Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F434 I0 R1
|
1130 |
215.9 |
7031662 |
97.1% |
6827743 |
147.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
1,540,399 |
A→G |
100% |
intergenic (‑114/+146) |
yddL ← / ← yddG |
putative lipoprotein;putative membrane; Not classified; putative outer membrane porin protein/aromatic amino acid exporter |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 1,540,399 | 0 | A | G | 98.6%
| 847.8
/ ‑0.7
| 217 | intergenic (‑114/+146) | yddL/yddG | putative lipoprotein;putative membrane; Not classified; putative outer membrane porin protein/aromatic amino acid exporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (2/1); new base G (95/117); total (98/119) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.90e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.02e-01 |
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 222 total aligned reads displayed.
GTTACAACCACCGCAACTATTTTTAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCGGGCCGTAGACCCGGCAGTTAT > CP009273/1540254‑1540543
|
gTTACAACCACCGCAACTATTTTTAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGgaa > 1:1056433/1‑148 (MQ=255)
tACAACCACCGCAACTATTTTTAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGgaaaa > 2:2504636/1‑148 (MQ=255)
aCAACCACCGCAACTATTTTTAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAAt < 2:1588911/148‑1 (MQ=255)
cAACCACCGCAACTATTTTTAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATa > 1:1021672/1‑148 (MQ=255)
cAACCACCGCAACTATTTTTAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATa > 1:2624811/1‑148 (MQ=255)
aaCCACCGCAACTATTTTTAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAg < 1:1881020/148‑1 (MQ=255)
ccaccGCAACTATTTTTAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGAt > 1:2318700/1‑148 (MQ=255)
ccaccGCAACTATTTTTAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGAt < 2:2430409/148‑1 (MQ=255)
accGCAACTATTTTTAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAACATAGATGa > 2:2671475/1‑148 (MQ=255)
ccGCAACTATTTTTAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGaa > 1:1721152/1‑148 (MQ=255)
gCAACTATTTTTAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACTAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAaat < 2:1541960/148‑1 (MQ=255)
aCTATTTTTAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAaataat < 1:626231/148‑1 (MQ=255)
cTATTTTTAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAataata < 1:747531/148‑1 (MQ=255)
aTTTTTAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAAtatt > 2:1977675/1‑148 (MQ=255)
tttttAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAAtatta < 1:78624/148‑1 (MQ=255)
tttttAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAAtatta < 1:3265818/148‑1 (MQ=255)
tttttAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAAtatta < 1:2135059/148‑1 (MQ=255)
tttAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATattatt < 1:2411476/148‑1 (MQ=255)
ttAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATAttattt < 2:85986/148‑1 (MQ=255)
tAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATAttattta < 2:1155295/148‑1 (MQ=255)
tAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATAttattta < 2:1050928/148‑1 (MQ=255)
aTTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATc < 2:2892202/148‑1 (MQ=255)
tCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGat < 1:431404/148‑1 (MQ=255)
tttAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATAtg > 1:2300722/1‑148 (MQ=255)
tAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATAtgtg < 1:3450092/148‑1 (MQ=255)
cAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATc < 1:708002/148‑1 (MQ=255)
gAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGa > 2:823399/1‑148 (MQ=255)
aaTCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGaa < 1:2035241/148‑1 (MQ=255)
aaTCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGaa < 1:855891/148‑1 (MQ=255)
aTCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAg < 1:3489924/148‑1 (MQ=255)
gccTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGt < 2:835731/147‑1 (MQ=255)
ccTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTc > 2:1783565/1‑148 (MQ=255)
ttAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGaaa > 1:2233222/1‑148 (MQ=255)
tCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGata > 2:1695157/1‑148 (MQ=255)
gTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGAtata < 1:2550198/148‑1 (MQ=255)
gTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGAtata < 1:3160089/148‑1 (MQ=255)
tAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAg > 2:3161992/1‑148 (MQ=255)
aaaCGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAgg > 1:3243679/1‑148 (MQ=255)
aaCGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGt > 2:416801/1‑148 (MQ=255)
aCGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTg > 1:1153526/1‑148 (MQ=255)
gTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGaa < 1:1226134/148‑1 (MQ=255)
tATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAAt > 1:434388/1‑148 (MQ=255)
ttttCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTa < 2:762109/148‑1 (MQ=255)
ttttCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTa < 2:3309746/148‑1 (MQ=255)
ttttCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTa < 1:676752/148‑1 (MQ=255)
tttCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGTAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTAc > 2:2268194/1‑148 (MQ=255)
tttCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTAc > 2:806714/1‑148 (MQ=255)
tttCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTAc > 1:2809108/1‑148 (MQ=255)
tttCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTAc < 1:3408206/148‑1 (MQ=255)
tCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTg < 2:545315/148‑1 (MQ=255)
aaaCGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTa > 1:3112914/1‑148 (MQ=255)
aCGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTAtt > 2:3066067/1‑148 (MQ=255)
ttttAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGaaa < 1:3007334/148‑1 (MQ=255)
aCGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAatttatt < 2:2318700/148‑1 (MQ=255)
aCGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAatttatt > 1:320334/1‑148 (MQ=255)
aCGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAatttatt < 1:1394935/148‑1 (MQ=255)
cGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAatttattt > 2:787709/1‑148 (MQ=255)
cGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTAtttttt < 1:1685962/148‑1 (MQ=255)
gTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTAttttttt > 2:675453/1‑148 (MQ=255)
tCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTa > 1:2970864/1‑148 (MQ=255)
cATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTaa < 1:1599481/148‑1 (MQ=255)
cATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTaa > 1:2506023/1‑148 (MQ=255)
tttATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAata < 1:1180824/148‑1 (MQ=255)
tttATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAata > 2:1394049/1‑148 (MQ=255)
ttATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAatat < 2:473916/148‑1 (MQ=255)
tataAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATAtt < 1:113473/148‑1 (MQ=255)
taAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGt < 2:2848316/148‑1 (MQ=255)
taAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGt < 1:1278491/148‑1 (MQ=255)
aTGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAGGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATCTTGTCgg > 2:1905119/1‑148 (MQ=255)
tGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGa < 2:3399039/148‑1 (MQ=255)
aCATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAAt < 1:788315/148‑1 (MQ=255)
aCATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAAAAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAAt < 2:2062182/148‑1 (MQ=255)
aCTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATAATATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATTTGATATAAGGTGAATTACTGGTCTTTGAAATTTATTTTGTTAATATTGTCGGACTTTAt > 2:1733758/1‑148 (MQ=255)
aCTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTAt < 2:439768/148‑1 (MQ=255)
cTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATc > 2:1023068/1‑148 (MQ=255)
tttAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGAtt > 2:1444130/1‑148 (MQ=255)
ttAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTa > 1:90996/1‑148 (MQ=255)
tAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTaa > 1:3050080/1‑148 (MQ=255)
aaaaTAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGGTGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAAc < 2:275596/148‑1 (MQ=255)
aaaaTAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAAc < 2:1270123/148‑1 (MQ=255)
aaaaTAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAAc < 1:2148308/148‑1 (MQ=255)
aaTAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTa > 1:495020/1‑148 (MQ=255)
aaTAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTa > 2:2532500/1‑148 (MQ=255)
aaTAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTa > 1:3027704/1‑148 (MQ=255)
aTAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATCATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCTGAATTTATCTGATTAACTAc > 2:2605048/1‑148 (MQ=255)
aGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCg < 1:136078/148‑1 (MQ=255)
aGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCg < 1:549322/148‑1 (MQ=255)
aGAATGGAGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCg < 1:1912507/148‑1 (MQ=255)
aaTGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCggg > 1:950564/1‑148 (MQ=255)
tGGTGATTAAAAACAATGCCGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCTATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCGGGcc < 2:2165612/148‑1 (MQ=255)
gATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCGGGCCGTAg > 1:3376067/1‑148 (MQ=255)
ttAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCGGGCCGTAGAc > 2:1278435/1‑148 (MQ=255)
aaaCAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCGGGCCGTAGACCCgg > 2:1913711/1‑148 (MQ=255)
aaCAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGANTTACTGGGATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCGGGCCGTAGACCCGGc > 1:1785544/1‑148 (MQ=255)
aCAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCGGGCCGTAGACCCGGCa > 2:1067654/1‑148 (MQ=255)
cAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCGGGCCGTAGACCCGGCAg > 1:3324292/1‑148 (MQ=255)
aTGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCGGGCCGTAGACCCGGCAGtt > 2:357576/1‑148 (MQ=255)
aTGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCGGGCCGTAGACCCGGCAGtt < 1:759624/148‑1 (MQ=255)
aTGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCGGGCCGTAGACCCGGCAGtt > 1:3376650/1‑148 (MQ=255)
tGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCGGGCCGTAGACCCGGCAGTTa > 1:149068/1‑148 (MQ=255)
|
GTTACAACCACCGCAACTATTTTTAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCGGGCCGTAGACCCGGCAGTTAT > CP009273/1540254‑1540543
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CCAGTTACAACCACCGCAACTATTTTTAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCGGGCCGTAGACCCGGCAGTTATT > CP009273/1540251‑1540544
|
CCAGTTACAACCACCGCAACTATTTTTAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGA > SRR19973065.649912/1‑150 (MQ=60)
CAGTTACAACCACCGCAACTATTTTTAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAA > SRR19973065.1063438/1‑150 (MQ=60)
AGTTACAACCACCGCAACTATTTTTAATTTCATTTAACATTATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAA < SRR19973065.1435673/150‑1 (MQ=60)
AGTTACAACCACCGCAACTATTTTTAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAA < SRR19973065.1834694/150‑1 (MQ=60)
TTACAACCACCGCAACTATTTTTAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAAT < SRR19973065.3152966/150‑1 (MQ=60)
TACAACCACCGCAACTATTTTTAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATA > SRR19973065.1028445/1‑150 (MQ=60)
TACAACCACCGCAACTATTTTTAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATA > SRR19973065.2641049/1‑150 (MQ=60)
AACCACCGCAACTATTTTTAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGAT > SRR19973065.2333232/1‑150 (MQ=60)
AACCACCGCAACTATTTTTAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGAT > SRR19973065.2333215/1‑150 (MQ=60)
AACCACCGCAACTATTTTTAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGAT < SRR19973065.1893403/150‑1 (MQ=60)
AACCACCGCAACTATTTTTAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGAT < SRR19973065.1893340/150‑1 (MQ=60)
CACCGCAACTATTTTTAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAA > SRR19973065.767185/1‑150 (MQ=60)
CACCGCAACTATTTTTAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAA > SRR19973065.1732581/1‑150 (MQ=60)
CCGCAACTATTTTTAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAAT < SRR19973065.2636911/150‑1 (MQ=60)
CCGCAACTATTTTTAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAAT < SRR19973065.2883996/150‑1 (MQ=60)
ACTATTTTTAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATAT < SRR19973065.630297/150‑1 (MQ=60)
CTATTTTTAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATT < SRR19973065.752529/150‑1 (MQ=60)
CTATTTTTAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATT < SRR19973065.541239/150‑1 (MQ=60)
ATTTTTAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTAT > SRR19973065.3090503/1‑150 (MQ=60)
TTTTTAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCTTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATT < SRR19973065.2148798/150‑1 (MQ=60)
TTTTTAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATT < SRR19973065.3016938/150‑1 (MQ=60)
TTTTTAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATT < SRR19973065.3285620/150‑1 (MQ=60)
TTTTTAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATT < SRR19973065.79418/150‑1 (MQ=60)
TTTAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTA < SRR19973065.2426661/150‑1 (MQ=60)
ATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGA > SRR19973065.1107282/1‑150 (MQ=60)
TCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATAT < SRR19973065.434401/150‑1 (MQ=60)
CATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATG > SRR19973065.2315198/1‑150 (MQ=60)
CATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATG > SRR19973065.3479177/1‑150 (MQ=60)
ATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATATATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGT > SRR19973065.277443/1‑150 (MQ=60)
TAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGAT < SRR19973065.3471130/150‑1 (MQ=60)
ACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCG < SRR19973065.645994/150‑1 (MQ=60)
ACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCG < SRR19973065.2419931/150‑1 (MQ=60)
ACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCG < SRR19973065.341325/150‑1 (MQ=60)
CAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGA < SRR19973065.712726/150‑1 (MQ=60)
GAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAAAGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATATATGAAATAATATTATTTATAGATATGTGATCGAAG > SRR19973065.617059/1‑150 (MQ=60)
AATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGT < SRR19973065.2048288/150‑1 (MQ=60)
AATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGT < SRR19973065.861420/150‑1 (MQ=60)
AATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGT < SRR19973065.861267/150‑1 (MQ=60)
ATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTC < SRR19973065.3511148/150‑1 (MQ=60)
CTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAA > SRR19973065.1561882/1‑150 (MQ=60)
CTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAA > SRR19973065.567466/1‑150 (MQ=60)
TTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAA > SRR19973065.1277195/1‑150 (MQ=60)
TTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAA > SRR19973065.2247431/1‑150 (MQ=60)
TTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGAT < SRR19973065.30427/150‑1 (MQ=60)
TATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATA > SRR19973065.3153567/1‑150 (MQ=60)
CGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAA > SRR19973065.3500969/1‑150 (MQ=60)
GTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAG < SRR19973065.2566161/150‑1 (MQ=60)
GTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAG < SRR19973065.3179236/150‑1 (MQ=60)
TTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGG > SRR19973065.3263248/1‑150 (MQ=60)
TTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGG > SRR19973065.3263242/1‑150 (MQ=60)
AAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTG > SRR19973065.1160942/1‑150 (MQ=60)
ACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAA > SRR19973065.2170885/1‑150 (MQ=60)
CGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAAT > SRR19973065.435093/1‑150 (MQ=60)
CGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAAT > SRR19973065.433680/1‑150 (MQ=60)
CGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAAT < SRR19973065.2520379/150‑1 (MQ=60)
CGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAAT < SRR19973065.1349396/150‑1 (MQ=60)
CGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAAT > SRR19973065.437410/1‑150 (MQ=60)
GTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATT < SRR19973065.1234133/150‑1 (MQ=60)
ATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTAC > SRR19973065.2826482/1‑150 (MQ=60)
TTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACT < SRR19973065.681260/150‑1 (MQ=60)
TTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACT < SRR19973065.683182/150‑1 (MQ=60)
TTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTG < SRR19973065.3429029/150‑1 (MQ=60)
CTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTA > SRR19973065.2257899/1‑150 (MQ=60)
CTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTA > SRR19973065.3131888/1‑150 (MQ=60)
AACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATagatcggaagagcacacgtctgaactccagtcactgatgccaga > SRR19973065.1903558/1‑106 (MQ=60)
ACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTG < SRR19973065.3328753/150‑1 (MQ=60)
TTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATT < SRR19973065.3025754/150‑1 (MQ=60)
TTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATT < SRR19973065.1175116/150‑1 (MQ=60)
TTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATT < SRR19973065.1706471/150‑1 (MQ=60)
AAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATT > SRR19973065.322542/1‑150 (MQ=60)
ACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTT < SRR19973065.1404092/150‑1 (MQ=60)
CGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTT < SRR19973065.1056132/150‑1 (MQ=60)
CGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTT < SRR19973065.1755236/150‑1 (MQ=60)
CGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATCTGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTA > SRR19973065.1229921/1‑150 (MQ=60)
CGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTA < SRR19973065.1697229/150‑1 (MQ=60)
CGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTA > SRR19973065.2989032/1‑150 (MQ=60)
CGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTA < SRR19973065.3444691/150‑1 (MQ=60)
GTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAA > SRR19973065.2521772/1‑150 (MQ=60)
GTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGAAAAAAAACAATGATGAAAATAGATGAAATAATATAATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGAGAATTACTGGTATTTGAAATATATTTTATTAA > SRR19973065.2521384/1‑150 (MQ=60)
CATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATA < SRR19973065.1610167/150‑1 (MQ=60)
CATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATA < SRR19973065.1608979/150‑1 (MQ=60)
ATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATAT < SRR19973065.3395531/150‑1 (MQ=60)
TTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATT < SRR19973065.1188308/150‑1 (MQ=60)
TTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATT < SRR19973065.3212490/150‑1 (MQ=60)
TATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGT < SRR19973065.114481/150‑1 (MQ=60)
ATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTC > SRR19973065.1228634/1‑150 (MQ=60)
TAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCG < SRR19973065.1286932/150‑1 (MQ=60)
AAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGG < SRR19973065.2245041/150‑1 (MQ=60)
TGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAAT < SRR19973065.1457930/150‑1 (MQ=60)
ACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTT < SRR19973065.793541/150‑1 (MQ=60)
ACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTT < SRR19973065.792932/150‑1 (MQ=60)
TACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATC < SRR19973065.3227831/150‑1 (MQ=60)
ACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCT < SRR19973065.2079371/150‑1 (MQ=60)
TTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTA > SRR19973065.92019/1‑150 (MQ=60)
TTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTA > SRR19973065.91859/1‑150 (MQ=60)
TTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAA > SRR19973065.3068735/1‑150 (MQ=60)
TAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACT < SRR19973065.1990540/150‑1 (MQ=60)
AAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTA > SRR19973065.498347/1‑150 (MQ=60)
AAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTA > SRR19973065.744670/1‑150 (MQ=60)
AAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTA < SRR19973065.2160733/150‑1 (MQ=60)
AAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTA < SRR19973065.2162122/150‑1 (MQ=60)
AAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTA > SRR19973065.3046174/1‑150 (MQ=60)
AAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTA > SRR19973065.3046257/1‑150 (MQ=60)
AGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCGGG < SRR19973065.137246/150‑1 (MQ=60)
AGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCGGG < SRR19973065.137243/150‑1 (MQ=60)
AGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCGGG < SRR19973065.552857/150‑1 (MQ=60)
AGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCGGG > SRR19973065.1150927/1‑150 (MQ=60)
AGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCGGG > SRR19973065.956278/1‑150 (MQ=60)
AGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCGGG > SRR19973065.956843/1‑150 (MQ=60)
AGAATGGAGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCGGG < SRR19973065.1925065/150‑1 (MQ=60)
AATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCGGGCC > SRR19973065.489562/1‑150 (MQ=60)
GGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCGGGCCGTA < SRR19973065.3386241/150‑1 (MQ=60)
GTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCGGGCCGTAG > SRR19973065.3396711/1‑150 (MQ=60)
GTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCGGGCCGTAG > SRR19973065.3396759/1‑150 (MQ=60)
GATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCGGGCCGTAGAC > SRR19973065.1680195/1‑150 (MQ=60)
TTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCGGGCCGTAGACCC < SRR19973065.2548394/150‑1 (MQ=60)
AAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGANTTACTGGGATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCGGGCCGTAGACCCGGC > SRR19973065.1797230/1‑150 (MQ=60)
AAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGANTTACTGGGATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCGGGCCGTAGACCCGGC > SRR19973065.1797335/1‑150 (MQ=60)
AACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCGGGCCGTAGACCCGGCAG > SRR19973065.3344578/1‑150 (MQ=60)
CAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCGGGCCGTAGACCCGGCAGTT > SRR19973065.3049079/1‑150 (MQ=60)
CAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCGGGCCGTAGACCCGGCAGTT > SRR19973065.3397297/1‑150 (MQ=60)
AATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCGGGCCGTAGACCCGGCAGTTA > SRR19973065.150325/1‑150 (MQ=60)
AATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAAATTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCGGGCCGTAGACCCGGCAGTTA > SRR19973065.88173/1‑150 (MQ=60)
ATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCGGGCCGTAGACCCGGCAGTTAT < SRR19973065.764686/150‑1 (MQ=60)
ATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCGGGCCGTAGACCCGGCAGTTAT < SRR19973065.764628/150‑1 (MQ=60)
ATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCGGGCCGTAGACCCGGCAGTTAT < SRR19973065.764556/150‑1 (MQ=60)
TGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCGGGCCGTAGACCCGGCAGTTATT > SRR19973065.2393702/1‑150 (MQ=60)
TGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACAGGGCCGTAGACCCGGCAGTTATT > SRR19973065.2393680/1‑150 (MQ=60)
|
CCAGTTACAACCACCGCAACTATTTTTAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCGGGCCGTAGACCCGGCAGTTATT > CP009273/1540251‑1540544
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |