Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F488 I0 R1
|
1275 |
300.1 |
10328444 |
91.0% |
9398884 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
1,540,399 |
A→G |
93.2% |
intergenic (‑114/+146) |
yddL ← / ← yddG |
putative lipoprotein;putative membrane; Not classified; putative outer membrane porin protein/aromatic amino acid exporter |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 1,540,399 | 0 | A | G | 93.2%
| 685.6
/ 24.8
| 204 | intergenic (‑114/+146) | yddL/yddG | putative lipoprotein;putative membrane; Not classified; putative outer membrane porin protein/aromatic amino acid exporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (9/5); new base G (104/85); total (113/91) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.85e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 210 total aligned reads displayed.
AGTTACAACCACCGCAACTATTTTTAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCGGGCCGTAGACCCGGCAGTTATT > CP009273/1540253‑1540544
|
aGTTACAACCACCGCAACTATTTTTAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGgaaa > 1:722097/1‑150 (MQ=255)
aGTTACAACCACCGCAACTATTTTTAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGgaaa > 2:2585309/1‑150 (MQ=255)
aGTTACAACCACCGCAACTATTTTTAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGgaaa > 1:3373710/1‑150 (MQ=255)
gTTACAACCACCGCAACTATTTTTAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGgaaaa < 2:4212963/150‑1 (MQ=255)
ttACAACCACCGCAACTATTTTTAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAAt > 2:4607099/1‑150 (MQ=255)
tACAACCACCGCAACTATTTTTAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATa < 2:2439933/150‑1 (MQ=255)
tACAACCACCGCAACTATTTTTAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATa < 2:4660363/150‑1 (MQ=255)
tACAACCACCGCAACTATTTTTAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATa > 2:2901054/1‑150 (MQ=255)
cAACCACCGCAACTATTTTTAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGa < 2:5044039/150‑1 (MQ=255)
aaCCACCGCAACTATTTTAAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGAt > 1:1998714/1‑150 (MQ=255)
ccaccGCAACTATTTTTAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGa < 1:1270872/150‑1 (MQ=255)
caccGCAACTATTTTTAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGaa > 1:1689001/1‑150 (MQ=255)
accGCAACTATTTTTAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGaaa < 1:3676342/150‑1 (MQ=255)
gCAACTATTTTTAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAaataa > 1:1489964/1‑150 (MQ=255)
cAACTATTTTTAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAaataat < 1:2590607/150‑1 (MQ=255)
cAACTATTTTTAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAaataat > 2:554725/1‑150 (MQ=255)
aaCTATTTTTAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAataata > 1:2633551/1‑150 (MQ=255)
aaCTATTTTTAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAataata > 2:796680/1‑150 (MQ=255)
tttAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGAAATAATAttagtta > 2:3609713/1‑150 (MQ=255)
cATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATAtg > 2:1154477/1‑150 (MQ=255)
ttAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGa > 1:2878230/1‑150 (MQ=255)
tAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGAt > 1:3659398/1‑150 (MQ=255)
aaCAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACTAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATc < 2:1406273/150‑1 (MQ=255)
aaCAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATc > 2:894287/1‑150 (MQ=255)
aaCAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATc < 2:3352430/150‑1 (MQ=255)
aaCAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATc > 1:1633560/1‑150 (MQ=255)
aCAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCg > 2:2646812/1‑150 (MQ=255)
aCAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCg > 2:1354075/1‑150 (MQ=255)
aCAGAATACTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTGATCGATATGTGATCg < 2:3373710/150‑1 (MQ=255)
cAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGa > 2:374462/1‑150 (MQ=255)
cAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGa > 1:4220667/1‑150 (MQ=255)
aGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGaa > 2:346346/1‑150 (MQ=255)
ccTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGa > 2:1943276/1‑150 (MQ=255)
ttttAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGaaa < 2:2801130/150‑1 (MQ=255)
tttAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAAt < 1:2755910/150‑1 (MQ=255)
ttAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATg < 1:1562270/150‑1 (MQ=255)
ttAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATg < 2:1859589/150‑1 (MQ=255)
tAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATga > 2:4559370/1‑150 (MQ=255)
tAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATga > 2:3979899/1‑150 (MQ=255)
tCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGAtata < 2:631563/150‑1 (MQ=255)
ttAAACTTATTTTCTAACCGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAgg < 2:4755462/150‑1 (MQ=255)
ttAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGTAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCTATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAgg < 2:805170/150‑1 (MQ=255)
aaaCGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTg < 1:879025/150‑1 (MQ=255)
aaaCGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTg > 2:2253303/1‑150 (MQ=255)
aaCGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGa < 2:4471473/150‑1 (MQ=255)
gTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAAtt > 2:365076/1‑150 (MQ=255)
aTTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGACTGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAACTAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGCTATAAGGTGAAttcc > 2:4378478/1‑148 (MQ=255)
aTTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTAc < 2:1114352/150‑1 (MQ=255)
ttttCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACt < 2:700831/150‑1 (MQ=255)
ttgtCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACt < 2:832402/147‑1 (MQ=255)
tttCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTg < 1:1370898/150‑1 (MQ=255)
ttCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTgg < 1:3331320/150‑1 (MQ=255)
tCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGt < 2:3707853/150‑1 (MQ=255)
cTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTa < 2:1603510/150‑1 (MQ=255)
cTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTa < 2:4522284/150‑1 (MQ=255)
atAAACGAATTTTAAACGGCTTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTa < 2:1671868/149‑1 (MQ=255)
tAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTAt > 2:4990963/1‑150 (MQ=255)
aaCGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTAttt > 2:720552/1‑150 (MQ=255)
cGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGa > 1:1836635/1‑150 (MQ=255)
gAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGaa > 2:2331205/1‑150 (MQ=255)
ttttAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAatt < 1:1735716/150‑1 (MQ=255)
ttAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAattta > 2:197825/1‑150 (MQ=255)
tAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAatttat > 1:1035310/1‑150 (MQ=255)
aaCGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAatttattt > 1:1217986/1‑150 (MQ=255)
ggCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTAtttttt > 1:4861522/1‑150 (MQ=255)
ggCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTAtttttt < 2:2140678/150‑1 (MQ=255)
ggCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTAtttttt > 1:1424312/1‑150 (MQ=255)
tttATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATAtt < 1:1094604/150‑1 (MQ=255)
aaaTGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAACCCGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCgg < 1:2316336/150‑1 (MQ=255)
aaTGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGa > 1:99385/1‑150 (MQ=255)
aTGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGaa > 2:3303148/1‑150 (MQ=255)
gACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAAtt < 1:492466/150‑1 (MQ=255)
gACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAAtt < 1:3199694/150‑1 (MQ=255)
gACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAAtt > 2:3131823/1‑150 (MQ=255)
gACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAAtt > 2:3131837/1‑150 (MQ=255)
aCATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGTTATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAAttt < 1:4019794/150‑1 (MQ=255)
aCTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCt > 2:4781029/1‑150 (MQ=255)
tGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGa < 1:4488066/150‑1 (MQ=255)
tGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGa > 1:1016807/1‑150 (MQ=255)
tttttAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGAtt < 2:3281594/150‑1 (MQ=255)
ttttAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTa < 2:1722835/150‑1 (MQ=255)
tAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACt < 1:4781174/150‑1 (MQ=255)
tAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACt > 2:4483826/1‑150 (MQ=255)
tAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACt > 2:4885795/1‑150 (MQ=255)
aaaaTAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTa > 2:3572401/1‑150 (MQ=255)
aaTAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGTTGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTAcc > 1:3155815/1‑150 (MQ=255)
aTAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCg > 2:154336/1‑150 (MQ=255)
aTAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCg < 2:3561868/150‑1 (MQ=255)
tGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCGGGCCGt < 2:2108547/150‑1 (MQ=255)
tGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCGGGCCGt > 2:2062830/1‑150 (MQ=255)
ggTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCGGGCCGTa < 2:4304427/150‑1 (MQ=255)
gTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCGGGCCGTAg < 2:162447/150‑1 (MQ=255)
gATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGACATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCGGGCCGTAGAc > 1:220924/1‑150 (MQ=255)
tAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCGGGCCGTAGACCCg < 1:2901054/150‑1 (MQ=255)
aaaaaCAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCGGGCCGTAGACCCgg < 2:3035890/150‑1 (MQ=255)
aaaaCAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCGGGCCGTAGACCCGGc > 2:4342734/1‑150 (MQ=255)
aaCAATGAGGACAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTGTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCGGGCCGTAGACCCGGCAg < 2:1470406/150‑1 (MQ=255)
aCAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCGGGCCGTAGACCCGGCAGt > 1:662648/1‑150 (MQ=255)
aaTGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCGGGCCGTAGACCCGGCAGTTa > 1:2073955/1‑150 (MQ=255)
tGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCGGGCCGTAGACCCGGCAGTTAtt < 1:4607099/150‑1 (MQ=255)
|
AGTTACAACCACCGCAACTATTTTTAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCGGGCCGTAGACCCGGCAGTTATT > CP009273/1540253‑1540544
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
ACCAGTTACAACCACCGCAACTATTTTTAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCGGGCCGTAGACCCGGCAGTTATTTT > CP009273/1540250‑1540546
|
ACCAGTTACAACCACCGCAACTATTTTTAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGG > SRR19973063.3292477/1‑150 (MQ=60)
ACCAGTTACAACCACCGCAACTATTTTTAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGG > SRR19973063.1144651/1‑150 (MQ=60)
ACCAGTTACAACCACCGCAACTATTTTTAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGG < SRR19973063.2635139/150‑1 (MQ=60)
CCAGTTACAACCACCGCAACTATTTTTAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGA < SRR19973063.4459699/150‑1 (MQ=60)
AGTTACAACCACCGCAACTATTTTTAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAA > SRR19973063.724220/1‑150 (MQ=60)
AGTTACAACCACCGCAACTATTTTTAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAA > SRR19973063.3384186/1‑150 (MQ=60)
AGTTACAACCACCGCAACTATTTTTAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAAAAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAA > SRR19973063.3384455/1‑150 (MQ=60)
GTTACAACCACCGCAACTATTTTTAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAA < SRR19973063.702505/150‑1 (MQ=60)
TTACAACCACCGCAACTATTTTTAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAAT > SRR19973063.1722923/1‑150 (MQ=60)
ACAACCACCGCAACTATTTTTAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAG < SRR19973063.294477/150‑1 (MQ=60)
CAACCACCGCAACTATTTTTAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGA > SRR19973063.150896/1‑150 (MQ=60)
CAACCACCGCAACTATTTTTAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGA < SRR19973063.1437274/150‑1 (MQ=60)
AACCACCGCAACTATTTTAAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGAT > SRR19973063.2004957/1‑150 (MQ=60)
ACCACCGCAACTATTTTTAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATG > SRR19973063.1362057/1‑150 (MQ=60)
CCACCGCAACTATTTTTAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGA < SRR19973063.1274648/150‑1 (MQ=60)
CACCGCAACTATTTTTAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAA > SRR19973063.1694145/1‑150 (MQ=60)
ACCGCAACTATTTTTAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAA < SRR19973063.3688111/150‑1 (MQ=60)
CGCAACTATTTTTAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATA > SRR19973063.4619607/1‑150 (MQ=60)
GCAACTATTTTTAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAA > SRR19973063.1494528/1‑150 (MQ=60)
CAACTATTTTTAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAAT < SRR19973063.2598842/150‑1 (MQ=60)
AACTATTTTTAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATA > SRR19973063.2641955/1‑150 (MQ=60)
TTTAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTA > SRR19973063.1227550/1‑150 (MQ=60)
TTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGA > SRR19973063.2887435/1‑150 (MQ=60)
TAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATCTGTGAT > SRR19973063.3671137/1‑150 (MQ=60)
TAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGAT > SRR19973063.3671128/1‑150 (MQ=60)
AACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATC > SRR19973063.1638552/1‑150 (MQ=60)
AACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATC > SRR19973063.1638557/1‑150 (MQ=60)
CAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGA > SRR19973063.4234124/1‑150 (MQ=60)
CTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAA > SRR19973063.3573288/1‑150 (MQ=60)
CTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAA < SRR19973063.2110181/150‑1 (MQ=60)
TTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAA > SRR19973063.247789/1‑150 (MQ=60)
TTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAAT < SRR19973063.2764800/150‑1 (MQ=60)
TTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAAT < SRR19973063.2764919/150‑1 (MQ=60)
TTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATG < SRR19973063.1567067/150‑1 (MQ=60)
ATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATAT > SRR19973063.1885300/1‑150 (MQ=60)
ATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATAT > SRR19973063.4343152/1‑150 (MQ=60)
GTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGTCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAG < SRR19973063.1404640/150‑1 (MQ=60)
AAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTG < SRR19973063.881560/150‑1 (MQ=60)
AAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTG < SRR19973063.4732990/150‑1 (MQ=60)
GTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGACATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATT < SRR19973063.2629717/150‑1 (MQ=60)
TATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTA > SRR19973063.162950/1‑150 (MQ=60)
TATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTA > SRR19973063.2766867/1‑150 (MQ=60)
TTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTG < SRR19973063.1375032/150‑1 (MQ=60)
TTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGG < SRR19973063.3341950/150‑1 (MQ=60)
CGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGA > SRR19973063.1842361/1‑150 (MQ=60)
GAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAA > SRR19973063.4221220/1‑150 (MQ=60)
AATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAA > SRR19973063.3210172/1‑150 (MQ=60)
TTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATT < SRR19973063.1740998/150‑1 (MQ=60)
TAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTAT > SRR19973063.1038361/1‑150 (MQ=60)
TAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTAT > SRR19973063.1038445/1‑150 (MQ=60)
AACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTT > SRR19973063.1221477/1‑150 (MQ=60)
AACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTT > SRR19973063.1221633/1‑150 (MQ=60)
ACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTT > SRR19973063.2708916/1‑150 (MQ=60)
GGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTT > SRR19973063.4877182/1‑150 (MQ=60)
GGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTT > SRR19973063.1428646/1‑150 (MQ=60)
TTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATT < SRR19973063.1097937/150‑1 (MQ=60)
TAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCG > SRR19973063.1776337/1‑150 (MQ=60)
AAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGTATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGG > SRR19973063.1682809/1‑150 (MQ=60)
AAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAACCCGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGG < SRR19973063.2323744/150‑1 (MQ=60)
AATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGA > SRR19973063.99727/1‑150 (MQ=60)
GACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATT < SRR19973063.3209980/150‑1 (MQ=60)
GACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATT < SRR19973063.493881/150‑1 (MQ=60)
ACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGTTATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTT < SRR19973063.4032689/150‑1 (MQ=60)
ACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTT < SRR19973063.4921279/150‑1 (MQ=60)
ATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATCTAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATGTAT > SRR19973063.4268960/1‑150 (MQ=60)
CTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTG < SRR19973063.896887/150‑1 (MQ=60)
TGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGA > SRR19973063.1019872/1‑150 (MQ=60)
TGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGA < SRR19973063.4502459/150‑1 (MQ=60)
TAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACT < SRR19973063.4796445/150‑1 (MQ=60)
AATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGTTGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACC > SRR19973063.3165965/1‑150 (MQ=60)
GTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCGGGCCGTAG < SRR19973063.4808951/150‑1 (MQ=60)
GATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGACATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAAGTTATCTGATTAACTACCGGGCCGTAGAC > SRR19973063.221586/1‑150 (MQ=60)
GATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCGGGCCGTAGAC > SRR19973063.222142/1‑150 (MQ=60)
TAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCGGGCCGTAGACCCG < SRR19973063.798978/150‑1 (MQ=60)
TAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCGGGCCGTAGACCCG < SRR19973063.2910315/150‑1 (MQ=60)
TAAAAAAAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCGGGCCGTAGACCCG < SRR19973063.3798425/150‑1 (MQ=60)
AAAAACAATGAGAAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCGGGCCGTAGACCCGG > SRR19973063.1048667/1‑150 (MQ=60)
ACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCGGGCCGTAGACCCGGCAGT > SRR19973063.664444/1‑150 (MQ=60)
ACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCGGGCCGTAGACCCGGCAGT > SRR19973063.664587/1‑150 (MQ=60)
ACAAGGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCGGGCCGTAGACCCGGCAGT < SRR19973063.3193232/150‑1 (MQ=60)
AATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCGGGCCGTAGACCCGGCAGTTA > SRR19973063.2080440/1‑150 (MQ=60)
AATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCGGGCCGTAGACCCGGCAGTTA > SRR19973063.2080430/1‑150 (MQ=60)
ATGAGAAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCGGGCCGTAGACCCGGCAGTTAT > SRR19973063.2899824/1‑150 (MQ=60)
TGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCGGGCCGTAGACCCGGCAGTTATT < SRR19973063.4621835/150‑1 (MQ=60)
AGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCGGGCCGTAGACCCGGCAGTTATTTT < SRR19973063.324853/150‑1 (MQ=60)
AGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCGGGCCGTAGACCCGGCAGTTATTTT < SRR19973063.3198039/150‑1 (MQ=60)
AGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCGGGCCGTAGACCCGGCAGTTATTTT < SRR19973063.406934/150‑1 (MQ=60)
AGGAAAATAGATGAAATAATATTAATTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTTGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCGGGCCGTAGACCCGGCAGTTATTTT > SRR19973063.1804533/1‑150 (MQ=60)
|
ACCAGTTACAACCACCGCAACTATTTTTAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCGGGCCGTAGACCCGGCAGTTATTTT > CP009273/1540250‑1540546
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
