Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F309 I0 R1
|
1697 |
197.2 |
6627756 |
95.7% |
6342762 |
147.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
1,083,443 |
G→T |
83.7% |
S624* (TCG→TAG) |
pgaB ← |
poly‑beta‑1,6‑N‑acetyl‑D‑glucosamine (PGA) N‑deacetylase outer membrane export lipoprotein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 1,083,443 | 0 | G | T | 83.7%
| 435.3
/ 98.2
| 207 | S624* (TCG→TAG) | pgaB | poly‑beta‑1,6‑N‑acetyl‑D‑glucosamine (PGA) N‑deacetylase outer membrane export lipoprotein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (23/11); new base T (99/74); total (122/85) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.41e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 215 total aligned reads displayed.
ATCATTTTTCGGATACCAGGCTGTTGAAAACTCAGGACGAATAAGGTCTATTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCGAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGAGGGATGTTTTTAATTTGATTGGTCAATTGTATTAACCATTGGTCAGCCGATTTTTCTGCGACACCTTCC > CP009273/1083298‑1083589
|
aTCATTTTTCGGATACCAGGCTGTTGAAAACTCAGGACGAATAAGGTCTATTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCtaa > 1:3214407/1‑148 (MQ=255)
aTCATTTTTCGGATACCAGGCTGTTGAAAACTCAGGACGAATAAGGTCTATTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCgaa > 1:979842/1‑148 (MQ=255)
tCATTTTTCGGATACCAGGCTGTTGAAAACTCAGGACGAATAAGGTCTATTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCAAGTGAGCGAGGTGTTGCtaag > 2:1048531/1‑148 (MQ=255)
tCATTTTTCGGATACCAGGCTGTTGAAAACTCAGGACGAATAAGGTCTATTTCAGGTTGGGTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCtaag > 2:2281985/1‑148 (MQ=255)
tttttCGGATACCAGGCTGTTGAAAACTCAGGACGAATAAGGTCTATTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCTAAGaaa < 1:511790/148‑1 (MQ=255)
tttttCGGATACCAGGCTGTTGAAAACTCAGGACGAATAAGGTCTATTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCTAAGaaa > 1:1434164/1‑148 (MQ=255)
gATACCAGGCTGTTGAAAACTCAGGACGAATAAGGTCTATTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCTAAGAAATAGCCTg > 2:1611141/1‑148 (MQ=255)
aTACCAGGCTGTTGAAAACTCAGGACGAATAAGGTCTATTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCTAAGAAATAGCCTGa < 2:2095404/148‑1 (MQ=255)
aTACCAGGCTGTTGAAAACTCAGGACGAATAAGGTCTATTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCTAAGAAATAGCCTGa > 1:2006039/1‑148 (MQ=255)
ccAGGCTGTTGAAAACTCAGGACGAATAAGGTCTATTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCGAAGAAATAGCCTGATGc < 1:2669534/148‑1 (MQ=255)
cAGGCTGTTGAAAACTCAGGACGAATAAGGTCTATTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCGAAGAAATAGCCTGATGCt > 2:1665104/1‑148 (MQ=255)
aGGCTGTTGAAAACTCAGGACGAATAAGGTCTATTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCTAAGAAATAGCCTGATGCTg < 1:1749587/148‑1 (MQ=255)
ggCTGTTGAAAACTCAGGACGAATAAGGTCTATTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCTAAGAAATAGCCTGATGCTGa > 1:2388594/1‑148 (MQ=255)
ggCTGTTGAAAACTCAGGACGAATAAGGTCTATTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCGAAGAAATAGCCTGATGCTGa > 2:1121145/1‑148 (MQ=255)
gCTGTTGAAAACTCAGGACGAATAAGGTCTATTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCTAAGAAATAGCCTGATGCTGAc > 2:3024989/1‑148 (MQ=255)
ttGAAAACTCAGGACGAATAAGGTCTATTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCTAAGAAATAGCCTGATGCTGACCAtt < 2:570671/148‑1 (MQ=255)
gAAAACTCAGGACGAATAAGGTCTATTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCGAAGAAATAGCCTGATGCTGACCAtttt < 2:314714/148‑1 (MQ=255)
aaaaCTCAGGACGAATAAGGTCTATTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCTAAGAAATAGCCTGATGCTGACCAttttt < 2:28671/148‑1 (MQ=255)
aaaaCTCAGGACGAATAAGGTCTATTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCTAAGAAATAGCCTGATGCTGACCAttttt < 2:827941/148‑1 (MQ=255)
aaaCTCAGGACGAATAAGGTCTATTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCTAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTc > 2:1454137/1‑148 (MQ=255)
aaaCTCAGGACGAATAAGGTCTATTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCTAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTc < 1:1501698/148‑1 (MQ=255)
aaCTCAGGACGAATAAGGTCTATTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCTAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCt > 1:845540/1‑148 (MQ=255)
aCTCAGGACGAATAAGGTCTATTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCTAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTg > 1:2194369/1‑148 (MQ=255)
aCTCAGGACGAATAAGGTCTATTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCTAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTg > 2:303491/1‑148 (MQ=255)
aTAAGGTCTATTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCTAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGACAGTTTtgtg > 2:2460096/1‑148 (MQ=255)
tAAGGTCTATTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCTAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGc > 2:2247919/1‑148 (MQ=255)
tAAGGTCTATTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCTAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGc > 1:759108/1‑148 (MQ=255)
ggTCTATTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCTAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTg > 2:52234/1‑148 (MQ=255)
tCTATTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCTAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTa > 2:1876274/1‑148 (MQ=255)
tCTATTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCTAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTa < 1:800129/148‑1 (MQ=255)
tCTATTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCAATCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCTAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTa < 1:796515/148‑1 (MQ=255)
cTATTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCTAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTaa < 1:1316798/148‑1 (MQ=255)
cTATTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCTAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTaa > 2:430330/1‑148 (MQ=255)
aTTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCTAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAAtt > 1:2314531/1‑148 (MQ=255)
aTTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCTAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAAtt < 1:1558621/148‑1 (MQ=255)
tttCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCTAAGAAATAGACTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGAATGTAAtac > 1:1573084/1‑146 (MQ=255)
gttggttATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCTAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAAt < 2:2946796/148‑1 (MQ=255)
tggttATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCTAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAg < 2:789173/148‑1 (MQ=255)
ggttATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCTAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGa < 2:1624950/148‑1 (MQ=255)
tATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCTAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGAttt > 1:2610759/1‑148 (MQ=255)
tGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCTAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGt < 1:1819929/148‑1 (MQ=255)
gCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCTAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTc > 1:3170617/1‑148 (MQ=255)
gCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCTAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTc < 1:2281985/148‑1 (MQ=255)
gAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCGAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCttt < 1:1238846/148‑1 (MQ=255)
aTTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCTAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGcc > 1:622879/1‑148 (MQ=255)
tGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCTAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTg > 1:693975/1‑148 (MQ=255)
tCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCTAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGAg > 1:608048/1‑148 (MQ=255)
tCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCTAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGAg > 2:2504680/1‑148 (MQ=255)
tCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCTAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGAg > 1:2268207/1‑148 (MQ=255)
gggATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCTAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGAggg < 1:1425925/148‑1 (MQ=255)
ggATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCTAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGAGGGa < 2:2049635/148‑1 (MQ=255)
ggATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCTAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGAGGGa < 2:2049396/148‑1 (MQ=255)
gATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCTAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGAGGGAt > 1:466955/1‑148 (MQ=255)
ataataACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCGAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGAGGGATg > 1:1474281/1‑148 (MQ=255)
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aataaCCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCTAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGAGGGATGtt < 1:3011148/148‑1 (MQ=255)
aataaCCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCGAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGAGGGATGtt > 1:3093611/1‑148 (MQ=255)
aataaCCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCGAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGAGGGATGtt > 1:473877/1‑148 (MQ=255)
aataaCCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCGAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGAGGGATGtt > 1:473450/1‑148 (MQ=255)
ataaCCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCTAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGAGGGATGttt < 2:2564293/148‑1 (MQ=255)
ataaCCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCGAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGAGGGATGttt > 2:2834696/1‑148 (MQ=255)
taaCCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCTAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGAGGGATGtttt > 1:643329/1‑148 (MQ=255)
taaCCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCGAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGAGGGATGtttt > 2:486187/1‑148 (MQ=255)
aaCCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCTAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTTTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGACTGAGTGATGttttt > 2:2025925/1‑148 (MQ=255)
aCCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCTAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGAGGGATGTTTTTa > 2:512427/1‑148 (MQ=255)
tAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCTAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGAGGGATGTTTTTAAttt > 1:538171/1‑148 (MQ=255)
gTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCTAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGAGGGATGTTTTTAATTTGa < 1:3081897/148‑1 (MQ=255)
ttttCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCTAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGAGGGATGTTTTTAATTTGAtt > 1:3279725/1‑148 (MQ=255)
ttttCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCTAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGAGGGATGTTTTTAATTTGAtt > 1:93081/1‑148 (MQ=255)
ttttCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCTAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGAGGGATGTTTTTAATTTGAtt < 2:2754903/148‑1 (MQ=255)
ttCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCGAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGAGGGATGTTTTTAATTTGATTgg < 1:2022690/148‑1 (MQ=255)
aCTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCTAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGAGGGATGTTTTTAATTTGATTGGTCa > 1:136885/1‑148 (MQ=255)
cTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCTAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGAGGGATGTTTTTAATTTGATTGGTCaa < 2:1922614/148‑1 (MQ=255)
cTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCTAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGAGGGATGTTTTTAATTTGATTGGTCaa > 1:3189539/1‑148 (MQ=255)
tCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCTAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGAGGGATGTTTTTAATTTGATTGGTCAAt > 1:2295351/1‑148 (MQ=255)
aTTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCTAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAAATCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGAGGGATGTTTTTAATTTGATTGGTCAATTGt < 2:2231050/148‑1 (MQ=255)
ttCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCGAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGAGGGATGTTTTTAATTTGATTGGTCAATTGTa > 1:1364704/1‑148 (MQ=255)
tCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCGAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGAGGGATGTTTTTAATTTGATTGGTCAATTGTAt > 2:734986/1‑148 (MQ=255)
tCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCGAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGAGGGATGTTTTTAATTTGATTGGTCAATTGTAt > 2:2394544/1‑148 (MQ=255)
ttGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCTAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGAGGGATGTTTTTAATTTGATTGGTCAATTGTATTAAc > 2:1762848/1‑148 (MQ=255)
tGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCTAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGAGGGATGTTTTTAATTTGATTGGTCAATTGTATTAAcc < 2:3296547/148‑1 (MQ=255)
aaTAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCTAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGAGGGATGTTTTTAATTTGATTGGTCAATTGTATTAACCAtt > 2:1428124/1‑148 (MQ=255)
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TCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCTAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGAGGG < SRR19973070.1792362/150‑1 (MQ=60)
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TAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCTAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGAGGGATGTTTTTAATTTGATTGGTCAATTGTATTAACCATTG < SRR19973070.2520946/150‑1 (MQ=60)
ATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCTAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGAGGGATGTTTTTAATTTGATTGGTCAATTGTATTAACCATTGGT > SRR19973070.467481/1‑150 (MQ=60)
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GGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCTAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGAGGGATGTTTTTAATTTGATTGGTCAATTGTATTAACCATTGGTCAG < SRR19973070.862490/150‑1 (MQ=60)
GGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCTAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGAGGGATGTTTTTAATTTGATTGGTCAATTGTATTAACCATTGGTCAG > SRR19973070.1738296/1‑150 (MQ=60)
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GCTAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGAGGGATGTTTTTAATTTGATTGGTCAATTGTATTAACCATTGGTCAGCCGATTTTTCTGCGACACCTTCCA < SRR19973070.2719631/150‑1 (MQ=60)
GCTAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGAGGGATGTTTTTAATTTGATTGGTCAATTGTATTAACCATTGGTCAGCCGATTTTTCTGCGACACCTTCCA < SRR19973070.1055914/150‑1 (MQ=60)
CTAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGAGGGATGTTTTTAATTTGATTGGTCAATTGTATTAACCATTGGTCAGCCGATTTTTCTGCGACACCTTCCAG < SRR19973070.1821768/150‑1 (MQ=60)
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ATTAATCATTTTTCGGATACCAGGCTGTTGAAAACTCAGGACGAATAAGGTCTATTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCGAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGAGGGATGTTTTTAATTTGATTGGTCAATTGTATTAACCATTGGTCAGCCGATTTTTCTGCGACACCTTCCAG > CP009273/1083294‑1083591
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
