Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A19 F50 I1 R1
|
21 |
62.9 |
2410612 |
90.0% |
2169550 |
142.3 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
800,807 |
G→T |
A17S (GCG→TCG) |
ybhH → |
putative isomerase YbhH |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 800,807 | 0 | G | T | 98.6%
| 206.1
/ ‑5.7
| 71 | A17S (GCG→TCG) | ybhH | putative isomerase YbhH |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base T (31/39); minor base A (0/1); total (31/40) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.44e-01 |
TATTAATCGTTGAGCTAAAGTCATTAGAGATGCTTTGCCCTTAATGTAACCATATCGCAATAAGTTATGTTTTTAAATTGAGGGCATTATTATGAAAAAAATACCCTGCGTGATGATGCGAGGTGGAACCTCGAGGGGCGCGTTCCTGTTAGCGGAACATTTACCCGAAGATCAAACGCAGCGCGATAAAATATTGATGGCAATTATGGGTTCCGGTAACGATCTGGAAATTGACGGTATTGGCGGCGGTAATCCACTGACCAGTAAAGTCGCCATTATT > NC_000913/800668‑800947
|
tattaATCGTTGAGCTAAAGTCATTAGAGATGCTTTGCCCTTAATGTAACCATATCGCAATAAGTTATGTTTTTAAATTGAGGGCATTATTATGCAAAAAATACCCTGCGTGATGATGCGAGGTGGAACCTCGAGGGGCTCGt > 1:818070/1‑143 (MQ=255)
attaATCGTTGAGCTAAAGTCATTAGAGATGCTTTGCCCTTAATGTAACCATATCGCAATAAGTTATGTTTTTAAATTGAGGGCATTATTATGAACAAAGGTTTCTGCGTGATGATGCGAGGTGGAACCTCGAGGGGCTCGtt > 2:847098/1‑143 (MQ=255)
taagacGTGGAGGTAAAGTCAGTAGAGATGCTCTTGCTTTAATGTAGTGTAATTTCAAGTGGTGATGTGCAAAAAGTGCGGGCATTAGTATGAAAAAAACACCCTGCGTGATGATGCGAGGTGGAACCTCGAGGGGCTCGTTc < 2:850820/138‑1 (MQ=255)
aagcGTTGAGCGAAAGTCATTAGAGATGCTTTGCCCTTAATGTAACCATATCGCAATAAGTTATGTTTTTAAATTGAGGGCATTATTATGAAAAAAATACCCTGCGTGATGATGCGAGGTGGAACCTCGAGGGGCTCGTTCCt < 1:884493/140‑1 (MQ=255)
aaTCTTTGATCTAAAGTCATTAGAGATGCATTTCCCTTAATTTAACCATATCTCAATAATTTATTTTTCTAAAACAAAAACAATAAAAAAAAAAAAATACCCTGCGTGATGATGCGAGGTGGAACCTCGAGGGGCTCGTTCCt < 1:588487/143‑1 (MQ=255)
aaTCGTTGAGCTAAAGTCATTAGAGATGCTTTGCCCTTAATGTAACCATATCGCAATAAGTTATGTTTTTAAATTGAGGGCATTATTATGAAAAAAATACCCTGCGTGATGATGCGAGGTGGAACCTCGAGGGGCTCGTTCCt > 1:74312/1‑143 (MQ=255)
gTTGAGCTAAAGTCATTAGAGATGCTTTGCCCTTAATGTAACCATATCGCAATAAGTTATGTTTTTAAATTGAGGGCATTATTATGAAAAAAATCCCCTGCGTGATGCTGCGAGGTGGAACCTCGAGGGGCTCGTTCCTGTTa > 1:3241/1‑143 (MQ=255)
gTTGAGCTAAAGTCATTAGAGATGCTTTGCCCTTAATGTAACCATATCGCAATAAGTTATGTTTTTAAATTGAGGGCATTATTATGAAAAAAATACCCTGCGTGATGATGCGAGGTGGAACCTCGAGGGGCTCGTTCCTGTTa < 1:825844/143‑1 (MQ=255)
gTTGAGATAAAGTTATTAGAGATGCTTTGTATTTAATGTAACCATATCGCAATAAGTTATGTTTTTAAATTGAGGGCATTATTATGAAAAAAATACCCTGCGTGATGATGCGAGGTGGAACCTCGAGGGGCTCGTTCCTGTTa < 2:465920/143‑1 (MQ=255)
ttaggCTAAAGTGAGTAGAGATGCTTTGCCCTTAATGTAACCATATCGAAAGAAGTTATGTTTTGAAATTGAGGGCATTATTATGAAAAAAATACCCTGCGTGATGATGCGAGGTGGAACCTCGAGGGGCTCGTTCCTGTTAg < 2:767752/139‑1 (MQ=255)
gAGCTAAAGTCATTAGAGATGCTTTGCCCTTAATGTAACCATATCGCAATAAGTTATGTTTTTAAATTGAGGGCATTATTATGAAAAAAATACCCTGCGTGATGATGCGAGGTGGAACCTCGAGGGGCTCGTTCCTGTTAGCg < 1:76456/143‑1 (MQ=255)
aaGTCATTAGAGATGCTTTGCCCTTTATGTAACCATATCGCAATAAGTTATGTTTTTAAATTGAGGGCATTATTATGAAAAAAATACCCTGCGTGATGATGCGAGGTGGAACCTCGAGGGGCTCGTTCCTGTTAGCGGAACAt > 2:371936/1‑143 (MQ=255)
aTTAGCGATGCTTTGCCCTTAATGTAACCATATCGCAATAAGTTATGTTTTTAAATTGAGGGCATTATTATGAAAAAAATACCCTGCGTGATGATGCGAGGTGGAACCTCGAGGGGCTCGTTCCTGTTAGCGGAACATTTAcc < 1:1024034/143‑1 (MQ=255)
tAGAGATGCTTTGCCCTTAATGTAACCATATCGCACTAAGTTATGTTTTTAAATTGAGGGCATTATTATGAAAAAAATACCCTGCGTGATGATGCGAGGTGGAACCTCGAGGGGCTCGTTCCTGTTAGCGGAACATTTACCCg > 1:631867/1‑143 (MQ=255)
gagaTGCTTTGCCCTTAATGTAACCATATCGCAATAAGTTATGTTTTTAAATTGAGGGCATTATTATGAAAAAAATACCCTGCGTGATGATGCGAGGTGGAACCTCGAGGGGCTCGTTCCTGTTAGCGGAACGTTTACCCGaa > 1:470868/1‑143 (MQ=255)
agaTGCTTTGCCCTTAATGTAACCATATCGCAATAAGTTATGTTTTTAAATTGAGGGCATTATTATGAAAAAAATACCCTGCGTGATGATGCGAGGTGGAACCTCGAGGGGCTCGTTCCTGTTAGCGGAACATTTACCCGAAg > 1:115105/1‑143 (MQ=255)
agaTGCGTGGCGCGTAATGGAAGCAGAGGGCAATAAGTTATGGGTGTAAATTGAGGGCATGATTATGAAAAGAAGACCCTGCGTGATGATGCGAGGTGGAACCTCGAGGGGCTCGTTCCTGTTAGCGGAACATTTACCCGAAg < 2:166614/143‑1 (MQ=255)
tttGCCCTTAATGTAACCATATCGCAATAAGTTATGTTTTTAAATTGAGGGCATTATTATGAAAAAAATACCCTGCGTGATGATGCGAGGTGGAACCTCGAGGGGCTCGTTCCTGTTAGCGGAACATTTACCCGAAGATCaaa < 2:537468/143‑1 (MQ=255)
cccTGAATGGAACCAGAGCCGAATGAGTTATGGTGTTAGATTCAGTGCATTATTATGAAAAGAATACCCTGCGTGATGATGCGAGGTTGAACCTCGAGGGGCTCGTTCCTGTTAGCGGAACATTTACCCGAAGATCAAACGCa < 2:1138951/143‑1 (MQ=255)
ccTTAATGTAACCATATCGCAATAAGTTATGTTTTTAAATTGAGGGCATTATTATGAAAAAAATACCCTGCGTGATGATGCGAGGTGGAACCTCGAGGGGCTCGTTCCTGTTAGCGGAACATTTACCAGAAAAACAAACCCAg > 1:740968/1‑143 (MQ=255)
cTTAATGTAACCATATCGCAATAAGTTATGTTTTTAAATTGAGGGCATTATTATGAAAAAAATACCCTGCGTGATGATGCGAGGTGGAACCTCGAGGGGCTCGTTCCTGTTAGCGGAACATTTACCCGAAGATCAAACGCAgc > 1:231574/1‑143 (MQ=255)
gTAACCATATCGCAATAAGTTATGTTTTTAAATTGAGGGCATTATTATGAAAAAAATACCCTGCGTGATGATGCGAGGTGGAACCTCGAGGGGCTCGTTCCTGTTAGCGGAACATTTACCCGAAGATCAAACGCAGCGCGATa < 1:118316/143‑1 (MQ=255)
cATATCGCAATAAGTTATGTTTTTAAATTGAGGGCATTATTATGAAAAAAATACCCTGCGTGATGATGCGAGGTGGAACCTCGAGGGGCTCGTTCCTGTTAGCGGAACATTTACCCGAAGATCAAACGCAGCGCGATAAActa > 1:371501/1‑143 (MQ=255)
cATATCGAAATAAGTTATGTTTTTAAATAGAGGGCATTATTATGAAAAAAATACCCTGCGTGATGATGCGAGGTGGAACCTCGAGGGGCTCGTTCCTGTTAGCGGAACATTTACCCGAAGATCAAACGCAGCGCGATAAAata < 1:731527/143‑1 (MQ=255)
atatCGCAATAAGTTATGTTTTTAAATTGAGGGCATTATTATGAAAAAAATACCCTGCGTGATGATGCGAGGTGGAACCTCGAGGGGCTCGTTCCTGTTAGCGGAACATTTACCCGAAGATCAAACGCCGCGCGATCAAatcc > 1:433435/1‑141 (MQ=255)
atatCGCAATAAGTTATGTTTTTAAATTGAGGGCATTATTATGAAAAAAATACCCTGCGTGATGATGCGAGGTGGAACCTCGAGGGGCTCGTTCCTGTTAGCGGAACATTTACCCGAAGATCAAACGCAGCGCGATAAAatat > 2:740401/1‑143 (MQ=255)
tatCGCAATAAGTTATGTTTTTAAATTGAGGGCATTATTATGAAAAAAATACCCTGCGTGATGATGCGAGGTGGAACCTCGAGGGGCTCGTTCCTGTTAGCGGAACATTTACCCGAAGATCAAACGCAGCGCGATAAAATAtt < 1:1056834/143‑1 (MQ=255)
cGCAATAAGTTATGTTTTTAAATTGAGGGCATTATTATTAAAAAAATACCCTGCGTGATGATGCGAGGTGGAACCTCGAGGGGCTCGTTCCTGTTAGCGGAACATTTACCCGAAGATCAAACGCAGCGCGATAAAATATTGAt < 1:694633/143‑1 (MQ=255)
gCAATAAGTTATGTTTTTAAATTGAGGGCATTATTATGAAAAAAATACCCTGCGTGATGATGCGAGGTGGAACCTCGAGGGGCTCGTTCCTGTTAGCGGCACATTTACCCGAAGATCAAACGCAGCGCGATTACATCttgttg > 1:68364/1‑143 (MQ=255)
tAAGTTATGTTTTTAAATTGAGGGCATTATTATGAAAAAAATACCCTGCGTGATGATGCGAGGTGGAACCTCGAGGGGCTCGTTCCTGTTAGCGGAACATTTACCCGAAGGTCAAACGCAGCGCGATAAAATATTGATGGCac > 2:752102/1‑142 (MQ=255)
tggtatattAAATTGAGGGGATTATTATGAAGAAAGGACCCTGGTTGGTGATGCGAGGTGAAACCTCGAGGGGCTCGTTCCTGTTAGCGGAACATTTACGCGAAGAGCAAACGCAGCGCGATAAAATATTGATGGCAATTATg < 2:967090/136‑1 (MQ=255)
aggTTTTTAAATTGAGGGCATTATTATGAAAAAAATAACCTGAGTGATGATGCGAGGTGGAACCTCGAGAGGATCCTTCCTGTTAGCAGAACAATTACCCGAAGATCCAACGCAGCACGATCAACGACTGATGGCCACTAtca > 2:496628/3‑141 (MQ=255)
aTGTTTTTAAATTGAGGGCATTATTATGAAAAAAATACCCTGCGTGATGATGCGAGGTGGAACAAAGAGGGGCTCGTTCCTGTTAGCGGAACATTTACCCGAAGATCAAACGCAGAGCGATAAAAAATTGATGGCAATAATgg > 2:1172840/1‑143 (MQ=255)
tttAAATTGAGGGCATTATTATGAAAAAAATACCCTGCGTGATGATGCGAGGTGGAACCTCGAGGGGCTCGTTCCTGTTAGCGGAACATTTACCCGAAGATCAAACGCAGCGCGAGAGAATATTGATGGCAATTATGGGTTca > 1:1013993/1‑142 (MQ=255)
ttAAATTGAGGGCATTATTATGAAACCAACAAAAGCCGTTATTATGCGAGGTGGAACCTCGAGGGGCTCGTTCCTGTTAGCGGAACATTTACCCGAAGATCAAACGCAGCGCGATAAAATATTGATGGCAATTATGGGTTCCg < 1:813180/143‑1 (MQ=255)
aaaTTGAGGGCATTATTATGAAAAAAATACCCTGCGTGATTATGCGAGGTGGAACCTCGAGGGGCTCGTTCCTGTTAGCGGAACATTTACCCGAAGAGCAAACGCAGCGCGATAAAATATTGGTGGCAACGATGGGTTCCGGt > 1:149287/1‑143 (MQ=255)
aaTTGAGGGCATTATTATGAAAAAAATACCCTGCGTGATGATGCGAGGTGGAACCTCGAGGGGCTCGTTCCTGTTAGCGGAACATTTACCCGAAGATCAAACGCAGCGCGATAAAATATTGATGGCAATAATGGGTTGCGGtc > 2:332635/1‑142 (MQ=255)
attagtggCAGTGTTATGCAAAAAAGACCCTGGGTGATGATGCGAGGTGGAACCTCGAGGGGCTCGTTCCTGTTAGCGGAACATTTACCCGAAGATCAAACGCAGCGCGATAAAATATTGATGGCAATTATGGGTTCCGGTaa < 2:510881/137‑1 (MQ=255)
aTTGGGCGCATTATTATGAAAAAAATACCCTGCGTGATGATGCGAGGTGGAACCTCGAGAAACATCTCCAAACGAATTAAGTGTTTTCCCCAAGACCAAACCCAGCGCGATAAAATATTGATGGCAATTATGGGTTCCGGTaa < 1:881085/143‑1 (MQ=255)
aTTGAGGGCATTATTATGAAAAAAATACCCTGCGTGATGATGCGAGGTGGAACCTCGAGGGGCTCGTTCGTGTTAGCGGAACATTTACCCGAAGATCAAACGCGGCGCGATAAAATATAGATGGCAATTATAGGTTCCGGCaa > 2:374868/1‑143 (MQ=255)
ggCATTATGATGAAAAAAATACCCTGCGTGATGATGCGAGGTGGAACCTCGAGGGGCTCGTTCCTGTTAGCGGAACATTTACCCGAAGATCAAACGCAGCGCGATAAAATATTGATGGCAATTATGGGTTCCGGTAACGATCt < 1:559900/143‑1 (MQ=255)
tattatGAAAAAAATACCCTGCGTGATTATGCGAGGTGGAACCTCGAGGGGCTCGTTCCTGTTAGCGGAACATTTACCCGAAGATCAAACGCAGCGCGATAAAATATTGATGGCAATTATGGGTTCCGGTAACGATCTGGaaa < 1:713673/143‑1 (MQ=255)
gattatGAAAAACATCCCCTGCGTGATGATGCGAGGTGGAACCTCGAGGGGCTCGTTCCTGTTAGCGGAACATTTACCCGAAGATCAAACGCAGCGCGATAAAATATTGATGGCAATTCTGGGTTCCGGTAACGATCTGGaaa < 1:208506/142‑1 (MQ=255)
ttatGAAAAAAATACCCTGCGTGATGATGCGAGGTGGAACCTCGAGGGGCTCGTTCCTGTTAGCGGAACATTTACCCGAAGATCAAACGCAGCGCGATAAAATATTGATGGCAATTATGGGTTCCGGTAACGATCTGGAAAtt < 1:371936/143‑1 (MQ=255)
tatGAAAAAAATACCCTGCGTGATGATGCGAGGTGGAACCTCGAGGGGCTCGTTCCTGTTAGCGGAACATTTACCCGAAGATCAAACGCAGCGCGATAAAATATTGATGGCAATTATGGGTGCCGGTAGCGATCTGGAACttc > 2:281354/1‑142 (MQ=255)
agcaaaaaaaTACCCTGCGTGATGATGCGAGGTGGAACCTCGAGGGGCTCGTGCCTGTTAGCGGAACATTGACCCGAAGATCAAACGCAGCGCGATAAAATATTGATGGCAATTATGGGTTCCGGTAACGATCTGGAAATTGa < 2:1134029/140‑1 (MQ=255)
tGAAAAAACTGCCCTGCGTGATGATGCGAGGTGGAACCTCGAGGGGCTCGTGCCTGTTAGCGGAACATTTACCCGAAGATCAAACGCAGCGCGATAAAATATTGATGGCAATTATGGGTTCCGGTAACGATCTGGAAATTGAc < 2:1183401/143‑1 (MQ=255)
gAAAAAAATACCCTGCGTGATGATGCGAGGTGGAACCTCGAGGGGCTCGTTCCTGTTAGCGGAACATTTACCCGAAGATCAAACGCAGCGCGATAAAATATTGATGGCAATTATGGGTTCCGGTAACGATCTGGAAATTGACg < 2:322721/143‑1 (MQ=255)
tACCCTGCGTGATGATGCGAGGTGGAACCTCGAGGGGCTCGTTCCTGTTAGCGGCACATTTACCCGAAGATCAAACGCAGCGCGATAAAATATTGATGGCAATTATGGGTTCCGGTAACGATCTGGAAATTGACgggagtgct > 1:436594/1‑136 (MQ=255)
tACCCTGCGTGAGGATGCGAGGTGGAACCTCGAGTGGCTCGTTCCTATGTGCTGAACATTTACCCGAAGATCAAACGCAGCGCGATAAAATATTGATGGCAATTATGGGTTCCGGTAACGATCTGGAAATTGACGGTATTggc < 2:474038/143‑1 (MQ=255)
ccTGCGTGATGATGCGAGGTGGAACCTCGAGGGGCTCGTTCCTGTTAGCGGAACATTTACCCGAAGATCAAACGCAGCGCGATAAAATATTGATGGCAATTATGGGTTCCGGGAACGATCTGGAAATTGACGGTATTggcggc > 2:931277/1‑143 (MQ=255)
tGCGTGATGATGCGAGGTGGAACCTCGAGGGGCTCGTTCCTGTTAGCGGAACATTTACCCGAAGATCAAACGCAGCGCGATAAAATATTGATGGCACTTATGGGTTCCGGTCCCCATCTGGAAATTACCGGTATTGGcggcgg > 1:39405/1‑143 (MQ=255)
gTGAGGATGCGAGGTGGATCCTCGGGGGGCTCGTGCGTTTTAGCGTAACATTTACCCGAAGATCAAACGCAGCGTGTTAAAATATTGATGGCAATTATGGGTTCCGGTAACGATCTGGAAATTGACGGTATTGGCGGCGGTaa < 2:556041/143‑1 (MQ=255)
tgatgaGGCGAGGTGGAACCTCGAGGGGCTCGTTCCTGTTAGCGGAACATTTACCCGAAGATCAAACGCAGCGCGATAAAATATTGATGGCAATTATGGGTTCCGGTAACGATCTGGAAATTGACGGTATTGGCGGCGGTAAt < 1:763563/143‑1 (MQ=255)
gatgatGCGAGGTGGAACCGCGAGGGGCTCGTTCCTGTTAGCGGAACATTTACCCGAAGATCAAACGCAGCGCGATAAAATATTGATGGCAATTATGGGTTCCGGTAACGATCTGGAAATTGACGGTATTGGCGGCGGTAATc < 1:178457/143‑1 (MQ=255)
gatgatGCGAGGGGGAACCTCGAGGGGCTCGTTCCTGTTAGCGGAACATTTACCCGAAGATCAAACGCAGCGCGATAAAATATTGATGGCAATTATGGGTTCCGGTAACGATCTGGAAATTGACGGTATTGGCGGCGGTAATc < 1:1165507/143‑1 (MQ=255)
tgatgCGAGGTGGAACCTCGAGGGGCTCGTTCCTGTTAGCGGAACATTTACCCGAAGATCAAACGCAGCGCGATAAGATATTGAGGGCAATTATGGGTTCCGGTAACGATCTGGAAATTGACGGTATTGGCGGCGGTAATCCa < 1:717943/143‑1 (MQ=255)
tgaggCGAGGTGGAACCCCGAGGGGCTCGTTCCTGTTAGCGGAACATTTCCCCGAAGATCAATCGCAGCGCGATAAAATATTGATGGCAATTATGGGTTCCGGTAACGATCTGGAAATTGACGGTATTGGCGGCGGTAATCCa < 1:604137/143‑1 (MQ=255)
gatgCGAGGTGGAACCTCGAGGGGCTCGTTCCTGTTAGCGGAACATTTACCCGAAGATCAAACGCAGCGCGATAAAATATTGATGGCAATTATGGGTTCCGGTAACGATCTGGAAATTGACGGTATTGGCGGCGGTAATCCAc < 1:705616/143‑1 (MQ=255)
gtgCGAGGTGGCACCTCGAGGGGCTCGTTCCTGTTAGCGGAACATTTACCCGAAGATCAAACGCAGCGCGATAAACTATTGATGGCAATTATGGGTTCCGGTAACGATCTGGAAATTGACGGTATTGGCGGCGGTAATCCACt < 1:889036/142‑1 (MQ=255)
atgCGAGGTGGAACCTCGAGGGGCTCGTTCCTGTTAGCGGAACATTTTCCCGAAGATCAAAAGCAGCGCGACAAAATATTGATGGCAATTATGGGTTCCGGTAACGATCTGGAAATTGACGGTCAGGGCGGCGGTAACCCCCt > 2:892467/1‑143 (MQ=255)
atgCGAGGTGGAACCTCGAGGGGCTCGTTCCTGTTAGCGGAACATTTACCCGAAGATCAAACGCAGCGCGATAAAATATTGATGTCAATTATGGGTTCCGGTAACGATCTGGAAATTGACGGTATTGGCGGCGGTAATCCACt < 1:851362/143‑1 (MQ=255)
atgCGAGGTGGAACCTCGAGGGGCTCGTTCCTGTTAGCGGAACATTTACCCGAAGAGCAAACGCAGCGCGATAAAATATTGATGGCAATTATGGGTTCCGGTAACGATCTGGAAATTGACGGTATTGGCGGCGGTAGTCCACt > 2:34372/1‑143 (MQ=255)
atgCGAGGTGGAACCTCGAGGGGCTCGTGCCGGTTAGGGGAACATTTACCCTGATGTCAAACGCAGTGCTGTAAAATTTCGATGGCAATTATGGGTTCCGGTAACGATCTGGAAATTGACGGTATTGGCGGCGGTAATCCACt < 2:850507/143‑1 (MQ=255)
cGAGGTGGAACCTCGAGGGGCTCGTTCCTGTTAGCGGAACATTTACCCGAAGATCAAACGCAGCGCGATAAAATATTGATGGCAATTATGGGTTCCGGTAACGATCTGGAACTTGACGGTATTGTCGTCGGTACTCCACTgcc > 1:1038886/1‑141 (MQ=255)
cGAGCTGGAACCTCGAGGGGCTCGTTCCTGTTAGCGGAACATTTACCCGAAGATCAAACGCAGCGCGATAAAATATTGATGGCAATTATGGGTTCCGGTAACGATCTGGAAATTGACGGTATTGGCGGCGGTAATCCACTGAc < 2:743035/143‑1 (MQ=255)
acaGGTGGAAACGCGGGGGGCTCGTAGCTGTTAGCGGAACATTTAACCGAAGATCAAACGCAGCGCGATAAAATATTGATGGCAATTATGGGTTCCGGTAACGAGCTGGAAATTGACGGTATTGGCGGCGGTAATCCACTGAc < 2:213525/141‑1 (MQ=255)
gTGGAACCTCGAGGGGCTCGTTCCTGTTAGCGGAACATTTACCCGAAGATCAAACGCAGCGCGCTACAATATTGATGGCAATTATGGGTTCCGGTAACGATCTGGAAATTGACGGTATTGGCGGCGGTAATCCACTGACCAGt > 1:189998/1‑143 (MQ=255)
tCGAGGGGCTCGTTCCTGTTAGCGGAACATTTACCCGAAGATCAAACGCAGCGCGATAAAATATTGATGGCAATTATGGGTTCCGGTAACGATCTGGAAATTGACGGTATTGGCGGCGGTAACCCACTGACCAGTCACGTCGc > 1:434967/1‑143 (MQ=255)
cGAGGGGCTCGTTCCTGTTAGCGGAACATTTACCCGAAGATCAAACGCAGCGCGATAAAATATTGATGGCAATTATGGGTTCCGGTAACGATCTGGAAATTGACGGTATTGGCGGCGGTAATCCACTGACCAGTAAAGTCGcc > 2:994073/1‑143 (MQ=255)
cGAGGCGCTCGTTCCTGTTAGCGGAACATTTACCCGAAGATCAAACGCAGCGCGATAAAATATTGATGGCAATTATGGGTTCCGGTAACGATCTGGAAATTGACGGTATTGGCGGCGGTAATCCACTGACCAGTAAAGTCGcc < 2:396527/143‑1 (MQ=255)
gcgcGTTCCTGTTAGCGGAACATTTACCCGAAGATCAAACGCAGCGCGATAAAATATTGATGGCAATTATGGGTTCCGGTAACGATCTGGAAATTGACGGTATTGGCGGCGGTAATCCACTGACCAGTAAAGTCGCCattatt < 1:431390/143‑1 (MQ=255)
|
TATTAATCGTTGAGCTAAAGTCATTAGAGATGCTTTGCCCTTAATGTAACCATATCGCAATAAGTTATGTTTTTAAATTGAGGGCATTATTATGAAAAAAATACCCTGCGTGATGATGCGAGGTGGAACCTCGAGGGGCGCGTTCCTGTTAGCGGAACATTTACCCGAAGATCAAACGCAGCGCGATAAAATATTGATGGCAATTATGGGTTCCGGTAACGATCTGGAAATTGACGGTATTGGCGGCGGTAATCCACTGACCAGTAAAGTCGCCATTATT > NC_000913/800668‑800947
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
