)
ggtggATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAg > 2:597037/1‑148 (MQ=255)
aTCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACa > 2:2914185/1‑148 (MQ=255)
aTCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACa > 2:1456492/1‑148 (MQ=255)
tCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAg < 2:3053241/148‑1 (MQ=255)
cacaCTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAgg > 2:2070777/1‑148 (MQ=255)
cacaCTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCGTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAgg < 1:974152/148‑1 (MQ=255)
acacTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGt > 1:1796500/1‑148 (MQ=255)
cacTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTg < 1:1782055/148‑1 (MQ=255)
gtcgcgGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGTTTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCGGaaa < 2:161008/148‑1 (MQ=255)
tcgcgGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCGGaact > 2:293896/1‑146 (MQ=255)
tcgcgGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCGGAAAt < 2:3326000/148‑1 (MQ=255)
cgGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCGGAAATGTa < 1:3641532/148‑1 (MQ=255)
cgGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCGGAAATGTa < 1:920419/148‑1 (MQ=255)
gCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCGGAAATGTATc < 2:2792994/148‑1 (MQ=255)
cTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCGGAAATGTATCtt > 2:3199876/1‑148 (MQ=255)
ttGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCGGAAATGTATCTTGa > 2:3736012/1‑148 (MQ=255)
ttGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCGGAAATGTATCTTGa > 1:711610/1‑148 (MQ=255)
ttCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCGGAAATGTATCTTGACGTTc > 1:2164298/1‑148 (MQ=255)
tCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCGGAAATGTATCTTg > 2:951621/1‑141 (MQ=255)
tCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCGGAAATGTATCTTg < 1:951621/141‑1 (MQ=255)
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AACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTT > SRR19973069.447922/1‑150 (MQ=60)
AACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTT > SRR19973069.1233212/1‑150 (MQ=60)
GTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCTGCGATAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAG < SRR19973069.1977867/150‑1 (MQ=60)
GTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAG < SRR19973069.702364/150‑1 (MQ=60)
ACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTG < SRR19973069.3206582/150‑1 (MQ=60)
CCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGC < SRR19973069.576833/150‑1 (MQ=60)
GGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACA < SRR19973069.3147862/150‑1 (MQ=60)
TCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGT > SRR19973069.1809152/1‑150 (MQ=60)
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CACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTG < SRR19973069.2338269/150‑1 (MQ=60)
CACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTG < SRR19973069.2238197/150‑1 (MQ=60)
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CACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCGTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTG < SRR19973069.980688/150‑1 (MQ=60)
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CACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCC < SRR19973069.1794568/150‑1 (MQ=60)
CACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCC < SRR19973069.1794605/150‑1 (MQ=60)
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TCGCGGCCTTTGGTGTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCGGAAATGT < SRR19973069.1624126/150‑1 (MQ=60)
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CGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCGGAAATGTATC < SRR19973069.3665388/150‑1 (MQ=60)
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GGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCGGAAATGTATCT < SRR19973069.601073/150‑1 (MQ=60)
CTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCGGAAATGTATCTTGA > SRR19973069.716612/1‑150 (MQ=60)
CTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCGGAAATGTATCTTGA > SRR19973069.773896/1‑150 (MQ=60)
gatctTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCGGAAATGTATCTTGAC < SRR19973069.958016/145‑1 (MQ=60)
gatctTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCGGAAATGTATCTTGAC < SRR19973069.958108/145‑1 (MQ=60)
GTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCGGAAATGTATCTTGACGTTC > SRR19973069.1338402/1‑150 (MQ=60)
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CGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCGGAAATGTATCTTGACGTTCTGGCCAGTCGTGT > SRR19973069.1798105/1‑150 (MQ=60)
CTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCGGACATGTATCTTGACGTTCTGGCCAGTCGTGTGG > SRR19973069.2108778/1‑150 (MQ=60)
CTAACGTTGCCGTGCGTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCGGAAATGTATCTTGACGTTCTGGCCAGTCGTTTGG < SRR19973069.3233812/150‑1 (MQ=60)
CTAACGTTGCCGTGCGTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCGGAAATGTATCTTGACGTTCTGGCCAGTCGTTTGG < SRR19973069.3233793/150‑1 (MQ=60)
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CCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCGGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCGGAAATGTATCTTGACGTTCTGGCCAGTCGTTTGGGGATGCATG < SRR19973069.1126537/150‑1 (MQ=60)
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CCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCGGAAATGTATCTTGACGTTCTGGCCAGTCGTTTGGGGATGCATG < SRR19973069.1126514/150‑1 (MQ=60)
CTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCGGAAATGTATCTTGACGTTCTGGCCAGTCGTTTGGGGATGCATGATGCT > SRR19973069.2242547/1‑150 (MQ=60)
TTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCGGAAATGTATCTTGACGTTCTGGCCAGTCGTTTGGGGATGCATGATGCTT < SRR19973069.1549275/150‑1 (MQ=60)
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GTGGGCTTTTCTTCAAAATGGAAGCTCACCCAGGACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCGTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCGGAAATGTATCTTGACGTTCTGGCCAGTCGTTTGGGGATGCATGATGCTT > CP009273/253710‑254004
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |