Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F534 I1 R1
|
1235 |
230.2 |
7611948 |
95.1% |
7238962 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
153,472 |
G→T |
intergenic (‑102/+268) |
yadN ← / ← folK |
putative fimbrial‑like adhesin protein/2‑amino‑4‑hydroxy‑6‑hydroxymethyldihyropteridine pyrophosphokinase |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 153,472 | 0 | G | T | 100.0%
| 779.7
/ NA
| 234 | intergenic (‑102/+268) | yadN/folK | putative fimbrial‑like adhesin protein/2‑amino‑4‑hydroxy‑6‑hydroxymethyldihyropteridine pyrophosphokinase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base T (128/106); total (128/106) |
Only 100 of 234 total aligned reads displayed.
TCGCCAGCATAAGACCAGACAGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATGATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGTTAGGGTATGGAGATGGGAT > CP009273/153325‑153618
|
tCGCCAGCATAAGACCAGACAGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTat < 2:770520/150‑1 (MQ=255)
gCCAGCATAAGACCAGACAGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTatat < 2:1469075/150‑1 (MQ=255)
ccAGCATAAGACCAGACAGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATAtt > 1:1413449/1‑150 (MQ=255)
ccAGCATAAGACCAGACAGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATAtt > 1:1959888/1‑150 (MQ=255)
aGCATAAGACCAGACAGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTg < 2:2498009/150‑1 (MQ=255)
aGCATAAGACCAGACAGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTg < 1:1842389/150‑1 (MQ=255)
gCATAAGACCAGACAGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGt > 2:3206225/1‑150 (MQ=255)
aGACCAGACAGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTAccc > 2:2493577/1‑150 (MQ=255)
gACCAGACAGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCa > 2:1664146/1‑150 (MQ=255)
cAGACAGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAAt < 1:2614722/150‑1 (MQ=255)
aGACAGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAAtt < 1:3033395/150‑1 (MQ=255)
aGACAGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAAtt < 2:1264643/150‑1 (MQ=255)
gACAGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAGCAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAAttt < 1:1919546/150‑1 (MQ=255)
cAGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTAc > 2:1745893/1‑150 (MQ=255)
gggCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACaa < 2:3728761/150‑1 (MQ=255)
ggCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAAc > 2:3528375/1‑150 (MQ=255)
gCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAAcc > 2:1776381/1‑150 (MQ=255)
aaCCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTg > 1:1293033/1‑150 (MQ=255)
aaCCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTg > 1:431610/1‑150 (MQ=255)
aCCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGt > 1:3422750/1‑150 (MQ=255)
ccTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGtt > 1:2917942/1‑150 (MQ=255)
tAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCa > 1:983446/1‑150 (MQ=255)
tAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCa < 1:88523/150‑1 (MQ=255)
aaTTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCAt > 1:3125878/1‑150 (MQ=255)
tttAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGt < 1:610714/150‑1 (MQ=255)
tttAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGt < 2:1913179/150‑1 (MQ=255)
tAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCg < 1:2508457/150‑1 (MQ=255)
tAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCg > 1:115924/1‑150 (MQ=255)
aGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGc > 2:3104489/1‑150 (MQ=255)
aGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGc > 1:1019812/1‑150 (MQ=255)
aCATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCt < 1:353999/150‑1 (MQ=255)
aCATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCt > 1:3771529/1‑150 (MQ=255)
aTAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTAt > 2:2825458/1‑150 (MQ=255)
aaaaaTCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATtg > 1:2867443/1‑150 (MQ=255)
aaaaTCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATtgt > 1:2822519/1‑150 (MQ=255)
aaaTCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATtgtg > 1:334391/1‑150 (MQ=255)
aaTCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGc < 2:1027063/150‑1 (MQ=255)
aTCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCa > 2:287466/1‑150 (MQ=255)
ccTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACt < 1:3479103/150‑1 (MQ=255)
cTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACtt > 1:2189906/1‑150 (MQ=255)
cTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACtt > 2:2620780/1‑150 (MQ=255)
tttAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACttt > 2:2119197/1‑150 (MQ=255)
ttAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATCTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTa > 1:65809/1‑150 (MQ=255)
aataaAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGa > 1:3269500/1‑150 (MQ=255)
ataaAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGaa > 1:2469148/1‑150 (MQ=255)
aaaTTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCt < 1:3738751/150‑1 (MQ=255)
aaTTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCtt > 2:1368347/1‑150 (MQ=255)
ttCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCtttt < 2:3216630/150‑1 (MQ=255)
aTTAGTCAGATTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTCTTGAAc < 1:2352594/150‑1 (MQ=255)
aTTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAAc > 1:3012318/1‑150 (MQ=255)
tAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACaa > 1:1821987/1‑150 (MQ=255)
tAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACaa > 1:1567400/1‑150 (MQ=255)
tCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACaaatt < 2:2454548/150‑1 (MQ=255)
tCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACaaatt < 2:548020/150‑1 (MQ=255)
aGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACaaattaa < 2:1001224/150‑1 (MQ=255)
aGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACaaattaa < 2:3605929/150‑1 (MQ=255)
aGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACaaattaa > 2:2753953/1‑150 (MQ=255)
aGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACaaattaa > 1:1722278/1‑150 (MQ=255)
gACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTAACCAAATTTGCAACCATTGTTCATTATGTAGCCTATTTTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACaaaataaa > 2:3437858/1‑150 (MQ=255)
aCTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACaaattaaat < 2:2208037/150‑1 (MQ=255)
tACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAAttt > 1:1206743/1‑150 (MQ=255)
aCATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATCGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTa < 2:3020695/150‑1 (MQ=255)
aCATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTa < 2:1615484/150‑1 (MQ=255)
aTGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACt > 2:969185/1‑150 (MQ=255)
aTGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACt > 2:1084251/1‑150 (MQ=255)
aTGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACt > 2:1084164/1‑150 (MQ=255)
tGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACtt < 1:2258989/150‑1 (MQ=255)
tttGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTaa > 1:3667862/1‑150 (MQ=255)
tGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAAtt > 1:3231161/1‑150 (MQ=255)
tGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAAtt > 1:3132241/1‑150 (MQ=255)
agaaTGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCaa < 1:2119197/150‑1 (MQ=255)
gaaTGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATAGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCaaa > 1:1057419/1‑150 (MQ=255)
aaTGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCaaaa > 2:2431098/1‑150 (MQ=255)
tGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAAtt < 1:1115342/150‑1 (MQ=255)
aCTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTaa > 1:2904942/1‑150 (MQ=255)
cATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTaaaa > 2:684203/1‑150 (MQ=255)
gACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAAGGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATa > 1:3636173/1‑150 (MQ=255)
acacAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATaa > 2:47978/1‑150 (MQ=255)
acacAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATaa < 2:3262669/150‑1 (MQ=255)
cacaAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAg > 1:637276/1‑150 (MQ=255)
caAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGtt < 2:1164645/150‑1 (MQ=255)
aaaCAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCa < 2:2091232/150‑1 (MQ=255)
aCAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAAt < 2:129379/150‑1 (MQ=255)
cAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATCTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAAtt < 2:65809/150‑1 (MQ=255)
aaaTGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTg > 1:1071296/1‑150 (MQ=255)
aaTGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTgg > 2:2249189/1‑150 (MQ=255)
tGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGtt > 2:2171379/1‑150 (MQ=255)
gTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGTTa < 2:2918009/150‑1 (MQ=255)
gTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGTTa < 2:2917942/150‑1 (MQ=255)
gTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGTTa > 1:2028495/1‑150 (MQ=255)
tAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGTTAgg > 2:2971447/1‑150 (MQ=255)
gATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGTTAGGGt < 1:2971127/150‑1 (MQ=255)
gATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGTTAGGGt > 2:888761/1‑150 (MQ=255)
atTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGTTAGGGTATg < 2:1019812/150‑1 (MQ=255)
ttAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGTTAGGGTATgg < 1:2187269/150‑1 (MQ=255)
aaTGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGTTAGGGTATGgag > 1:47915/1‑150 (MQ=255)
aTGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGTTAGGGTATGgaga > 2:2230309/1‑150 (MQ=255)
gAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGTTAGGGTATGGAGATg > 1:853037/1‑150 (MQ=255)
aaTTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGTTAGGGTATGGAGATGGGAt < 2:2528036/150‑1 (MQ=255)
aaTTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGTTAGGGTATGGAGATGGGAt < 2:2790623/150‑1 (MQ=255)
|
TCGCCAGCATAAGACCAGACAGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATGATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGTTAGGGTATGGAGATGGGAT > CP009273/153325‑153618
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GCCAGCATAAGACCAGACAGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATGATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGTTAGGGTATGGAGATGGGATTG > CP009273/153327‑153620
|
GCCAGCATAAGACCAGACATGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATAT < SRR19973061.3647846/150‑1 (MQ=60)
CCAGCATAAGACCAGACAGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATT > SRR19973061.1964789/1‑150 (MQ=60)
CCAGCATAAGACCAGACAGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATT > SRR19973061.1417013/1‑150 (MQ=60)
CCAGCATAAGACCAGACAGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATACTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATT > SRR19973061.2354753/1‑150 (MQ=60)
CAGCATAAGACCAGACATGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGAATATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTT < SRR19973061.62991/150‑1 (MQ=60)
AGCATAAGACCAGACAGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTG < SRR19973061.1846999/150‑1 (MQ=60)
ATAAGACCAGACAGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTA < SRR19973061.3622077/150‑1 (MQ=60)
CAGACAGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAAT < SRR19973061.2621434/150‑1 (MQ=60)
AGACAGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATT > SRR19973061.1001611/1‑150 (MQ=60)
AGACAGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATT < SRR19973061.1655959/150‑1 (MQ=60)
AGACAGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATT < SRR19973061.3041232/150‑1 (MQ=60)
AGACAGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATT > SRR19973061.1001403/1‑150 (MQ=60)
GACAGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAGCAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTT < SRR19973061.1924306/150‑1 (MQ=60)
CAGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTAC < SRR19973061.377313/150‑1 (MQ=60)
GGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAAC > SRR19973061.1891705/1‑150 (MQ=60)
CAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCA < SRR19973061.2020781/150‑1 (MQ=60)
CAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCA > SRR19973061.1277856/1‑150 (MQ=60)
CAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCA < SRR19973061.2709250/150‑1 (MQ=60)
AACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTG > SRR19973061.1296244/1‑150 (MQ=60)
AACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTG > SRR19973061.432788/1‑150 (MQ=60)
ACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGT > SRR19973061.3431534/1‑150 (MQ=60)
ACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGT > SRR19973061.326012/1‑150 (MQ=60)
CCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTT > SRR19973061.2925433/1‑150 (MQ=60)
CCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTT > SRR19973061.2925485/1‑150 (MQ=60)
CCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTT > SRR19973061.2925500/1‑150 (MQ=60)
CTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTC < SRR19973061.2092771/150‑1 (MQ=60)
TAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCA < SRR19973061.87925/150‑1 (MQ=60)
TAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCA < SRR19973061.88822/150‑1 (MQ=60)
TAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCA > SRR19973061.985950/1‑150 (MQ=60)
AATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCAT > SRR19973061.3133951/1‑150 (MQ=60)
AATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCAT > SRR19973061.3133933/1‑150 (MQ=60)
TTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGT < SRR19973061.612286/150‑1 (MQ=60)
TAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCG > SRR19973061.115418/1‑150 (MQ=60)
TAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCG > SRR19973061.116309/1‑150 (MQ=60)
TAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCG < SRR19973061.2514849/150‑1 (MQ=60)
AGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGC > SRR19973061.1022409/1‑150 (MQ=60)
AGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGC > SRR19973061.2096486/1‑150 (MQ=60)
AGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGC > SRR19973061.1928422/1‑150 (MQ=60)
ACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCT > SRR19973061.3781159/1‑150 (MQ=60)
ACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCT < SRR19973061.354954/150‑1 (MQ=60)
ACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCT > SRR19973061.3781269/1‑150 (MQ=60)
AAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTG > SRR19973061.2874790/1‑150 (MQ=60)
AAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGT > SRR19973061.2829752/1‑150 (MQ=60)
AAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTG > SRR19973061.335270/1‑150 (MQ=60)
TCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCAC > SRR19973061.1824173/1‑150 (MQ=60)
TCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCAC > SRR19973061.3725457/1‑150 (MQ=60)
CCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACT < SRR19973061.3488003/150‑1 (MQ=60)
CTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTT > SRR19973061.2195413/1‑150 (MQ=60)
CTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTT > SRR19973061.2195410/1‑150 (MQ=60)
CTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTT > SRR19973061.2195393/1‑150 (MQ=60)
CTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTT > SRR19973061.2916501/1‑150 (MQ=60)
CTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTT < SRR19973061.647366/150‑1 (MQ=60)
CTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTT > SRR19973061.1703708/1‑150 (MQ=60)
TTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATCTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTA > SRR19973061.66055/1‑150 (MQ=60)
TAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAG > SRR19973061.3131490/1‑150 (MQ=60)
TAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAG > SRR19973061.1828099/1‑150 (MQ=60)
AATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGA > SRR19973061.2874550/1‑150 (MQ=60)
AATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGA > SRR19973061.3277921/1‑150 (MQ=60)
ATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAA > SRR19973061.2475576/1‑150 (MQ=60)
ATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAA > SRR19973061.2475436/1‑150 (MQ=60)
AAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCT < SRR19973061.3214466/150‑1 (MQ=60)
AAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCT < SRR19973061.3748320/150‑1 (MQ=60)
AATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTCTTGTGCACTTTAGAAGCTT > SRR19973061.3271067/1‑150 (MQ=60)
AATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTT > SRR19973061.501652/1‑150 (MQ=60)
ATTAGTCAGATTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTCTTGAAC < SRR19973061.2358574/150‑1 (MQ=60)
ATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAAC > SRR19973061.152181/1‑150 (MQ=60)
ATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAAC < SRR19973061.2358719/150‑1 (MQ=60)
ATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAAC > SRR19973061.3020092/1‑150 (MQ=60)
TAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAA > SRR19973061.1826549/1‑150 (MQ=60)
TAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAA > SRR19973061.1571293/1‑150 (MQ=60)
GTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAAT > SRR19973061.1115825/1‑150 (MQ=60)
GTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAAT < SRR19973061.2245229/150‑1 (MQ=60)
GTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAAT < SRR19973061.941204/150‑1 (MQ=60)
AGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAA > SRR19973061.1726594/1‑150 (MQ=60)
AGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAA > SRR19973061.1305935/1‑150 (MQ=60)
TACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTT > SRR19973061.1209772/1‑150 (MQ=60)
TACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTT > SRR19973061.1209821/1‑150 (MQ=60)
TACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTT < SRR19973061.454127/150‑1 (MQ=60)
TACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTT > SRR19973061.104630/1‑150 (MQ=60)
TGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTT < SRR19973061.2264678/150‑1 (MQ=60)
TTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAA > SRR19973061.3677238/1‑150 (MQ=60)
TGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATT > SRR19973061.3239468/1‑150 (MQ=60)
TGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATT > SRR19973061.3140309/1‑150 (MQ=60)
AGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAA < SRR19973061.2124517/150‑1 (MQ=60)
GAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATAGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAA > SRR19973061.1060134/1‑150 (MQ=60)
AATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAA > SRR19973061.348683/1‑150 (MQ=60)
ATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAAT < SRR19973061.288238/150‑1 (MQ=60)
ATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAAT < SRR19973061.3648747/150‑1 (MQ=60)
TGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATT < SRR19973061.1118193/150‑1 (MQ=60)
GACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTA < SRR19973061.3354984/150‑1 (MQ=60)
ACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAA > SRR19973061.2912393/1‑150 (MQ=60)
TGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAAT > SRR19973061.3279999/1‑150 (MQ=60)
GACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAAGGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATA > SRR19973061.3645467/1‑150 (MQ=60)
ACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAA < SRR19973061.1103691/150‑1 (MQ=60)
CACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAG > SRR19973061.638894/1‑150 (MQ=60)
AATATGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCA < SRR19973061.3537411/150‑1 (MQ=60)
AATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCA < SRR19973061.2593067/150‑1 (MQ=60)
AATAGGAGAAAAAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCA < SRR19973061.191689/150‑1 (MQ=60)
ATATGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCATATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCAC < SRR19973061.2131094/150‑1 (MQ=60)
AAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCA < SRR19973061.2869193/150‑1 (MQ=60)
ACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAAT > SRR19973061.1199348/1‑150 (MQ=60)
CAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATT < SRR19973061.803176/150‑1 (MQ=60)
AAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTG > SRR19973061.1074043/1‑150 (MQ=60)
AAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTG > SRR19973061.1074035/1‑150 (MQ=60)
AAAAGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTG > SRR19973061.635766/1‑150 (MQ=60)
AATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGG < SRR19973061.311063/150‑1 (MQ=60)
GTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGTTA > SRR19973061.2033585/1‑150 (MQ=60)
TAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGTTAGG > SRR19973061.856032/1‑150 (MQ=60)
AGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGTTAGGG > SRR19973061.3039694/1‑150 (MQ=60)
GATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGTTAGGGT < SRR19973061.2978788/150‑1 (MQ=60)
GATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGTTAGGGT < SRR19973061.2979108/150‑1 (MQ=60)
ATATTAATGAGCAATTATATCTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGTTAGGGTA > SRR19973061.400397/1‑150 (MQ=60)
ATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGTTAGGGTATG < SRR19973061.3486424/150‑1 (MQ=60)
TTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGTTAGGGTATGG < SRR19973061.2192768/150‑1 (MQ=60)
AATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGTTAGGGTATGGAG > SRR19973061.48097/1‑150 (MQ=60)
AATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGTTAGGGTATGGAG < SRR19973061.2499929/150‑1 (MQ=60)
GAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGTTAGGGTATGGAGATG > SRR19973061.855258/1‑150 (MQ=60)
ATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGTTAGGGTATGGAGATGGGATT < SRR19973061.1251607/150‑1 (MQ=60)
TTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGTTAGGGTATGGAGATGGGATTG < SRR19973061.2300532/150‑1 (MQ=60)
|
GCCAGCATAAGACCAGACAGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATGATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGTTAGGGTATGGAGATGGGATTG > CP009273/153327‑153620
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |