Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F368 I0 R1
|
1472 |
214.4 |
7116750 |
95.9% |
6824963 |
147.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
153,472 |
G→T |
100% |
intergenic (‑102/+268) |
yadN ← / ← folK |
putative fimbrial‑like adhesin protein/2‑amino‑4‑hydroxy‑6‑hydroxymethyldihyropteridine pyrophosphokinase |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 153,472 | 0 | G | T | 100.0%
| 730.4
/ ‑6.7
| 224 | intergenic (‑102/+268) | yadN/folK | putative fimbrial‑like adhesin protein/2‑amino‑4‑hydroxy‑6‑hydroxymethyldihyropteridine pyrophosphokinase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); new base T (121/102); total (121/103) |
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 227 total aligned reads displayed.
GCCAGCATAAGACCAGACAGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATGATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGTTAGGGTATGGAGATGGGA > CP009273/153327‑153617
|
gCCAGCATAAGACCAGACAGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTat < 1:3442624/148‑1 (MQ=255)
gCCAGCATAAGACCAGACAGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTat > 2:2571695/1‑148 (MQ=255)
ccAGCATAAGACCAGACAGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATtata < 1:2099922/148‑1 (MQ=255)
cAGCATAAGACCAGACAGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTatat > 2:3188843/1‑148 (MQ=255)
cATAAGACCAGACAGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTg > 1:1348/1‑148 (MQ=255)
gACCAGACAGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTAcc < 2:1732547/148‑1 (MQ=255)
gACCAGACAGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTAcc > 1:1915592/1‑148 (MQ=255)
gACCAGACAGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTAcc > 1:644538/1‑148 (MQ=255)
cAGACAGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑aa > 2:262919/1‑148 (MQ=255)
aCAGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAAtt > 1:2752510/1‑148 (MQ=255)
aCAGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAAtt < 2:2931425/148‑1 (MQ=255)
aCAGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAAtt > 1:244489/1‑148 (MQ=255)
gggCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTAc > 2:784543/1‑148 (MQ=255)
cAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAAc > 2:2010948/1‑148 (MQ=255)
cAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAAc > 1:2710094/1‑148 (MQ=255)
aaaCCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCa < 1:2177478/148‑1 (MQ=255)
aaCCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCAt > 2:2799047/1‑148 (MQ=255)
aaCCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCAt > 1:781045/1‑148 (MQ=255)
aaCCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCAt > 2:598523/1‑148 (MQ=255)
aCCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCAtt < 2:208617/148‑1 (MQ=255)
aCCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCAtt < 2:3257884/148‑1 (MQ=255)
ccTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTg < 2:2198242/148‑1 (MQ=255)
ccTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTg < 2:569676/148‑1 (MQ=255)
cTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGt < 2:1739491/148‑1 (MQ=255)
aTTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGTCTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCa > 1:2302743/1‑148 (MQ=255)
tttAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAg < 2:189592/148‑1 (MQ=255)
tttAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAg < 1:2030692/148‑1 (MQ=255)
tAGACATAAAAATCCTTTAATAAAAGTCCATTAGACAGACTACCTGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACACATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGt < 2:1277091/148‑1 (MQ=255)
gACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTc > 1:845974/1‑148 (MQ=255)
gACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCg > 1:2426161/1‑148 (MQ=255)
aTAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCt > 1:1545481/1‑148 (MQ=255)
aaaaaTCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTAt > 1:4119/1‑148 (MQ=255)
aaaTCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATtg > 1:107669/1‑148 (MQ=255)
aTCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATtgtg > 1:1225851/1‑148 (MQ=255)
ccTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCa < 1:2547764/148‑1 (MQ=255)
ataaAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAg < 2:1140666/148‑1 (MQ=255)
aaaaTTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGaa > 2:1884501/1‑148 (MQ=255)
ttCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCtt > 2:1388212/1‑148 (MQ=255)
tCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCttt < 2:1545481/148‑1 (MQ=255)
aTTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGa < 1:2986449/148‑1 (MQ=255)
aTTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGa < 2:3146374/148‑1 (MQ=255)
ttAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGaa > 2:2318216/1‑148 (MQ=255)
ttAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGaa > 1:1906724/1‑148 (MQ=255)
ttAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGaa < 2:3428601/148‑1 (MQ=255)
aGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACa < 2:1601262/148‑1 (MQ=255)
tCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACaaa > 2:1100838/1‑148 (MQ=255)
aCTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACaaattaa < 1:3156880/148‑1 (MQ=255)
cATGTTTGAATAATGACTATTCATGACACAAATATTAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAAttt < 1:2464588/148‑1 (MQ=255)
tGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTAc > 2:3096530/1‑148 (MQ=255)
tttGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACtt > 2:1505531/1‑148 (MQ=255)
tttGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACtt > 2:3468989/1‑148 (MQ=255)
tGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTaa < 2:423132/148‑1 (MQ=255)
tGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTaa < 2:1348/148‑1 (MQ=255)
aagaaTGACTATTCATGACACACATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTGTAGAAGCCTTTGAACAAATTAAATTTACTTAAtt < 2:677338/148‑1 (MQ=255)
aagaaTGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCAGTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAATGTTAGTTAAtt > 2:2678072/1‑148 (MQ=255)
gaaTGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCa > 1:2528440/1‑148 (MQ=255)
gaaTGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCa > 2:1621952/1‑148 (MQ=255)
aaTGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCaa < 1:3293251/148‑1 (MQ=255)
tGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCaaaa > 1:1692267/1‑148 (MQ=255)
tGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCaaaa > 1:1937590/1‑148 (MQ=255)
gACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAAt > 2:2424899/1‑148 (MQ=255)
tATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTaa > 1:1779595/1‑148 (MQ=255)
ttCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGt > 1:3229442/1‑148 (MQ=255)
ttCATGACACAAATAGGAGAAACAAACGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGt > 1:2356951/1‑148 (MQ=255)
tCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTa < 2:1687306/148‑1 (MQ=255)
aTGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTaaa > 1:2353280/1‑148 (MQ=255)
tGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTaaaa < 2:107669/148‑1 (MQ=255)
gACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTaaaaa > 2:1901549/1‑148 (MQ=255)
cacaAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATa < 1:1884501/148‑1 (MQ=255)
cacaAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATa < 1:464656/148‑1 (MQ=255)
cacaAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATa < 2:3277790/148‑1 (MQ=255)
caAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAg < 2:3521162/148‑1 (MQ=255)
aaaTAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGt < 2:871414/148‑1 (MQ=255)
aaaTAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTGTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGt < 1:2660832/148‑1 (MQ=255)
aaaTAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCAATAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGt < 2:1902503/148‑1 (MQ=255)
aaTAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGtt < 1:488394/148‑1 (MQ=255)
aTAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTc < 2:1000023/148‑1 (MQ=255)
gagaAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACaa > 2:1763663/1‑148 (MQ=255)
agaAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAg < 1:2858086/148‑1 (MQ=255)
agaAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAg > 2:302216/1‑148 (MQ=255)
agaAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAg > 2:2515923/1‑148 (MQ=255)
agaAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAg > 2:2515681/1‑148 (MQ=255)
aaaCAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTg < 2:1935026/148‑1 (MQ=255)
aaaCAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTg > 1:3531594/1‑148 (MQ=255)
aCAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCa < 2:3205848/148‑1 (MQ=255)
gTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGt < 1:738729/148‑1 (MQ=255)
ttAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGtt < 1:1621952/148‑1 (MQ=255)
ttAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGtt < 1:2799047/148‑1 (MQ=255)
aGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGTTAg > 1:1719227/1‑148 (MQ=255)
tatTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGTTAGGGt < 2:21597/148‑1 (MQ=255)
atTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGTTAGGGTa > 1:2753235/1‑148 (MQ=255)
tAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGTTAGGGTATg > 1:1972147/1‑148 (MQ=255)
tAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGTTAGGGTATg > 1:2863007/1‑148 (MQ=255)
tAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGTTAGGGTATg > 1:2933406/1‑148 (MQ=255)
tAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGTTAGGGTATg > 1:529639/1‑148 (MQ=255)
aaTGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGTTAGGGTATgg > 1:385533/1‑148 (MQ=255)
tGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGTTAGGGTATGgag < 2:2356853/148‑1 (MQ=255)
gAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGTTAGGGTATGgaga < 1:3282225/148‑1 (MQ=255)
gAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGTTAGGGTATGgaga > 1:1208215/1‑148 (MQ=255)
aTGATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGTTAGGGTATGGAGATGGGa < 2:332161/148‑1 (MQ=255)
|
GCCAGCATAAGACCAGACAGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATGATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGTTAGGGTATGGAGATGGGA > CP009273/153327‑153617
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GCCAGCATAAGACCAGACAGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATGATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGTTAGGGTATGGAGATGGGATTGA > CP009273/153327‑153621
|
GCCAGCATAAGACCAGACAGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATAT < SRR19973067.3464532/150‑1 (MQ=60)
CCAGCATAAGACCAGACAGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATT < SRR19973067.2113849/150‑1 (MQ=60)
CCAGCATAAGACCAGACAGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATT < SRR19973067.84720/150‑1 (MQ=60)
CCAGCATAAGACCAGACAGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATT < SRR19973067.316349/150‑1 (MQ=60)
CAGCATAAGACCAGACAGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTT > SRR19973067.1176659/1‑150 (MQ=60)
AGCATAAGACCAGACAGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTG > SRR19973067.1373/1‑150 (MQ=60)
ATAAGACCAGACAGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTA > SRR19973067.2822175/1‑150 (MQ=60)
AAGACCAGACAGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACC > SRR19973067.648892/1‑150 (MQ=60)
AAGACCAGACAGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACC > SRR19973067.1928418/1‑150 (MQ=60)
AAGACCAGACAGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACC > SRR19973067.1928667/1‑150 (MQ=60)
AAGACCAGACAGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAAGTATCTTTGTTACC > SRR19973067.2770702/1‑150 (MQ=60)
AAGACCAGACAGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACAAAAATAGGAGAAAAAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACC > SRR19973067.1928729/1‑150 (MQ=60)
AGACAGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATT > SRR19973067.502684/1‑150 (MQ=60)
AGACAGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATT < SRR19973067.2633202/150‑1 (MQ=60)
AGACAGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATT > SRR19973067.246185/1‑150 (MQ=60)
AGACAGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATT > SRR19973067.2770294/1‑150 (MQ=60)
AGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACA < SRR19973067.2736507/150‑1 (MQ=60)
GGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAAC < SRR19973067.2336469/150‑1 (MQ=60)
GGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAAC > SRR19973067.2727549/1‑150 (MQ=60)
CAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCA > SRR19973067.1368740/1‑150 (MQ=60)
AAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCAT > SRR19973067.786451/1‑150 (MQ=60)
AAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCAT > SRR19973067.1948224/1‑150 (MQ=60)
AAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCAT > SRR19973067.786394/1‑150 (MQ=60)
AAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATT < SRR19973067.2192042/150‑1 (MQ=60)
AAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATT < SRR19973067.1954058/150‑1 (MQ=60)
AACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTG < SRR19973067.255546/150‑1 (MQ=60)
TAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGTCTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCA > SRR19973067.2317918/1‑150 (MQ=60)
TTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGG > SRR19973067.390155/1‑150 (MQ=60)
TTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGT < SRR19973067.2044309/150‑1 (MQ=60)
TAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTC > SRR19973067.851704/1‑150 (MQ=60)
TAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCG > SRR19973067.2442097/1‑150 (MQ=60)
TAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCG > SRR19973067.2442078/1‑150 (MQ=60)
ACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCT > SRR19973067.1555980/1‑150 (MQ=60)
ATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTAT > SRR19973067.4193/1‑150 (MQ=60)
AAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTG > SRR19973067.108725/1‑150 (MQ=60)
AAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTG > SRR19973067.1234042/1‑150 (MQ=60)
AAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTG > SRR19973067.1228491/1‑150 (MQ=60)
CCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACT < SRR19973067.2564432/150‑1 (MQ=60)
TTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTT > SRR19973067.1775466/1‑150 (MQ=60)
TAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAG > SRR19973067.2003403/1‑150 (MQ=60)
ATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTCTTGTGCACTTTAGAA > SRR19973067.2117617/1‑150 (MQ=60)
TTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTT < SRR19973067.65675/150‑1 (MQ=60)
CCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGA > SRR19973067.2419926/1‑150 (MQ=60)
CCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCAGTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGA < SRR19973067.881737/150‑1 (MQ=60)
CATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAA > SRR19973067.1919723/1‑150 (MQ=60)
ATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAAC < SRR19973067.2773861/150‑1 (MQ=60)
ATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAAC < SRR19973067.3005339/150‑1 (MQ=60)
TAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAA > SRR19973067.49179/1‑150 (MQ=60)
GTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAAT < SRR19973067.1366053/150‑1 (MQ=60)
CAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTA > SRR19973067.3209127/1‑150 (MQ=60)
CAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTA < SRR19973067.2516427/150‑1 (MQ=60)
ACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAAT < SRR19973067.3176886/150‑1 (MQ=60)
TACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTT < SRR19973067.3315353/150‑1 (MQ=60)
CATGTTTGAATAATGACTATTCATGACACAAATATTAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTAC < SRR19973067.2480794/150‑1 (MQ=60)
CATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTAC < SRR19973067.3046145/150‑1 (MQ=60)
TTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAAT < SRR19973067.2994099/150‑1 (MQ=60)
GAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTC < SRR19973067.407776/150‑1 (MQ=60)
AAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCA > SRR19973067.2544958/1‑150 (MQ=60)
AAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCA > SRR19973067.2545009/1‑150 (MQ=60)
GAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAAAGAGCACTTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAA < SRR19973067.2695243/150‑1 (MQ=60)
AATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAA > SRR19973067.1950803/1‑150 (MQ=60)
AATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAA > SRR19973067.1703919/1‑150 (MQ=60)
AATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAA < SRR19973067.3313964/150‑1 (MQ=60)
TGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATT < SRR19973067.917407/150‑1 (MQ=60)
ACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAA > SRR19973067.1791634/1‑150 (MQ=60)
ACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAA > SRR19973067.1883106/1‑150 (MQ=60)
CTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAG > SRR19973067.2477481/1‑150 (MQ=60)
TATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGT > SRR19973067.3249712/1‑150 (MQ=60)
TATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGT > SRR19973067.2372224/1‑150 (MQ=60)
TATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAACGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGT > SRR19973067.2372323/1‑150 (MQ=60)
TTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAA > SRR19973067.596035/1‑150 (MQ=60)
TCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAA > SRR19973067.2368794/1‑150 (MQ=60)
TCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAA > SRR19973067.2368639/1‑150 (MQ=60)
CATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAA > SRR19973067.457296/1‑150 (MQ=60)
ACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGATCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCATATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAA < SRR19973067.3354677/150‑1 (MQ=60)
CACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAG < SRR19973067.1897368/150‑1 (MQ=60)
CACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAG < SRR19973067.467870/150‑1 (MQ=60)
ACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGT < SRR19973067.596965/150‑1 (MQ=60)
AAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTGTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTC < SRR19973067.2677949/150‑1 (MQ=60)
AATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCA < SRR19973067.491748/150‑1 (MQ=60)
AATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCA > SRR19973067.1742695/1‑150 (MQ=60)
AGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTG < SRR19973067.2876413/150‑1 (MQ=60)
AGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTG < SRR19973067.2876414/150‑1 (MQ=60)
AGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTG > SRR19973067.3553917/1‑150 (MQ=60)
ATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGT < SRR19973067.2224967/150‑1 (MQ=60)
ATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGT > SRR19973067.1916527/1‑150 (MQ=60)
GTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGTTA < SRR19973067.165783/150‑1 (MQ=60)
GTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGTTA < SRR19973067.743856/150‑1 (MQ=60)
TTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGTTAG < SRR19973067.2817104/150‑1 (MQ=60)
TTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGTTAG > SRR19973067.1731005/1‑150 (MQ=60)
TTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGTTAG < SRR19973067.1633023/150‑1 (MQ=60)
TTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGTTAG > SRR19973067.1730273/1‑150 (MQ=60)
TTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGTTAG < SRR19973067.1633083/150‑1 (MQ=60)
GATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGTTAGGGT < SRR19973067.3547532/150‑1 (MQ=60)
ATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGTTAGGGTA > SRR19973067.2771023/1‑150 (MQ=60)
TATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGTTAGGGTAT > SRR19973067.2850199/1‑150 (MQ=60)
ATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGTTAGGGTATG > SRR19973067.2103911/1‑150 (MQ=60)
ATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGTTAGGGTATG > SRR19973067.533197/1‑150 (MQ=60)
ATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGTTAGGGTATG > SRR19973067.2881354/1‑150 (MQ=60)
ATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGTTAGGGTATG > SRR19973067.2951711/1‑150 (MQ=60)
ATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGTTAGGGTATG > SRR19973067.2952025/1‑150 (MQ=60)
ATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGTTAGGGTATG > SRR19973067.1985517/1‑150 (MQ=60)
ATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGTTAGGGTATG < SRR19973067.2727471/150‑1 (MQ=60)
TTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGTTAGGGTATGG > SRR19973067.388223/1‑150 (MQ=60)
TTAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGTTAGGGTATGG > SRR19973067.388170/1‑150 (MQ=60)
TAATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGTTAGGGTATGGA < SRR19973067.2099074/150‑1 (MQ=60)
ATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGTTAGGGTATGGAGA > SRR19973067.1315523/1‑150 (MQ=60)
ATGAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGTTAGGGTATGGAGA > SRR19973067.1216153/1‑150 (MQ=60)
GAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGTTAGGGTATGGAGATG < SRR19973067.3302206/150‑1 (MQ=60)
GAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGTTAGGGTATGGAGATG < SRR19973067.3302826/150‑1 (MQ=60)
GAGCAATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGTTAGGGTATGGAGATG < SRR19973067.3302813/150‑1 (MQ=60)
AATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGTTAGGGTATGGAGATGGGAT > SRR19973067.928004/1‑150 (MQ=60)
AATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGTTAGGGTATGGAGATGGGAT > SRR19973067.2226439/1‑150 (MQ=60)
ATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGTTAGGGTATGGAGATGGGATT < SRR19973067.315268/150‑1 (MQ=60)
ATTATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGTTAGGGTATGGAGATGGGATT < SRR19973067.1108327/150‑1 (MQ=60)
TATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGTTAGGGTATGGAGATGGGATTGA > SRR19973067.2387924/1‑150 (MQ=60)
TATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGTTAGGGTATGGAGATGGGATTGA < SRR19973067.2015166/150‑1 (MQ=60)
TATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGTTAGGGTATGGAGATGGGATTGA < SRR19973067.1969737/150‑1 (MQ=60)
TATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGTTAGGGTATGGAGATGGGATTGA < SRR19973067.160261/150‑1 (MQ=60)
|
GCCAGCATAAGACCAGACAGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATGATATTTGTTACCC‑AAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGTTAGGGTATGGAGATGGGATTGA > CP009273/153327‑153621
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |