Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A28 F34 I1 R1
|
9 |
132.5 |
2962696 |
84.5% |
2503478 |
259.6 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,685,527 |
A→G |
G354G (GGT→GGC) |
fumC ← |
fumarate hydratase (fumarase C),aerobic Class II |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,685,527 | 0 | A | G | 97.6%
| 409.3
/ NA
| 126 | G354G (GGT→GGC) | fumC | fumarate hydratase (fumarase C),aerobic Class II |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (2/1); new base G (64/56); total (68/58) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 126 total aligned reads displayed.
CCCAGCGCAAGGGCCGCAGCTTTTAAGGTCAGCCCTTCTTTATGCGCTTTTTTGGCGATCTCGGCGGCTTTGTCATAACCAATGTGGGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTACCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGC‑ATGGTTAATGC‑CTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCATTTTCCGGGATTGAGATTTCACCAATTCCGCAGCGCGGGCCAGAGGCCAGCCAGCGGACATCATTGGCGATTTTCATCAGTGACGCAGCCAACCCTTTCAACGCGCCGTGCGCCTGAACCAGGGCATCACAGGTCGCCAGCGCTTCA > NC_000913/1685261‑1685794
|
cccATCGCAAGGGCCGCAGTTTTTAAGTGCAGCCCTTCTTTATGAGCTTTTTTGGCGATATCGGCGGCTTTGTCATAACCAATGTGGGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTGATTGATTGATTCGCTCACTATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAg < 1:317908/274‑1 (MQ=255)
cccAGCGCAAGGGCCGCAGCTTTTAAGGTCAGCCCTTCTTTATGCGCTTTTTTGGCGATCTCGGCGGCTTTGTCATAACCAATGTGGGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCCATTGCAGGACATCGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAACGTTGCCGGAAgc > 1:88639/1‑275 (MQ=255)
cccAGCGCAAGGGCCGCAGCTTTTAAGGTCAGCCCTTCTTTATGCGCTTTTTTGGCGATCTCGGCGGCTTTGTCATAACCAATGTGGGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCCAACCGATTGGAGGAAATTGTGGCTTACCATTGGACGGAGTACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGag > 2:53290/1‑272 (MQ=255)
gcAAGGGCCGCAGCTTTTAAGGTCAGCCCTTCTTTATGCGCTTTTTTGGAGATCTCGGCGGCTTTGTCATAACCAATGTGGGTGTTAAGCNCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGATCAAGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCACGCGACCAGGTTTCAGGAAATTGTGGAGCGCATTTGGACGTAAGACGTTCGCTTCAACGCTGCAGGAAGCGccca > 4:369886/1‑273 (MQ=255)
cAAGGGCCGCAGCTTTTAAGGTCAGCCCTTCTTTATGCGCTTTTTTGGTGATCTCGGCGGCTTTGTCATAACCAATGTGGGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGcccccc < 1:599327/275‑1 (MQ=255)
gggCCGCAGCTTTTAAGGTCAGCCCTTCTTTATGCGCTTTTTTGGCGATCTCGGCGGCTTTGTTATAACCAATGTGGGTGTTAAGCGCAGNCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCTGTTCAATACACACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGACATCTGCAAGCAAGAGCACAGATTGCCTGAAATTGTGGATCAACATTGGCCGGAAGAGGTCCAGTTCAAATTTGACGGACGCTccgccccg > 4:348304/1‑272 (MQ=255)
cGCAGCTTTTAAGGTCCTCCCTTCTTTTTGCGCTTTTTTGGCGATCTCGGCGGCTTTGTCATAACCAATGTGGGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCAATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCa < 2:348304/269‑1 (MQ=255)
gtgaGCCTTTCTTTATGCGCTTTTTGGGCGATCTCGGCGGCTTTGTCATAACCAATGTGGGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCAcgtcgt < 1:215879/271‑1 (MQ=255)
cAGCCCTTCTTTATGCGCTTTTTTGGCGATCTCGGCGGCTTTGTCATAACCAATGTGGGTGTTAAGCGCAGTCATCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGACTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATCGTGGATAACCATTTGACGTAAGACGTTCAGTTCAATGTTGCCGGAAGCTCCCCCCCTGTTGCTCGcaccttcttccc > 3:351569/1‑264 (MQ=255)
cAGCCCTTCTTTATGCGCTTTTTTGGCGATCTCGGCGGCTTTGTCATAACCAATGTGGGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCCCCGATTGCAGGAAATTTTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGACGCGCCCCCCATGTTGGTCGCCACGTCGTTc > 2:41309/1‑274 (MQ=255)
aGCCCTTCTTTATGCGCTTTTTTGGCGATCTCGGCGGCTTTGTCATAACCAATGTGGGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTTGATCACCATTGGACAGAATACGTTCAGTTCAAAGTTTCCGGAAGCGCCACACAAGTGGATCGACACGGCGTTccc > 2:203125/1‑275 (MQ=255)
cccTTCTTTATGCGCTTTTTTGGCGATCTCGGCGGCTTTGTCATAACCAATGTGGGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGACATTTTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTACCGGAAGGGCCCCCCCTGTTGATCGCCACGTCGTTcccct > 3:604714/1‑274 (MQ=255)
ctgcttTCTGCGCTTTTTTGGCTAGCTCGGCGGCTTTGTCATAACCAATGTGGGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCAt < 2:500090/271‑1 (MQ=255)
tGCGCTTTTTTGGCGATCTCGGCGGCTTTGTCATAACCAATGTGGGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGGCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGCAAGGACGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCTGAAGCGCCCCCCCTGTTGATCGCCCCGTCGTTCCCCATCACCTGTca > 2:623091/1‑275 (MQ=255)
cTTTTTTGGCGATCTCGGCGGCTTTGTCATAACCAATGTGGGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTTAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCCAGTCGTTCCCCATCACCTGCcagca > 3:39738/1‑274 (MQ=255)
tttttGGCGATCTCGGCGGCTTTGTCGTAACCAATGTGGGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCagag < 2:514366/275‑1 (MQ=255)
tttttGGCGATCTCGGCGGCTTTGTCATAACCAATGTGGGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCagag < 2:553795/275‑1 (MQ=255)
ttttGGGGATCTCGGCGGCTTTGTAATAACCAATGTGGGTGGTAAAAGGAGTCACCAGCAGCAGCGATTCATTGAGTAATTCATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGc < 4:41309/275‑1 (MQ=255)
ttttGGCGATCGCGGCGGCTTTGTCATAACCAATGTGGGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTAACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGc < 2:369886/275‑1 (MQ=255)
ttgtGGCGATCTCGGCGGCTTTGTCATACCCAATGTGGGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCCCTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGc < 1:158617/272‑1 (MQ=255)
tttGGCGATCTTGGCGGCTTTGTCATAACCAATGTGGGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGC‑a < 2:218469/275‑1 (MQ=255)
tttGGCGATCTCGGCGGCTTTGTCATATACAATGTGTGTGTTCAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTTGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGC‑a < 2:578507/275‑1 (MQ=255)
gCGATCTCGGCGGCTTGGTCATAACCAATGTGGGTGTTAAGCGCAGGTACCAGCATCAGCGATTCATTTAGTAATTTATTTATTCGCTCAAGATTCGGTTCAAGACCCACTGGGCAGTGGTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGC‑ATGGt < 1:368500/275‑1 (MQ=255)
gATCTCGGTGGCGTTGTCATAACGAAATGGGGTGTTAAGTACAGTCACCAGCATCAGCGCTTCATTGAGACATTGATTGATTCGCTCACGATGCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGC‑ATGGTTa < 4:617206/275‑1 (MQ=255)
gATCTCGGCGGCTTTGTCATAACCAATGTGGGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGC‑ATGGTTa < 1:604714/275‑1 (MQ=255)
gATCTCGACGGCTTTGTCATAACCAATGTGGGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTTAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGACCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGC‑ATGGTTa < 1:629911/275‑1 (MQ=255)
ggatgtgtaaaaaCCAGTGTGGGTGTTACTCGGAGTTCCCTCCCTCCGCATTTCATGGAGTAATTGTTTGATTACCTCAGGCTTCGGTTCAATACCCACTGCGAAGTGTTTGTGAAGACTTTCCATGCCATCTGCCAGCCAGCGCACCGATTGCAGAAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGCCGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGC‑ATGGTTAATGC‑CTcac < 3:660523/264‑1 (MQ=255)
gcgttGTGATAACCAATGTGGGTGTGAAGCGCAGTCACAAGCATAAGCAATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTGCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGC‑ATGGTTAATGC‑CTcaca < 1:373009/272‑1 (MQ=255)
gcattGTCATAACCAATGTGGGTGTTACTCGCAGTCACCAGCATCAGCTGTTCATTGGGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCACCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGC‑ATGGTTAATGC‑CTcaca < 1:770097/272‑1 (MQ=255)
gcTTTGTCATAACCAATGTTGGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGAAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTTGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGC‑ATGGTTAATGC‑CTcaca < 1:101261/275‑1 (MQ=255)
gcTTTGTCATAACCAATGTGGGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAACCTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGC‑ATGGTTAATGC‑CTcaca < 1:637915/275‑1 (MQ=255)
acTTTGACATAGACAATGTGGGTGTTAGGCGCAGTCACCGGCATCAGGTATTCATTGAGTAATTGATTGAGTCGCTCAAGATTCGGTTCAGTAGCCACGGCGCAGTGTTAGTTAAAAGTTTCCATGCCATTGGCCAGCAAGCCCACCGATAGCAGGAAATTGGGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTTAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCGCATCACCGGACAGCAGAGC‑ATGGTTAATGC‑CTcaca < 3:206808/274‑1 (MQ=255)
tttCATAACCAATGTGGGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGC‑ATGGTTAATGC‑CTCACACtgt < 2:571120/273‑1 (MQ=255)
tCATAACCAATGTGGGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGC‑ATGGTTAATGC‑CTCACACTgtgt < 1:549761/275‑1 (MQ=255)
tattaCCAAGGTGGGGGTTAAGGGCAATCACCAGGTTCAGCGATTCAGTGAGTAATTGATTGAGTAGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCTCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGACAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGC‑ATGGTTAATGC‑CTCACACTGTGtt < 3:743162/271‑1 (MQ=255)
aaCCAATGTGGGTGTTAATCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGC‑ATGGTTAATGC‑CTCACACTGTGTTggg < 2:495633/275‑1 (MQ=255)
cgaattttggtggtAATCGCAGGCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGGTCAATAACCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCAGGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGC‑ATGGTTAATGC‑CTCACACTGTGTTGGGt < 3:89401/266‑1 (MQ=255)
ggTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGCGA‑ATGGTTAATGC‑CCCACCCTgtgtctgtcccttctac > 3:485852/1‑261 (MQ=255)
ttAAGGCCAGTCACCAGCATCAGCGATTTATTGAGTAATTGATTGGTTCGCCCCCGGTTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCACACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGC‑ATGGTTAATGC‑CTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCgg < 1:283685/275‑1 (MQ=255)
ttAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGCTCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGC‑ATGGTTAATGc‑c < 1:485852/246‑1 (MQ=255)
aaGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGC‑ATGGTTAATGC‑CTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCTGCa > 2:107085/1‑275 (MQ=255)
gccAGTCACCAACATCAGCTATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGC‑ATGGTTAATGC‑CTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGa < 1:514422/273‑1 (MQ=255)
gcAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATATGCCAGCAAGCGCACCGATTGCATGAAATTTTGAATAACCATTGGACGGAAGACGTACAGTTCAAAGTTGCCGGAACCGCCCCCCATGTTGATACCCAAGTCGTTCACCATCACCTCACA‑CACCCCAATGGATAATGC‑TCCCCACGCTGTTGGCTTCACTTTCCCCggactga > 4:421994/1‑269 (MQ=255)
ccAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCATCAAGCTCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGCCGGAAGACGCTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGCTGATCGCCCCGGCGTTCCCCATGACCGCAGCGCCGCGC‑AGGTGTACTGC‑CTCACCCTTGCTTCAGTTCACTTTCCCCCGCATgcatgggcg > 4:175889/1‑266 (MQ=255)
cAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCATAGC‑ATGGTTAATGC‑CTCACACTGGGTTGGGTTCCCTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCt > 1:698934/1‑275 (MQ=255)
gCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCCTCACCTGCCAGCAGAGC‑ATGGTTAATGC‑CTAACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCGCa > 2:149053/1‑275 (MQ=255)
tCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACTTGACAGCAGAGC‑ATGGTTAATGC‑CTCACACGGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCAtttt > 1:689987/1‑274 (MQ=255)
tCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCCAAGC‑ATGGTTAATGC‑CTCACACTGTGTTGGGTCCCCTTTCCCCGGAATGTTTGAGCTGCCCGGCCCAtttt > 3:119671/1‑274 (MQ=255)
aGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAACTTGTGGATCACCATTTGACGGAATACGTTCAGTTCACAGTTGCCGGAAGCCCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCCTCACCCGACAGCAGCCC‑CTGGTTAATGA‑CTCCCCCTGTCCTCGTGTCACTTTCCCCGCCATGATTGAGCTTCCCCGCTCATTTTCCggtac > 3:86364/1‑272 (MQ=255)
ttatttatttGCTCACGCTTCGGTTGAATACCCACTGCGCAGTGGTTGTTAAAACTTTCGATGCCAGCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCACATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGC‑ATGGTTAATGC‑CTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCATTTTCCGGGATTGAGAt < 2:306094/273‑1 (MQ=255)
gattgattCGCTCACGATTCGGTTCAAGACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTACATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTGCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGC‑ATGGTTAATGC‑CTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCATTTTCCGGGATTGAGAt < 1:793672/274‑1 (MQ=255)
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attCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTcc > 2:508395/1‑169 (MQ=255)
attCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGC‑ATGGTTAATGG‑CTCACACTGTGTTGGGTTCCTTTTCCCCGGCATGCTTGAGCGGCCCGGCTCATTTTCCGGGATTGACAtctccct > 2:409484/1‑272 (MQ=255)
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tACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGC‑ATGGTTAATGC‑CTCACACTGTGTTGGGTTCCCTTTCCCCGGCATGGTTGAGCTGCCCGGCTCATTTTCCGGGCTTGAGATTTCACCAATTCCGCCGCGCGGGCCagcg > 3:144370/1‑273 (MQ=255)
aCTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCCTCACCTGACAGCATAGC‑ATGGTTAATGC‑CTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGCTTGAGCTGCCTGGCTCATTTTCCGGGATTGCGATTTCCCCAATTCCGCAGCGCGGGCCAGAGgccag > 1:46345/1‑275 (MQ=255)
aCTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGC‑ATGGTTAATGC‑CTCACACTGTGtt > 2:40573/1‑186 (MQ=255)
tGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCTCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGACC‑ATGGTTAATGC‑CTCACACTGTGTCGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGTGCTGCCCGGCTCATTTTCCGGGATTGACATTTCACCAATTCCGCTGCGCGGGCCCGAGgccagcc > 2:283115/1‑275 (MQ=255)
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aGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGC‑ATGGTTAATGC‑CTCACACTCTGTTGGGTTCACTTTCCCCGTCATGTTTGAGCTGCCCGGCTCATTTTCCGGGATTGGGCTTTCACCAATGTCTCAGCGCGGGCCTGAGGCCAGCCcgcg > 2:211544/1‑274 (MQ=255)
tgttAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTCCCCCATCACCTGACAGCAGCGC‑CTGGTTAATGC‑CTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCCTGATTGAGCTGCCCGGCTCATTTTCCGGGATTGCGATTTCCCCAATCCCCCATCCTCGGCCCGAGGccacccagtcgctatc > 4:486618/1‑266 (MQ=255)
aaaCTTTCCGTGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTGCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGCTCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGC‑ATGGTTAATGC‑CTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCATTTTCCGGGATTGAGATTTCACCAATTCCGCAGCGCGGGCCAGAGGCCAGCCAGCGGACATCATTgg < 1:613784/274‑1 (MQ=255)
aaCTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGC‑ATGGTTAATGC‑CTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCCTTTTCCGGCATTTAGCTTTCACCATTTCCGCACCCCGGCCCCGCGGCCCGCCAGCGGGcaccttttgc > 4:108160/1‑266 (MQ=255)
aaCTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGC‑ATGGTTAATGC‑CTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCACGGCTCCTTTTCCGGGATTGAGATTTCACAACTTCCGCAGCGCGGGCCAGAGTCCAGCCAGCGGAcccccttggt > 2:207889/1‑265 (MQ=255)
tCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGC‑ATGGTTAATGC‑CTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCCTTTTCCGGGATTCGGATTTCCCCAACTCCTCAGCCCGGCCCTGCGGCCAGCCGGCGGACCTCATTGGCGCttt > 4:212809/1‑274 (MQ=255)
tCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGC‑ATGGTTAATGC‑CTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCATTTTCCGGGATTGAGATTTCACCAATTCCGCAGCGCGGGCCAGAGGCCAGCCAGAGGACATCATTGGCGAttt > 1:458612/1‑274 (MQ=255)
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tccAACTGCCAGCAAGCGCAACGATTGCAGGAAATTGTGAATCACCATGGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGC‑ATGGTTAATGC‑CTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCATTTTCCGGGATTGAGATTTCACCAATTCCGCAGCGCGGGCCAGAGGCCAGCCAGCGGACATCATTGGCGATTTtcatca < 2:658496/274‑1 (MQ=255)
tcgtccagccagCGCAACTATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCAGGTTGCTCGCCACGTCGGTCCCCATCACCTGACAGCAGAGC‑ATGGTTAATGC‑CTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCATTTTCCGGGATTGAGATTTCACCAATTCCGCAGCGCGGGCCAGAGGCCAGCCAGCGGACATCATTGGCGATTTTCATCAGTGa < 1:39738/271‑1 (MQ=255)
tCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGC‑ATGGTTAATGC‑CTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCCCCTTTTCCGGGTTTGAGATTTCACCACACCCGCAGCGCGGGCCACTGGCCAGGCCGGGGACATC‑TTGGCGATTTTCAGCAGTGa > 1:509772/1‑274 (MQ=255)
accgCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATGGTGGCTCCCCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTTGTTCCCCAGCACCTGACAGCAGAGC‑ATGGTTAATGC‑CTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCATTTTCCGGGAGTGAGATTTCACCAATTCCGCAGCGCGGGCCAGAGGCCAGCCAGCGGACATCATTGGCGATTTTCATCAGTGa < 3:148038/272‑1 (MQ=255)
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aGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGC‑ATGGTTAATGC‑CTCACACTGTGTTGTGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCATTTTCCGGGATTGAGATTTCACCAATTCCGCCGCGCGGGCCAGAGGCCAGCCAGCGGACATCATTGGCGATTTTCATCAGTTACGCAGCaaa > 2:141345/1‑274 (MQ=255)
aGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCAACACCTGACAGCAGAGC‑ATGGTTAATGC‑CTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCATTTTCCGGGATTGAGATTTCACCAATTCCGCAGCGCGGGCCAGAGGCCAGCCAGCGGACAGCATTGGCGATTTTCATCAGTGACGCAGCCacc > 1:420111/1‑273 (MQ=255)
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aTTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGC‑ATGGTTAATGC‑CTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCATTTTCCGGGATTGAGATTTCACCAATTCCGCAGCGCGGGCCAGAGGCCAGCCAGCGGACATCATTGGCGATTTTCATCAGTGACGCAGCCACCCCTTTCAAc > 3:518105/1‑275 (MQ=255)
aTTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGC‑ATGGTTAATGC‑CTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCATTTTCCGGGATTGAGATTTCACCAATTCCGCAGCCCGGGCCAGAGCCCAGCCAGCGGACATCATTGGCGAGTCTCATCAGTGACGCAGCCAACCCTTTCAACGCCCCGTtcg > 1:724220/1‑275 (MQ=255)
aTTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGC‑ATGGTTAATGC‑CTCAAACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCATTTTCCGGGATTGAGATTTCACCACTTCCGCAGCGCGGGCCAGAGGCCAGCCAGCGGTCATCATTGGCGATTTTCATCAGTGACGCAGCACACCATTTCAACGCGCCCTgc > 2:182866/1‑274 (MQ=255)
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ggATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGC‑ATGGTTAATGC‑CTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCATTTTCCGGGATTGAGATTTCACCAATTCCGCAGCGCGGGCCAGAGGCCAGCCAGCGGACATCATTGGCGATTTTCATCAGTGACGCAGCCAACCCTTTCAACGCGCCGTGCGCCTGa > 1:43947/1‑275 (MQ=255)
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aTTGGAGTGAAGACGGTCAGTGCCGAGTCGCCGGAAGCGCCCACCATGTTGATCGCCACGTCTTTCCCCATCACCTGACAGCAGGGC‑ATGGTTAATGC‑CTCACACTGTGTTGGGTTCCCTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCATTTTCCGGGATTGAGATTTCACCAATTCCGCAGCGCGGGCCAGAGGCCAGCCAGCGGACATCATTGGCGATTTTCATCAGTGACGCAGCCAACCCTTTCAACGCGCCGTGCGCCTGAACCAg < 4:624451/272‑1 (MQ=255)
aCGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGC‑ATGGTTAATGC‑CTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCATTTTCCGGGATTGAGATTTCACCAATTCCGCAGCGCGGGCCAGAGgccagc < 1:581227/196‑1 (MQ=255)
aaGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGC‑ATGGTTAATGC‑CTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCATTTTCCGGGATTGAGATTTCACCAATTCCGCAGCGCGGGCCAGAGGCCAGCCAGCGGACATCATTGGCGATTTTCATCAGTGACGCAGCCAACCCTTTCAACGCGCCGTGCGCCTGAACCAGGGCAt > 1:517042/1‑268 (MQ=255)
aaGACGTTCAGTTCAAAGTTGCCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGC‑ATGGTTAATGC‑CTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCATTTTCCGGGATTGAGATTTCACCAATTCCGCAGCGCGGGCCAGAGGCCAGCCAGCGGACATCATTGGCGATTTTCATCAGTGACGCAGCCAACCCTTTCAACGCGCCGTGCGCCTGAACCAGGGCATCACAGGt > 1:126238/1‑275 (MQ=255)
ttcaAAGTTGCCGCAAGCGCCCCCCAGGTTTATCGCACAGTCGTTCCCCTTCACCTGACAGCAGAGC‑ATGGTTAATGC‑CTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCATTTTCCGGGATTGAGATTTCACCAATTCCGCAGCGCGGGCCAGAGGCCAGCCAGCGGACATCATTGGCGATTTTCATCAGTGACGCAGCCAACCCTTTCAACGCGCCGTGCGCCTGAACCAGGGCATCACAGGTCGCCAGCGCtt < 3:126238/275‑1 (MQ=255)
aaggTTGCCGGGAGCGCCCCCCGTGTGTATCGCCACGAGTTTCCCCTTCACCCGACGGTCGGTG‑ATGTGTCAGGCTTTCAC‑CAGTGTTGGGTTGACTTTCCCCGGCATGATTTGGCGGCCCGGCTCATTTTCCGTCATTGAGATTTATCCAATTCCGCAGGGGGGGCCAGCGGCCGGCCAGCGGACATCATTGGCGATTTTCATCAGTGACGCAGCCAACCCTTTCAACGCGCCGTGCGCCTGAACCAGGGCATCACAGGTCGCCAGCGCTTCa < 4:438042/271‑1 (MQ=255)
|
CCCAGCGCAAGGGCCGCAGCTTTTAAGGTCAGCCCTTCTTTATGCGCTTTTTTGGCGATCTCGGCGGCTTTGTCATAACCAATGTGGGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTACCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGC‑ATGGTTAATGC‑CTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCATTTTCCGGGATTGAGATTTCACCAATTCCGCAGCGCGGGCCAGAGGCCAGCCAGCGGACATCATTGGCGATTTTCATCAGTGACGCAGCCAACCCTTTCAACGCGCCGTGCGCCTGAACCAGGGCATCACAGGTCGCCAGCGCTTCA > NC_000913/1685261‑1685794
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
