Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A8 F35 I0 R1
|
304 |
9232.4 |
10623078 |
98.3% |
10442485 |
135.6 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP022686 |
4,780,176 |
A→C |
14.1% |
intergenic (‑75/+95) |
phoP ← / ← purB |
two‑component system response regulator PhoP/adenylosuccinate lyase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP022686 | 4,780,176 | 0 | A | C | 14.1%
| 269.8
/ 10.0
| 152 | intergenic (‑75/+95) | phoP/purB | two‑component system response regulator PhoP/adenylosuccinate lyase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (108/19); new base C (2/23); total (110/42) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 9.68e-14 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 163 total aligned reads displayed.
TGAATCTGAACTTTAAGGTGGTGACGTAACAACGCATTGTCTTCAACAACCAGTACGCGCATTTTTATTTCTCCCTGTCTTAATTATTAAAATAGTGTAACGCGATTATGTGGTTATGGGGGTAAACATTAAATAAACCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCAGGCCGGACAGCATCGCCATCCGGCACTGTTTTGAGGCTTATTTCAGCTCATCAACCATGGTGATGGCGCGACCAATGTAGTT > NZ_CP022686/4780040‑4780315
|
taaTCTGAACTTTAAGGTGGTGACGTAACAACGCATTGTCTTCAACAACCAGTACGCGCATTTTTATTTCTCCCTGTCTTAATTATTAAAATAGTGTAACGCGATTATGTGGTTATGGGGGTAAACATTAAATAAAcc < 4:132272/137‑1 (MQ=255)
gAACTTTAAGGTGGTGACGTAACAACGCATTGTCTTCAACAACCAGTACGCGCATTTTTATTTCTCCCTGTCTTAATTATTAAAATAGTGTAACGCGATTATGTGGTTATGGGTGTAAACATTAAATAAACCAGCggg > 3:1303275/1‑138 (MQ=255)
aaatttAAGGTTGTGACGTAACAACGCAGTGTCTTCAACAACCAGTACGCGCATTTTTATTTCTCCATGTCTGAAGTATTAAAATAGTGTAACGCGATTATGTGTTTATGGGTGTAAACATTAAACAAACCAGCGgggga > 6:919222/4‑140 (MQ=255)
aaCTTTAAGGTGGTGACGTAACAACGCATTGTCTTCAACAACCAGTACGCGCATTTTTATTTCTCCCTGTCTTAATTATTAAAATAGTGTAACGCGATTATGTGGTTATGGGGGTAAACATTAAATAAACCAGCGgggga > 6:229506/1‑140 (MQ=255)
aaCTTTAAGGTGGTGACGTAACAACGCATTGTCTTCAACAACCAGTACGCGCATTTTTATTTCTCCCTGTCTTAATTATTAAAATAGTGTAACGCGATTATGTGGTTATGGGGGTAAACATTAAATAAACCAGCGgggga > 8:914031/1‑140 (MQ=255)
aaCTTTAAGGTGGTGACGTAACAACGCATTGTATTCAACAACCAGTACGCGCATTTTTATTTCTCCCTGTCTTAATTATTAAAATAGTGTAACGCGATTATGTGGTTATGGTGGTAAAAATTAAATAAACCAGCGtggga > 6:902584/1‑140 (MQ=255)
aaGGTGGTGACGTAACAACGCATTGTCTTCAACAACCAGTACGCGCATTTTTATTTCTCCCTGTCTTAATTATTAAAATAGTGTAACGCGATTATGTGGTTATGGGGGTAAACATTAAATAAACCAGCGGgggaggggag > 2:688744/1‑140 (MQ=255)
tggtgACGTAACAACGCATTGTCTTCAACAACCAGTACGCGCATTTTTATTTCTCCCTGTCTTAATTATTAAAATAGTGTAACGCGATTATGTGGTTATGGGGGTAAACATTAAATAAACCAGAGGGGGAGGGGAGGTaa > 5:458708/1‑140 (MQ=255)
gtgACGTAACAACGCATTGTCTTCAACAACCAGTACGCGCATTTTTATTTCTCCCTGTCTTAATTATTAAAATAGTGTAACGCGATTATGTGGTTATGGGGGTAAACATTAAATAAACCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAg > 1:110718/1‑140 (MQ=255)
gtgACGTAACAACGCATTGTCTTCAACAACCAGTACGCGCATTTTTATTTCTCCCTGTCTTAATTATTAAAATAGTGTAACGCGATTATGTGGTTATGGGGGTAAACATTAAATAAACCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAg > 1:180884/1‑140 (MQ=255)
gtgACGTAACAACGCATTGTCTTCAACAACCAGTACGCGCATTTTTATTTCTCCCTGTCTTAATTATTAAAATAGTGTAACGCGATTATGTGGTTATGGGGGTAAACATTAAATAAACCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAg > 1:1223574/1‑140 (MQ=255)
gtgACGTAACAACGCATTGTCTTCAACAACCAGTACGCGCATTTTTATTTCTCCCTGTCTTAATTATTAAAATAGTGTAACGCGAGTATGTGGTTATGGGGGTAAACATTAAATAAACCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAg > 2:1282577/1‑140 (MQ=255)
gtgACGTAACAACGCATTGTCTTCAACAACCAGTACGCGCATTTTTATTTCTCACTGTCTTAATTATTAAAATAGTGTAACGCGATTATGTGGTTATGGGGGTAAACATTAAATAAACCAGCGGGGGAGGGGAGTTAAAg > 1:1071557/1‑140 (MQ=255)
gtgACGTAACAACGCATTGTCTTCAACAACCAGTACGCGCATTTTTATATCTCCCTGTCTTAATTATTAAAATAGTGTAACGCGATTATGTGGTTATGGGGGTAAACATTAAATAAACCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAg > 1:668121/1‑140 (MQ=255)
ttacctAACAACGCATTGTCTTCAACAAACAGTACGCGAATTTTTATTTCTACCTGTCTTAATTATTAAAATAGTGTAACGCGATTATGTGGTTATGGGGGTAAACATTAAATAAACCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGt > 8:672167/6‑140 (MQ=255)
tgACGTAACAACGCATTGTCTTCAACAACCAGTACGCGCATTTTTATTTCTCCCTGTCTTAATTATTAAAATAGTGTAACGCGATTATGTGGTTATGGGGGTAAACATTAAATAAACCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGt > 7:634835/1‑140 (MQ=255)
aCGTAACAACGCATTGTCTTCAACAACCAGTACGCGCATTTTTATTTCTCCCTGTCTTAATTATTAAAATAGTGTAACGCGATTATGTGGTTATGGGGGTAAACATTAAATAAACCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGt > 4:434478/1‑138 (MQ=255)
ctAACAACGCATTGTCTTCAACAACCAGTACGCGCATTTTTATTTCTCCCTGTCTTAATTATTAAAATAGTGTAACGCGATTATGTGGTTATGGGGGTAAACCTTAAATACACCCGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGaaa < 6:43127/139‑1 (MQ=255)
aacGCATTGTCTTCAACAACCAGTACGCGCATTTTTATTTCTCCCTGTCTTAATTATTAAAATAGTGTAACGCGATTATGTGGTTATGGGGGTAAACATTAAATAAACCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGaaaaaa > 4:925/1‑138 (MQ=255)
aTTGTCTTCAACAACCAGTACGCGCATTTTTATTTCTCCCTGTCTTAATTATTAAAATAGTGTAACGCGATTATGTGGTTATGGGGGTATACATTAAATAAACCAGCGGTGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAACAg > 8:386062/1‑140 (MQ=255)
ttGTCTTCAACAACCAGTACGCGCATTTTTATTTCTCCCTGTCTTAATTATTAAAATAGTGTAACGCGATTATGTGGTTATGGGGGTAAACATTAAATAAACCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATaaaaa > 4:1329721/1‑138 (MQ=255)
tGTCTTCATCAACCAGTACGCGCATTTTTATTTCTCCCTGTCTTAATTATTAAAATAGTGTAACGCGATTATGTGGTTATGGGGGTAAACATTAAATAAACCAGCGGTGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCg > 8:1081499/1‑140 (MQ=255)
tCTTCAACAACCATTACGCTCATTTTTATTTCTCCCTGTCTTAATTATTAAAATAGTGTAACGCGATTCTGTGGTTCTGGGGGTAAACATTAAATAAACCAGCGGGGGAGGGGATGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGa < 1:583090/140‑1 (MQ=255)
tCTTCAACAACCAGTACGCGCATTTTTATTTCTCCCTGTCTTAATTATTAAAATAGTGTAACTCGATTATGGGGTTATGGGGGTAAACATTAACTAACCCAGCGGGGGCGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGa < 1:1280104/140‑1 (MQ=255)
tCTTCAACAACCAGTACGCGCATTTATATTTCTCCCTGTCTTAATTATTAAAATAGTGTAACGCGATTAGGTGGTTATGGGGGCAACCATTAAATAAACCAGCGGGGCAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGa < 2:1138720/140‑1 (MQ=255)
tCTTAAACAACCAGTACGCGCATTATTATTTCTCCCTGTCATTATTATTAAAATAGTGTAACGCGATTTTGTGGTTATGGGGGTCAACATTAAATAAACCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGa < 8:613445/140‑1 (MQ=255)
tCAACAACCATTACGCGCTTTTTTATTTCTCCCTTTCTTAATTATTAAAATAGTGAAACGCGATTATGGGTTTATGGGGGTATACAATAAAAAACCGCGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATaa < 8:630687/140‑1 (MQ=255)
tCAACAACCAGTACGCTCATTTTTATTTCTCCCTGTATTAATTATTAAAATAGTGTAACGCGAATATGTGTTTATGGGGCTAAACATTAAATAAACCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATaa < 1:1081922/140‑1 (MQ=255)
aacaacCAGTACGCGCATTTTTATTTCTCCCTGTCTTAATTATTAAAATAGTGTAACGCGATTATGTGGTTATGGGGGTAAACATTAAATAAACCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATaa > 4:199382/1‑138 (MQ=255)
aacaacCAGTACGCGCATTTTTATTTCTCCCTGTCTTAATTATTAAAATAGTGTAACGCGATTATGTGGTTATGGGGGTAAACATTAAATAAACCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAAta > 5:469199/1‑139 (MQ=255)
aacaacCAGTACGCGCATTTTTATTTCTCCCTGTCTTAATTATTAAAATAGTGTAACGCGATTATGTGGTTATGGGGGTAAACATTAAATAAACCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATc > 2:423056/1‑140 (MQ=255)
aacaacCAGGACGCGCATTTTTATTTCTCCCTGTCTTAATTATTAAAATAGTGTACCGCGATTATGTGGTTATGGGGGTAAACATTAAATAAACCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATc > 8:844520/1‑140 (MQ=255)
caaaCAGTACGCGCATTTTTATTTCTCCCTGTATTAAGTATTAAAATAGTGTAAAGCGATTATGTGGTTATGTGGGTAAACATTAAATAAACCAGCGGGGCAGCGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGATGATAATcct > 5:790964/1‑138 (MQ=255)
ccAGTACGCGCATTTTTATTTCTCCCTGTCTTAATTATTAAAATAGTGTAACGCGATTATGTGGTTATGGGGGTAAACATTAAATAAACCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTtaat > 5:61466/1‑140 (MQ=255)
ccAGTACGCGCATTTTTATTTCTCCCTGTCTTAATTATTAAAATAGTGTAACGCGATTATGTGGTTATGGGGGTAAACATTAAATAAACCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTtaat > 5:653515/1‑140 (MQ=255)
ccAGTACGCGCATTTTTATTTCTCCCTGTCTTAATTATTAAAATAGTGTAACGCGATTATGTGGTTATGGGGGTAAACATTAAATAAACCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTtaat > 7:76332/1‑140 (MQ=255)
ccAGTACGCGCATTTTTATTTCTCACTGTCTTAATTATTAAAATAGTGTAACGCGATTATGTGGTTATGGGGGTAAACATTAAATAAACCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGTATAATCTtaat > 2:1229176/1‑140 (MQ=255)
agaaCGCGCACTGTTTTTTCTCCCTGTCTTAATTATTAATATAGTGTCACGCGATTATGGGGTTAGGGGGGGAAACATTAAATACCCCCGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTtaataa < 1:637254/137‑1 (MQ=255)
aGTACGCGCATTTTTATTTCTCCCTGTCTTAATTATTAAAATAGTGTAACGCGATTATGTGGTTATGGGGGTAAACATTAAATAAACCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTtaat > 3:301431/1‑138 (MQ=255)
aGTACGCGCATTTTTATTTCTCCCTGTCTTAATTATTAAAATAGTGTAACGCGATTATGTGGTTATGGGGGTAAACATTAAATAAACCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAAGCTtaat > 4:1349704/1‑138 (MQ=255)
gTACGATCATTTTATTTTCTACATTTCTTAATTATTACAATATAGTAATGCGTTTATCGTGTTATTGGGGACAAAATTAAATATACCAGCGTGGCAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAg < 2:580567/140‑1 (MQ=255)
tACGCGCATTTATATTTATCCTTGTAGTTATTATTAAAATAGTGTACCGCGATTATGTGGTTATTGGGGTAACCATTAAATAACCCAGCGGGGGCGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGc < 2:578604/140‑1 (MQ=255)
gcgcATTTTTATTTCTCCCTGTCTTAATTATTAAAATAGTGTAACGCGATTATGTTGTTATGGGGGTAAACATTAAATAAACCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCAgg > 5:243572/1‑140 (MQ=255)
aTTTTTATTTCTCCCTGTCTTAATTATTAAAATAGTGTAACGCGATTATGTGGTTATGGGGGTAAACATTAAATAAACCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCAGGCCgg > 6:1137165/1‑140 (MQ=255)
tttATTTCTCCCTGTCTTAATTATTAAAATAGTGTAACGCGATTATGTGGTTATGGGGGTAAACATTAAATAAACCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCAGGCCGGACa > 8:1052001/1‑140 (MQ=255)
tttCTCCATGTCTTAATTATTAAAATAGTGTAACGCGATTATGTGGTTATGGGGGAAAACAATAAAAAACCCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCAGGCCGGACAGCAt < 2:145345/140‑1 (MQ=255)
atgctcCCTGTCTTATTAAATAAAATAGTGTAACGCGCTTATGTGGTAATGGGGGTAAACATTAAATAAACCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCAGGCCGGACAGc < 3:915647/135‑1 (MQ=255)
cccTGTCTTAATTATTAAAATAGTGTAACGCGATTATGTGGTTATGGGGGTAAACATTAAATAAACCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCAGGCCGGACAGCATCGCCa > 1:918632/1‑140 (MQ=255)
cacTGTCTTAATTATTAAAATAGTGTAACGCGATTATGTGGTTATGGGGGTAAACATTAAATAAACCAGCGGGCGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCATGCCGGACAGCATCGc > 4:1209449/3‑138 (MQ=255)
cTGTCTTAATTATTAAAATAGTGTAACGCGATTATGTGGTTATGGGGGTAAACATTAAATAAACCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCAGGCCGGACAGCATCGCCa > 3:263434/1‑138 (MQ=255)
tttattattAAAAAAGTGTAACGCGTTTATGTGGTGACGGGGGTACACATTAAATCACCCCCCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCAGGCCGGACAGCATCGCCATCCGGCa < 2:1360298/137‑1 (MQ=255)
ttAATAATTAAAATAGTGTAACGCGATTATGACGTCAGCGGGGGAAACAATAAAAAAACCCGCGGGGGAGGTGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCAGGCCGGACAGCATCGCCATCCGGCa < 7:419718/140‑1 (MQ=255)
ttAATAAATAAAATAGTGAAACGCTATTATGTGTGTATGCGCGTAAACATTAAATAAACCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCAGGCCGGACAGCATCGCCATCCGGCa < 1:426317/140‑1 (MQ=255)
caaaTTATTAAAAAAGAGTAACGCGAGTCAGTCGTTCTGTGGTCAAACATTAAATCCACCAGCGTGTCCCGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCAGGCCGGACAGCATCGCCATCCgg < 4:576681/136‑1 (MQ=255)
ttaaaTAGTCAACCGCGTCTAAGTGGTTATTGGTTTAAACATTAAATAACACAGCGGGTGAGGTGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCAGGCCGGACAGCATCGCCATCCGGCACTGTTTTg < 6:1220267/138‑1 (MQ=255)
taAAATAGTGTAACGCGATTATGTGGTTATGGGGGTAAACATTAAATAAACCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAATAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCAGGCCGGACAGCATCGCCATCCGGCACTGTTTTg > 6:645709/1‑140 (MQ=255)
taAAATAGTGTAACGCGATTATGTGGTTATGGGGGTAAACATTAAATAAACCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCAGGCCGGACAGCATCGCCATCCGGCACTGTTTTg > 5:664831/1‑140 (MQ=255)
taAAATAGTGTAACGCGATTATGTGGTTATGGGGGTAAACATTAAATAAACCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCAGGCCGGACAGCATCGCCATCCGGCACTGTTTTg > 6:480950/1‑140 (MQ=255)
taAAATAGTGTAACGCGATTATGTGGTTATGGGGGTAAACATTAAATAAACCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCAGGCCGGACAGCATCGCCATCCGGCACTGTTTTg > 1:892474/1‑140 (MQ=255)
taAAATAGTGTAACGCGATTATGTGGTTATGGGGGTAAACATTAAATAAACCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCAGGCCGGACAGCATCGCCATCCGGCACTGTTTTg > 1:851175/1‑140 (MQ=255)
taAAATAGTGTAACGCGATTATGTGGTTATGGGGGTAAACATTAAATAAACCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCAGGCCGGACAGCATCGCCATCCGGCACTGTTTTg > 7:1154740/1‑140 (MQ=255)
taAAATAGTGTAACGCGATTATGTGGTTATGGGGGTAAACATTAAATAAACCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCAGGCCGGACAGCATCGCCATCCGGCACTGTTTTg > 7:219567/1‑140 (MQ=255)
taAAATAGTGTAACGCGATTATGTGGTTATGGGGGTAAACATTAAATAAACCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCAGGCCGGACAGCATCGCCATCCGGCACTGTTTTg > 5:1201106/1‑140 (MQ=255)
taAAATAGTGTAACGCGATTATGTGGTTATGGGGGTAAACATTAAATAAACCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCAGGCCGGACAGCATCGACATCCGGCACTGTTTTg > 6:404744/1‑140 (MQ=255)
aaaacTAGCGTAACGCGACTCTGTGGCTATGGGCCTAAACACAAACTACCCCCGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCAGGCCGGACAGCATCGCCATCCGGCACTGTTTTg < 2:277411/139‑1 (MQ=255)
aaaTAGTGTAACGCGATTATGTGGTTATGGGGGTAAACATTAAATAAACCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCAGGCCGGACAGCATCGCCATCCGGCACTGTTTTg > 3:689937/1‑138 (MQ=255)
tgtAACGCGATTATGTGGTTATGGGGGTAAACATTAAATAACCCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCAGGACTGACAGCATCGCCATCCGGCACTGTTTTGAGGCTTAt > 8:1137828/1‑140 (MQ=255)
tgtAACGCGATTATGTGGTTATGGGGGTAAACATTAAATAAACCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATACGCAGGCCGGACAGCATCGCCATCCGGCACTGTTTTGAGGCTTAt > 2:1216145/1‑140 (MQ=255)
tgtAACGCGATTATGTGGTTATGGGGGTAAACATTAAATAAACCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCAGGCCGGACAGCATCGCCATCCGGCACTGTTTTGAGGCTTAt > 8:418221/1‑140 (MQ=255)
tgtAACGCGATTATGTGGTTATGGGGGTAAACATTAAATAAACCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCAGGCCGGACAGCATCGCCATCCGGCACTGTTTTGAGGCTTAt > 7:945317/1‑140 (MQ=255)
cgcgATTATGTGGTTATGGGGGTAAACATTAAATAAACCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCAGGCCGGCCAGCATCGCCATCCGGCACTGTTTGGAGGCTTATTTCAg > 2:1009535/1‑140 (MQ=255)
cgcgATTATGTGGTTATGGGGGTAAACATTAAATAAACCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCAGGCCGGACAGCATCGCCATCCGGCACTGTTTTGAGGCTTATTTCAg > 5:334691/1‑140 (MQ=255)
gATTATGTGGTTATGGGGGTAAACATTAAATAAACCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCAGGCCGGACAGCATCGCCATCCGGCACTGTTTTGAGGCTTATTTCAGCtc > 2:1093787/1‑140 (MQ=255)
ttATGTGGTTATGGGTGTAAACATTAAATCAACCCGCGGGGGACGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCAGGCCGGACAGCATCGCCATCCGGCACTGTTTTGAGGCTTATTTCAGCtc < 3:118353/138‑1 (MQ=255)
ttATGTGGTTATGGGGGTAAACATTAAATAAACCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCAGGCCGGACAGCATCGCCATCCGGCACTGTTTTGAGGCTTATTTCAGCtcat > 5:149843/1‑140 (MQ=255)
ttATGTGGTTATGGGGGTAAACATTAAATAAACCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCAGGCCGGACAGCATCGCCATCCGGCACTGTTTTGAGGCTTATTTCAGCtcat > 6:1239907/1‑140 (MQ=255)
ttATGTGGTTATGGCCGCAAACATAAACACACCCCGCGGCGCCGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCAGGCCGGACAGCATCGCCATCCGGCACTGTTTTGAGGCTTATTTCAGCtcat < 8:153267/140‑1 (MQ=255)
tATGTGGTTATGGGTGAAAACAATAAATCAACCCGCGGGGGCGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCAGGCCGGACAGCATCGCCATCCGGCACTGTTTTGAGGCTTATTTCAGCtcatc < 7:1166536/140‑1 (MQ=255)
aTGTGGTTATGGGGGTAAACATTAAATAAACCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCAGGCCGGACAGCATCGCCATCCGGCACTGTTTTGAGGCTTATTTCAGCtcat > 3:868487/1‑138 (MQ=255)
ggctATGGGCGTACACATAAAACAACCCCGCGGGGGCGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCAGGCCGGACAGCATCGCCATCCGGCACTGTTTTGAGGCTTATTTCAGCTCATCAAc < 4:689937/135‑1 (MQ=255)
ggTTATGGGGGTAAACATTAAATAAACCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCAGGCCGGACAGCATCGCCATCCGGCACTGTTTTGAGGCTTATTTCAGCTCATCAACCa > 8:234539/1‑140 (MQ=255)
gTTATGGGGGTAAACATTAAATAAACCAGCGGGGGAGGGTAGGTAAAGTAAAAAAAAAAAAAGCGAAAAATGTAAATAACCAGCCCGCAAAGCTACCCAAGCCGTAAATGTTTTGTGGCTTATTACGCGTCATCAAcc > 4:806691/1‑138 (MQ=255)
aTGGGGGTAAACATTAAATAACCCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGATAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCAGGCCGGACAGCATCGCCATCCGGCACTGTTTTGAGGCTTATTTCAGCTCATCAACCATGGt > 1:937058/1‑140 (MQ=255)
aTGGGGGTAAACATTAAATAAACCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCAGGCCGGACAGCATCGCCATCCGGCACTGTTTTGAGGCTTATTTCAGCTCATCAACCATGGt > 7:1151435/1‑140 (MQ=255)
gggggTAAACATTAAATAAACCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCAGGCCGGACAGCATCGCCATCCGGCACTGTTTTGAGGCTTATTTCAGCTCATCAACCATGGTGa > 2:847906/1‑140 (MQ=255)
ggggTAAACATTAAATAAACCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCAGGCCGGACAGCATCGCCATCCGGCACTGTTTTGAGGCTTATTTCAGCTCATCAACCATGGTGAt > 5:643438/1‑140 (MQ=255)
gTAAACATTAAATAACCCCGCGGGGGAGGTGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCAGGCCGGACAGCATCGCCATCCGGCACTGTTTTGAGGCTTATTTCAGCTCATCAACCATGGTGATGgc < 5:1449/140‑1 (MQ=255)
ctAAACATAAAATACCCCAGCGGGGGCGGGGAGGTAAAGTCAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCAGGCCGGACAGCATCGCCATCCGGCACTGTTTTGAGGCTTATTTCAGCTCATCAACCATGGTGATGgc < 1:775218/139‑1 (MQ=255)
tAAACATTAAATAAACCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCAGGCCGGACAGCATCGCCATCCGGCACTGTTTTGAGGCTTATTTCAGCTCATCAACCATGGTGATGgcg > 1:1265555/1‑140 (MQ=255)
tAAACATTAAATAAACCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCAGGCCGGACAGCATCGCCATCCGGCACTGTTTTGAGGCTTATTTAAGCTCATCAACCATGGTTATGgcg > 8:636690/1‑140 (MQ=255)
aaaCATTAAATACCCCAGCGGGGGAGGGGAGGGAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATACTCTTAATAAGCAGGCCGGACAGCATCGCCATCCGGCACTGTTTTGAGGCTTATTTCAGCTCATCAACCATGGTGATGgc < 3:1041053/138‑1 (MQ=255)
aaaCATTAAATAAACCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCAGGCCGGACAGCATCGCCATCCGGCACTGTTTTGAGGCTTATTTCAGCTCATCAACCATGGTGATGgcgc > 7:57993/1‑140 (MQ=255)
taaataaaCCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCAGGCCGGACAGCATCGCCATCCGGCACTGTTTTGAGGCTTATTTCAGCTCATCAACCATGGTGATGGCGCGACCaa > 2:85232/1‑140 (MQ=255)
aaaatacaCCCGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCAGGCCGGACAGCATCGCCATCCGGCACTGTTTTGAGGCTTATTTCAGCTCATCAACCATGGTGATGGCGCGACCaa < 5:263159/139‑1 (MQ=255)
aataaaCCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCAGGCCGGACAGCATCGCCATCCGGCACTGTTTTGAGGCTTATTTCAGCTCATCAACCATGGTGATGGCGCGACCaa > 4:968753/1‑138 (MQ=255)
aCCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCAGGCCGGACAGCTTCGCCATCCGGCACTGTTTTGAGGCTTATTTCAGCTCATCAACCATGGTGATGGCGCGACCAAGGTAGtt > 1:1113870/1‑140 (MQ=255)
aCCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCAGGCCGGACAGCATCGCCATCCGGCACTGTTTTGAGGCTTATTTCAGCTCATCAACCATGGTGATGGCGCGACCAATGTAGtt > 2:400030/1‑140 (MQ=255)
aCCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCAGGCCGGACAGCATCGCCATCCGGCACTGTTTTGAGGCTTATTTCAGCTCATCAACCATGGTGATGGCGCGACCAATGTAGtt > 6:470830/1‑140 (MQ=255)
aCCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCAGGCCGGACAGCATCGCCATCCGGCACTGTTTTGAGGCTTATTTCAGCTCATCAACCATGGTGATGGCGCGACCAATGTAGtt > 1:344424/1‑140 (MQ=255)
aCCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGAGGATAATCTTAATAAGCAGGCCGGACAGCATCGCCATCCGGCACTGTTTTGAGGCTTATTTCAGCTCATCAACCATGGTGATGGCGCGACCAATGTAGtt > 8:966198/1‑140 (MQ=255)
|
TGAATCTGAACTTTAAGGTGGTGACGTAACAACGCATTGTCTTCAACAACCAGTACGCGCATTTTTATTTCTCCCTGTCTTAATTATTAAAATAGTGTAACGCGATTATGTGGTTATGGGGGTAAACATTAAATAAACCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCAGGCCGGACAGCATCGCCATCCGGCACTGTTTTGAGGCTTATTTCAGCTCATCAACCATGGTGATGGCGCGACCAATGTAGTT > NZ_CP022686/4780040‑4780315
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
