Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A6 F13 I0 R1
|
235 |
6960.4 |
9135780 |
98.4% |
8989607 |
135.7 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP022686 |
4,780,176 |
A→C |
17.4% |
intergenic (‑75/+95) |
phoP ← / ← purB |
two‑component system response regulator PhoP/adenylosuccinate lyase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP022686 | 4,780,176 | 0 | A | C | 17.4%
| 202.8
/ 11.7
| 123 | intergenic (‑75/+95) | phoP/purB | two‑component system response regulator PhoP/adenylosuccinate lyase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (77/22); new base C (2/21); total (79/44) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.12e-10 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 142 total aligned reads displayed.
TCCTGAATCTGAACTTTAAGGTGGTGACGTAACAACGCATTGTCTTCAACAACCAGTACGCGCATTTTTATTTCTCCCTGTCTTAATTATTAAAATAGTGTAACGCGATTATGTGGTTATGGGGGTAAACATTAAATAAACCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCAGGCCGGACAGCATCGCCATCCGGCACTGTTTTGAGGCTTATTTCAGCTCATCAACCATGGTGATGGCGCGACCAATGTAGTT > NZ_CP022686/4780037‑4780315
|
tCCTGAATCTGAACTTTAAGGTGGTGACGTAACAACGCATTGTCTTCAACAACCAGTACGCGCATTTTTATTTCTCCCTGTCTTAATTATTAAAATAGTGTAACGCGATTATGTGGTTATGGGGGTAAACATtaaataaa > 8:172661/1‑140 (MQ=255)
tCCTGAATCTGAACTTTAAGGTGGTGACGTAACAACGCATTGTCTTCAACAACCAGTACGCGCATTTTTATTTCTCCCTGTCTTAATTATTAAAATAGTGTAACGCGATTATGTGGTTATGGGGGTAAACATtaaataaa > 6:100368/1‑140 (MQ=255)
ttaCTTTTAGGTGGAGACGTAACAACGCATTGTCTTCAACAAACTGTAGGCTCATTTTTATTTCTCCCTGTCTTATTTATTAAACTTGTGTAACGCGATTTTGTGGTTATGGGGGTAAACATTAAATAAACCAGCggggg < 1:272637/138‑1 (MQ=255)
aaCTTTAAGGTGGTGACGTAACAACGCATTGTCTTCAACAACCAGTACGCGCATTTTTATTTCTCCCTGTCTTAATTATTAAAATAGTGTAACGCGATTATGTGGTTATGGGGGTAAACATTAAATAAACCAGCGgggga > 6:550845/1‑140 (MQ=255)
aCTTTAAGGTGGGTACGTAACAACTCATTGTCTTCAACAACCTGTACGATCATATTTATTTCTCCCTTTCTTATTTATTAAAATAGTGTAACGATATTTTGTGGTTATGGGGGTAAACTTTAAATAAACCAGCggggg < 4:1129426/138‑1 (MQ=255)
cTTTAAGGTGGTGACGTAACAACGCATTGTCTTCAACAACCAGTACGCGCATTTTTATTTCTCCCTGTCTTAATTATTAAAATAGTGTAACGCGATTATGTGGTTATGGGGGTAAACATTAAATAAACCAGCGgggga > 4:954320/1‑138 (MQ=255)
tttAAGGTTGTTACTTAATAACGAATTGTCTTCAACATACAGTAGGCTCATTTTTATTTCTCCCTTTCTTAATTATTAAATTAGTGTAACGCGATTATGTGGTTATGGGGGTAAACATTAAATAAACCAGCGggggaggg < 2:355359/140‑1 (MQ=255)
ttAAGGTGGTGACGTAACAACGCATTGTCTTCAACAACCAGTACGCGCATTTTTATTTCTCCCTGTCTTAATTATTAAAATAGTGTACCGCGATTATGTGGTTATGGGGGTAAACATTAAATAAACCAGCGggggagggg > 2:567121/1‑140 (MQ=255)
gtggttACCTAAAAACGCATTGTATTCAACAACCAGTACTCGCATTTTTATTTCTCCCTTTCTTAATTATTAAAATAGTGTACCCCGATTATGTGGTTATGGGGCAAAACATTAAATAACCCCGCGGGGGCGGGGAGGTa < 8:1000155/140‑1 (MQ=255)
gtgACGTAACAACGCATTGTCTTCAACAACCAGTACGCGCATTTTTATTTCTCCCTGTCTTAATTATTAAAATAGTGTAACGCGATTATGTGGTTATGGGGGTAAACATTAAATAAACCAGCGGGGGAGGGGAGGTaatg > 6:106261/1‑138 (MQ=255)
aCGTAACAACGCATTGTCTTCAACAACCAGTACGCGCATTTTTATTTCTCCCTGTCTTAATTATTAAAATAGTGTAACGCGATTATGTGGTTATGGGGGTAAACATTAAATAAACCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGt > 4:379624/1‑138 (MQ=255)
aCGTAACAACGCATTGTCTTCAACAACCAGTACGCGCATTTTTATTTCTCCCTGTCTTAATTATTAAAATAGTGTAACGCGATTATGTGGTTATGGGGGTAAACATTAAATAAACCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGt > 4:945108/1‑138 (MQ=255)
aCGTAACAACGCATTGTCTTCAACAACCAGTACGCGCATTTTTATTTCTCCCTGTCTTAATTATTAAAATAGTGTAACGCGATTATGTGGTTATGGGGGTAAACATTAAATAAACCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGa > 7:387297/1‑140 (MQ=255)
acaacGCATTGTCTTCAACAACCAGTACGCGCATTTTTTTTTCTCCCTGTCTTAATTATTAAAATAGTGTAACGCGATTATGTGGTTATGGGGGTAAACATTAAATAAACCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGaaaaaa > 1:191382/1‑140 (MQ=255)
cATTGTCTTCAACAACCAGTACGCGCATTTTTATTTCTCCCTGTCTTAATTATTAAAATAGTGTAACGCGATTATGTGGTTATGGGGGTAAACATTAAATAAACCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATaaaaa > 2:16408/1‑140 (MQ=255)
aTTGTCTTCAACAACCAGTACGCGCATTTTTATTTCTCCCTGTCTTAATTATTAAAATAGTGTAACGCGATTATGTGGTTATGGGGGTAAACATTAAATAAACCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAg > 2:602309/1‑140 (MQ=255)
aTTGTCTTCAACAACCAGTACGCGCATTTTTATTTCTCCCTGTCTTAATTATTAAAATAGTGTAACGCGATTATGTGGTTATGGGGGTAAACATTAAATAAACCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAg > 6:323820/1‑140 (MQ=255)
ttGTCTTCAACAACCAGTACGCGCATTTTTATTTCTCCCTGTCTTAATTATTAAAATAGTGTAACGCGATTATGTGGTTATGGGGGTAAACATTAAATAAACCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATaaaaa > 4:592715/1‑138 (MQ=255)
tGTCTTCAACAACCAGTACGCGCATTTTTATTTCTCCCTGTATTAATTATTAAAATAGTGTAACGCGATTATGTGGTTATGGGGGTAAACATTAAATAAACCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCg > 1:461160/1‑140 (MQ=255)
tCTTCAACACACAGTACGCGCATTTTTATTTATCCCTGTCTTAATTATTAAAATAGTGTAACGCTATTATGTGGTTATGGGGGTAACCATTAAATACCCCCGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGa < 2:905543/140‑1 (MQ=255)
acTTCAACAACCATTACGCTCATTTTTTTTTCTCCCTTTCTTAAATATTAAAATACGCTAACTCGATTCTGGGGTTATTGGCCAACACATAACATACCCCAGCGGGCGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGa < 6:617733/139‑1 (MQ=255)
ccaacaaCCAGTACGCGCATATTTATATCTCCCTGTCTTTATTATAAAAAAAGTGTAACGCTATGCTGTGGTTCTGGGGCTAAACATTAAAAAAACCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATaa < 1:830308/139‑1 (MQ=255)
caacCAGTACGCGCATTTTTATTTCTCCCTGTCTTAATTATTAAAATAGTGTAACGCGATTATGTGGTTATGGGGGTAAACATTAAATAAACCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATc > 4:361643/1‑138 (MQ=255)
ccAGTACGCGCATTTTTATTTCTCCCTGTCTTAATTATTAAAATAGTGTAACGCTATTATGTGGTTATGGGGGTAAACATTAAATAAACCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGTATAATCTtaat > 6:34310/1‑140 (MQ=255)
ccAGTACGCGCATTTTTATTTCTCCCTGTCTTAATTATTAAAATAGTGTAACGCGATTATGTGGTTATGGGGGTAAACATTAAATAAACCAGCGGGGGAGGGGTGGTAAAGTGAAATATTAAACAGCGGATAATCTtatt > 2:513247/1‑138 (MQ=255)
ccAGTACGCGCATTTTTATTTCTCCCTGTCTTAATTATTAAAATAGTGTAACGCGATTATGTGGTTATGGGGGTAAACATTAAATAAACCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTtaat > 6:1040580/1‑140 (MQ=255)
ccAGTACGCGCATTTTTATTTCTCCCTGTCTTAATTATTAAAATAGTGTAACGCGATTAGGTGGTTATGGGGGTAAACATTAAATAAACCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTtaat > 2:1162751/1‑140 (MQ=255)
cttctgcgcATTTTTATTTCACCCTGTCTTAATTATTAAAATAGTCTAACGCGATTATGTGGGTATGGGGTTCAACATTAAATAACCCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTtaat < 4:482432/133‑1 (MQ=255)
cgTACGCGCATTTTTATTTCTCCCTCTCTTAATTATTAAATACGTGTACCGCGATTATGTGGATCTGCGTGTAAACATAAAAAACCCCCGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTtaataa < 8:262588/139‑1 (MQ=255)
aGTACGCGCATTTTTATTTCTCCCTGTCTTAATTATTAAAATAGTGTAACGCGATTATGTGGTTATGGGGGTAAACATTAAATAAACCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTtaataa > 2:851280/1‑140 (MQ=255)
aGTACGCGCATTTTTATTTCTCCCTGTCTTAATTATTAAAATAGTGTAACGCGATTATGTGGTTATGGGGGTAAACATTAAATAAACCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTtaataa > 5:976377/1‑140 (MQ=255)
cgcATTTTTATTTCTCCCTGTCTTAATTATTAAAATAGTGTAACGCGATTATGTGGTTATGGGGGTAAACATTAAATAAACCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCAGGc > 8:615681/1‑140 (MQ=255)
ttttATTTCTCCCTGTCTTAATTATTAAAATAGTGTAACGCGATTATGTGGTTATGGGGGTAAACATTAAATAAACCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCAGGCCGGAc > 6:942022/1‑140 (MQ=255)
tctcCCTGCCTTAATTATAAAAAAAGCGTACCGCGATTATGGGGTTATCCGCGCAAACAATAAATACCCCAGCGTGGGCGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCAGGCCGGACAGCATCg < 6:437785/140‑1 (MQ=255)
ctcCCTGTCTTAATTATTAAAATAGTGTAACGCGATTATGTGGTTATGGGGGTAAACATTAAATAAACCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCAGGCCGGACAGCATCGc > 1:1110796/1‑140 (MQ=255)
tCTTAATTATTAAAATAGTGTAACGCGATTATGTGGTTATGTGGGTAAACATTAAATAAACCAGCGTGGGAGGGGAGGTAAATTCAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCAGGCCGGACAGCATCGCCATCCgg > 2:1060522/1‑140 (MQ=255)
ttAATTATTAAAATAGTGTAACGCGATTATGTGGTTATGGGGGTAAACATTAAATCACCCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAAGCTTAATAAGCAGGCCGGACAGCATCGCCATCCGGCa < 1:877554/140‑1 (MQ=255)
atAATTATTAAAATAGTGTACCGCGATTCTGTGGTTATGGGTGTAAACACTCAATAACCCAGCGGGGGCGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCAGGCCGGACAGCATCGCCATCCGGCa < 6:410514/139‑1 (MQ=255)
aaTTATTAAAATAGTGTAACGCGAATATGAGGTTATGGGGGTAAACATTAAATAAACCAGCGCGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATCATCTTAATAAGCAGGCCGTCCAGCATCGCCATCCGGCACt > 7:870949/1‑140 (MQ=255)
attaAAATAGTGTAACGCGATTATGTGGTTATGGGGGTAAACATTAAATAAACCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCAGGCCGGACAGCCTCGCCATCCGTCACTGttt > 8:742937/1‑140 (MQ=255)
taAAATCGTGTAACGCGATTATGAGGTTATGGGGGTAAACATTAAATAACCCAGCGGCGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCAGGCCGGACAGCATCGCCATCCGGCACTGTTTTg < 7:68375/140‑1 (MQ=255)
taAAATAGTGTAACGCGATTATGTGGTTATGGGGGTAAACATTAAATAAACCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCAGGCCGGACAGCATCGCCATCCGGCACTGTTTTg > 1:796922/1‑140 (MQ=255)
taAAATAGTGTAACGCGATTATGTGGTTATGGGGGTAAACATTAAATAAACCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCAGGCCGGACAGCATCGCCATCCGGCACTGTTTTg > 1:727348/1‑140 (MQ=255)
taAAATAGTGTAACGCGATTATGTGGTTATGGGGGTAAACATTAAATAAACCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCAGGCCGGACAGCATCGCCATCCGGCACTGTTTTg > 2:783239/1‑140 (MQ=255)
aaaTAGTGTAACGCGATTATGTGGTTATGGGGGTAAACATTAAATAACCCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCAGGCCGGACAGCATCGCCATCCGGCACTGTTTTg > 3:1009793/1‑138 (MQ=255)
atacgttAACGCGACTCTCTGGTTTGGGGGGCAAACATTAAATACACCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCAGGCCGGACAGCATCGCCATCCGGCACTGTTTTGAGGc < 6:976377/134‑1 (MQ=255)
gtgtAACGCGATTATGTGGTTATGGGGGTAAACATTAAATAAACCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCAGGCCGGACAGCATCGCCATCCGGCACTGTTTTGAGGCTTa > 5:507611/1‑140 (MQ=255)
gtAACGCGATTATGTGGTTATGGGGGTAAACATTAAATAACCCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCAGGCCGGACAGCATCGCCATCCGGCACTGTTTTGAGGCTTAtt > 6:848610/1‑140 (MQ=255)
aaCGCGAATATGCGGTGATGGGGGTAAACATTAAATAAACCAGCGGGGGAGGGGAGGGAAAGTGAAAAAATAAAAAGAGGATAATCTTAATAAGCAGGCCGGACAGCATCGCCATCCGGCACTGTTTTGAGGCTTATTTc < 8:465312/140‑1 (MQ=255)
cgctcttATGTTGTTATGGTCTTAAACCTTATATAAGCCAGCGGGTGATGGGAGGTAAATTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCAGGCCGGACAGCATCGCCATCCGGCACTGTTTTGAGGCTTATTTCAg < 5:832792/135‑1 (MQ=255)
cgcgATTATGTGGTTATGGGGGTAAACATTAAATAAACCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCAGGCCGGACAGCATCGCCATCCGGCACTGTTTTGAGGCTTATTTCAg > 1:696567/1‑140 (MQ=255)
cgcgATTATGTGGTTATGGGGGTAAACATTAAATAAACCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCAGGCCGGACAGCATCGCCATCCGGCACTGTTTTGAGGCTTATTTCAg > 6:1088961/1‑140 (MQ=255)
cgcgATTATGTGGTTATGGGGGTAAACATTAAATAAACCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCAGGCCGGACAGAATCGCCATCCGGCACTGTTTTGAGGCTTATTTccg > 5:362599/1‑138 (MQ=255)
cgATTATGTGGTTATGGGGGTAAACATTAAATAAACCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCAGGCCGGACAGCATCGCCATCCTGCACTGTTTTGCGGCTTATTTCAg > 3:36413/1‑138 (MQ=255)
gATTATGTGGTTATGGGGGTAAACATTAAATAAACCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCAGGCCGGACAGCATCGCCATCCGGCACTGTTTTGAGGCTTATTTCAGCtc > 2:12765/1‑140 (MQ=255)
gATTATGTGGTTATGGGGGTAAACATTAAATAAACCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCAGGCCGGACAGCATCGCCATCCGGCACTGTTTTGAGGCTTATTTCAGCtc > 2:7319/1‑140 (MQ=255)
gATTATGTGGTTATGGGGGGAAACATAAAATAAACCCGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCAGGCCGGACAGCATCGCCATCCGGCACTGTTTTGAGGCTTATTTCAGCtc < 2:928009/140‑1 (MQ=255)
ttttggggTTATGGGGGCACACAGTAAATATCCCCGCGGGGGCGGGGCGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCAGGCCGGACAGCATCGCCATCCGGCACTGTTTTGAGGCTTATTTCAGCtcat < 7:1014725/134‑1 (MQ=255)
ttctgtgGTTATGGTGGTAAACATAAAATAAACCCGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCAGGCCGGACAGCATCGCCATCCGGCACTGTTTTGAGGCTTATTTCAGCtcat < 2:526257/137‑1 (MQ=255)
ttctgtgGTTATGGGCGTAAACAATCAATAAACCACCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCAGGCCGGACAGCATCGCCATCCGGCACTGTTTTGAGGCTTATTTCAGCtcat < 7:121128/137‑1 (MQ=255)
ttATGTGGTTATGGGGGTAAACATTAAATAAACCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCAGGCCGGACAGCATCGCCATCCGGCACTGTTTTGAGGCTTATTTCAGCtcat > 5:598792/1‑140 (MQ=255)
ttATGTGGTTATGGGGGTAAACATTAAATAAACCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCAGGCCGGACAGCATCGCCATCCGGCACTGTTTTGAGGCTTATTTCAGCtcat > 6:943746/1‑140 (MQ=255)
ttATGTGGTTATGGGGGTAAACATTAAATAAACCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCAGGCCGGACAGCATCGCCATCCGGCACTGTTTTGAGGCTTATTTCAGCtcat > 1:128990/1‑140 (MQ=255)
ttATGTGGTTATGGGGGTAAACATTAAATAAACCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCAGGCCGGACAGCATCGCCATCCGGCACTGTTTTGAGGCTTATTTCAGCtcat > 6:66792/1‑140 (MQ=255)
ttATGTGGTTATGGGGGAAAACATTAAATAACCCCGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCAGGCCGGACAGCATCGCCATCCGGCACTGTTTTGAGGCTTATTTCAGCtcat < 1:346509/140‑1 (MQ=255)
ttATGTGGGTATGGGGCTAAACCTTAAATAACCCCGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCAGGCCGGACAGCATCGCCATCCGGCACTGTTTTGAGGCTTATTTCAGCtcat < 5:164095/140‑1 (MQ=255)
tATGTGGTTATGGGTGTACACAATAAATAAACCCGGGGGGTTGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAATAGCGGATTATCTTAATAAGCAGGCCGGACAGCATCGCCATCCGGCACTGTTTTGAGGCTTATTTCAGCtcatc < 2:1086834/140‑1 (MQ=255)
aTGTGGTTATGGGGGTAAACATTAAATAAACCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCAGGCCGGACAGCATCGCCATCCGGCACTGTTTTGAGGCTTATTTCAGCtcat > 3:583071/1‑138 (MQ=255)
aTGTGGTTATGGGGGTAAACATTAAATAAACCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCAGGCCGGACAGCATCGCCATCCGGCACTGTTTTGAGGCTTATTTCAGCtcat > 3:593203/1‑138 (MQ=255)
gggtctGGGGGTAACCCTAAAAACCACCAGCCGGGGCGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCAGGCCGGACAGCATCGCCATCCGGCACTGTTTTGAGGCTTATTTCAGCTCATCAACCa < 2:230293/135‑1 (MQ=255)
ggctagggggcTACACATTAAATAACCCAGCGGGGGAGGGGCGGTACAGTGAAAACATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCAGGCCGGACAGCATCGCCATCCGGCACTGTTTTGAGGCTTATTTCAGCTCATCAACCa < 7:128122/134‑1 (MQ=255)
ggTTATTTGGGTAAACATTAAATATACCATCGTGGGATGGGAGGTAAAGTTAAATAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCAGGCCGGACAGCATCGCCATCCGGCACTGTTTTGAGGCTTATTTCAGCTCATCAAc < 3:846421/138‑1 (MQ=255)
gcgtATGCGGCTAAACACTAAATACACCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCAGGCCGGACAGCATCGCCATCCGGCACTGTTTTGAGGCTTATTTCAGCTCATCTAc < 3:1164995/135‑1 (MQ=255)
gTTATGGGGGTAAACATTAAATAAACCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCAGGCCGGACAGCATCGCCATCCGGCACTGTTTTGAGGCTTATTTCAGCTCATCAACCAt > 6:539166/1‑140 (MQ=255)
gTTATGGGGGTAAACATTAAATAAACCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCAGGCCGGACAGCATCGCCATCCGGCACTGTTTTGAGGCTTATTTCAGCTCATCAACCAt > 1:222609/1‑140 (MQ=255)
ttATGGGGGTAAACATTAAATAAACCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCAGGCCGGACAGCATCGCCATCCGGCACTGTTTTGAGGCTTATTTCAGCTCATCAACAATg > 7:58391/1‑140 (MQ=255)
tATGGGGGTAAACATTAAATAAACCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCAGGCCGGACAGCATCGCCATCCGGCACTGTTTTGAGGCTTATTTCAGCTCATCAACCAt > 4:520568/1‑138 (MQ=255)
aTGGGGGTAAACATTAAATAAACCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCAGGCCGGACAGCATCGCCATCCGGCACTGTTTTGAGGCTTATTTCAGCTCATCAACCATg > 4:1081762/1‑138 (MQ=255)
aTGGGGGTAAACATTAAATAAACCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCAGGCCGGACAGCATCGCCATCCGGCACTGTTTTGAGGCTTATTTCAGCTCATCAACCATGGt > 5:116564/1‑140 (MQ=255)
aTGGGGGTAAACATTAAATAAACCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCAGGCCGGACAGCATCGCCATCCGGCACTGTTTTGAGGCTTATTTCAGCTCATCAACCATGGt > 8:8594/1‑140 (MQ=255)
aTGGGGGTAAACATTAAATAAACCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGAGAATCTTAATAAGCAGGCCGGACAGCCTCGCCATCCGGCACTGGTTTGAGGCTTATTTCAGCTCATCAGCCATggg > 8:810560/1‑139 (MQ=255)
gggcggaaaaCATAAAATACAGCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAATTGCAAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCAGCCCGGACATCATCGCCATCCGGCACTGTTTTGAGGCTTATTTCAGCTCATCAACCATGGTg < 6:592556/133‑1 (MQ=255)
gTAAACATTAAATAAACCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCAGGCCGGACAGCATCGCCATCCGGCACTGTTTTGAGGCTTATTTCAGCTCATCAACCATGGTGATGgc > 7:119699/1‑140 (MQ=255)
ctAAACATTCAATAAACCCGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCAGGCCGGACAGCATCGCCATCCGGCACTGTTTTGAGGCTTATTTCAGCTCATCAACCATGGTGATGgc < 5:621596/139‑1 (MQ=255)
acaaaCATTAAATAACGCAGCGGGGGTGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCAGGCCGGACAGCATCGCCATCCGGCACTGTTTTGAGGCTTATTTCTGCTCATCAACCATGGTGATGgc < 5:1803/138‑1 (MQ=255)
aaaCATTAAATCTACCAGCCGGGGCGGGGATGTAATGTGAAAAAATAAAAAGCGGTTAATCTTAATAAGCAGGCCGGACAGCATCGCCATGCGGCACTGTTTTGAGGCTTATTTCAGCTCATCAACCATGGTGATGgcgc < 8:110489/140‑1 (MQ=255)
aaCATTAAATAAACCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCAGGCCGGACAGCATCGCCATCCGGCACTGTTTTGAGGCTTATTTCAGCTCATCAACCATGGTGATGgcg > 3:818640/1‑138 (MQ=255)
aTTAAATAAACCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCAGGCCGGACAGCATCGCCATCCGGCACTGTTTTGAGGCTTATTTCAGCTCATCAACCATGGTGATGGCGCGa > 3:559891/1‑138 (MQ=255)
taaataaaCCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCAGGCCGGACAGCATCGCCATCCGGCACTGTTTTGAGGCTTATTTCAGCTCATCAACCATGGTGATGGCGCGACCaa > 7:37600/1‑140 (MQ=255)
taaataaaCCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCAGGCCGGACAGCATCGCCATCCGGCACTGTTTTGAGGCTTATTTCAGCTCATCAACCATGGTGATGGCGCGACCaa > 5:756778/1‑140 (MQ=255)
taaataaaCCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCAGGCCGGACAGCATCGCCATCCGGCACTGTTTTGAGGCTTATTTCAGCTCATCAACCATGGTGATGGCGCGACCaa > 1:442087/1‑140 (MQ=255)
taaataaaCCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCAGGCCGGACAGCATCGCCATCCGGCACTGTTTTGAGGCTTATTTCAGCTCATCAACCATGGTGATGGCGAGACCaa > 5:56281/1‑140 (MQ=255)
aCCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCAGGCCGGACAGCATCGCCATCCGGCACTGTTTTGAGGCTTATTTCAGCTCATCACCCATGGTGATGGCGCGACCAATGTAGtt > 1:1073233/1‑140 (MQ=255)
aCCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCAGGCCGGACAGCATCGCCATCCGGCACTGTTTTGAGGCTTATTTCAGCTCATCACCCATGGTGATGGCGCGACCAATGTAGtt > 8:460229/1‑140 (MQ=255)
aCCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCAGGCCGGACAGCATCGCCATCCGGCACTGTTTTGAGGCTTATTTCAGCTCATCAACCATGGTGATGGCGCGACCAATGTAGtt > 6:801926/1‑140 (MQ=255)
aCCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCAGGCCGGACAGCATCGCCATCCGGCACTGTTTTGAGGCTTATTTCAGCTCATCAACCATGGTGATGGCGCGACCAATGTAGtt > 2:62573/1‑140 (MQ=255)
aCCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCAGGCCGGACAGCATCGCCATCCGGCACTGTTTTGAGGCTTATTTCAGCTCATCAACCATGGTGATGGCGCGACCAATGTAGtt > 7:436015/1‑140 (MQ=255)
aCCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCAGGCCGGACAGCATCGCCATCCGGCACTGTTTTGAGGCTTATTTCAGCTCATCAACCATGGTGATGGCGCGACCAATGTAGtt > 6:402640/1‑140 (MQ=255)
aCCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCAGGCCGGACAGCATCGCCATCCGGCACTGTTATGAGGCTTATTTCAGCTCATCACCCATGGTGATGCCGCGACCAAGGTAGtt > 2:71897/1‑140 (MQ=255)
aCCAGCGGGGGAGGCGAGGTAAAGAGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCAGGCCGGCCATCATCGCCATCCGGCACTGTTTTCAGGATTATTTCAGCTCATCAACCATGGTGATGGCGCGACCAATGAAgat > 1:1079733/1‑138 (MQ=255)
|
TCCTGAATCTGAACTTTAAGGTGGTGACGTAACAACGCATTGTCTTCAACAACCAGTACGCGCATTTTTATTTCTCCCTGTCTTAATTATTAAAATAGTGTAACGCGATTATGTGGTTATGGGGGTAAACATTAAATAAACCAGCGGGGGAGGGGAGGTAAAGTGAAAAAATAAAAAGCGGATAATCTTAATAAGCAGGCCGGACAGCATCGCCATCCGGCACTGTTTTGAGGCTTATTTCAGCTCATCAACCATGGTGATGGCGCGACCAATGTAGTT > NZ_CP022686/4780037‑4780315
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
