Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F60 I0 R1
|
465 |
320.4 |
10502068 |
95.5% |
10029474 |
149.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
235,036 |
G→T |
14.8% |
S63Y (TCC→TAC) |
ykfM ← |
lethality reduction protein, putative inner membrane protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 235,036 | 0 | G | T | 14.8%
| 492.9
/ 9.4
| 210 | S63Y (TCC→TAC) | ykfM | lethality reduction protein, putative inner membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (104/57); new base T (2/41); total (106/104) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.41e-13 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 215 total aligned reads displayed.
GCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAATGCAGGGAAAAATAATATGGCCATAAAAAA > CP009273/234889‑235184
|
gCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAATAATGATTTTATTATAGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAATGa > 2:1342788/1‑149 (MQ=255)
gCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGa < 2:563721/149‑1 (MQ=255)
aTTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGaaaa < 1:798842/149‑1 (MQ=255)
aTTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGaaaa < 2:1459966/149‑1 (MQ=255)
ttAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAATGAAAAc > 2:2781661/1‑149 (MQ=255)
aaGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGAc > 2:4174367/1‑149 (MQ=255)
aGGTGCTATTCCGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGTGTTAGCTGTTTTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTAAATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACa < 2:669718/149‑1 (MQ=255)
tGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAATAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAAAATTTAAAAATGAAAACGACATGa > 1:321724/1‑149 (MQ=255)
tGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATTATTTTATTATAGTAATTAAAATTACATGAAAATTTAAAAAGGAAAACGACAAGa > 1:1976406/1‑149 (MQ=255)
gCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGaa > 2:225577/1‑149 (MQ=255)
gATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATAGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAAAGACAAGAAACCGAAGc > 2:4474353/1‑149 (MQ=255)
atatatATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTTTTTTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAATAATGATTTTATTATCTTAATTAAAATTAAATTAATATTTAAAATGGAAAACGACATGAAACCGAAGca < 2:2370435/144‑1 (MQ=255)
aTAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATTTTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAATGAAAACGACATGAAACCGAAGca > 1:4735732/1‑149 (MQ=255)
atatATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGATTTTTTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAATAATGATTTTATTATCTTAAGTAAAATTACATTAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGcaca < 2:3643642/146‑1 (MQ=255)
aGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTTTTATCTTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGcaca < 2:3351570/149‑1 (MQ=255)
tattatTAAAATTATAATTTTTTGGTGTTTTTTTTTGTCTGTGGCTAAATTGAATACCTTGGTTTTTTTTTTTAATATTGATTTTATTATCTTATGTAAAATTACTTTAATATTTAAAATGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGaa < 2:3594025/149‑1 (MQ=255)
aTTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTTTTAAGAATGATTTTATTATAGTTAATAAAATTAAATGAATATTTAAAAATGAAAAAGACATGaaacagaaaaacagaaa > 1:3661454/1‑148 (MQ=255)
ttAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATTATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAATGAAAACGACATTAAAACGAAGCACAGAATc > 1:4274979/1‑149 (MQ=255)
gTAAAAATATAAGAGTTAGCTTTATTGTTATGTCTGTGGCTAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATTTTTTTATTATCTTAATTAAAATTAAATTAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAAc < 2:2252125/149‑1 (MQ=255)
gTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAAATACATGAAAAATTAAAAAGGAAAACCACATGAAACCGAAGCACACAaacaac > 2:4823827/1‑149 (MQ=255)
aaaaTATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTAATAATGATTTTATTATAGTAATTAAAATTACATGTATATTTTAAAAGGAAAAAGACATGAAACCGAATCACAGACTCAACAtt > 2:889197/1‑149 (MQ=255)
atatatGTGTTAGCTTTATTGTTATGTCTGTGGCTAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTAAGAATGATTTTATTATCGTATGTAAATTTACATGAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATtctc < 2:4545580/149‑1 (MQ=255)
aattgTTAGCTTTTTTTTTTTGTCTGTGGCTAAATTGACTACATTCTTTTTTTTTATTAAGAATTATTTTATTATCTTAATTAAAATTAAATTAATTTTTAAAAAGCAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAAt < 1:3829742/145‑1 (MQ=255)
agagTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCTTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTAAATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATc < 2:2542665/149‑1 (MQ=255)
gagTTAGCTGTATTTTTTTGTCTGTGGCTAAATTTACTACCTTCTTTTTTTTGATTAAGATTTATTTTATTATCGTAATTAAAATTACATTAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCa < 2:2235187/149‑1 (MQ=255)
ttAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATaa > 2:3849778/1‑149 (MQ=255)
tGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAAAGATTTTATTATAGTAAGTAAAATTAAAAGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACAATATCCAATCATAAAatat > 1:1223868/1‑149 (MQ=255)
ttttGTTATTTCTTTGGCGAATTTGACTACATTCTTTTTTTTGATTAAGATTTATTTTATTATCTTAATTAAAATTACATTAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATAttt < 2:2967306/147‑1 (MQ=255)
aTTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAAACGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTc > 2:2652540/1‑149 (MQ=255)
ttGTTTTGTGTGTGGCTAAATTGACTACCTTCTTTTTTTTTATTAATATTGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTAATTTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTcc < 1:4703486/149‑1 (MQ=255)
ttGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTcc > 2:256671/1‑149 (MQ=255)
gTTATGTCTGTGGCGAAATTTACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAATTTACATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGt < 2:305260/149‑1 (MQ=255)
gTCTGTGGCTAAATTGAATACCTTGTTTTTTTTTATTAATAATTATTTTATTATCTTAATTAAAATTAAATTAATATTAAAAAAGCAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGc < 1:156421/149‑1 (MQ=255)
gTCGGTGGCTAATTTGAATACATTCTTTTTTTTGATAAAGATTTATTTTATTATCTTAATTAAAATTAAATTAATATTTAAAAAGCAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGc < 1:182468/149‑1 (MQ=255)
tCTGTGGCTAATTTGACTACCTTTGTTTTTTTTATTAATAATTATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATTAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCa < 1:272387/149‑1 (MQ=255)
tCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAAAATTCTCCAATCATAAAATATTTACGTGGAGCa > 2:3813346/1‑149 (MQ=255)
tCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACAGGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTACGTGGAGCa > 2:2074425/1‑149 (MQ=255)
tgtgGCGAAATTGACTACCTTCTTTTTTTTTATTAATAATGATTTTATTATCGTAATTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCAtt < 2:4545800/149‑1 (MQ=255)
gtgGCTAATTTTACAACCTTCTTTTTTTTTATTAATAATTATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCAttt < 1:2131448/149‑1 (MQ=255)
gtgGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCAttt > 2:5187808/1‑149 (MQ=255)
gctaatttGACTACCTTCTTTTTTTTTATTAATATTGATTTTATTATCTTAATTAAAATTAAATGAATATTAAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTttat < 1:5008060/143‑1 (MQ=255)
gctaaaTTGACTACCTTCTTTTTTTTTATTAAGAATTATTTTATTATCTTAAGTAAAATTACATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTttat < 2:1917363/146‑1 (MQ=255)
gCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATTTTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCCTAAAATATTTCCGTGGAGCATTttat < 2:4353864/149‑1 (MQ=255)
gAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAATAATGATTTTATTTTCTTAATTAAAATTACATGAATTTTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTttatta < 1:1279477/149‑1 (MQ=255)
aaTTGACTAAATTCGTTTTTTTGATTAATAATGATCTTATTATCGTAAGTAAAATTAAATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTattatt < 2:2985310/149‑1 (MQ=255)
aTTGACTACCTTCTTTTTTTTTATTAATAATTATTTTATTATCTTAATTAAAATAACATTAATATTAAAAAAGCAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTg < 1:1464425/149‑1 (MQ=255)
aTTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTAAGAATGATTTTATTATCTTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTg < 2:3145106/149‑1 (MQ=255)
aTTGACTACCCTCGTATTTTGGATTAAGAATGATTTTATTAACGTAAGTCAAATAACATGAATATTTAAAAAGGAAACCGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTg < 2:3145047/149‑1 (MQ=255)
ttaCTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCTTAAGTAAAATTACATTAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGaa < 2:4446897/147‑1 (MQ=255)
gACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATTATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGCAAACGACATGAAAACGAAGCACCGAATCAAACTTCTCCAATCATTAAATATTTACGTGGAGCATTTTATTTTTGAat > 2:1819775/1‑149 (MQ=255)
gACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAATTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAAAGACAAGAAACCGAAGCACAGAATAAACATTCTCCAATCATAAAATATTTACGTGGAGAATTTTATTATTGAat > 2:3667458/1‑149 (MQ=255)
cTACCTTCGTTTTTTTTATTAATATTGATTTTATTATCTTAATTAAAATTACATTATTATTTAAAATGTAACACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAatat < 1:1912120/149‑1 (MQ=255)
tACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATTATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAAtata < 2:2294845/149‑1 (MQ=255)
ccTTCGTTTTTTTGTTTAATAATGATTTTATTATAGTAAGTAAAATTACATGAATAATTAAAAATGAAAAAGACAAGAAACCCAAGCACACAAACAACAATCTACAAAAAAAAAAAAATTACGGGGAGCATTTTATAATTGAAaataaa > 2:1564230/1‑147 (MQ=255)
attCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTAAATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATagag < 2:807957/148‑1 (MQ=255)
ttCGTTTTTTTTATTAAGAATTATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAgg < 2:243946/149‑1 (MQ=255)
ttCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAgg > 2:1006800/1‑149 (MQ=255)
ttCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAgg > 1:2995893/1‑149 (MQ=255)
ttttttttGTTTAAGAATTATTTTTTTATCGTAATTAAAATTAATATAATTTTTAAAATGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGttt < 1:4442369/148‑1 (MQ=255)
gTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGttt > 1:2338000/1‑149 (MQ=255)
ttttGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAGGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACt > 2:4970246/1‑149 (MQ=255)
ttGATTAAGAATGATTTTATTATCTTAATTAAAATTACATTAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTcc < 1:4934572/149‑1 (MQ=255)
aTTAATAATTATTTTATTATCTTAATTAAAATTAAATGAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGt < 1:2820050/149‑1 (MQ=255)
aaTGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTaaaaaa > 1:4879797/1‑149 (MQ=255)
aTGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAAc > 2:297629/1‑149 (MQ=255)
tattatCTTAATTAAAATTAAATTAATATTTAAAATGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAaagaag < 1:1619443/149‑1 (MQ=255)
tattatCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAaagaag < 2:1027330/149‑1 (MQ=255)
attatCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGc > 1:4183866/1‑149 (MQ=255)
ttatCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCa > 1:3307636/1‑149 (MQ=255)
tatCGTAATTAAAATTACATTAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCAt < 2:1976406/149‑1 (MQ=255)
tatCGTAAGTAAAATTACATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCAt < 2:321724/149‑1 (MQ=255)
atCTTAATTAAAATTAAATTAATATTTAAAAATTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCAtt < 1:4540434/149‑1 (MQ=255)
atCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCAtt > 1:1785207/1‑149 (MQ=255)
tCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTg > 2:2950639/1‑149 (MQ=255)
cGTAATTAAATTTACATGAATATTTAAAATGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGa < 1:404654/149‑1 (MQ=255)
gtaagtaaAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGaa > 2:1518893/1‑149 (MQ=255)
taagtaaAATTAAATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACCCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAAt < 2:5195760/149‑1 (MQ=255)
attaaAATTAAATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAATGc < 1:3931480/147‑1 (MQ=255)
gtaaAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAATGCa > 2:3767974/1‑149 (MQ=255)
gtaaAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAATGCa < 2:529483/149‑1 (MQ=255)
aaaaTTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAATGCAgg < 2:158092/149‑1 (MQ=255)
aaattaaattAATATTTAAAATGGAACACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAATGCAggg < 1:3907919/149‑1 (MQ=255)
aaTTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAATGCAGGGa > 2:411902/1‑149 (MQ=255)
aaTTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAATGCAGGGa > 1:5210410/1‑149 (MQ=255)
aTTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAATGCAGGGaa > 2:5164092/1‑149 (MQ=255)
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aaGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAATGCAGGGAAAAATAATATGGCCATaaa > 2:2290184/1‑149 (MQ=255)
ggAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAATGCAGGGAAAAATAATATGGCCATaaaaa > 1:4558952/1‑149 (MQ=255)
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GCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAATGCAGGGAAAAATAATATGGCCATAAAAAA > CP009273/234889‑235184
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
