Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F5 I0 R1
|
92 |
232.7 |
8849178 |
85.5% |
7566047 |
149.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
235,036 |
G→T |
19.2% |
S63Y (TCC→TAC) |
ykfM ← |
lethality reduction protein, putative inner membrane protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 235,036 | 0 | G | T | 19.2%
| 311.0
/ 5.0
| 160 | S63Y (TCC→TAC) | ykfM | lethality reduction protein, putative inner membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (76/38); new base T (5/35); total (81/79) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.22e-09 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 167 total aligned reads displayed.
GCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAATGCAGGGAAAAATAATATGGCCATAAAAAA > CP009273/234889‑235184
|
gCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGa > 2:1808468/1‑149 (MQ=255)
tATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGaaa < 1:3755546/149‑1 (MQ=255)
tATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGaaa < 1:4073458/149‑1 (MQ=255)
aTTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTTTTAAGAAATATTTTATTATAGTAAGTAAAAATAAAAGAAAATTTAAAAAGGaaaa > 1:3361348/1‑149 (MQ=255)
aTTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTAAGAATTATTTTATTATCGTAAGTAAAATTAAAATAATATTTAAAAAGGaaaa > 2:31891/1‑149 (MQ=255)
aTTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGTTTAATAAAAATTTTAATATAGTAAATAAAATAAAAAGAATATTTAAAAAATaaaa > 1:3361444/1‑149 (MQ=255)
aTTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGaaaa > 1:2468066/1‑149 (MQ=255)
tAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACg < 2:1142777/149‑1 (MQ=255)
tatggTGCTTTTACGTTAGCTATTAGTAATTATATATGTGTTAGCTGTTTTGTTTTGTGTGTGGCGTAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTATGATTGATTTTTTTTTCGTAAGTAAAATTACATGATTATTTAATAAGGTAAACGa < 2:3308427/146‑1 (MQ=255)
aaaGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTTTTAAGAAATAATTTATTAACTTAAATAAAAAAAAATAAAAATTTAAAAAAGAacacaa > 1:3686394/1‑147 (MQ=255)
aGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACa < 2:1019905/149‑1 (MQ=255)
aGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTAAATGAATATTTTAAAAGGAAAACGACa > 2:17743/1‑149 (MQ=255)
ggTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGTTTAAGAAAGATTTTATTATAGGAAGTAAAAATACCAGAATATTTAAAAAGGAAAACGACaa > 1:1676435/1‑148 (MQ=255)
ggTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACAt > 2:722832/1‑149 (MQ=255)
ggTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAAAGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTAAAAGAAGATTTAAAAAGGAAAACGAcca > 1:1676383/1‑147 (MQ=255)
ggTGATTTTACTATAGATATTATTAAAAATATAAGATTTAGCTGTATTTTTATGTCTTTGGCGAAATTTACTACCTTCTTTTTTTTTATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACAt < 2:4213102/149‑1 (MQ=255)
ggTGATTTTACGATAGCTATTTGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTTTTATGTCTGTGGCTAATTTGACTACCTTCTTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAATTAAATTTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACAt < 2:1990200/149‑1 (MQ=255)
gCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTGTTTTTTAGTAAGAAAGATTATAATTTACGAAATAAAAAAAAAAGTAAATTTAAAAATGAAAacaacaaaaa > 1:1896020/1‑145 (MQ=255)
ttACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTAAGAATGATTTTATTATAGTAAGTAAAATTACAAGAATATTTAAAAATGAAAAACACATGAAACCg > 1:4146865/1‑149 (MQ=255)
aTAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGca > 2:2101825/1‑149 (MQ=255)
aTAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTGTTTTTGATTTATAATTATTTTATTATAGTAAGTAAAAATAAAAGAATATTTATAAATTAAAACGACAAGAAACCCAAGca > 1:4162188/1‑149 (MQ=255)
aGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCTAAATTTACTACATTCTTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGcaca < 2:1387347/149‑1 (MQ=255)
tatattatTAAAAATATAAGAGTTTGCTTTTTTGTTATGTCGGTGGCGAAATTGACTACCTTCTTTTTTTTGATTAATAATTATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAg < 2:3548308/147‑1 (MQ=255)
gCTATTCTTAAATATTTAAGTTTTTGTTTTTTTGTTTTGTCTGTGGCTAATTTGACTACCTTGTTTTTTTTTATTAATATTTTTTTTTTTATCTTATGTAAATTTACATTAATTTTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAg < 2:2238873/149‑1 (MQ=255)
aTTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATAGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAATGAAAACGACATGAAACCGCAGCACAGaaa > 1:2382015/1‑148 (MQ=255)
ttAGTAAAAATATAAGTGTTAGCTGTTTTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGAATACCTTCTTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCTTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATc < 2:2909632/149‑1 (MQ=255)
aGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGTTTAAGAATGATTTTATTATAGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAAAGACATTAAACCGAAGCACAGAATaaa > 2:871082/1‑149 (MQ=255)
aaaaaTATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATTATTTTATTTTAGTAAGTAAAAATACAAGAAAATTTAAAAAGGAAAACGACAAGAAACCCAAGCACAGAAacaacaa > 1:819065/1‑148 (MQ=255)
aaaaTATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATTATTTTATTATCGTAATTAAAATTACAAGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACAtt > 1:1409745/1‑149 (MQ=255)
atatAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAATAAATATTTTATTATAGTAAGTAAAATTAAAAGAAAATTTAAAAAAGAAAACAACATGAAAACCAAGCACACAATaaaaaaaatc > 1:2310802/1‑142 (MQ=255)
agTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATAGTAAGTAAAATTAAATGAATATTTAAAAATGAAAACGACATGAAACCGAAGCACATAATCAACATTATCCaaaaat > 1:3961147/1‑145 (MQ=255)
gTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAATAAAGATTTTATTATATTAAGTAAAATTAAAAGAAAATTTAAAAAGGAAAAAGACATGAAACCCAAGCACAGAAACAACAATAACCAATCATa > 1:1681580/1‑149 (MQ=255)
aGCTTTTTTGTTTTGTCTGTGGCTAATTTGACTACATTCTTTTTTTTGATTAAGAATTTTTTTATTATCTTAATTAAAATTACATTAATTTTTAAAATGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATaaaa < 1:4042423/149‑1 (MQ=255)
aGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATTATTTTATTATCGTAAGTAAAATTAAATGAATATTTAAAAATGAAAAAGACATGAAAAAGAATCACAGAATAAACAATATACAATCATaaaa > 2:2600688/1‑149 (MQ=255)
gCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAAAGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAat > 2:192849/1‑149 (MQ=255)
gCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAAAGATTTTATTATAGTAAGTAAAAATACAAGAATATTTAAAAAGTAAAACGACAAGAAACCCAAGCACAGAATCAACAATCTCCAAACATAAAat > 2:2966504/1‑149 (MQ=255)
tGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTAATAATTATTTTATTATAGTAAATAAAATTAAAATAATATTTAAAAAGGAAAAATACAATAAACACAAGAAAACAAAAAACAATATACAAACATAAAaaat > 1:1899733/1‑149 (MQ=255)
ttATTGTTTTGTCTGTGGAGAAATTGAATACATTCTTTTTTTTGATTAATAATTATTTTATTATCTAAATAAAAATTACATTAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATAtt < 2:432572/148‑1 (MQ=255)
ttATTGTTATGTCTGTGGCTAAATTGACTACCTTCTTTTTTTTTATTAATAATTATTTTATTATCTTAAGTAAAATTACTTTAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATAtt < 2:2636988/148‑1 (MQ=255)
ttATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTGCGTTTTTTTTATTAAGAATGATTTTATTATCTTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATAtt < 2:666013/148‑1 (MQ=255)
ttGTTTTGTCGGGGGCTAAATTGAATACTTTGTTTTTTTTTATTAATATTTATTTTATTTTATTAATTAAATTTAAATTATTTTTTAAAATGTAACACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTcc < 1:433008/149‑1 (MQ=255)
ttGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAAAGATTTTATTATCGTAAGTAAAAATAAATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTca > 2:3816078/1‑148 (MQ=255)
ttGTTATGTCTGTGGCGAAATTCACTCCCTTCTTTTTTTTGATTAATAATTATTTTATTATCTTAATAAAAATTACATTAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTcc < 1:1658592/149‑1 (MQ=255)
gTTATGTCTGTGGCTAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTTTTATCGTAAGTAAATTTACATTATTATTTAAAATGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGt < 1:2494198/149‑1 (MQ=255)
gTTAGGTCTGTGGCTAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGt < 2:2422518/149‑1 (MQ=255)
aTGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTTTTTAGAATTATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACAGAAGCACAGAATAAACAATATCCAATCATAAAATATTTGAGTGGa > 2:1561560/1‑149 (MQ=255)
aTGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTGTTTTTGATTAAGAATGATTTTTTTATAGTTAGTAAAATTACATTAATTTTTAAAAATGAAAACGACAAGAAACCGAAGCCCACAAACAACAATCTACAAACATAAAATATTTACGTGGa > 2:2204920/1‑149 (MQ=255)
tttCTGTGGCTAAATTGACTACCTTATTTTTTTTTATTAAGATTTATTTTATTATCTTAATTAAAATTAAATGAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAg < 2:3174793/147‑1 (MQ=255)
tCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGTTTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGTCATGAAACCGAAGCAAAGAATCAACATTCTCCAATAATAAAATATTTCAGTGGAGCa > 2:735258/1‑149 (MQ=255)
gtgGCGAAATTTACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCAttt < 2:293979/149‑1 (MQ=255)
gtgGCGAAATTGACTCCCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTATTTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCAttt < 2:4269636/149‑1 (MQ=255)
taaaTTGACTCCCTTCTTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGAAATTAAAATTAAATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTttatta < 2:3946553/148‑1 (MQ=255)
aatttGACTACCTTCTTTTTTTTTTTTAATAATTATTTTATTATCTTAATTAAAATTACATTAATATTAAAAAAGTAACACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTtattat < 1:2665206/146‑1 (MQ=255)
aCTACCTTCGTTTTTTTTATTAAGAATGATTTTATTATCTTAATTAAAATTAAATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAata < 2:4075449/149‑1 (MQ=255)
tACCTTCTTTTTTTTGATTAATAATTTTTTTATTATCTTAATTAAGATTAAATTAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAAtata < 1:3169863/149‑1 (MQ=255)
aCCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACAATCTCCAATAATAAAATATTTACGTGGAGCCTATTATTATTTAAtatat > 2:3127646/1‑148 (MQ=255)
ttCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAgg > 2:2194576/1‑149 (MQ=255)
ttgTTTTTTTTATTAAGAATTTTTTTATTATCTTAATTAAAATTACTTTAATATTTAAAAAGCAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGt < 1:1192050/147‑1 (MQ=255)
tgtttttttttATTAATAATTATTTTTTTATCGTAATAAAATTTAATTTAATATAAAAAATGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGt < 1:1192107/146‑1 (MQ=255)
gATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCgg > 2:2370974/1‑149 (MQ=255)
ttAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTa > 2:3282928/1‑149 (MQ=255)
ttAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTa > 1:267005/1‑149 (MQ=255)
aaGAATTATTTTATTATCTTAATTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTaaa < 2:3502686/149‑1 (MQ=255)
aGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTaaaa > 1:1897804/1‑149 (MQ=255)
aaTGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTaaaaaa > 1:820080/1‑149 (MQ=255)
aTGATTTTATTATCTTAAGTAAAATTAAATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAAc < 2:3232828/149‑1 (MQ=255)
tGATTTTATTATCTTAATTAAAATTAAATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACa < 2:1179823/149‑1 (MQ=255)
tGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACa > 2:1914881/1‑149 (MQ=255)
gATTTTATTATCTTAATTAAAATAAAATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACaa < 1:4393871/149‑1 (MQ=255)
gATTTTATTATATTAATTAAAATTAAATTAATATTTAAAATGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACaa < 1:1767398/149‑1 (MQ=255)
ttattaTCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAaagaa > 2:4388075/1‑149 (MQ=255)
ttattaTCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAaagaa > 2:4388106/1‑149 (MQ=255)
attatCGAAATTAAAATAACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACAAGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGc < 2:4302799/149‑1 (MQ=255)
ttatCTTTAGTAAATTTACTTTAATATTTAAAATGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCa < 1:3951908/149‑1 (MQ=255)
tatCGTAATTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCAt < 2:1768944/149‑1 (MQ=255)
tatCGTAAGTAAAATTACATTAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCAt < 2:853365/149‑1 (MQ=255)
atCTTAAGTAAAATTAAATTAATTTTTAAAATGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAGGCAtt < 1:3423796/149‑1 (MQ=255)
atCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCAtt > 2:422505/1‑149 (MQ=255)
ttattaaaaaTAACATTAATATTAAAAAAGTAACACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGaa < 1:3684770/143‑1 (MQ=255)
gtaattaaAATTACATGAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGaa < 2:1681580/149‑1 (MQ=255)
gtaagtaaAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGaa > 2:1760309/1‑149 (MQ=255)
aattaaAATTACATGAATATTAAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAATg < 2:172852/146‑1 (MQ=255)
gtaaAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAATGCa > 1:2081934/1‑149 (MQ=255)
aaaTTAATTTAATTTTAAAAAATTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAATGCAggg < 1:3784564/149‑1 (MQ=255)
aCATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGATTATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAATGCAGGGaaaaa < 2:2039030/149‑1 (MQ=255)
attaaTATTTAAAAATCAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAATGCAGGGAAAaata < 1:1540271/146‑1 (MQ=255)
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GCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAATGCAGGGAAAAATAATATGGCCATAAAAAA > CP009273/234889‑235184
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
