Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
A1 F204 I0 R1
|
1155 |
255.8 |
8356456 |
95.7% |
7997128 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
RA |
CP009273 |
1,083,443 |
G→T |
56.8% |
S624* (TCG→TAG) |
pgaB ← |
poly‑beta‑1,6‑N‑acetyl‑D‑glucosamine (PGA) N‑deacetylase outer membrane export lipoprotein |
|
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
* | CP009273 | 1,083,443 | 0 | G | T | 56.8%
| 31.8
/ inf
| 250 | S624* (TCG→TAG) | pgaB | poly‑beta‑1,6‑N‑acetyl‑D‑glucosamine (PGA) N‑deacetylase outer membrane export lipoprotein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (56/52); new base T (68/74); total (124/126) |
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.10e-01 |
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 264 total aligned reads displayed.
TTAATCATTTTTCGGATACCAGGCTGTTGAAAACTCAGGACGAATAAGGTCTATTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCGAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGAGGGATGTTTTTAATTTGATTGGTCAATTGTATTAACCATTGGTCAGCCGATTTTTCTGCGACACCTTCCAGA > CP009273/1083295‑1083592
|
tAATCATTTTTCGGATACCAGGCTGTTGAAAACTCAGGACGAATAAGGTCTATTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCtaa > 1:2744943/1‑150 (MQ=255)
tAATCATTTTTCGGATACCAGGCTGTTGAAAACTCAGGACGAATAAGGTCTATTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCgaa > 1:2312945/1‑150 (MQ=255)
aaTCATTTTTCGGATACCAGGCTGTTGAAAACTCAGGACGAATAAGGTCTATTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCtaag < 1:2455040/150‑1 (MQ=255)
cATTTTTCGGATACCAGGCTGTTGAAAACTCAGGACGAATAAGGTCTATTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCGAAGaaa > 2:3205409/1‑150 (MQ=255)
ttttCGGATACCAGGCTGTTGAAAACTCAGGACGAATAAGGTCTATTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCGAAGAAATAg > 1:2183707/1‑150 (MQ=255)
tttCGGATACCAGGCTGTTGAAAACTCAGGACGAATAAGGTCTATTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCTAAGAAATAGc < 1:2023860/150‑1 (MQ=255)
ttCGGATACCAGGCTGTTGAAAACTCAGGACGAATAAGGTCTATTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCTAAGAAATAGcc > 1:1390046/1‑150 (MQ=255)
tCGGATACCAGGCTGTTGAAAACTCAGGACGAATAAGGTCTATTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCGAAGAAATAGCCt > 2:3933749/1‑150 (MQ=255)
cGGATACCAGGCTGTTGAAAACTCAGGACGAATAAGGTCTATTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCGAAGAAATAGCCTg > 1:2260489/1‑150 (MQ=255)
cAGGCTGTTGAAAACTCAGGACGAATAAGGTCTATTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCGAAGAAATAGCCTGATGCTGa > 1:4092809/1‑150 (MQ=255)
aGGCTGTTGAAAACTCAGGACGAATAAGGTCTATTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCTAAGAAATAGCCTGATGCTGAc > 2:522537/1‑150 (MQ=255)
ggCTGTTGAAAACTCAGGACGAATAAGGTCTATTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCTAAGAAATAGCCTGATGCTGAcc > 1:3058127/1‑150 (MQ=255)
ggCTGTTGAAAACTCAGGACGAATAAGGTCTATTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCGAAGAAATAGCCTGATGCTGAcc > 1:1752150/1‑150 (MQ=255)
gTTGAAAACTCAGGACGAATAAGGTCTATTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCGAAGAAATAGCCTGATGCTGACCAttt > 1:3283360/1‑150 (MQ=255)
aaaCTCAGGACGAATAAGGTCTATTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCTAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTg > 2:3761511/1‑150 (MQ=255)
aCTCAGGACGAATAAGTTCTATTTCAGGTTTGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGATCATACAGTGAGCGAGTTGTTGCGAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGcc < 2:1993823/150‑1 (MQ=255)
aGGACGAATAAGGTCTATTTCAGGTTGGTTATGCATAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCCGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGAGAAGAAATAGCCTGATGCTGACAATTTTTCTGACAGtt > 2:2954129/1‑150 (MQ=255)
aGGACGAATAAGGTCTATTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCTAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGtt > 2:1463698/1‑150 (MQ=255)
aGGACGAATAAGGTCTATTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCGAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGtt < 1:1583613/150‑1 (MQ=255)
ggACGAATAAGGTCTATTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCGAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGttt > 2:2345789/1‑150 (MQ=255)
cGAATAAGGTCTATTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCTAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTtgt > 1:933693/1‑150 (MQ=255)
cGAATAAGGTCTATTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCTAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTtgt > 2:1941822/1‑150 (MQ=255)
aaTAAGGTCTATTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCGAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGc > 1:344593/1‑150 (MQ=255)
ggTCTATTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCTAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTa > 1:663231/1‑150 (MQ=255)
gTCTATTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCGAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTaa < 1:362054/150‑1 (MQ=255)
gTCTATTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCGAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTaa < 1:2994144/150‑1 (MQ=255)
cTATTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCTAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAAtt < 2:310696/150‑1 (MQ=255)
aTTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCTAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCt < 2:3856479/150‑1 (MQ=255)
aTTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCTAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCt < 1:3452679/150‑1 (MQ=255)
cAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCGAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTaaaa > 2:383273/1‑150 (MQ=255)
aGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCTAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAAt > 1:940341/1‑150 (MQ=255)
aGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCTAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAAt > 1:3221287/1‑150 (MQ=255)
ggttggttATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCTAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATa > 1:2205154/1‑150 (MQ=255)
ggttggttATGCAGAAAATTGACGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCGAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATa < 2:3459525/150‑1 (MQ=255)
ttggttATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCTAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGa > 1:2859150/1‑150 (MQ=255)
ttggttATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCGAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGa > 2:2876503/1‑150 (MQ=255)
ggttATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCGAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGAtt > 2:2327799/1‑150 (MQ=255)
gCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCTAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCtt > 2:1296581/1‑150 (MQ=255)
cAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCTAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCttt > 1:3718095/1‑150 (MQ=255)
cAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCTAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCttt > 1:4022021/1‑150 (MQ=255)
cAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCGAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCttt < 2:1542235/150‑1 (MQ=255)
cAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCGAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCttt < 2:1536254/150‑1 (MQ=255)
aGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCTAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTa > 1:341553/1‑150 (MQ=255)
aGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCTAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTa < 2:370485/150‑1 (MQ=255)
aaaaTTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCGAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGc > 1:679386/1‑150 (MQ=255)
aaTTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCTAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCt < 1:1745102/150‑1 (MQ=255)
aTTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCGAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTg > 1:2383904/1‑150 (MQ=255)
ttGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCTAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGa < 2:1024281/150‑1 (MQ=255)
tCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCTAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGAggg < 1:47270/150‑1 (MQ=255)
gggATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCGAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGAGGGAt < 1:3409206/150‑1 (MQ=255)
aataaCCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCTAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGAGGGATGtttt > 2:1914170/1‑150 (MQ=255)
aataaCCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCTAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGAGGGATGtttt < 1:545431/150‑1 (MQ=255)
aataaCCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCTAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGAGGGATGtttt > 2:1130936/1‑150 (MQ=255)
aataaCCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCGAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGAGGGATGtttt < 2:166526/150‑1 (MQ=255)
taaCCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCGAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGAGGGATGTTTTTa < 1:446542/150‑1 (MQ=255)
aCCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCTAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGAGGGATGTTTTTAAt < 2:2545645/150‑1 (MQ=255)
ttttCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCTAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGAGGGATGTTTTTAATTTGATTgg < 1:262144/150‑1 (MQ=255)
ttttCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCTAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGAGGGATGTTTTTAATTTGATTgg < 1:1916914/150‑1 (MQ=255)
ttCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCTAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGAGGGATGTTTTTAATTTGATTGGTc > 1:3340977/1‑150 (MQ=255)
tCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCTAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGAGGGATGTTTTTAATTTGATTGGTCa < 2:1283464/150‑1 (MQ=255)
tCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCGAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGAGGGATGTTTTTAATTTGATTGGTCa < 1:3381751/150‑1 (MQ=255)
cACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCGAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGAGGGATGTTTTTAATTTGATTGGTCaa > 2:2508787/1‑150 (MQ=255)
cACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCGAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGAGGGATGTTTTTAATTTGATTGGTCaa > 2:374946/1‑150 (MQ=255)
aCTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCTAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGAGGGATGTTTTTAATTTGATTGGTCAAt < 1:388508/150‑1 (MQ=255)
ccATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCTAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGAGGGATGTTTTTAATTTGATTGGTCAATTGt > 1:2266396/1‑150 (MQ=255)
ccATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCGAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGAGGGATGTTTTTAATTTGATTGGTCAATTGt > 2:2277887/1‑150 (MQ=255)
cATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCTAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGAGGGATGTTTTTAATTTGATTGGTCAATTGTa > 1:1169447/1‑150 (MQ=255)
cATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCTAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGAGGGATGTTTTTAATTTGATTGGTCAATTGTa < 2:1390046/150‑1 (MQ=255)
cATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCGAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGAGGGATGTTTTTAATTTGATTGGTCAATTGTa < 2:2805801/150‑1 (MQ=255)
cATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCGAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGAGGGATGTTTTTAATTTGATTGGTCAATTGTa < 1:131671/150‑1 (MQ=255)
ttCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCTAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGAGGGATGTTTTTAATTTGATTGGTCAATTGTAtt < 2:2984045/150‑1 (MQ=255)
tCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCGAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGAGGGATGTTTTTAATTTGATTGGTCAATTGTATTa < 1:643317/150‑1 (MQ=255)
tCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCGAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGAGGGATGTTTTTAATTTGATTGGTCAATTGTATTa > 1:3828131/1‑150 (MQ=255)
aGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCTAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGAGGGATGTTTTTAATTTGATTGGTCAATTGTATTAAc > 1:398326/1‑150 (MQ=255)
aGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGATGCTAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGAGGGATGTTTTTAATTTGATTGGTCAATTGTATTAAc > 2:688729/1‑150 (MQ=255)
gTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCTAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGAGGGATGTTTTTAATTTGATTGGTCAATTGTATTAAcc < 2:704874/150‑1 (MQ=255)
gTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCTAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGAGGGATGTTTTTAATTTGATTGGTCAATTGTATTAACCAtt < 1:3839264/150‑1 (MQ=255)
aaTAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCGAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGAGGGATGTTTTTAATTTGATTGGTCAATTGTATTAACCATTgg > 2:3404442/1‑150 (MQ=255)
tCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCTAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGAGGGATGTTTTTAATTTGATTGGTCAATTGTATTAACCATTGGTCAGCCg < 2:3135541/150‑1 (MQ=255)
aTCCAGTGAGCGAGTTGTTGCTAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGAGGGATGTTTTTAATTTGATTGGTCAATTGTATTAACCATTGGTCAGCCGAt > 1:1453850/1‑150 (MQ=255)
tCCAGTGAGCGAGTTGTTGCTAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGAGGGATGTTTTTAATTTGATTGGTCAATTGTATTAACCATTGGTCAGCCGAtt > 2:1089683/1‑150 (MQ=255)
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GCGAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGAGGGATGTTTTTAATTTGATTGGTCAATTGTATTAACCATTGGTCAGCCGATTTTTCTGCGACACCTTCCA < SRR19973074.3094144/150‑1 (MQ=60)
TAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGAGGGATGTTTTTAATTTGATTGGTCAATTGTATTAACCATTGGTCAGCCGATTTTTCTGCGACACCTTCCAGA > SRR19973074.109859/1‑150 (MQ=60)
TAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGAGGGATGTTTTTAATTTGATTGGTCAATTGTATTAACCATTGGTCAGCCGATTTTTCTGCGACACCTTCCAGA < SRR19973074.1409157/150‑1 (MQ=60)
GAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGAGGGATGTTTTTAATTTGATTGGTCAATTGTATTAACCATTGGTCAGCCGATTTTTCTGCGACACCTTCCAGA > SRR19973074.2091698/1‑150 (MQ=60)
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TTAATCATTTTTCGGATACCAGGCTGTTGAAAACTCAGGACGAATAAGGTCTATTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCGAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGAGGGATGTTTTTAATTTGATTGGTCAATTGTATTAACCATTGGTCAGCCGATTTTTCTGCGACACCTTCCAGA > CP009273/1083295‑1083592
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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |