Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F52 I0 R1
|
779 |
320.1 |
10410758 |
96.6% |
10056792 |
149.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
235,036 |
G→T |
16.6% |
S63Y (TCC→TAC) |
ykfM ← |
lethality reduction protein, putative inner membrane protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 235,036 | 0 | G | T | 16.6%
| 436.1
/ 12.0
| 205 | S63Y (TCC→TAC) | ykfM | lethality reduction protein, putative inner membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (96/59); new base T (4/41); total (100/105) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.22e-10 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 210 total aligned reads displayed.
AGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGT‑AAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAATGCAGGGAAAAATAATATGGCCATAAAAAA > CP009273/234888‑235184
|
aGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGT‑AAAATTACATGAATATTTAAAAAgg < 1:3984633/149‑1 (MQ=255)
aGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGT‑AAAATTACATGAATATTTAAAAAgg < 1:1340441/149‑1 (MQ=255)
tATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGT‑AAAATTACATGAATATTTAAAAAGGaaa < 2:4886651/149‑1 (MQ=255)
aaaGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATAGTAAGT‑AAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGa > 2:1606312/1‑149 (MQ=255)
ggTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGT‑AAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAAAGACAt > 2:1455001/1‑149 (MQ=255)
ggTGATATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATATGAGTTTGCTGTTTTGTTATGTCTGTGGCTAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGT‑AAATTTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACAt < 2:1142086/149‑1 (MQ=255)
ttttACTATAGCTTTTATTAAAAATATATGTGTTAGCTGTATTTTTTTGTCTGTGGCTAAATTTACTACCTTCTTTTTTTTGATTAATAATGATTTTTTTATCTTAATT‑AAAATTAATTTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAAc < 1:3426334/147‑1 (MQ=255)
ttACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTGTTTTTGTTTAATAATTATTTTATTATAGTAATT‑AAAATTAAATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACAAGaaaacc > 1:550700/1‑146 (MQ=255)
tACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTAAGAATTATTTTATTATCGTAATT‑AAAAATACATGAATATTTAAAAATTAAAAAGACATTAAAACGa > 1:5014466/1‑149 (MQ=255)
attgCTTTTATTAAAAATATAATTTTTAGCTTTATTTTTTTGTCTGTGGCTAAATTGACTACCTTCTTTTTTTTTATTAATATTTATTTTATTATGGTAATT‑AAATTTAAATGAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGca < 2:1890107/146‑1 (MQ=255)
aTAGCTATTTGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTTTTGTTTTGTCTGTGGCTAAATTGACTCCCTTCTTTTTTTTTATTAAGAATGATTTTATTATCTTAATT‑AAAATTACATGAATATTTAAAATGTAAAACGACATGAAACCGAAGca < 2:1538751/149‑1 (MQ=255)
aTAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATTATTTTATTATAGTAAGT‑AAAATTAAAAGAATATTTAAAAATGAAAACGACATGAAACCGAAGca > 1:2542692/1‑149 (MQ=255)
tAGCTTTTTTTAAAAATATAATAGTTTGCTGTTTTGTTTTGTCTGTGGCTAATTTGACTACGTTCTTTTTTTTTATTAATAATTTTTTTATTATCTTATGT‑AAAATTACTTTAATTTTTAAAATGTAAAACGACATGAAACCGAAGcac < 2:4401623/149‑1 (MQ=255)
aGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTAATAATGATTTTATTATAGTAAGT‑AAAATTAAAAGAAAATTTAAAAAGGAAAACGACAAGAAACCCAACcaca > 1:2609731/1‑149 (MQ=255)
aGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGTTTAAGAAAGATTTTATTATAGTAAGT‑AAAATTAAATGAATATTTAAAAATTAAAACTAAATGAAACCGAATcaaa > 1:1499043/1‑147 (MQ=255)
gCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGT‑AAAAATACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACAAGAAACCGAAGCACAg > 1:2577380/1‑149 (MQ=255)
ttttattaAAATTATAAGTGTTAGCTGTTTTGTTTTGTCTGTGGCTAATTTGACTACATTATTTTTTTTTTTTAATATTTATTTTTTTATCTTAAGT‑AAATTTAATTGATTATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGaa < 1:3720080/147‑1 (MQ=255)
ttttAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCTTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGT‑AAATTTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCa < 1:1248301/146‑1 (MQ=255)
aGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGT‑AAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCaa > 2:2901294/1‑149 (MQ=255)
gTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTAAGAATGATTTTATTATAGTAAGT‑AAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAAAGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAAc > 2:5131872/1‑149 (MQ=255)
gTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGT‑AAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAAc > 1:296517/1‑149 (MQ=255)
tAAAATTATAAGTGTTTGGTGTTTTGTTTTGTGTGTGGCTAAATTTACTACGTTCGTTTTTTTGTTTAAGATTTTTTTTTTTATCGTAATT‑AAAATTACATTAATATTTAAAATGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACa < 1:4465282/149‑1 (MQ=255)
aaaaaTATAAGAGTTCGCTTTATTGTTATGTGTGTGGCGAATTTGACTACCTTCGTTTTTTTGATAAAGAATTATTTTATTATCTTAAGT‑AAAATTACATTAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACAt < 2:471848/149‑1 (MQ=255)
tataAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATAGTAAGT‑AAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAAACAACATTCTcc > 2:4848432/1‑149 (MQ=255)
ataAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTAAGAAAGATTTTATTATCGTAAATAAAAATTAAAT‑AAAATTTAAAAAGGAAAACGAAAATAAAAAGAAGCACAGAAACAACAAtctcaa > 1:1131804/1‑147 (MQ=255)
ataAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGT‑AAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCa > 2:5121293/1‑149 (MQ=255)
taAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATAGTAAGT‑AAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAAACGAAGCACAGAATCAACATTCTCCaa > 2:4997278/1‑149 (MQ=255)
aagttttAGCTTTTTTTTTTTTTGTGTGGCTAATTTGAATACCTTCTTTTTTTTTATTAAGATTTATTTTATTATCGTATTT‑AAAATTACTTGAATATTTAAAATGTAACACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAAt < 1:3310205/144‑1 (MQ=255)
agagTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGT‑AAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATc > 2:827512/1‑149 (MQ=255)
gagTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGT‑AAAATTACATGAATATTTAAAAATGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACAATATCCAATCa > 2:4186038/1‑149 (MQ=255)
agTTAGCTTTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAATAATTATTTTATTATCTTAAGT‑AAATTTACATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCAt < 1:295423/149‑1 (MQ=255)
ttAGCTGTATTGTTTTGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAATT‑AAAATTACATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATaa < 2:2449235/149‑1 (MQ=255)
cTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGTTTTAGAATTATTTTATTATCGTAAGT‑AAAATTAAAAGAATATTTAAAAATGAAAAAGACAAGAAAACGAAGCACAGAATCAACAATAAACAAACATAAAata > 1:1555486/1‑149 (MQ=255)
tttttttATGTGTGGGGCTAAATTGAATACCTTCTTTTTTTTGATTAAGAATGTTTTTTTTATCGTAATT‑AAAATTAAATTAATTTTTAAAATGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATAttt < 1:4693236/144‑1 (MQ=255)
tttGTTTTGTGTGTGGCTAATTTGACAACTTTGTTTTTTTTGTTTATTATTTTTTTTTTTTTGTTATTT‑AAATTTAATTTATTATTTAAAATGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTc < 1:1888525/148‑1 (MQ=255)
tATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGT‑AAAATTACATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAAAATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTgg > 2:4131694/1‑149 (MQ=255)
ttgtgtgtgGCTAAATTGACTACTTTCGTTTTTTTGATTAAGATTTTTTTTATTATCGTATGT‑AAAATTAAATGAATATTTAAAATGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGa < 1:2171243/148‑1 (MQ=255)
aTGTCTGTGGCTAAATTGACTACCTTCTTTTTTTTGATTAAGAATTATTTTATTATCGTAATT‑AAAATTACATTAATATTAAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGa < 2:104012/149‑1 (MQ=255)
tGTCTGTGGCGAATTTGACTACCTTCTTTTTTTTTATTAAGATTTATTTTATTATCTTAAGT‑AAATTTACATTAATTTTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAg < 1:696555/149‑1 (MQ=255)
tGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGT‑AAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAg > 2:3350506/1‑149 (MQ=255)
gtatgtgGCTAAATTGACTACCTTCTTTTTTTTTATTAATAATGATTTTATTATCGTAAGT‑AAAATTACATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGc < 2:4199041/146‑1 (MQ=255)
tCTGTGCCCAAATTCACTACATTCGTTTTTTTGATTAAGAATTATTTTATTAACTTAATT‑AAAATTACATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCa < 2:3300301/149‑1 (MQ=255)
tgtgGCTAATTTGACTACCTTCTTTTTTTTGATTAATAATTATTTTATTATCTTAATT‑AAAATTAAATGAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCAtt < 1:233552/149‑1 (MQ=255)
tgtgGCTAATTTGACTACATTCTTTTTTTTTATTAATAATTATTTTATTATCTTAATT‑AAAATTAAATGAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCAtt < 1:2835835/149‑1 (MQ=255)
tgtgGCTAAATTGACTACTTTGTTTTTTTTTATTAATATTTATTTTATTATCTTAATA‑AAATTTAAATGAATATTTAAAATGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCAtt < 1:3069302/149‑1 (MQ=255)
tgtgGCTAAATTGAATACCTTCTTTTTTTTTATAAATAATGATTTTATTATCTTAATT‑AAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCAtt < 2:3909783/149‑1 (MQ=255)
tgtgGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTTAGAATTATTTTTTTATAGTAAGT‑AAAAATAAAATAATAATTAAAAAATAAAAACACAATAAAACCAATCACACAAAAAAAAATATACAAAAAAAAAAAATTTAAGTGGAGCAtt > 1:956341/1‑149 (MQ=255)
tgtgGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGT‑AAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAAACATAAAATATTTCCGTGGAGCAtt > 1:5170536/1‑149 (MQ=255)
tgGCTAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGT‑AAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCAtttt < 2:3526235/149‑1 (MQ=255)
tgGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGAATAAGAAATAATTTATTATACTAAGT‑AAAAATAAAATAATATATAAAAATGAAAACGAAAATAAACAGAAGCAAACAAACAAAATTCTCCAAAAATAAAATATTTACGAGGAGCAtttt > 2:22784/1‑149 (MQ=255)
aaaTTGACTACCTTCTTTTTTTTGATTAATAATTATTTTATTATCGTAAGT‑AAAATTAAATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTtattat < 2:1343652/149‑1 (MQ=255)
aaaTTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAATAATGATTTTATTATCGTAAGA‑AAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTtattat < 2:255200/149‑1 (MQ=255)
tGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGT‑AAAATTACTTGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGaa < 2:2379684/149‑1 (MQ=255)
ctcctttCGTTTTTTTTATTAATATTTATTTTATTATCTTACTT‑AAATTTACATCAATATTTAAAATGCAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAatat < 1:2237720/144‑1 (MQ=255)
tACCTTCGTTTTTTTTATTAAGAATGATTTTATTATAGTAAGT‑AAAATTACAAGAATATTTAAAAATGAAAAAGACAAGAAACCGAAGCACAGAATCAACAATATCCAATCATAAAAAATTTAAGTGGAGCATTTTATTATTTAAtata > 2:2351853/1‑149 (MQ=255)
ttttttttGATAAATAATTATTTTATTATCGTAATT‑AAAATTACATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGttt < 2:1495309/148‑1 (MQ=255)
gTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGT‑AAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGttt < 2:809945/149‑1 (MQ=255)
gTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGT‑AAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGttt > 2:2668991/1‑149 (MQ=255)
gTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGT‑AAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGttt > 2:752515/1‑149 (MQ=255)
gTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGT‑AAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGttt > 1:4656260/1‑149 (MQ=255)
ttttttATTAATAATTTTTTTATTATATTAATT‑AAAATTAAATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAAc < 1:5057543/149‑1 (MQ=255)
aaGAATGATTTTATTATCTTAATA‑AAAATTAAATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTaaa < 1:4024023/149‑1 (MQ=255)
aaGAATGATTTTATTATCGTAAGT‑AAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTaaa > 2:2820152/1‑149 (MQ=255)
ttgtttttttTATCTTAATT‑AAAATTACATTAATATTAAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAAc < 1:617919/145‑1 (MQ=255)
aTGATTTTATTACCGTAATT‑AAAATTACATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAAc < 1:816407/149‑1 (MQ=255)
ttttATTATCTTAATT‑AAAATTACATGAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAaag < 2:1963946/149‑1 (MQ=255)
attatCGTAAGT‑AAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGc < 2:417350/149‑1 (MQ=255)
tCGTAAGT‑AAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTg > 2:1777223/1‑149 (MQ=255)
gtaagt‑aaATTTACATGAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGaa < 2:601575/149‑1 (MQ=255)
taatt‑aaATTTAATTTAATTTTTAAAATTTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAAt < 1:4441323/149‑1 (MQ=255)
taagt‑aaAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAATCAAAGAAGCCTTGAAt > 2:3510754/1‑149 (MQ=255)
taagt‑aaAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAAt > 1:486578/1‑149 (MQ=255)
gt‑aaAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAATGCa > 1:3005546/1‑149 (MQ=255)
t‑aaAATTAAATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAATGCAg < 2:2609715/149‑1 (MQ=255)
t‑aaAATTAAATTAATATTAAAAAAGAAACACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAATGCAg < 1:905415/149‑1 (MQ=255)
aaaaTTAAATTAATATTTAAAAATGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAATGCAgg < 1:3291788/149‑1 (MQ=255)
aaTTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAATGCAGGGa > 1:427287/1‑149 (MQ=255)
attaaattaaTATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAATGCAGGGaa < 1:3216952/149‑1 (MQ=255)
aTTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAATGCAGGGaa > 1:2684606/1‑149 (MQ=255)
tACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAATGCAGGGaaaa > 2:4478833/1‑149 (MQ=255)
aCATTAATATTTAAAATGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAATGCAGGGaaaaa < 1:3566036/149‑1 (MQ=255)
cATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAATGCAGGGAAAaat > 2:3842161/1‑149 (MQ=255)
aTGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAGCAAAGAAGCATTGAATGCAGGGAAAaata > 1:3507460/1‑149 (MQ=255)
aTGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAATGCAGGGAAAaata > 1:3507212/1‑149 (MQ=255)
gAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAATGAAGGGAAAaataat > 2:4457189/1‑149 (MQ=255)
aaaTATTTAAAAACGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAATGCAGGGAAAaataat < 1:2363912/148‑1 (MQ=255)
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ggAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAATGCAGGGAAAAATAATATGGCCATaaaaa < 2:2628066/149‑1 (MQ=255)
gAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAATGCAGGGAAAAATAATATGGCCATaaaaaa > 2:2122505/1‑149 (MQ=255)
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AGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGT‑AAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAATGCAGGGAAAAATAATATGGCCATAAAAAA > CP009273/234888‑235184
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
