Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A11 F109 I1 R1
|
12 |
118.2 |
2503160 |
89.1% |
2230315 |
260.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,685,527 |
A→G |
G354G (GGT→GGC) |
fumC ← |
fumarate hydratase (fumarase C),aerobic Class II |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,685,527 | 0 | A | G | 98.1%
| 357.3
/ ‑4.7
| 106 | G354G (GGT→GGC) | fumC | fumarate hydratase (fumarase C),aerobic Class II |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/1); new base G (55/47); total (58/48) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 106 total aligned reads displayed.
GATACCCCAGCGCAAGGGCCGCAGCTTTTAAGGTCAGCCCTTCTTTATGCGCTTTTTTGGCGATCTCGGCGGCTTTGTCATAACCAATGTGGGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTACCGGAAGCGC‑CCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCATTTTCCGGGATTGAGATTTCACCAATTCCGCAGCGCGGGCCAGAGGCCAGCCAGCGGACATCATTGGCGATTTTCATCAGTGACGCAGCCAACCCTTTCAACGCGCCGTGCGCCTGAACCAGGGCATCACAGGTCGCCAGCGCTT > NC_000913/1685256‑1685792
|
gATACCCCAGCTCAAGGGCCGCAGCTTTTAAGGTCAGCCCGTCTTTATGCTCTTTTTTGGCGATCTCGGCGGCTTTGTCATAACCACTGTGGGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGGTTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCgg < 2:258582/276‑1 (MQ=255)
atgccccAGCGCAAGGGTCGCAGCTTTTAATGTCACCCCTTCTTTATGCGCGTTTTTGGCGATCTCGGCGTCGTTGTCATAACCAATGTGGTTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGTTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGa < 4:471214/273‑1 (MQ=255)
agtcccatgcgcAAGGTCCGCATCTTGTAAGTTCATCCCTTCTTTATGCGCTTGTTTGGCGCTGTCGACGGCATTGTCATAACCAAGTTGGGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATGCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCAGCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCgg < 4:445145/267‑1 (MQ=255)
ctccAGCACAAGTGCCGCAGCTTGTAAGGTCATCCCTTCTTTATGCGCTTTTTTGGCGATCTCGTCGGCTTTGTCATAACCAATGGGGGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAgc < 2:463477/274‑1 (MQ=255)
cccgaccgcACGGGCCGCAGCTTTTAAGGTCAGCCCTTCTTTATGCGCTTTTTTGGCGATCTCGGCGGCTTTGTCATAACCTATGTGGGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAgc < 2:566090/270‑1 (MQ=255)
aGCGCAAGGGCCGCAGCTTTTAAGGTCAGCCCTTCTTTATGCGCTTTTTTGGCGATCTCGGCGGCTTTGTCATAACCAATGTGGGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGc‑c < 1:21764/275‑1 (MQ=255)
gcgcAAGGGCCGCAGCTTTTAAGGTCAGCCCTTCTTTATGCGCTTTTTTGGCGATCTCGGCGGCTTTGTCATAACCAATGTGGGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGc‑cc > 2:182807/1‑275 (MQ=255)
cgcAAGGGCCGCAGCTTTTAAGGTCAGCCCTTCTTTATGCGCTTTTTTGGCGATCTCGGCGGCTTTGGCATAACCAATGTGGGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAACACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATGGCAGGAAATTGTGGATCACAATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAgagacc > 3:211845/1‑269 (MQ=255)
gcAAGGGCCGCAGCTTTTAAGGTCAGCCCTTCTTTATGCGCTTTTTTGGCGATCTCGGCGGCTTTGTCATAACCAATGTGGGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCACGCGCCCCCATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGc‑cccc > 2:356510/1‑275 (MQ=255)
gggCCGCAGCTTTTAAGGTCAGCCCTTCTTTATGCGCTTTTTTGGCGATCTCGGCGGCTTTGTCATAACCAATGTGGGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGTGCTTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACTCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGTCAGCAAGCGCACCGATTGCAGACAATGGTGGATCACCATTGGTCGGCAGACGTTCAGTTACAAGTTGCCGGATGCTC‑CCCCCATg > 3:217197/1‑275 (MQ=255)
gggCCGCAGCTTTTAAGGTCAGCCCTTCTTTATGCGCTTTTTTGGCGATCTCGGCGGCTTTGTCATAACCAATGTGGGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGGTCAATACCCACTGCGAAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCAATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGAGTGTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGC‑CCGCCa > 3:382437/1‑273 (MQ=255)
cAGCCCTTCTTTATGCGCTTTTTTGGCGATCTCGGCGGCTTTGTCATAACCAATGTGGGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCCGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTTCCGGCAGCCC‑CCCCCCTGTTTACCGCTCCGTCGTTcc > 2:270398/1‑275 (MQ=255)
cAGCCCTTCTTTATGCGCTTTTTTGGCGATCTCGGCGGCTTTGTCATAACCAATGTGGGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGC‑CCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTc > 3:384984/1‑274 (MQ=255)
cccTTCTTTATTCGCTTTTTTGGCGATCTCGGCGGCTTTGTCATAACCAATGTGTGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGC‑CCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCAt < 2:558800/276‑1 (MQ=255)
cttTATGCTCTTTTTTGGCGATCTCGGCGGCTTTGTCAGAACCAATGTGGGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCTAGTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGC‑CCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCt < 2:566626/276‑1 (MQ=255)
tGCGCTTTTTTGGCGATCTCGGCGGCTTTGTCATAACCAATGTGGGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGC‑CCCCCATGGTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGAcag > 2:564847/1‑276 (MQ=255)
gcTTTTTTGGCGATCTCGGCTGCGTTGTCATATCCAATGTGGGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCATCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGCTTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGC‑CCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGAcagca < 1:203002/275‑1 (MQ=255)
cTTTTTTGGCGATCTCGGCGGCTTTGTCATAACCAATGTGGGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAACGTTGCCGGACGTCC‑CCCCCATGTTTATCGCCTCGTCCGTGCCCATCACCTgtctctt > 4:113331/1‑268 (MQ=255)
cTTTTTTGGCGATCTCGGCGGCTTTGTCATAACCAATGTGGGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGC‑CCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGAcagca < 3:44894/274‑1 (MQ=255)
ttttttGGCGATCTCGGCGGCTTTGTCATAACCAATGTGGGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGC‑CCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCa > 2:166561/1‑263 (MQ=255)
ttttttGGCGATCTCGGCGGCTTTGTCATAACCAATGTGGGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGAACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGGTGCCGGACGCCC‑CCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGAcagccta > 4:550490/1‑272 (MQ=255)
tttGTCGATCTCGGCGGCTTTGTCATAACCAATGTGGGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGC‑CCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCt < 4:166561/263‑1 (MQ=255)
cgactctgtcggaTTTTTAATAACCAATGGTGGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCAGCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGC‑CCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTa < 4:182807/267‑1 (MQ=255)
cGATCTCTGCGACTTTATCATAACCAATGTGGGTGTTAATCGCAGTCACCAGCATCAGCTATTCATTGAGTAATTGATTGATGCGCTCACGATTCAGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAACACTTTCCATTCCATCTGCCAGCAAACGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGC‑CCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACGGCAGAGCATGGTTa < 2:146524/276‑1 (MQ=255)
gatagcggcggCTTTGTCATAACCAGAGTGGGTGTTAAGCGCGTTCACCAGCATCCGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCACTCACGATTCAGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGGAATTGTGGATCGCCATTGGACAGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGC‑CCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTa < 3:633941/270‑1 (MQ=255)
gATCTCGGCGGCTTTGTCATAACCAATGTGGGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTATTTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCTCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGC‑CCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTa < 1:511112/275‑1 (MQ=255)
ctcGGCGGCTTTGTCATAACCAATGTGGGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCAACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGC‑CCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTg > 1:434317/1‑255 (MQ=255)
cggcggCTTTGTCATAACCAATGTGGGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGC‑CCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGcc < 3:148026/275‑1 (MQ=255)
cagcggcgTTGTCATAACCAATGTGGGGTTTAAGCGCAGTCACCGGCATCAGCGATTCATTAGGTAAGTGATTGATTCGCTAACGATGCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGAACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGC‑CCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGcc < 3:281144/273‑1 (MQ=255)
gcggcTTTGTCATAACCAATGTGGGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCAACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGC‑CCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGAcag < 3:434317/255‑1 (MQ=255)
ggcTTTGTCATAACCAATGTGGGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGC‑CCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTcaca < 2:336518/276‑1 (MQ=255)
ggcTTTGTCATAACCAATGTGGGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGC‑CCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTcac < 1:257053/275‑1 (MQ=255)
tcTTTGTCATAAACAATGTGGGTGTTAAGCGCAATCACCAGCATCAGAGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGC‑CCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTcaca < 1:190519/274‑1 (MQ=255)
ggtttGTCATAACCAATGTGGGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCAGTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTACCGGAAGCGC‑CCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTcaca < 3:254651/273‑1 (MQ=255)
gcTGTGTCATAACCAAAGTTGGTCTTAAGCGCAGTCCCCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTTACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAGCTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGC‑CCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTcaca < 1:231793/275‑1 (MQ=255)
aCCAATGTGGGTGTTAAGCGCAGTCTCCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGCACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTGGCCGGAAGCGC‑CCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGt > 4:207761/1‑275 (MQ=255)
tgtgGGTTTTAAGCGGAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTTAGTAATTGATTGATTCGTTCACGATTCGGTTCCATACCCACTGCGCAGGGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGTAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGC‑CCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCAc < 1:231692/274‑1 (MQ=255)
tgtgGGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATATCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCACGCGAACCGATTGCAGGAAATTGTCGATCACCATTTGACGGAAGACGTTTAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGC‑CCCCCATGTTGATCGCCACGCCGTTCCCAATCCCCCGACAGCAACGCATGTTTAATGCCTCACACCGTTATCGGTTCCCt > 3:457968/1‑275 (MQ=255)
tgtgGGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGCTTGCAGGAAATCTTGGATCAACATTGGACGTAAGACGTCCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCTC‑CCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCACAGCATGGTTAATGACTCACGCTGTGTTGCGTTCAttt > 2:487932/1‑276 (MQ=255)
tgtgGGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGC‑CCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTTCTGGGTTCACt > 1:160038/1‑275 (MQ=255)
gtgtTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGC‑CCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCAGCACCTGACAGCAGAGCCTGGTTACTGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTc > 1:281616/1‑273 (MQ=255)
ttcaGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTATAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGC‑CCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCgg < 1:433052/272‑1 (MQ=255)
ttAAGCCCAATCACCAGCATAAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTATTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGC‑CCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCgg < 3:368251/275‑1 (MQ=255)
gtgcAGTCACCAGCCTCAGCGATTCATTGAGTAATTCATTGATTCGCTCCCGATTCGTTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTTTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGAACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGC‑CCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGa < 4:564847/274‑1 (MQ=255)
cAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTACCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGC‑CCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCt < 1:217197/275‑1 (MQ=255)
tCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCCCCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGC‑CCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGCTTAACGCCTCACACTGTGTTGGTTTCACTTACCCCGGCATGATTGATCTGCCCGGCTCCTTTTc > 2:369325/1‑275 (MQ=255)
aTTGAGTAATTTATTGATTCGCTCACGATTCGGGTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTGCCCTGCCATCTGCCAGCAAGCGGACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGC‑CCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCATTTTCCg < 1:548103/275‑1 (MQ=255)
gattgattCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTTAAAGTTTCCGGAAGCGC‑CCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACATGACAGCAGACCATGGTTAATGCCCCACACTGTGTTGGGGTCACTTTCCCCGGGCTCTTTGCGATGCCCGTGTCCTTTTCCGGGttttgagtt > 3:404590/1‑269 (MQ=255)
attgattCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGC‑CCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTTGGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGGTTGAGCTTCCCGGCCTTTGTTCCGGGATTGTGAttt > 4:304527/1‑275 (MQ=255)
attgattCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGC‑CCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCgg > 3:134465/1‑252 (MQ=255)
tgattCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGC‑CCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCGCATTTTCCGGGATTGAGATTTc > 1:97357/1‑274 (MQ=255)
tgattCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTAGCCGGAAGCGC‑CCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTACTGCCTCACACTGCGGTTGGTTCACTTTCCCCGGCAGTATTGACCTTCCCGGCCACTTTTCCGGGttttgcattttc > 4:262110/1‑266 (MQ=255)
attCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGC‑CCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCa < 1:134465/252‑1 (MQ=255)
gcacaATTCGTGTCAATACCCTCTGCGGAGTGGGTGTTAAAACGTGCCAAGCCATCTGCCAGCAAGGGAACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGC‑CCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTACCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCATTTTCCGGGATTGAGATTTCACCAAGTCCg < 4:369325/275‑1 (MQ=255)
aTTCGGTTCAATACCCACTGTGCATTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGC‑CCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCATTTTCCGTGATTGAGATTTCACCAATTCCGCAgcg < 2:261385/276‑1 (MQ=255)
tACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGC‑CCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCCCATTTTCCGGGATTGGGATTTCACCAATTCCGCACGGCGGGcccagg > 1:523498/1‑271 (MQ=255)
tACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGC‑CCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACCGTGTTTGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCCCATTTTTCGGGATTGCGTTTTCACCAATTCCGCAGCCTGGGCCaagg > 3:531648/1‑272 (MQ=255)
aCTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGC‑CCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCATTTTCCGGGTTTGAGATTTCACCAATTCCGCCGCGCGGGCCAGAGgccagc > 2:552493/1‑276 (MQ=255)
aCTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGC‑CCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGATGCCCGGCTCATTTTCCGGGATTGAGATTTCACCAATTCCGCAGCGCGggccagcggccagc > 2:249870/1‑276 (MQ=255)
tGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGC‑CCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCATTTTCCGGGATTGAGATTTCACCAATTCCGCAGCGCGGGCCAGAGgccagcc > 1:43167/1‑275 (MQ=255)
tGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGC‑CCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCACCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCATTTTCCGGGATTGAGATTTCAACAATTCCGCAGCGCGGGCCAGAGgcccgcc > 1:108843/1‑275 (MQ=255)
gcgcAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGC‑CCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCATTTTCCGGGATTGAGATTTCACCAATTTCGCAGCGCGGGCCAGAGgccagcc > 1:112842/1‑274 (MQ=255)
gcgcAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGC‑CCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCATTTTCCGGGATTGAGATTTCACCAATTCCGCAGCGCGGGCCAGAGgccagcca > 1:169946/1‑275 (MQ=255)
gtgtTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTAAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGC‑CCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGATAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCACTTTCCGGCATTGAGAGTTCACCAATTCCGAAGCCGTGGCCAGAGGCACGCCAGCggc > 1:155728/1‑274 (MQ=255)
tttgttAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGC‑CCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCATTTTCCGGGATTGAGATTTCACCAATTCCGCAGCGCGGGCCAGCGGCCAGCCAGCGGAca > 1:212426/1‑274 (MQ=255)
aaCTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGC‑CCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCATTTTCCGGGATTGCGATTTCACCAATTCCGCCGCGCGGGCCAGAGGCCAGCCAGCGTACCTCATTGGCg > 2:381019/1‑275 (MQ=255)
aaCTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGC‑CCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCATTTTCCGGGATTGAGCTTTCCCCAATTCCGCAGCGCGGGCCAGAGGCCAGCCACGGGGCCTCATTGGCg > 4:27878/1‑275 (MQ=255)
aaCTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGC‑CCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCATTTTCCGGGATTGAGATTTCACCAATTCCGCAGCGCGGGCCAGAGGCCATCCAGCGGACATCATTGGc > 1:73953/1‑274 (MQ=255)
aaCTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGC‑CCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCATTTTCCGGGATTGAGATTTCACCAATTCCGCAGCGCGGGCAAGAGGCCACCCAGCGGACATCATTGGCg > 2:225716/1‑275 (MQ=255)
aaCTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGC‑CCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCATTTTCCGGGATTGAGATTTCACCAATTCCGAAGCGCGGGCCAGAGGCCAGCCAGCGGACATCATTGGCg > 1:483583/1‑275 (MQ=255)
tCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGC‑CCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCATTTTCCGGGATTGAGATTTCACCAATTCCGCAGCGCGGGCCAGAGGCCAGCCAGCGGACATCATTGGCGAt < 1:384984/272‑1 (MQ=255)
gCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCG‑‑CCCCCATGATGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTTATTTTCTGGGATTGAGATTTCACCAATTCCGCACCGCGGGCCAGAGGCCACCCAGTGGATACTATTGTCGATCTTCATCAg > 2:353519/1‑275 (MQ=255)
aTCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGC‑CCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCATTTTCCGGGATTGAGATTTCACCAATTCCGCAGCGCGGGCAAGAGGCCAGCCAGCGGACATCCTTGGCGATTTTCATCAGTGa > 2:565112/1‑276 (MQ=255)
aTCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGACGTAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGCAAGCGC‑CCCCCAGGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTTACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCATTTTCCGGGATTGAGATTTCACCAATTCCGCAGCGCGGGCCAGAGGCCAGCCAGCGGACATCATTGGCGATTTTCATCAGTGa < 2:454539/276‑1 (MQ=255)
tCTTCCAGCAAGCGAACCGATTGCAGGACAGTGTGGATCACCATTGGCCGGACGACGTTCAGTGCAAAGTTGCCGGAAGCGC‑CCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTACCCCATACCCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACTCTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCTGCATGATTGAGCTGCCCGGCTAATTGTCCGGGATTGAGATTTCACCAATTCCGCAGCGCGGGCCAGAGGCCAGCCAGCGGACATCATTGGCGATTTTCATCAGTGa < 3:108843/275‑1 (MQ=255)
cTGCCAGCCAGCGAACCGATTACAGGAAATTGTGGCTCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGC‑CCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCATTTTCCGGGATTGAGATTTCACCAATTCCGCAGCGCGGGCCAGAGGCCAGCCAGCGGACATCATTGGCGATTTTCATCAGTGAc < 1:211845/275‑1 (MQ=255)
cTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGC‑CCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCATTTTCCGGGATTGAGATTTCACCAATTCCGCAGCGCGGGCCAGAGGCCAGCCAGCGGACATCATTGGCGATTTTCATCAGTGa > 1:20525/1‑274 (MQ=255)
cAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGC‑CCCCCATGTTGATCGCCACTTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCCCACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCCTCTTCCGGGGTTGAGATTTCCCCAATTCCGACGCGCCGGCCACAGGCCAGCCGGCGTACGTCAGTCGCAATTTTAATCAGTCACGCAGCCa > 4:390626/1‑275 (MQ=255)
aaGCGCACCTATTTCAGGCAATTGTGGATCCCCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGC‑CCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCATTTTCCGGGATTGAGATTTCACCAATTCCGCAGCGCGGGCCAGAGGCCAGCCAGCGGACATCATTGGCGATTTTCATCAGTGACGCAGCCAAc < 2:569570/276‑1 (MQ=255)
cACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGC‑CCCCCAAGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACATGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCTGCATGATTGAGCTGCCCGGCCCATTTTCCGGGATTCGTATTTCTCCAATTCTGCAGCGCGGGCCAGAGGCCAGCACGCGGACATCATTGGCGTATTTCATCATCTACTCAGGCAAcccct > 3:70667/1‑273 (MQ=255)
gCAGGAAATTGTTGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCACTTCAAAGTTGCCGGAAGCGC‑CCCCCATGTTGATCTCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCATTTTCCGGGATTGAGATTTCACCAATTCCGCAGCGCGGGCCAGAGGCCAGCCAGCGGACATCATTGGCGATTTTCATCAGTGACGCAGCCAACCCTTTCAAcg < 2:192216/273‑1 (MQ=255)
gaaagtgatgATCACCATGGGACGGAAGACCGTCAGTTCAAAGCTGCCGTAAACGC‑CCCCCAGGGTGATCGCCACGTCGTCCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTGAATGCCTCACACTGTGTTGGTTGCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCATTTTCCGGGATTGAGATTTCACCAATTCCGCAGCGCGGGCCAGAGGCCAGCCAGCGGACATCATTGGCGATTTTCATCAGTGACGCAGCCAACCCTTTCAACGCGCCGt < 4:142848/266‑1 (MQ=255)
aaaTTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTACGTTCAAAGTGGCCGGAAGCGC‑CCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCATTTTCCGGGATTGAGATTTCACCAATTCCGCAGCGCGGGCCAGAGGCCAGCCAGCGGACATCATTGGCGATTTTCATCAGTGACGCAGCCAACCCTTTCAACGCGCCGt < 3:281616/274‑1 (MQ=255)
tgtgGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGC‑CCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGCGCTGCCCGGCTCATTTTCCGGGATTGAGATTTCACCAATTTCGCAGCGCGTGCCAGAGGCCAGCCAGCGGACATCATTGGCGATTTTAATCAGTGACGCAGCCAAACCTTTCAACCCACCGGGCGcc > 3:140766/1‑275 (MQ=255)
tgtgGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGC‑CCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCATTTTCCGGGATTGAGATTTCACCAATTCCGCAGCGCGGGCCAGAGGCCAGCCAGCGGACATCCTTGGCGATTTTACACATTGACGCAGCCACCCCTTTACACGCCCCGtcccc > 3:603176/1‑270 (MQ=255)
tgGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGC‑CCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCATTTTCCGGGATTGAGATTTCACCAATTCCGCAGCGCGGGCCAGAGGCCAGCCAGCGGACATCATTGGCGATTTTCATCAGTGACGCAGCCAACCCTTCCCACGCGCCGGTCGCCtt > 3:430348/1‑274 (MQ=255)
cACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGC‑CCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCATTTTCCGGGATTGAGATTTCACCAATTCCGCAGCGCGGGCCAGAGGCCAGCCAGCGGACATCATTGGCGATTTTCATCAGTGACGCAGCCAACCCTTTCAACGCGCCGTGCGCCTGAAcccg > 2:84571/1‑274 (MQ=255)
ccttGGACGGAAGCCGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGC‑CCCCCAGTTTCACCGCCACGTCGTTCCCCAGCACCTGACGGCATAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGTGTTCACTTTCCCCTGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCATTTTCCGGGATTGAGATTTCACCAATTCCGCAGCGCGGGCCAGAGGCCAGCCAGCGGACATCATTGGCGATTTTCATCAGTGACGCAGCCAACCCTTTCAACGCGCCGTGCGCCTGAACCAg < 1:404590/271‑1 (MQ=255)
cATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGC‑CCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATNGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGACCGGCTCATTTTCCGGGATTGAGATTTCACCAATTCCGCAGCGCGGGCCCGAGGCCAACCAGCGGGCATCATTGGCGATTTTCATCAGTTACGCAACCAACCCTTTCAACCCCCCTTgccaccgaccccggc > 4:315586/1‑262 (MQ=255)
ttGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGCAGCGC‑CCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCATTTTCCGGGATTGAGATTTCACCAATTCCGCAGCGCGGGCCAGAGGCCAGCCAGCGGACATCATTGGCGATTTTCATCAGTGACGCAGCCAACCCTTTCAACGCGCCGTGCGCCTGAACCAGGGCAt < 2:304527/276‑1 (MQ=255)
ttGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGC‑CCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCATTTTCCGGGATTGAGATTTCACCAATTCCGCAGCGCGGGCCAGAGGCAAGCTAGCGGACACCATTGGCGATTTTCAGCAGTGACGCAGCCAACCCTTTCAACGCCCCTTGCGCTTTAACCAGGGc > 1:481628/1‑274 (MQ=255)
aaGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGC‑CCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCATTTTCCGGGATTGAGATTTCACCAATTCTGCAGCGCGGGCCAGAGGCCAGCCAGCGGACATCATTGGCGATTTTCATCAGTGACGCAGCCAACCCTTTACACGCGCCGTGCGCCTTAAACAGGGCATCCCAggg > 1:608859/1‑274 (MQ=255)
aaGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGC‑CCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCATTTTCCGGGATTGAGATTTCACCAATTCCGCAGCGCGGGCCAGAGGCCAGCCAGCGGACATCATTGGCGATTTTCATCAGTGACGCAGCCAACCCTTTCAACGCGCCGTGCGCCTGAACCAGGGCATCACAGGt > 1:362121/1‑275 (MQ=255)
gACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGC‑CCCCCAt > 2:520622/1‑36 (MQ=255)
gttcagttcaAAGTTGCCGGAAGCGC‑CCCCCATGtt < 4:520622/36‑1 (MQ=255)
gttcaAAGTTGCCGGAAGCGC‑CCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCATTTTCCGGGATTGAGATTTCACCAATTCCGCAGCGCGGGCCCGAGGCCAGCCAGCGGACATCATTGCCGATTTTCATCAGTGACGCAGCCAACCCTTTCAACGCTCCGTGCGTCTGAACCAGGCCCTCCCCGGTTGCCAccgc > 1:327860/1‑274 (MQ=255)
gttcaAAGTTGCCGGAAGCGC‑CCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCATTTTCCGGGATTGAGATTTCACCAATTCCGCAGCGCGGGCCAGAGGCCAGCCAGCGGACATCATTGGCGCTTTTCATCAGTGACGCAGCCAACCCTTTCAACGCTCCGTTCGCCTGAACCAGGGCATCACAGGTCGCCCGCGCt > 2:285981/1‑275 (MQ=255)
gttcaAAGTTGCCGGAAGCGC‑CCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCATTTTCCGGGATTGAGATTTCACCAATTCCGCAGCGCGGGCCAGAGGCCAGCCAGCGGACATCATTGGCGATTTTCATCAGTGACGCAGCCAACCCTTTCAAACCGCCGTGCCCCTGAACCAGGGCATTACAGGTCGCCCGGGCt > 1:558839/1‑275 (MQ=255)
gtcaAGGTTGCCGGAACCGC‑CCCCCATGTTGATCCCCCCGTCGTTCCCCATCACCTGACGGCAGAGAATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCATTTTCCGGGATTGAGATTTCACCAATTCCGCAGCGCGGGCCAGAGGCCAGCCAGCGGACATCATTGGCGATTTTCATCAGTGACGCAGCCAACCCTTTCAACGCGCCGTGCGCCTGAACCAGGGCATCACAGGTCGCCAGCGCtt < 1:470578/274‑1 (MQ=255)
tcaAAGTTGCCGG‑AGCGCGCCCCCATGTTGCACGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGGGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCATTTTCCGGGATTGAGATTTCACCAATTCCGCAGCGCGGGCCAGAGGCCAGCCAGCGGACATCATTGGCGATTTTCATCAGTGACGCAGCCAACCCTTTCAACGCGCCGTGCGCCTGAACCAGGGCATCACAGGTCGCCAGCGCtt < 3:112842/274‑1 (MQ=255)
|
GATACCCCAGCGCAAGGGCCGCAGCTTTTAAGGTCAGCCCTTCTTTATGCGCTTTTTTGGCGATCTCGGCGGCTTTGTCATAACCAATGTGGGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTACCGGAAGCGC‑CCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCATTTTCCGGGATTGAGATTTCACCAATTCCGCAGCGCGGGCCAGAGGCCAGCCAGCGGACATCATTGGCGATTTTCATCAGTGACGCAGCCAACCCTTTCAACGCGCCGTGCGCCTGAACCAGGGCATCACAGGTCGCCAGCGCTT > NC_000913/1685256‑1685792
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
