Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A7 F106 I1 R1
|
11 |
134.4 |
2836798 |
90.9% |
2578649 |
259.7 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,685,527 |
A→G |
G354G (GGT→GGC) |
fumC ← |
fumarate hydratase (fumarase C),aerobic Class II |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,685,527 | 0 | A | G | 98.1%
| 524.9
/ NA
| 159 | G354G (GGT→GGC) | fumC | fumarate hydratase (fumarase C),aerobic Class II |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/1); major base G (74/79); minor base T (2/1); total (78/81) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.13e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 159 total aligned reads displayed.
CCCCAGCGCAAGGGCCGCAGCTTTTAAGGTCAGCCCTTCTTTATGCGCTTTTTTGGCGATCTCGGCGG‑CTTTGTCATAACCAATGTGGGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTACCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCATTTTCCGGGATTGAGATTTCACCAATTCCGCAGCGCGGGCCAGAGGCCAGCCAGCGGACATCATTGGCGATTTTCATCAGTGACGCAGCCAACCCTTTCAACGCGCCGTGCGCCTGAACCAGGGCATCACAGGTCGCCAGCGCTT > NC_000913/1685260‑1685792
|
cccAGCGCAAGGGCCGCAGCTTTTAAGGTCAGCCCTTCTTTATGCGCTTTTTTGGCGATCTCGGCGG‑CTTTGTCATAACCAATGTGGGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAgc > 1:581583/1‑275 (MQ=255)
ccggcgcAAGGGCCGCAGCTTTTAAGGTCACCCCTTCTTTATGCGCTTTTTTGGCGCTCTCCGCGG‑CTTTGTCATAACCAATGTGGGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCATCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAgcgc < 4:238340/273‑1 (MQ=255)
ccAGCGCAAGGGCCGCAGTTTTTAAGGTCAGCCCTTCTGTATGCGCTTTTTTGGCGATCTCGGCGG‑CTTTGTCATAACCAATGTGGGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAgc < 1:331685/274‑1 (MQ=255)
gcAAGGGCCGCAGCTTTTAAGGTCAGCCCTTCTTTATGCGCTTTTTTGGCGATCTCGGCGG‑CTTTGTCATAACCAATGTGGGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGcccc < 1:24227/274‑1 (MQ=255)
cAAGGGCCGCAGCTTTTAAGGTTAGCCCGTCTTTATGCGCTTGTTTGGCGTTCTCGGCGG‑CTTTGTCATAACCAATGTGGGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAACGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCTCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGcccccc < 3:143100/275‑1 (MQ=255)
aaGGGCCGCAGCTTTTAAGGTTAGCCCTTCTTTATGCGCTTTTTTGGCGATCTCGGCGG‑CTTTGTCATAACCAATGTGGGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGAACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCa < 1:571247/275‑1 (MQ=255)
cGCAGCTTTTAAGGTCAGCCCTTCTTTATGCGCTTTTTTGGCGATCTCGGCGG‑CTTTGTCATAACCAATGTGGGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGa < 1:706682/275‑1 (MQ=255)
ttttAAGGTCAGTCCTGCTTTATGCGCTTTTTTGGCGATCTCGGCGG‑CTTTGTCATAACCAATGTGGGTGTTAAGCACAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGcc < 1:153129/274‑1 (MQ=255)
ttAAGGTCAGCCCTTCTTTATGCGCTTTTTTGGCGATCTCGGCGG‑CTTTGTCATAACCAATGTGGGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCGATCTGCCAGCAAGCGCCCTGATTGCAGGAAATTGTGGCTCACCCTTGGCCGGGTGACGTTCAGTTCAAAGTTCTCTGTGGCGTCCCCCATGTTGATGGccca > 1:405791/1‑272 (MQ=255)
aaagTCAGCCCTTCCTTATGCGCTTTTTTGGCGGTCTCGGCGG‑CTTTGTCATAACCAATGTGGGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTC‑GTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAAGTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCAcgtcg < 3:105375/272‑1 (MQ=255)
cAGCCCTTCTTTATGCGCTTTTTTGGCGATCTCGGCGG‑CTTTGTCATAACCAATGTGGGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTc > 1:686165/1‑274 (MQ=255)
agctccTTTTGTATGTGCTTTTTTGGCGATATCGTGGG‑TTTTGTCAAAACCAATTATGGTTGTAAGCGCAGTCACAAGAATCATCGATTCATTGAGTAATTTATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTccc < 4:171042/272‑1 (MQ=255)
aGCCCTTCTTTATGCGCTTTTTTGGCGATCTCGGCGG‑CTTTGTCATAACCAATGTGGGTGTTAAGCGCAGTCCCCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATTCCCTCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGGGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTAAAGGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCCCCACTTCGTTccc > 2:306550/1‑275 (MQ=255)
aGCCCTTCTTTATGCGCTTTTTTGGCGATCTCGGCGG‑CTTTGTCATAACCAATGTGGGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTTATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCCTTGGACGGAACACGTTCAGTTCAAAGTTGCTGTAAGCGCCACCCATGTTAACCTCCCTGTCGTTccc > 1:138047/1‑275 (MQ=255)
ctgcgtgaTGCGCGTTTTTGGCGATCTCGGCGG‑CTTTGTCATAACCAATGTGGGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCGTCAGCTATTCATTGAGTCATTGATTGATTCGCGCACGGTTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGGTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAGATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCAt < 1:67652/267‑1 (MQ=255)
ttattttggcgcTTTTTTGGCGATTTCGGCGG‑CGTTGTCATAACCAAGGTGGGTGTTAAGCCCAGTAACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCa < 3:237206/267‑1 (MQ=255)
cttttagtgcTTTTTTCGCGTGCTCGGCGG‑TCTTGTCATAACCAATTTGCGTTTTAAGAGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGATTAATTGATTGATGCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCt < 4:249182/268‑1 (MQ=255)
tGCGCTTTTTTGGCGATCTCGGCGG‑CTTTGTCATAACCAATGTGGGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCTCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCCTTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGACAGCGCCCCCTATGTTGATCGGCACGTCGTTCCACATCCCCTGAca > 1:623920/1‑275 (MQ=255)
tGCGCTTTTTTGGCGATCTCGGCGG‑CTTTGTCATAACCAATGTGGGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTTGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCCTGTTTATCGCCACGTCGTTCCCCCACACCTGaacg > 2:496153/1‑273 (MQ=255)
tGCGCTTTTTTGGCGATCTCGGCGG‑CTTTGTCATAACCAATGTGGGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGtt > 4:180156/1‑260 (MQ=255)
gcTTTTTTGGCGATCTCGGCGG‑CTTTGTCATAACCAATGTGGGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTccc < 2:180156/260‑1 (MQ=255)
cTTTTTTGGCGATCTCGGCGG‑CTTTGTCATAACCAATGTGGGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGCTTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGGTCAATACCAACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGCACGGCAGACGTTCAGTTCAAAGTTTCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGTACTGCCCGTCGTTCCCCATCACCTGaactcc > 3:339571/1‑269 (MQ=255)
cTTTTTTGGCGATCTCGGCGG‑CTTTGTCATAACCAATGTGGGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTAAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATATTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGAcagca > 3:46108/1‑274 (MQ=255)
ttttttGGCGATCTCGGCGG‑CTTTGTCATAACCAATGTGGGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTTTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATTGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGAcagcag > 1:288933/1‑274 (MQ=255)
ttttttGGCGATCTCGGCGG‑CTTTGTCATAACCAATGTGGGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGAcacaag > 1:534484/1‑270 (MQ=255)
ttttttGGCGATCTCGGCGG‑CTTTGTCATAACCAATGTGGGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCagag < 2:635942/276‑1 (MQ=255)
ttttGGCGATCTCGGCGG‑CTTTGTCATAACCAATGTGGGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGc < 3:574923/275‑1 (MQ=255)
tttGGCGGTTTCCGCCGCCTTTGTC‑TAACCAAAGTTGGTGTTTAGGCCAATTAACCGCCATAGCGATTTCTTGGGTTATTGATTGGTTTGCTCACGATTCGGTTCAAAACCCACCGGGCAAGGTTTGTTAAAACTTTCCATGGCATCTGGCAGCAAGCGCACCGGTTTCAGGAAATTGGGGAACCCCATTGGACGGAAGACGTTTAGTTTAAAGGTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCa < 3:521117/275‑1 (MQ=255)
cGATCTCGGCGG‑CTTAGTCCTAACCAATGTGGGGGTTAAGCGCCGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGGGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTa < 4:282539/276‑1 (MQ=255)
cGACCTCGGCGG‑CTTTGTACTAACCAATTTGGGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCACACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTa < 2:80437/276‑1 (MQ=255)
gATCTGGGCGG‑CTTTGTCATAACCAATGTGGGTGTTAAGCGCAATCTCCAGCATTAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCACACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTa < 1:563393/275‑1 (MQ=255)
aTCTCGGCGG‑CTTTGTCATAACCAATGTGGGTGTTAAGCTCAGGCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGTTTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACTGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGCTCGTCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAAAGCATGGTTaa > 1:511091/1‑275 (MQ=255)
aTCTCGGCGG‑CTTTGTCATAACCAATGTGGGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCATCATTGGACGGAAGACGTTCTGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCGCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGCGCATGGTTa > 2:374928/1‑274 (MQ=255)
cccggcgg‑CTTTGTCATAACCAATGTGGTTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAAt < 3:171379/272‑1 (MQ=255)
cggcgg‑CTTTGTCAGAACCAATGTGGGTGTTAAGATCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACCATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGGTAAAACGTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGGTAAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGcc < 1:550786/275‑1 (MQ=255)
g‑cTTTGTCATAACCAAGGTGGTGGTTAAGCCCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTACCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTcaca < 3:288933/275‑1 (MQ=255)
tgtgGGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCGCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACtt > 2:538134/1‑276 (MQ=255)
gtTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATTTTGATCGCCACGTCTTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCCTGGTTAATGCCTCACTCTGTGTTGGTTTCACTTTCCCCg > 2:647307/1‑275 (MQ=255)
gtTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCgg < 2:401967/276‑1 (MQ=255)
gtTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTACCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGTTTCACTTTcccct > 1:272112/1‑274 (MQ=255)
ttAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCgg > 2:57248/1‑275 (MQ=255)
ttAACCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTAAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGAAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCgg < 3:702305/275‑1 (MQ=255)
aGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCCGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGa > 2:504241/1‑276 (MQ=255)
tCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCgg < 2:361713/274‑1 (MQ=255)
cAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACAATTGGACGGAAGCCGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTAGTTCCCCATCACCTGACAGCAGCGAATGGTTAATGCATCAAACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCAGGCTTGAGCGGTCCGGCTc > 4:665879/1‑276 (MQ=255)
gCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGGGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCACATCCCCTTACAGCAGAGCAGGGTTAATGCCCCACACTGCGTTGGGTTCCCTTTCCTCGGCTGTATTGATCTGCCCgcccca > 3:656496/1‑270 (MQ=255)
tCATTGAGTAATTGGTTGATTAGCTCACAATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCATTTTc < 3:590925/275‑1 (MQ=255)
aGTAATTGATTGCTTTGCTTACGATTCGGTTCAATCCCCACTTGGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCATTTTCCGGGAtt < 4:285403/276‑1 (MQ=255)
attgattgATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCCCACACGGGGTTGGGTCAACTTTCCCCGGCATGATTGAGGTGCCCGGCTCCTTTTCCGGGGTTgaga > 4:598698/1‑276 (MQ=255)
tgattgatTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCAAGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCTGCTCATTTTCCggg > 2:285403/1‑267 (MQ=255)
ggttgagtCGCGCACGATTCGGTTCACAAACCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGTCAGCAAGCGCACCGATTGCAAGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTGCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCATTTTCCGGGATTGAGAt < 1:339571/272‑1 (MQ=255)
tgattGCCTCACGAGTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCATGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCATTTTCCGGGATTGAGATTTCAc < 2:357071/276‑1 (MQ=255)
gATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCATTTTCCGGGAtt < 4:120635/254‑1 (MQ=255)
aTTCGGTTCAATACCCCCTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGAGTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCATTTTCCGGGATTGAGATTTCACCAATTCCGCAgcg < 2:224851/276‑1 (MQ=255)
tACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCCCATTTGCCGGGTTTGCGTTTTACCCATTTCCGCAGCGCggcgctgggg > 4:203350/1‑268 (MQ=255)
cACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCATTTTCCGGGATTGAGATTTCACCAATTCCGCAGCGCGGGCCAGAGgcca < 1:603680/275‑1 (MQ=255)
aCTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCCCCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTTGGTTCACTTTCCCCGCCCTGATTGAGCTGCCCGCCCCTTTTCCCGGGCTTGGAGTTTCCCCCCTTCCGCACCGGCGGccccgggccccc > 4:454297/1‑266 (MQ=255)
aCTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGCGCATGGTTAATGCCTCCCACTGTTTTGCGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCATGTTCCGGGATTGATATTTCACCAATTCCGCAGCGCGGGCCAGAGtccag > 3:418079/1‑275 (MQ=255)
aCTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCATTTTCCGGGATTGAGATTTCACCAATTCCGCAGCGCgggccaggggccag > 1:636638/1‑275 (MQ=255)
aCTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCAGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCATTTTCCGGGATTGAGATTTCACCAATTCCGCAGCGCGGGCCAAAGgccag > 1:444028/1‑275 (MQ=255)
gcgcAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCATTTTCCGGGATTGAGATTTCACCAATTCCGCAGCGCGGGCCAGAGgccagcca > 2:67698/1‑275 (MQ=255)
cgcAGTGTTTGTTAATACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGATCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCATTTTCCGGGATTGAGATTTCACCAATTCCGCAGCGCGGGCCAGAGgccagcca < 1:388800/274‑1 (MQ=255)
aGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGcc < 1:314002/167‑1 (MQ=255)
tgtttgttAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCt > 3:49043/1‑166 (MQ=255)
ttgttAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCACAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCACCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGTCTCATTTTTCGGGATTGAGATTTCACCAATTCCGCAGCAGCGGCCGGAGGTCAGCCAGAGGAcctc > 1:317820/1‑275 (MQ=255)
ttgttAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCCCCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACCCTGTGTTGCGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCATTTTCCGGGATTGAGCTTTCACCAATTCCGCAGCGCAGTCCAGAGCCCAGCCAGCGGAcatcg > 2:320128/1‑275 (MQ=255)
gttAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGATGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCG‑CCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCCCATTTTCCGGGCTTGAGATTTCACCAATTCCGCAGCCCGGGCCAGAGGCCCGCCCGCGGACATCAtt > 3:297382/1‑275 (MQ=255)
aaaCTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGAcag < 1:593518/138‑1 (MQ=255)
aaCTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCCTGATTGAGCTGCCCGGCTCATTCTCCGGGATTGAGATTTCACCAATTCCGCAGCGCTGGCCAGAGGCCAGCCGTCGGACATCATTTGCgg > 2:519744/1‑275 (MQ=255)
aaCTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCATTTTCCGTGATTGAGCTTTCACCAATTCCGCATCGCGGGCCACAGGCCCGCCAGCGGGTATCATTGGCg > 2:628024/1‑275 (MQ=255)
aaCTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCATTTTCCGGGATTGAGATTTCACCAATTCCGCAGCGCGGGCCAGAGGCCAGCCAGCGGACCTCATTGGCg > 2:387439/1‑275 (MQ=255)
aaCTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCATTTTCCGGGATTGAGATTTCACCAATTCCGCAGCGCGGGCCAGAGGCCAGCCAGCGGACATCATTGGCgc > 2:196457/1‑275 (MQ=255)
tCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCATTTTCCGTGCTTGAGTTTTCACCAATTCCTCATCCCGCGCCAGAGGCCCTCCAGCGGACATCAGTGGCGAtttt > 4:572170/1‑275 (MQ=255)
tCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCATTTTCCGGGATTGAGATTTCACCATTTCCGCAGCTCGGCCCAGAGGCCAGCCAGCGGCCATCATTGGCGAttt > 1:484461/1‑274 (MQ=255)
ctCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAATACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGCAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTGATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGGGCTGCCCGGCTCATTTTCCGGGATTGAGATTTCACCAATTCCGCAGCGCGGGCCAGAGGCCAGCCAGCGGACATCATTGGCGATTTTCATCAGTGa < 2:111871/275‑1 (MQ=255)
acgtccAGCAAGACGACAGATTGGAGGAAAGTGTGGAGCACCATTGGACCGAAGACGTTAAATTCAAAGTTGCCTGAACCGCCCCCCAGGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAACGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGAGTGAGCTGCCCGGCTCATTTTCCGGGATTGAGATTTCACCAATTCCGCAGCGCGGGCCAGAGGCCAGCCAGCGGACATCATTGGCGATTTTCATCAGTGAc < 4:504241/272‑1 (MQ=255)
cggCCAGCAAGCGTACCGATTGCAAGAAATTGTGGGTCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCACCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCATTTTCCGGGATTGAGATTTCACCAATTCCGCAGCGCGGGCCAGATGCCAGCCAGCGGACATCATTGGCGATTTTCATCAGTGAc < 3:623920/273‑1 (MQ=255)
cTGCCAGCGAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCATTTTCCGGGATTGAGATTTCACCAATTCCGCAGCGCGGGCCAGAGGCCAGCCAGCGGACATCATTGGCGATTTTCATCAGTGAc < 1:112073/275‑1 (MQ=255)
cTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCATTTTCCGGGATTGAGATTTCACCAATTCCGCAGCGCGGGCCAGAGGCCAGCCAGCGGACATCATTGGCGATTTTCATCAGTGAc > 2:623029/1‑275 (MQ=255)
agaggagtgccGATTGCAGGAGATTGGGGATGACCATTGGATGGAGGTCGTTCGGTTCAAAGGTGCCGGAAGCGCCCCCCAGGGTGATCGCCCCGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGTGCTGCCCGGCTCATTTTCCGGGATTGAGATTTCACCAATTCCGCAGCGCGGGCCAGAGGCCAGCCAGCGGACATCATTGGCGATTTTCATCAGTGACGCAGcc < 3:405791/266‑1 (MQ=255)
acgcACCGATTGCAGGAAATTGTGAATCGCCATTGGACGAAAGACGTTCGGTTCAAAATTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGAACGCCACGTCGTTCCCCAGCACCTTACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGATTCACTTTCCCCTGCATGATTGAGCTGCCCGACTCATTTTCCGGGATTGAGATTTCACCAATTCCGCAGCGCGGGCCAGAGGCCAGCCAGCGTACATCATTGGCGATTTTCATCAGTGACGCAGCCaa < 2:408044/272‑1 (MQ=255)
cACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCCCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCTCGGCTCATTTTCCGGGTTTGAGATTTCACCAATTCCGCAGCGCGTGCCAGCGGCCAGCCAGCGGACATCATTGGCGATTTTTATTTGTGACGCAGCCAACCCt > 3:99905/1‑274 (MQ=255)
ccGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCATTTTCCGGGATTGAGATTTCACCAATTCCGCAGCGCGGGCCAGAGGCCAGCCAGCGGa < 3:386976/234‑1 (MQ=255)
ccGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCATTTTCCGGGATTGAGATTTCACCAATTCCGCAGCGCGGGCCAGAGGCCAGCCAGCGGa > 1:386976/1‑234 (MQ=255)
gCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCATTTTCCGGGATTGAGATTTCACCAATTCCGCAGCGCGGGCCAGAGGCCAGCCAGCGGACATCATTGGCGATTTTCATCAGTGACGCAGCCAACCCTTTCAAcgcg < 2:432773/275‑1 (MQ=255)
gCAGGAAATTGTGGATCACCAGTGGACGGAATACTTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGGTCTCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTAGGTTCACTTTCCCAGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCATTTTCCGGGATTGAGATTTCACCAATTCCGCAGCGCGGGCCAGAGGCCAGCCAGCTGACATCATTGGCGATTTTCATCAGTGACGCAGCCAACCCTTTCAAcgcg < 2:380493/275‑1 (MQ=255)
ggAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCATTTTCCGGGATTGAGATTTCACCAATTCCGCAGCGCGGGCCAGAGGCCAGCCAGCGGACATCATTGGCGATTTTCATCAGTGACGCAGCCAACCCTTTCAACGCGCCg > 1:51514/1‑275 (MQ=255)
gtaaTTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCATTTTCCGGGATTGAGATTTCACCAATTCCGCAGCGCGGGCCAGAGGCCAGCCAGCGGACATCATTGGCGATTTTCATCAGTGACGCAGCCAACCCTTTCAACGCGCCGt < 2:231544/273‑1 (MQ=255)
gAAAGTGTGGATCACCCTTGGACGGAAGGCTTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGGTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCATTTTCCGGGATTGAGATTTCACCAATTCCGCAGCGCGGGCCAGAGGCCAGCCAGCGGACATCATTGGCGATTTTCATCAGTGACGCAGCCAACCCTTTCAACGCGCCg < 4:538134/274‑1 (MQ=255)
ttGTGGATCACCATCGGCGGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGAGCGCCACGTCGTTCCCCATCCCCTGATAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCAGTGTCCGGGATTGAGATTTCACCAATTCCGCAGCGCGGGCCAGAGGCCAGCCAGCGGACATCATTGGCGATTTTCATCAGTGACGCAGCCAACCCTTTCAACGCGCCGTGCGcc < 2:583062/276‑1 (MQ=255)
tgGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCATTTTCCGGGATTGAGATTTCACCAATTCCGCAGCGCGGGCCAGAGGCCAGCCAGCGGACATCATTGGCGATTTTCATCAGTGACGCAGCCAACCCTTTCAACGCGCCGGGCGCCTGa > 2:433658/1‑276 (MQ=255)
aTCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCATTTTCCGGGATTGAGATTTCACCAATTCCGCAGCGCGGGCCAGAGGCCAGCCAGCGGAAATCAGTGGCGATTTTCATCAGTGACGCAGCCAACCCTCTCAACACACCCTGCGcccgcac > 4:626972/1‑270 (MQ=255)
aTCACCATGGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTGCCCCATCACCTGAAAGCAGAGCATGGTTAATGCCGCACACTGGGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGAGTGAGCTGCCCGGCTCATTTTCCGGGATTGAGATTTCACCAATTCCGCAGCGCGGGCCAGAGGCCAGCCAGCGGACATCATTGGCGATTTTCATCAGTGACGCAGCCAACCCTTTCAACGCGCCGTGCGCCTGAAc < 1:43693/275‑1 (MQ=255)
tCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCATTTTCCGGGATTGAGATTTCACCAATTCCGCAGCGCGGGCCAGAGGCCAGCCAGCGGACATCATTGGCGATTTTCATCAGTGACGCAGCCAACCCTTTCAACGCGCCGTGCGCCTGAAcc < 2:106479/275‑1 (MQ=255)
cGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATg > 3:238513/1‑42 (MQ=255)
gttcagttcaAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCATTTTCCGGGATTGAGATTTCACCAATTCCGCAGCGCGGGCCAGAGGCCAGCCAGCGGACATCATTGGCGATTTTCATCAGTGACGCAGCCAACCCTTTCAACGCGCCGTGCGCCTGAACCAGGGCATCACAGGTCGCCa > 3:430344/1‑275 (MQ=255)
gttcagttcaAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCATTTTCCGGGATTGAGATTTCACCAATTCCGCAGCGCGGGCCAGAGGCCAGCCAGCGGACATCATTGGCGATTTTCATCAGTGACGCAGCCAACCCTTTCAACGCCCCGTGCCCCTGAACCCGGGCATCCCAGGTCGCCa > 3:313900/1‑275 (MQ=255)
ctgcagttccACTTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGCTCGCCACGTCCTTCCCCACCCCCTGCCCGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGTGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCATTTTCCGGGATTGAGATTTCACCAATTCCGCAGCGCGGGCCAGAGGCCAGCCAGCGGACATCATTGGCGATTTTCATCAGTGACGCAGCCAACCCTTTCAACGCGCCGTGCGCCTGAACCAGGGCATCACAGGTCGCCAg < 4:433658/273‑1 (MQ=255)
ttcagttcaAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCATTTTCCGGGATTGAGATTTCACCAATTCCGCAGCGCGGGCCAGAGGCCAGCCAGCGGACATCATTGGCGATTTTCATCAGTGACGCAGCCAACCCTTTCAACGCGCCGTGCGCCTGAACCAGGGCATCACAGGTCGCCAg < 1:116089/275‑1 (MQ=255)
ttcagttcaAAGTTGCCGGAAGCGCACCCCCTGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTACCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCATTTTCCGGGATTGAGATTTCACCAATTCCGCAGCGCGAGCCAGAGGCCAGCCAGCGGACATCATTGGCGATTTTCATCAGTGACGCAGCCAACCCTTTCAACGCGCCGTGCGCCTGAACCAGGGCTTCACAGGTCGCCAg < 1:99905/275‑1 (MQ=255)
|
CCCCAGCGCAAGGGCCGCAGCTTTTAAGGTCAGCCCTTCTTTATGCGCTTTTTTGGCGATCTCGGCGG‑CTTTGTCATAACCAATGTGGGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTACCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCATTTTCCGGGATTGAGATTTCACCAATTCCGCAGCGCGGGCCAGAGGCCAGCCAGCGGACATCATTGGCGATTTTCATCAGTGACGCAGCCAACCCTTTCAACGCGCCGTGCGCCTGAACCAGGGCATCACAGGTCGCCAGCGCTT > NC_000913/1685260‑1685792
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
