Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A9 F2 I0 R1
|
193 |
6708.0 |
8620653 |
98.5% |
8491343 |
136.3 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP022686 |
2,148,141 |
T→G |
11.3% |
F135V (TTC→GTC) |
panF → |
sodium/pantothenate symporter |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP022686 | 2,148,141 | 0 | T | G | 11.3%
| 246.8
/ 4.4
| 140 | F135V (TTC→GTC) | panF | sodium/pantothenate symporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (43/78); new base G (15/4); total (58/82) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.00e-04 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 161 total aligned reads displayed.
GCTTTCGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGG‑TGTGGCTGGCG‑AGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCGTTGTATACCGCCTTTGGCGGCTTTCGCGCCAG > NZ_CP022686/2148002‑2148280
|
gCTTTCGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTGTGG‑TGTGGGTGGGG‑AGTTTGAGTTTGCGgggtgggt > 3:43863/1‑140 (MQ=255)
cTTTCGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGG‑TGTGGCTGGCG‑AGTTTGAGTTTGCTGGGTGcgtt < 4:986692/140‑1 (MQ=255)
ttCGCGCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGG‑TGTGGCTGGCG‑AGTTTGAGTTTGCTGGTTGcgttcg < 1:74135/140‑1 (MQ=255)
ggCTCTGTATTCTCGTCTAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCAGCTACAATTCGGTGACGCTTAACGATATGCTGTTTGCCCTCTACCAGAGTCGTCTTCTGG‑TGTGGCTGGCG‑AGTTTGAGTTTGCTGGTTGcgttcgtt < 6:105418/139‑1 (MQ=255)
cGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGG‑TGTGGCTGGCG‑AGTTTGAGTTTGCTGGTTGcgttcgtt < 8:473300/140‑1 (MQ=255)
cGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGG‑TGTGGCTGGCG‑AGTTTGAGTTTGCTGGTTGcgttcgtt < 6:146911/140‑1 (MQ=255)
cGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGG‑TGTGGCTGGCG‑AGTTTGAGTTTGCTGGTTGcgttcgtt < 4:176065/140‑1 (MQ=255)
cGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGG‑TGTGGCTGGCG‑AGTTTGAGTTTGCTGGTTGcgttcgtt < 2:364684/140‑1 (MQ=255)
gCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTGGTCTGG‑TGTGGGGGGGG‑AGGTTGAGTTTTGTGGTTGcggtagttt > 3:215998/1‑139 (MQ=255)
cTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGG‑TGTGGCTGGCG‑AGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTgg < 2:1053291/140‑1 (MQ=255)
gTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTGTGGGGG‑GGTTGGTGGCGTGGTTTTATTTTG‑TGGTTGGGTTCGTTGGTggg > 5:476070/1‑138 (MQ=255)
tATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGG‑TGTGGCTGGCG‑AGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGa < 3:417721/140‑1 (MQ=255)
cGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTATGG‑GGTGGCTGGGC‑CGTTTGATTTTGCTGGGTTCGTTAGTTGGTGGGATGACCg > 1:911131/1‑140 (MQ=255)
gCAAGAATTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTAGTG‑TTTGGCTGGAG‑CGGTTTAGATTTCTGGTTGCTGTCGTTGGTGGGTTGCCCGTg > 7:323405/1‑140 (MQ=255)
gCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGG‑TGTGGCTGGCG‑AGTTTTAGTTTGCTGGGTGCGTTAGTTGGTGCGATGACCGTg > 8:428950/1‑140 (MQ=255)
gCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGG‑TGTGGCTGGCG‑AGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTg < 7:933876/140‑1 (MQ=255)
gCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGG‑TGTGGCTGGCG‑AGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTg < 5:60459/140‑1 (MQ=255)
gCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTATGG‑TGTGGCTGGCG‑ATTTTGAGTGTGCTGGTTGGGTTCGTTGGTTCGCTGagccgg > 8:424006/1‑135 (MQ=255)
gCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTGCTGG‑TGTGGCGGGGG‑AGTTTGATTTTGCTGGTTTCGGTCGTTTGTGGGATGCCCGTg > 2:217166/1‑140 (MQ=255)
gCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGGGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCGACCAGAGTCGTCTTCTGG‑TGTGGCTGGCG‑AGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTg < 6:551905/140‑1 (MQ=255)
gCAAGAAGTGCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCGACCAGAGTCGTCTTCTGG‑TGTGGCTGGCG‑AGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTg < 6:201288/140‑1 (MQ=255)
gCAAGAACTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGATCGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGGCGTCTGG‑TGTGGCTGGAG‑AGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTg < 2:1101484/140‑1 (MQ=255)
cAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTAACAGAGTCGTCTTCTGG‑TGTGGCTGGCG‑AGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGc < 3:973814/140‑1 (MQ=255)
aagaagTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTGTTCTGG‑TGTGGGTGGGG‑AGTTTGAGTTTTCTGGGTGCGTTCGTTTGGTCGCTGACCGGGCa > 1:1020650/1‑140 (MQ=255)
aagaagTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTGGTGTGG‑TGTGGGGGGCG‑GGTGTGTGTTTGGTGGGTGCGGTAGTGGGTGGGATGACCGGGcg > 2:704036/1‑139 (MQ=255)
agaagTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCGGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGATGCGTCTTCTGG‑TGTGGCTGGCG‑AGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGAGATGACCGTGCAg < 8:1021992/140‑1 (MQ=255)
gCAATTCTTGCGCGCCGCTTCAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGG‑TGTGGCTGGCG‑AGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATctg < 4:812614/140‑3 (MQ=255)
ttGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTGGTGGGG‑TGTGGGGGGGG‑AGTTTGTGTTTTGTGGGTGGGTTCGGTGGTGGGATGGCCGTGCAGGTTATCGGCGGTggg > 2:576420/1‑138 (MQ=255)
ttGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTGGTCTGG‑TGTGGGGGGCG‑GGGTTGTGGTTGGTGGTTTGGGTAGGTGGTGGGGTGAACCTGGAGTTTATAGGCGGGgcg > 8:290218/1‑140 (MQ=255)
tGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGG‑TGTGGCTGGAG‑TGTTTGTGTTTGCTTGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTgcgc < 2:361842/140‑1 (MQ=255)
cgcgcCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGG‑TGTGGCTGGCG‑AGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTgcgcgc < 5:311907/140‑1 (MQ=255)
cgcgcCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGG‑TGTGGCTGGCG‑AGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTgcgcgc < 1:608821/140‑1 (MQ=255)
cgcgcCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGG‑TGTGGCGGGCG‑AGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTgcgcgc < 2:39006/140‑1 (MQ=255)
ccgcTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTGGTGTGG‑TGTGGGTGGGG‑GGGTTGTTTTTTGTGGGGGGGGGAGTTGGTGGGCGGTGCGGGCAGTTTATAGGGGGGGCGCGCcggc > 7:550208/1‑140 (MQ=255)
ccgcTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCAGCTACCAGAGTCGTCTTCTTG‑TGTTGGAGGCG‑AGTTTGAGTTTGAAGGTTGGGTTCGGTGGTGCGCTTGCCCAGCAGGTTATAGGCGGTGGGAGccggg > 4:271606/1‑137 (MQ=255)
cTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTGGTAGGG‑GGTGGGGGGCG‑AGGTTGAGTTTTGTGGGTGCGGTCGTTTGTGCGAAGAACGTTCAGTTTTACGGGGGGGCGCGCCGGCggg > 3:842337/1‑140 (MQ=255)
gggTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGG‑TGTGGCGGGCG‑AGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACcgcg < 4:365280/139‑1 (MQ=255)
gggTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGGCGTCTTCTGG‑TGTGGCTGGCG‑AGTTTGCGTTTGCTGGTTGCGGGCGTTGGTGCGATGACCGTGCAG‑TTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGACACCgcgg < 5:191858/139‑1 (MQ=255)
cGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTGTTATGG‑TGTGGCGGGCG‑AGGTTGAGTTTGCTGGTTGGGGTCGTTGGTGGGCTGCCCGTGGAGTTTATAGGCGGTGCGCGCCGGCTGGAAACcgcg > 4:461380/1‑140 (MQ=255)
cGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGG‑TGTGGCTGGCG‑AGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTTGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACcgcg < 7:466165/140‑1 (MQ=255)
cGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGG‑TGTGGCTGGCG‑AGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACcgcg < 1:187137/140‑1 (MQ=255)
cGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGG‑TGTGGCTGGCG‑AGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACcgcg < 5:939948/140‑1 (MQ=255)
cGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGG‑TGTGGCTGGCG‑AGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACcgcg < 1:840371/140‑1 (MQ=255)
cGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCGTCTGG‑GGTGGGGGGGG‑CGGTTTTGTTTTGTGGGTGGGGTGGTTGGGGGGGTGTCCGTGGAGTTTTTCGGCGGGGCGCGGCGGCTGGGAACcgcc > 3:680193/1‑139 (MQ=255)
cGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCGTATGG‑TGTGGGTGGCG‑CGTTTGAGTTTTCGGGTTGCGGTCGGGGGGGCGATGACCGGGGAGTTTTTCGGCGGGGCGCGCCTGCGGGaacacccg > 8:876827/1‑134 (MQ=255)
cGGTGACGCTGAACGATATGCGGCTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGG‑TGTGGCTGGCG‑AGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACcgcg < 4:939833/140‑1 (MQ=255)
tGACGCTGAATGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTGGTCTGG‑TGTGGCTGGGG‑ATTTTTAGGTTGGTGGTTGCGTTAGTTGGTTGGATGACCGTGCAGTTTATCTGCGGTTCGCGCCGGCGGGAAACCgcggcg > 6:539821/1‑140 (MQ=255)
tGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGCGTCGTGTTGTGGTTGTGG‑TGGCG‑CGTTTGAGTTTTCGGGGTGGGGTGGGTGGGGGGATGAACCTGGAGTTTATATGCGGTGAGCGGCGGCTGGCAACCccggcg > 8:182098/1‑140 (MQ=255)
tGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTGTTGTGG‑TGTGGCTGGGG‑AGTTTGAGTTTTCTGGTTGCGTTAGTTGGTGCGATGACCGTGCAGGTTATAGGCGGTGCGCGCCGGCGGGAAACCgcggcg > 4:696781/1‑140 (MQ=255)
tGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGG‑TGTGGCTGGCG‑AGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCgcggcg < 4:706601/140‑1 (MQ=255)
aCGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTGGTGTGG‑GGTGGGGGGCG‑GGGTTGAGTTTGGTGGTTGAGTTCGTTGGTGCGATGGCCGGGCATGTTATCGGCGGTGGGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCggg > 8:689022/1‑140 (MQ=255)
aCGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGG‑TGTGGCTGGCG‑AGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCggg < 6:232144/140‑1 (MQ=255)
aCGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCGTGTGG‑TGTGGCTGGCG‑AGTTTGAGTTTTGTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCggg > 2:329412/1‑140 (MQ=255)
tGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGGCGTCTTCTGG‑TGTGGCTGGCG‑AGTTTGAGTTTGCTGGGTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTAtt < 5:470787/140‑1 (MQ=255)
gAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTGGTCGGG‑TGTGGGTGGCG‑AGGTTGAGTTTGAGGGTTGGGGTGGTTGGGGGGGTGACCGTGGAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCGGCGGGGAAACCCGGCGGGGAttt > 2:190367/1‑139 (MQ=255)
aaCGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCCTCGTGGGG‑TGTGGCTGGCG‑AGGTGGAGGTTGCGGGTTGCTTTCGATGGGTCAATGCCCCGTCACTTTATAGGCGGGGCGCTGAGGCTGGAAACACCGGCCGGTATTcc > 8:792539/1‑140 (MQ=255)
gATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGG‑TGTGGCTTGCG‑AGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTa < 7:586122/140‑1 (MQ=255)
tatGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTGTTCTGG‑TGTGGCTGGCG‑ATTTTGAGTTTGGTGGGTTCGGTGGTTTGTTCGATGACCGTGCAGTTTATAGGAGGTGCGCGCCTGCTGGAAACACCGGCGGGTTTTTCTTAtt > 4:233080/1‑139 (MQ=255)
tGCCCGCTACCAGAGTCGTCTGCTGG‑GGTGGCGTGGG‑AGTTTTAGTTTTGTGGTGGCGGTCGGTTGTGCGATGCCCGTGCAGGTTATCGGCGGTGCGCGCCGCGAGGTAACCCCGGCGGGGAGTACTTATTTAACCgggg > 6:958828/1‑139 (MQ=255)
cGCTACCAGAGTCGTCTTCTGG‑TGTGGCTGGCG‑AGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGgctgct < 3:773630/140‑1 (MQ=255)
cAGAGTCGTCTTCTGG‑TGTGGCTGGCG‑AGTTTGAGTTTGCTGGGGGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGAtttt < 2:993504/140‑1 (MQ=255)
tgagTGGTCTTCTGG‑TGTGGCTGGCG‑AGTTTGAGTTTGCTGGTGGCGGTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTTCTGATTTTc < 8:52997/139‑1 (MQ=255)
gtcgtcTTCTGG‑TGTGGGTGGCG‑AGTTTGAGTGTGCTGGTTGCGTTCGTGGGTGCGATTACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGGGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGt < 7:998789/140‑1 (MQ=255)
tcgtcgTGTGG‑TGGGGGTGGCG‑AGTTTGTGTTTGCTGGGTGCGTTGGGTTGTGCGATGACCGTGCAGTTTATAAGCGGTGGGCGCCAGGGTGAAACCGCCGGGGGGATTAAATATGAAACCGGGCATCGGAttttacgta > 6:207771/1‑135 (MQ=255)
cgtcTTCTGG‑TGTGGCTGGCG‑AGTTTGCGTGTGCTGGTTGCGTGCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTCTCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTAt < 4:595214/140‑1 (MQ=255)
cgtcTTCTGG‑TGTGGCTGGCG‑AGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTAt < 1:576420/140‑1 (MQ=255)
cgtcTTCTGG‑TGTGGCTGGCG‑AGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATCCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTAt < 1:513445/140‑1 (MQ=255)
cgtcTTCTGG‑TGTGGCTGGCG‑AGTTTGAGGTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTAt < 3:991/140‑1 (MQ=255)
cgtcTTCGGG‑TGGGGCTGGCG‑AGTTTGAGTTTGCTGGGTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTAt < 8:326029/140‑1 (MQ=255)
tctGG‑TGTGGCTGGCG‑TGTGTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGGTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCa < 6:893972/140‑1 (MQ=255)
tctGG‑TGTGGCTGGCG‑AGTTTGTGTTTGCTGGTTGCGTTCGTGGGTGCGATTACGGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGACTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCa < 4:878760/140‑1 (MQ=255)
tctGG‑TGTGGCTGGCG‑AGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTGGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCTGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCa < 4:717184/140‑1 (MQ=255)
tctGG‑TGTGGCTGGCG‑AGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCa < 3:41571/140‑1 (MQ=255)
tctGG‑TGTGGCTGGCG‑AGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCa < 7:125084/140‑1 (MQ=255)
tctGG‑TGTGGCTGGCG‑AGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCa < 8:902248/140‑1 (MQ=255)
tctGG‑TGTGGCTGGCG‑AGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGAGGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCa < 8:869719/140‑1 (MQ=255)
atGG‑TTTGGCTGGCG‑AGTTTGAGTTTGCTGGTTTCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATAGGCGGTGCGCGCCAGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTACTTATGAAACCCGGCTGCTGATTTTAGGTATCACCAt > 8:408130/2‑140 (MQ=255)
tGG‑TGTGGCTGGCG‑AGTTTGAGTTTGCTGGTTGCTTTCCTTGGGGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCAtt < 3:287914/140‑1 (MQ=255)
tGG‑TGTGGCTGGCG‑AGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTGCGTTGGTGCGATGCCCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCAtt < 4:852862/140‑1 (MQ=255)
g‑tgtTGCTGGCG‑AGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTACGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTATATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCAGCTGATTTTCGGTATCAGCAtttc > 6:615546/1‑138 (MQ=255)
g‑tgtGGCTGGCG‑AGTTTGAGTTTGCTGGTTTCGTTCGTTGGTTCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTTCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCATATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCAGTATAAGCAATGc > 2:10120/1‑140 (MQ=255)
g‑tgtGGCTGGCG‑AGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGc > 6:321372/1‑140 (MQ=255)
g‑tgtGGCTGGCG‑AGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGc > 4:128809/1‑140 (MQ=255)
tgtgGCTGGCG‑AGTTTGCGCTTGCTGGTTGCGTTCGATGGTGCGATGACCGTGCAGTGTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCg < 6:795904/140‑1 (MQ=255)
tgtgGCTGGCG‑AGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCg < 1:1101758/140‑1 (MQ=255)
tgtgGCTGGCG‑AGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCg < 8:733748/140‑1 (MQ=255)
tgtgGCTGGCG‑AGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCg < 2:939529/140‑1 (MQ=255)
tgtgGCTGGCG‑AGTTTGAGTTTGCTGGGTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCg < 4:1057283/140‑1 (MQ=255)
tgtgGCTGGCG‑AGTTTGAGTGTGCTGGTTGCGTGCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCg < 1:922740/140‑1 (MQ=255)
tgtgGCGGGCG‑AGTTAGAGTTTGCTGTTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCTGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCg < 6:965118/140‑1 (MQ=255)
ggtgGCTGGCG‑AGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCg < 5:685110/139‑1 (MQ=255)
gtgGCTGGCG‑AGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGGTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGGATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCGt < 7:548898/140‑1 (MQ=255)
gctggcG‑AGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCg < 2:645558/136‑1 (MQ=255)
gctggcG‑AGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGAGGCGGGTATACCTTATGAAACCGGGCTGATGATTTTCGGTATCAGCATTGCGttct > 2:928190/1‑138 (MQ=255)
gctggcG‑AGTTTGAGTTTGCTGGTGGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGAGGCGGGTATTCCTTAAGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCGTGGt > 7:932298/1‑140 (MQ=255)
gcG‑AGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGATGATTTTCGGTATCAGCATTGAGTAGTATAc > 6:444354/1‑140 (MQ=255)
ttGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCGTTGTATACCGCCTTTGGCGGCTTTcgc > 3:443207/1‑140 (MQ=255)
gttcgttGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCGTTGTATACCGCCTTTGGCGGCTTTCGCGCCa < 3:959224/140‑1 (MQ=255)
gttcgttGGTGCGATGACCGTGCAGTGTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCGTTGTATACCGCCTTTGGCGGCTTTCGCGCCa < 1:159388/140‑1 (MQ=255)
ttcgttGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCGTTGTATACCGCCTTTGGCGGCTTTCGCGCCAg > 6:1053444/1‑140 (MQ=255)
|
GCTTTCGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGG‑TGTGGCTGGCG‑AGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCGTTGTATACCGCCTTTGGCGGCTTTCGCGCCAG > NZ_CP022686/2148002‑2148280
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
