Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F361 I0 R1
|
1353 |
250.7 |
8230166 |
96.0% |
7900959 |
148.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
253,855 |
G→T |
100% |
R281L (CGT→CTT) |
frsA → |
fermentation‑respiration switch protein; PTS Enzyme IIA(Glc)‑binding protein; pNP‑butyrate esterase activity |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 253,855 | 0 | G | T | 98.3%
| 754.9
/ 2.8
| 235 | R281L (CGT→CTT) | frsA | fermentation‑respiration switch protein; PTS Enzyme IIA(Glc)‑binding protein; pNP‑butyrate esterase activity |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (3/1); new base T (110/121); total (113/122) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.54e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.67e-01 |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 235 total aligned reads displayed.
GGTGGGCTTTTCTTCAAAATGGAAGCTCACCCAGGACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCGTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCGGAAATGTATCTTGACGTTCTGGCCAGTCGTTTGGGGATGCATGAT > CP009273/253709‑254000
|
gTGGGCTTTTCTTCAAAATGGAAGCTCACCCAGGACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCt < 1:102878/149‑1 (MQ=255)
gTGGGCTTTTCTTCAAAATGGAAGCTCACCCAGGACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCt < 1:103260/149‑1 (MQ=255)
gTGGGCTTTTCTTCAAAATGGAAGCTCACCCAGGACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCt > 1:3615360/1‑149 (MQ=255)
tGGGCTTTTCTTCAAAATGGAAGCTCACCCAGGACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTg > 1:2511987/1‑149 (MQ=255)
gggCTTTTCTTCAAAATGGAAGCTCACCCAGGACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTgg > 1:3571915/1‑149 (MQ=255)
ggCGTTTCTTCAAAATGGAAGCTCACCCAGGACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGc < 2:1224653/149‑1 (MQ=255)
cTTTTCTTCAAAATGGAAGCTCACCCAGGACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCAt < 1:839988/149‑1 (MQ=255)
tcAAAATGGAAGCTCACCCAGGACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGGGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGa > 2:2396368/1‑149 (MQ=255)
aTGGAAGCTCACCCAGGACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATcgc < 1:2114800/149‑1 (MQ=255)
aTGGAAGCTCACCCAGGACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAAAGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATcgc > 2:854191/1‑149 (MQ=255)
ggAAGCTCACCCAGGACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATcgccg > 1:3321212/1‑149 (MQ=255)
aGCTCACCCAGGACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGTCATACCTTGAATCGCCGCGt > 2:2105693/1‑149 (MQ=255)
gCTCACCCAGGACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTc > 2:3773650/1‑149 (MQ=255)
cTCACCCAGGACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCt > 2:258049/1‑149 (MQ=255)
cACCCAGGACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGa > 2:66334/1‑149 (MQ=255)
ccAGGACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAg < 1:3898348/149‑1 (MQ=255)
aGGACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCg > 1:2939599/1‑149 (MQ=255)
gACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAGGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGt < 1:3863576/149‑1 (MQ=255)
gACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGt < 1:3088312/149‑1 (MQ=255)
aCTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGtt > 2:1955476/1‑149 (MQ=255)
aCTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGtt < 1:1220341/149‑1 (MQ=255)
cTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTg > 2:3992900/1‑149 (MQ=255)
tCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGc < 1:32048/149‑1 (MQ=255)
cAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCt < 2:3184313/149‑1 (MQ=255)
cAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCt < 2:2110667/149‑1 (MQ=255)
cAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCt < 1:185642/149‑1 (MQ=255)
ccTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTc < 1:190528/149‑1 (MQ=255)
cTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCt < 1:3032880/149‑1 (MQ=255)
cTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCt > 1:2461499/1‑149 (MQ=255)
tGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTGTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCtt < 2:396169/149‑1 (MQ=255)
cATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTcc < 1:4103023/149‑1 (MQ=255)
cAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTATCGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGt < 2:1418960/149‑1 (MQ=255)
aGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTa > 2:2900685/1‑149 (MQ=255)
aGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTa > 2:496700/1‑149 (MQ=255)
cACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGt < 1:1600014/149‑1 (MQ=255)
aCGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGtt < 2:4061922/149‑1 (MQ=255)
cGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTc < 1:1535727/149‑1 (MQ=255)
gTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCa < 1:278259/149‑1 (MQ=255)
gTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCa < 1:3476175/149‑1 (MQ=255)
tCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCAt < 1:4027068/149‑1 (MQ=255)
cTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATa < 1:1997450/149‑1 (MQ=255)
aaGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCt > 2:1612865/1‑149 (MQ=255)
aaGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCt > 1:1937296/1‑149 (MQ=255)
aaGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCt > 1:2559836/1‑149 (MQ=255)
ggCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGt < 2:2990625/149‑1 (MQ=255)
ggCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGt > 2:461906/1‑149 (MQ=255)
gcgcTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGtt < 1:793170/149‑1 (MQ=255)
gcTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGa < 1:1335328/149‑1 (MQ=255)
gcTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGa < 1:2928030/149‑1 (MQ=255)
gcTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGa < 1:3383990/149‑1 (MQ=255)
tGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGt < 2:1698728/149‑1 (MQ=255)
ccTATCGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGa < 2:1161778/149‑1 (MQ=255)
cTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGAt > 1:1996781/1‑149 (MQ=255)
tAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGAtt < 1:2197040/149‑1 (MQ=255)
tAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGAtt > 2:586553/1‑149 (MQ=255)
tAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGAtt > 2:586402/1‑149 (MQ=255)
tAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGAtt < 1:952503/149‑1 (MQ=255)
aCGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGAtttt < 2:3615360/149‑1 (MQ=255)
aCGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGAtttt > 2:3092581/1‑149 (MQ=255)
gtgggtggATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGcc < 1:2225045/149‑1 (MQ=255)
ggtggATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGc < 2:1110010/149‑1 (MQ=255)
ggtggATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCGTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGc > 2:3119329/1‑149 (MQ=255)
tggATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCaa < 1:3482229/149‑1 (MQ=255)
tggATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCaa < 2:457118/149‑1 (MQ=255)
ggATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAAc < 1:3490044/149‑1 (MQ=255)
ggATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAAc < 1:3768690/149‑1 (MQ=255)
gATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACa > 2:813573/1‑149 (MQ=255)
cacaCTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGTTTTTAAGTGCCAGCAACAGGt < 1:2412558/149‑1 (MQ=255)
cacTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGc > 1:3987873/1‑149 (MQ=255)
cacTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGc < 1:2027961/149‑1 (MQ=255)
cacTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAAAAGGTGc > 1:2557718/1‑149 (MQ=255)
cgcgtcgcgGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCGGa < 2:3642425/149‑1 (MQ=255)
cgtcgcgGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCGGaaa > 1:1125242/1‑149 (MQ=255)
tcgcgGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCGGAAATg > 1:2884121/1‑149 (MQ=255)
tcgcgGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCGGAAATg > 1:2884202/1‑149 (MQ=255)
cgGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCGGAAATGTAt < 1:854994/149‑1 (MQ=255)
ccTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCGGAAATGTATCtt < 2:2978143/149‑1 (MQ=255)
ccTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCGGAAATGTATCtt < 1:2376069/149‑1 (MQ=255)
ttGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCGGAAATGTATCTTGAc > 2:2858194/1‑149 (MQ=255)
ttGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCGGAAATGTATCTTGAc > 1:2977711/1‑149 (MQ=255)
ggTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCGGAAATGTATCTTGACGt > 1:1394779/1‑149 (MQ=255)
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CTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATAC < SRR19973068.2010613/150‑1 (MQ=60)
CTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATAC > SRR19973068.1049207/1‑150 (MQ=60)
AAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCT > SRR19973068.2576023/1‑150 (MQ=60)
AAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCT > SRR19973068.2576061/1‑150 (MQ=60)
AAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCT > SRR19973068.1950173/1‑150 (MQ=60)
GGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTT > SRR19973068.2530212/1‑150 (MQ=60)
GCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTG < SRR19973068.798563/150‑1 (MQ=60)
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CCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGAT > SRR19973068.3859163/1‑150 (MQ=60)
CCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGAT > SRR19973068.2009937/1‑150 (MQ=60)
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TAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTT < SRR19973068.2211402/150‑1 (MQ=60)
CGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAA > SRR19973068.878354/1‑150 (MQ=60)
TACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGT < SRR19973068.2496414/150‑1 (MQ=60)
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TGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAAC < SRR19973068.3503372/150‑1 (MQ=60)
GGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACA < SRR19973068.3791191/150‑1 (MQ=60)
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GGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACA < SRR19973068.3511217/150‑1 (MQ=60)
GATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAG < SRR19973068.3128497/150‑1 (MQ=60)
CACTCTAGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGTTTTTAAGTGCCAGCAACAGGTG < SRR19973068.2427856/150‑1 (MQ=60)
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ACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGC > SRR19973068.1962843/1‑150 (MQ=60)
ACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGC > SRR19973068.1964758/1‑150 (MQ=60)
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ACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTAGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGACTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGAGC > SRR19973068.2572448/1‑150 (MQ=60)
CACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCC < SRR19973068.2041250/150‑1 (MQ=60)
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GCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCGGAAA > SRR19973068.1132731/1‑150 (MQ=60)
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GTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCGGAAATG > SRR19973068.2902074/1‑150 (MQ=60)
GTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCGGAAATG > SRR19973068.2902073/1‑150 (MQ=60)
TCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCGGAAATGT < SRR19973068.185085/150‑1 (MQ=60)
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GTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCGGAAATGTATCTTGACGTTC > SRR19973068.1709812/1‑150 (MQ=60)
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CGGTGGGCTTTTCTTCAAAATGGAAGCTCACCCAGGACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCGTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCGGAAATGTATCTTGACGTTCTGGCCAGTCGTTTGGGGATGCATGATG > CP009273/253708‑254001
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |