Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A9 F36 I0 R1
|
107 |
8366.7 |
6299831 |
98.3% |
6192733 |
135.5 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP022686 |
2,148,141 |
T→G |
11.9% |
F135V (TTC→GTC) |
panF → |
sodium/pantothenate symporter |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP022686 | 2,148,141 | 0 | T | G | 11.9%
| 208.4
/ 2.9
| 115 | F135V (TTC→GTC) | panF | sodium/pantothenate symporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (34/64); new base G (14/3); total (48/67) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.33e-04 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 122 total aligned reads displayed.
CGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCGTTGTATACCGCCTTTGGCGGCTTTCGCGC > NZ_CP022686/2148007‑2148277
|
cGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGcgttcgtt < 5:157641/140‑1 (MQ=255)
cGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGcgttcg < 3:325193/138‑1 (MQ=255)
gCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCGTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGcgttcgt > 4:185264/1‑138 (MQ=255)
tCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTGGTGGGGTGTGGGGGGCGCGTTTGTGTTTTGGGGTTGGGTGGGTTggg > 7:705744/1‑139 (MQ=255)
tATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTGGGGTGGGGGGGGGGACGTTGAGTTTTCAGGGTGGGTTAGTAggggg > 3:155448/1‑135 (MQ=255)
tctcGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGa < 8:477170/140‑1 (MQ=255)
gcgcGGCAAGCAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGAt < 2:190553/135‑1 (MQ=255)
gCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCg < 3:363599/138‑1 (MQ=255)
gCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCg < 4:510403/138‑1 (MQ=255)
gCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCg < 2:426709/138‑1 (MQ=255)
gCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTg < 5:449890/140‑1 (MQ=255)
gCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTg < 5:292619/140‑1 (MQ=255)
gCAAGAAGTTCGCAATTCTTGAGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTg < 5:17575/140‑1 (MQ=255)
aagaagTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTGTTCTGGTGTGGGGGGGGCGTTTGAGTTTGGTGGTTGGGGTGGTTGGTGGGGTGACCGGGcc > 6:547355/1‑139 (MQ=255)
aagaagTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCGTCGGGTGTGGGGGGCGGGTTTGGGTTTGCTGGGGGGGGTCGTTGGTGCGCTGACCGTGCa > 6:480403/1‑140 (MQ=255)
gaagTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTGGTGGTGGGTGGGGGGGGAGATTTAGTTTTCTGGTTGCGTTCGTGTGTGGGATGTccctcga > 1:386931/1‑133 (MQ=255)
gaagTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCGTGTGGGGTGGGTGGCGGGTTTGAGTTTTCTGGTGGCGGTGGTTGGGGCGATGGCCGTGCa > 4:63607/1‑138 (MQ=255)
gaagTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCGTAGGGTGTGGCTGGCGAGTTTGTGTTTGCTGGTTGGGGTCGGTGGTGGGATGACCggggc > 4:703157/1‑134 (MQ=255)
tCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGGGTGGCTGGCGAGGTTGAGTTTGGTGGTTGGGTTGGTTGGTGGGATGGCCGGGCAGTTTAtg > 6:237819/1‑139 (MQ=255)
gCACTTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCGTGTGGGGTGGCGGGGGTGTTTGTGGTTGGGGGGTGGGGTCGGTGGGGGGGTGAACGGGCAGGTTAta > 2:343822/1‑137 (MQ=255)
cAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTGGTAGGGTGTGGGTGGGGAGTTTGAGTTTTCGGGGTGGGTTCGGTTGTGCGATGTCCGGGCAGtttttag > 1:496714/1‑134 (MQ=255)
ttCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCGTGTGGGGTGGGGGGGGCGTTTGAGTTTGCTGGGTTGGTTCGTTGGGGCGATGTCCGGGCAGTTTATcggcggg > 6:438489/1‑139 (MQ=255)
gcTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCGTGTGGTGTGGGTGGGGAGGTTGAGTTTGGTGGTTGGGGTGGTTGGTGCGATGGCCGTGGACTTTTTCGGCGGGGCGCGCctgc > 4:477402/1‑138 (MQ=255)
aCAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTgg < 1:754892/138‑1 (MQ=255)
cGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTGTTCTGGTGTGGCGGGCGAGTTTGTGTTTGGGTGTTGGGTGAGTTGGTGGGCTGGCCGTGGAGTTTTTCGGGGGGGGGCGCCGGAGGGCAACcgcg > 7:749210/1‑140 (MQ=255)
cGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCGGGCGAGTTTGTGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGGGATGCCCGGGGCGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAAccc > 4:196479/1‑137 (MQ=255)
cGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCGTCTGGGGTGGGGGGCGAGTTTGAGTTTTGTGGTTGCGGGCGTTGGGGGGGTGGCCGGGCAGTTTATAGGGGGTGCGCGCCGGCGGGAAAAcgcg > 5:653929/1‑140 (MQ=255)
gTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTGTGGTGTGGGTGGCGAGTTTGTGTTGGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGGCCCGGCAGGTTTAGGGGGGTGCGCCGCGGCTGGGAACCccggc > 6:756384/1‑140 (MQ=255)
tGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTGGTGTTGTGGGGGTGGCGCGTTTGAGTGTGATGGTTGGGGTCGGTGGGGGGATGACCGTGAGGGTTATAGGGGGGTCGCGCCTGCTGGAAACCgcggcg > 5:653353/1‑140 (MQ=255)
gACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTGGTCAGGTGTGGCGGGGGAGGGTGAGTTTGCTGGTTGGGGTGGTTTGGGGGATGACCCTGGCGGTTATAGGCGGGGCGCGCCTGCGGGAAACCccggg > 4:206488/1‑137 (MQ=255)
gACGCTGAACGATATGCTGTTAGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGcggcgg < 7:478700/140‑1 (MQ=255)
aCGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCgcggcg < 2:741360/138‑1 (MQ=255)
aCGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCggg < 6:508639/140‑1 (MQ=255)
aCGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTGCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCgcggcg < 1:139697/138‑1 (MQ=255)
aCGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCGTCTGGGGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGGGGGTTGGGTTCGTTGGTGGGATGACCGGGCAGTTTATCGGGGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCgcggcg > 4:92165/1‑138 (MQ=255)
gCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTa < 8:654787/140‑1 (MQ=255)
tGAACGATATGCTGGTTGCCCGCTACCAGAGGCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTGCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTAtt < 6:414730/140‑1 (MQ=255)
gAACGATATGCTGTTTGCACGCTACCAGAGTCGTCATATGGTTTAGCTGGCGAGTTTTGGGTTGCTTGTTGAGTTCGATGGGGGGCAGCGCCGGGAGGTTTTCGGCGCGGGCCGCCGGCTGGAAACCCCGGGGGGTAt > 2:271733/1‑138 (MQ=255)
aaCGATATGCTGGTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGGTGGGGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTcc < 5:384332/140‑1 (MQ=255)
cGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCGTCTGGTGTGGGGGGCGCGTTTGAGTTTGGTGGTTGCGTTCGTTTGTGCGCTGACCGTGCATTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGTAACCGCGGCGGGTTTTcc > 2:311558/1‑138 (MQ=255)
gCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCAGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTTATGGTTGCGTTAGTTGGTTCGATGACCGTGCAGTTTATAGGCGGTGCGCGCCGGCAGGAAAACGCCGCCGGGTTTACTTAAGa > 4:639412/1‑138 (MQ=255)
tGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGGGTGGGTGGCGAGTTTGAGGTTGCTGGGTGGGGTCGGTGGGGCGATGACCGGGCAGTTTATAGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGGTTTTCTTTTGAAAcc > 8:194101/1‑140 (MQ=255)
tGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCGTGTGGTGTGGGGGGGGGGTTTGAGGTTGCTGGTGGCGTTCGGTGGTGCGGCGACCCTGCAGTTTATCGGGGGTGCGCGGCAGCAGGAACCCGCCGCGCGGTGTACTGATGAAAcc > 6:183488/1‑140 (MQ=255)
tttGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGGTTGTTGGGTTAGTTGGGGCGGTTGCCGTGCAGTTTTTCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGTAACCGCGGCGGGGGTTGCGTATGAATCCgg > 8:316717/1‑140 (MQ=255)
tttGCCCGCTACCAGAGTCGTCGTATGGGGTGGGGGGCGTGTTTGATGTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCCTGCAGTTTTTAGGCGGGGCGCGCCTGCTGGGAACCGCGGGGGGGTTTACTTATGTAAcccg > 6:234463/1‑138 (MQ=255)
cccGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGgc < 4:743986/138‑1 (MQ=255)
ccGCTACCAGAGTCGTGTTGTGGTGTGGCGGGGGAGGTTGTGTTTGGTGGGTGGGTTGGTTGGTGGGCTGACCGTGCAGTTTTTAGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGGATTCCTTATGAAACCGGgct > 2:293730/1‑138 (MQ=255)
cGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTGCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGgctg < 3:294860/138‑1 (MQ=255)
cTACCAGCGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGACGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGa < 5:746325/140‑1 (MQ=255)
ccAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGAt < 4:561072/138‑1 (MQ=255)
ccgagGCGTCTTCTGGGGTGGCTGGCGAGTTGGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCTGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGGATTCTTTATGAAACCGGGCGGCTGAtttt < 7:113483/138‑1 (MQ=255)
agagTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTc < 8:14819/140‑1 (MQ=255)
ggcgtcTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCTTTCGTTTGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAACCCGGGCTGCTGATTTTCg < 4:339367/136‑1 (MQ=255)
cgtcTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGt < 2:704246/138‑1 (MQ=255)
cgtcTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTGCGTGGGGGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGt < 3:158563/138‑1 (MQ=255)
cgtcTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGGTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGt < 3:438340/138‑1 (MQ=255)
cgtcTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTGGCTGGTTGCGTGCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGt < 4:88071/138‑1 (MQ=255)
cgtcTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGGTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGt < 1:391954/138‑1 (MQ=255)
tctGGTGTGGCTGGCTAGTTTGAGTTTGGTGGTTGCGTGCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCTGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCa < 7:423129/140‑1 (MQ=255)
tctGGTGTGGCTGGCTAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTTCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCa < 7:551462/140‑1 (MQ=255)
tctGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCTGTTTATCGGCGGTGAGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGTGTATTCCTTATGAATCCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAg < 3:147049/138‑1 (MQ=255)
tctGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGGGCGCGCCGGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCa < 8:326594/140‑1 (MQ=255)
tctGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGGGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCa < 5:27128/140‑1 (MQ=255)
tatGGTGTGGCTGGCGAGTTTTTGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACGGTGCAGGTTATCTGCGGTGCGCGCCTGCTTGAAACCGCGGCTGGTATTCCTTTTGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCa < 7:716092/138‑1 (MQ=255)
tGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGGTGGTTGAGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTTGCGGCGGTGCGCGGCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCa < 2:419011/138‑1 (MQ=255)
tGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGTCCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCAtt < 5:237819/140‑1 (MQ=255)
tGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCa < 4:296743/138‑1 (MQ=255)
tGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCAtt < 6:289754/140‑1 (MQ=255)
tGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCAtt < 6:695685/140‑1 (MQ=255)
tGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGGTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCAtt < 7:392547/140‑1 (MQ=255)
tgtgGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGGGTTCGTTGGGGAGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACAGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTg < 3:185266/138‑1 (MQ=255)
tgtgGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTg < 1:301702/138‑1 (MQ=255)
tgtgGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTg < 4:219003/138‑1 (MQ=255)
tgtgGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTg < 1:501962/138‑1 (MQ=255)
tgtgGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTGCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTg < 2:14220/138‑1 (MQ=255)
ggtgGCTGGCGAGTTTGAGTGTGCTGGGTGCGTTCGGTGGTGCGATGACCGTGCAGTGTATCGGCGGGGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTCTGCACCCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTg < 4:552270/137‑1 (MQ=255)
gtgGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCGt < 6:653929/140‑1 (MQ=255)
gtgGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCGt < 6:146584/140‑1 (MQ=255)
gtgGCTGGCGAGTTTGAGGTTGCTGGTTGCGGTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTCTCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCGt < 6:529211/140‑1 (MQ=255)
ggggctggcGAGTTTGAGTTTGCGGGTAGCGTTCTTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTAAGACACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCGt < 7:479092/138‑1 (MQ=255)
tggctggcGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCGtt > 7:458230/1‑140 (MQ=255)
ggcctggcGAGGTTGAGTGTGCTGGTTGCGTTGGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTTGCGGCGGTGCGCGCCTGCGGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATGAGCATTGCg < 2:732199/135‑1 (MQ=255)
gctggcGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCTGCGGAGCGCGCCTGCTGGAAACCGAGGCGGGTATTCATTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCGtt > 4:800533/1‑138 (MQ=255)
gctggcGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCGtt > 1:18066/1‑138 (MQ=255)
gctggcGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCGtt > 2:680318/1‑138 (MQ=255)
gctggcGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCGTTGt > 7:41600/1‑140 (MQ=255)
gctggcGAGATTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGATGGAAACAGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGATGATTTTCGGTATCAGAATTGCGTTGt > 7:276389/1‑140 (MQ=255)
tggcGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCGTTGt > 2:237333/1‑138 (MQ=255)
ggcGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCGTTGta < 1:548873/138‑1 (MQ=255)
ggcGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTAGCAGCATTGCGTTGtata < 5:402778/140‑1 (MQ=255)
ggcGAGTGTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGGTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCGTTGta < 3:181426/138‑1 (MQ=255)
agtttgagtttgCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCGTTGTATAcc > 1:25253/1‑138 (MQ=255)
agtttgagtttgCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCGTTGTATAcc > 1:86769/1‑138 (MQ=255)
tgagtttgCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCGTTGTATACCGCCt > 2:437217/1‑138 (MQ=255)
agtttgCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTAGTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCGTTGTATACCGCCttt > 4:52057/1‑138 (MQ=255)
tttgCTGGGTGCGGTCGGGGGTGCGATGACCGTGCAGTTTAGCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCGTTGTATACCGCCTTTggcg < 5:43517/140‑1 (MQ=255)
ttggCTGGTTGCGTTCGTTGGGGCGATGACCGTGCAGGTTCTCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCGTTGTATACCGCCTTTggcg < 6:196000/137‑1 (MQ=255)
cTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCGTTGTATACCGCCTTTggcggc > 1:75158/1‑138 (MQ=255)
cgttcgttGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCGTTGTATACCGCCTTTGGCGGCTTTcgcg > 1:3077/1‑138 (MQ=255)
gttcgttGGGGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCGTTGTATACCGCCTTTGGCGGCTTTCgcgc < 2:571083/138‑1 (MQ=255)
|
CGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCGTTGTATACCGCCTTTGGCGGCTTTCGCGC > NZ_CP022686/2148007‑2148277
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
