Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A27 F36 I0 R1
|
164 |
7919.5 |
7665810 |
98.4% |
7543157 |
135.8 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP022686 |
2,148,115 |
T→G |
16.5% |
L126R (CTG→CGG) |
panF → |
sodium/pantothenate symporter |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP022686 | 2,148,115 | 0 | T | G | 16.5%
| 248.3
/ 7.9
| 159 | L126R (CTG→CGG) | panF | sodium/pantothenate symporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (37/89); new base G (29/2); total (67/92) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.13e-11 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 174 total aligned reads displayed.
GCGATGATTCAGCTTCCTGCAGTCTGGCTTTCGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCGTTGTA > NZ_CP022686/2147976‑2148253
|
gCGATGATTCAGCTTCCTGCAGTCTGGCTTTCGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGtggct > 4:583211/1‑140 (MQ=255)
gatgatTCAGCTTCCTGCAGTCTGGCTTTCGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCGTGGGGTGtggcggg > 2:892969/1‑140 (MQ=255)
atTCAGCTTCCTGCAGTCTGGCTTTCGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCgag < 5:808466/140‑1 (MQ=255)
ttCAGCTTCCTGCAGTCTGGCTTTCGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCgagt < 1:151479/140‑1 (MQ=255)
aGCTTCCTGCAGTCTGGCTTTCGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACTAAGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCGTGTGGTGTGGCTGGCgcggttg > 4:114607/1‑140 (MQ=255)
aGCTTCCTGCAGTCTGGCTTTCGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATACTTGCGCGCCGCTACAAAGCGGTGACGCTGCACGAAATGCTGTTTGACCGCTACCAGAGTCGTCTGCTTGGGTGGGTGGCgagtttt > 3:889301/1‑139 (MQ=255)
cTTCCTGCAGTCTGGCTTTCGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCgagtttgag < 1:385844/140‑1 (MQ=255)
ccTGCAGTCTGGCTTTCGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTGTTGGGGTGTGGCGGGGgggtttgggttt > 7:835309/1‑140 (MQ=255)
ttCTGGCTTTCGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGt < 8:196892/139‑1 (MQ=255)
tCTGGCTTTCGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGtt < 2:437328/140‑1 (MQ=255)
tCTGGCTTTCGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTATGGTGTGGCGGGCGCGTTTTAGTTTGGAGGtt > 3:150333/1‑140 (MQ=255)
tGGCTTTCGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGGGGCAGGCGGGTTTGAGTTTTGTGGtttc > 6:454426/1‑138 (MQ=255)
ggCTTTCGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGcg < 3:705226/140‑1 (MQ=255)
cTTTCGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTGGTAGGGTGTGGCTGGGGAGTTTGAGTTTGGTGGTTggggt > 3:1831/1‑136 (MQ=255)
cTTTCGCTCGGTATTCTAGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGcgtt < 3:455875/140‑1 (MQ=255)
cGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGcgttcgtt < 5:156011/140‑1 (MQ=255)
cGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGcgttcgtt < 3:583211/140‑1 (MQ=255)
tATTCTCGGCAAGTAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTTGTGCGa < 3:735779/140‑1 (MQ=255)
tctcGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGa < 1:979314/140‑1 (MQ=255)
gCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTGTTCTGGTGTGGCGGGGGAGTTTGAGTTTTGTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTg > 6:85887/1‑140 (MQ=255)
gCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTg < 3:414259/140‑1 (MQ=255)
gCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTg < 5:912260/140‑1 (MQ=255)
gCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGGTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTg < 2:936288/140‑1 (MQ=255)
gCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCGTCTGGTGTGGGTGGGGAGTTTTTGTTTGCGGGTTGCGGTCGTTGGTGGGCTGACCCTg > 3:827287/1‑140 (MQ=255)
gCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGGTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTg < 4:405729/140‑1 (MQ=255)
aagaagTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCTCTACCAGAGTCGTCTTGTGGTGTTGCTTGGGAGTTTGAGTTTTGTGGTTTGGGTCGTTTGTGAGATGGCCGTGcc > 4:489102/1‑139 (MQ=255)
aagaagTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTGTTCTGGGGTGGGTGGGGAGTTTGAGTTTGCTGGGTGCGTTCGTTGGTGCGCTGACCGTGCa > 8:714034/1‑140 (MQ=255)
aagaagTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCGTCTGGTGTGGCGGGGGCGGTTGAGTTTGGTGGTTGCGTTCGTTGGTGGGGAGACCGTGCa > 7:723664/1‑140 (MQ=255)
gCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACTATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGGCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATcgg < 4:368119/140‑1 (MQ=255)
cgcgcCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGATACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTTAGTTTGCTGGGTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGTCGGTgcgcgc < 8:395404/140‑1 (MQ=255)
ccgcTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTGTGATGGTGTGGATGGCGCATTTGAGTTTGGTGGTTTGGGTCGTTTGTGCGCTGACCGGGCAGTTTATAGGCGGTgcgcggcagg > 6:867616/1‑135 (MQ=255)
ccgcTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTGGTGGGGTGTGGGGGGGGGGGTTGTGTTTGGTGGTGGGGGTGGTTGGTGGGGTGACCGTGCAGTTTTTAGGCGGTGGGCGCcggc > 7:41137/1‑140 (MQ=255)
cgcgACAATGCGGTGACTCTGAACGTTCTGCTGGTTGCCCGCTACCATAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGATTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGAGCGATGACCGTGCAGTGTATCGGCGGTGCGCGCctgct < 1:762335/140‑1 (MQ=255)
cgcTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCGTATGGGGTGGGTGGCGGGGTTGAGGTTGGTGGTGGCGGTGGTTGGTGGGGTGACCCTGGAGTTTATAGGCGGTGCGCGCccgcg > 3:680727/1‑139 (MQ=255)
cAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTGGTGTGGTGTGGGTGGCGAGTTTTTGTTTTGTTGGTGGGGTCGGTTGTGGGAGTACCCTGCCGGTTATAGGCGGGGCGCGCCTGCGGGaaa > 1:696862/1‑140 (MQ=255)
tGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTGGTGTGGTGTGGGGGGGGAGGTTGAGTTTGCTGGTTGCGTGGGTTTGTGGGATGAACGGGCAGTGTATAGGGGGTGCGCGCCGGCTGGTAACcg > 7:288965/1‑140 (MQ=255)
tGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTGGGGTGGTGTTGGTGGGGAGGTTGTGTTTGGTGGTGGGGGTGGTTTGTGGGGTGCCCGTGGAGTTTTTAGGCGGTGGGCGCCGGCTGGAAAccc > 2:642635/1‑139 (MQ=255)
gggTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCTTCTTCTGGTGTGGCTGGCGTGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGGGCGATTACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACcgcg < 4:47838/139‑1 (MQ=255)
cGGTGATGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTGTTGTGGGGGGGGGGGCGAGGTTTAGTTTGCTGGTTGAGTGGGAGTGTGCGATGAAACTGGAGGTTATAGTCGGTGCCGGCCAGCTGGTAAccccc > 4:951025/1‑137 (MQ=255)
cGGTGACGCTGTCCGATTTGCTGTTTGCCGGCTATCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGGTGGCGTGGTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTGGTTGGGGCGTTGTCCGTGCTGTTTTTCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACcgcg < 7:392561/140‑1 (MQ=255)
cGGTGACGCTGACCGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGGCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACcgcg < 6:285592/140‑1 (MQ=255)
cGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTGGTCTGGTGTGGGTGGGGTGTTTGTGTTTGGTGGTTGGGTTCGTTGGTGGGCTTACCGGGCGGTTTTTAGGCGGTGCGCGCCGGCTGGGAAAcgcg > 7:76434/1‑140 (MQ=255)
cGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTGAGTGGTGGGTGGCGAGTTTGATTTTTGTGGTTGGGTTAGTTGGTGCGATGTACGGGAAGTTTATAGGCGGTGTGCGCCAGATGGaacacgac > 8:481202/1‑134 (MQ=255)
cGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTTAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACcgcg < 5:285984/140‑1 (MQ=255)
cGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACcgcg < 5:375520/140‑1 (MQ=255)
cGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACcgcg < 3:840917/140‑1 (MQ=255)
cGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACcgcg < 4:376949/140‑1 (MQ=255)
cGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCGTCTGGTGTGGCGGGCGCGGTTGAGTTTTCTGGTTGCGTTCGTTGGGGGGAGGCACGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGTAACcgcg > 4:910824/1‑140 (MQ=255)
gTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCgcggc < 2:727017/140‑1 (MQ=255)
gTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTATTGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCGGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATAGGCGGTGCGCGCCAGCTGGCAACCgcggc > 7:456606/1‑140 (MQ=255)
gTGACGATGAACGATATGCAGTTTGCCCGCTAACAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTGGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCgcggc < 5:414038/140‑1 (MQ=255)
tGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCGTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGGTTGCGGGTTGCGTTCGTTTGTGGGATTACCCGGCAGTTTATAGGGGGTGCGCCCCGGCTTGAACACgcggcg > 4:845855/1‑140 (MQ=255)
aCGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCggg < 3:659406/140‑1 (MQ=255)
aCGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCGGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGGGTTCGTTGGTGCGATGCCCGTGCAGTTTATAGGCGGGGCGCGCCGGCTGGAAACCCCGGCggg > 2:628736/1‑140 (MQ=255)
aCGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCGGATGGTGTGGGTGGCGAGTAAGAGGTTTCTGGTGTCGTTCGTTGGTGCGAATACCGAGCCGGTTATACGCGGTGCGCGCCCGCTGGAAACCCCGGCggg > 4:233856/1‑140 (MQ=255)
gCTGAACGTTATGCTGTTTGCCCGCTCCCAGAGGCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTGTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTa < 6:560270/140‑1 (MQ=255)
aaCGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCGTCGTGTGTGGGTGGCTAGTTTTAGTTTGCTGGTTTCGTTAGGTTGTGCGTAGAACGGGCACTTTATATGCGGTGGGCGCCGGCTGGAAACCCAGGCGGGTAttac > 8:381547/1‑138 (MQ=255)
tatGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTAAGGTGTGGCGGGGGAGGTTTAGTTTGCTGTTTTTGGTATTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTTAAGGCGGAGCGCCGCAGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTGCtattt > 6:20499/1‑136 (MQ=255)
tatGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCGGCGGGTGGGGCTGGGGAGGTTGAGGTTGGTGGTTGCGGTCGTTGGTGGGGTGCCCGGGGAGTTTTTAGGCGGTGCGCGCCGGCTGGAAACCCCGGCGGGTGttagatttt > 8:355907/1‑133 (MQ=255)
tttGCCCGCTACCAGAGTCGTGTTGTGGTGTGGGTGGGGAGTTTGTGTTTTGTGGTTGGGTTCGTTGGTGGGATGTGCGGGCAGTTTATAGGGGGGGCGCGCCGGCTGGTAAACGCCGCGGGGTTTTCTTTTTAAACCgg > 2:493868/1‑140 (MQ=255)
tttGCCCGCTACCAGAGTCGTGGTCAGGTGTGGGGGGCGAGTTTTAGTTTGCAGGTTGCGTTGGTTTGGGAGAGGAACGTGCAGTTTATAGGCGGGGCGCGCCTGGAGGTACCAGCCGCCGGTATTACCTGAGAAAcccg > 4:734400/1‑138 (MQ=255)
tttGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTGTGGTGTGGCGGGCGAGTTTGAGTTTGGTGGTTGCGGTAGTTGGTGGGCTGGCCCGGCAGTTTTTAGGCGGTGCGCCCCGGCTGGAAACCGCGGCGGGGATTACTTATGaactgta > 8:246826/1‑135 (MQ=255)
tttGCCCGCTACCAGAGTCGTCGTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGGTGGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCCGTGCGCGCCAGCTGGCAACCGCGGCGGGTATTACTTTTTAAACCgg > 2:783534/1‑140 (MQ=255)
tGCCCGCTACCAGAGTCGTGGTCTGGTGTGGGTGGCGAGTTTGATGTTGGTTGTTGCGGTGGTTGGTGGGATGACCCTGGAGGTTATCGGCGGGGCGCGCCGGCGGGAAACCGCGGCGGGGGTTGCATATGCAAACgggg > 2:99682/1‑139 (MQ=255)
cAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTCTCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGAtttt < 8:276717/140‑1 (MQ=255)
gtcgtcTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGt < 4:644601/140‑1 (MQ=255)
cgtcTTCTGGTGTGGCTGGCTAGTTTGTGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTAt < 3:318357/140‑1 (MQ=255)
cgtcTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTAt < 1:493868/140‑1 (MQ=255)
cgtcTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTAt < 1:736629/140‑1 (MQ=255)
cgtcTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTGGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTAt < 6:591971/140‑1 (MQ=255)
gtgttatGGTGTGGCTGGCGAGTTTTATTTTGCTGGTTGCGGTCGTTGGTGCGATTACCGAGCAGTTTATAGGCGGTGGGCGCCTGCTGGAAAACGCGGCGGGGTTTCATTATGTAACCCGGCTGCGGATTTTAGGTAta > 2:341834/7‑139 (MQ=255)
gtcgtcTGGTGTGGCGGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTGGTTGGTGCGATGACCCTGGAGTTTATAGGCGGTGCGCGCCTGCTGGTAACCCCGGCGGGTATTGAGTATGAAAACAGGCTGAGGATTTTAGGTAta > 6:741475/1‑139 (MQ=255)
tctGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCa < 1:249485/140‑1 (MQ=255)
tctGGTGTGGCTGGCGAGGTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCa < 5:614882/140‑1 (MQ=255)
tctGGTGTGGCGGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTGCGTGGGTGCTATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCa < 7:29336/140‑1 (MQ=255)
tctGGTGTGGCGGGCGAGGTTGAGTGTGCTGGGTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGGGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCa < 1:768369/140‑1 (MQ=255)
tGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCAtt < 1:111851/140‑1 (MQ=255)
tGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCAtt < 2:962168/140‑1 (MQ=255)
tGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCAtt < 2:840339/140‑1 (MQ=255)
tGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCAtt < 2:696691/140‑1 (MQ=255)
gcgtgtGGCTGGCGAGTTTGAGTGTGCGGGTAGCGCTCGTTGGTGCGAGGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGGATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATGTTCGGTATCAGCAtt < 5:703397/138‑1 (MQ=255)
ggTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGTAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGTCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTg < 5:81213/140‑1 (MQ=255)
tgtgTCAGGCTAGGTTGAGTTTGCTGGTGGCGTTCGTTGGCGCGATGACTGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCg < 8:578864/140‑1 (MQ=255)
tgtgGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCg < 4:285875/140‑1 (MQ=255)
tgtgGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGGTGCGTTCGGTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCg < 6:916448/140‑1 (MQ=255)
tgtgGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCGGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCg < 2:279881/140‑1 (MQ=255)
ggtgGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCg < 3:768625/139‑1 (MQ=255)
ggtgGCTGGCGAGTTGGAGTTTGCTGGCTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCGGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCg < 7:622396/139‑1 (MQ=255)
ggtgGCTGGCGAGGATGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGGTGGTGCGATGCCCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCg < 3:176038/139‑1 (MQ=255)
gtgGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCGt < 7:170569/140‑1 (MQ=255)
gtgGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCGt < 5:734294/140‑1 (MQ=255)
gtgGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGGGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCGt < 7:890852/140‑1 (MQ=255)
gtgGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGGTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCGt < 1:956764/140‑1 (MQ=255)
gtgGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGGTGCGTTCGTTGCTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCGt < 7:487292/140‑1 (MQ=255)
gtgGCTGGCGAGTTTGAGGTTGCTGGTTGCGGTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGGGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCGt < 1:97063/140‑1 (MQ=255)
tggctggcGAGTTTGAGTTTGCTGGTTTCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCGtt > 3:481279/1‑140 (MQ=255)
tggctggcGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTCGAAACCGCGGCGGGTATTCCATATGAAACCGGCCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCGtt > 2:416695/1‑140 (MQ=255)
tggctggcGAGTTTGAGCTTGCTGGTCGCGGTCGTTGGTGCGCTGACCGTGCAGCTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCGtt < 6:358292/140‑1 (MQ=255)
gctggcGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCGTTGt > 2:599955/1‑140 (MQ=255)
ctggcGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGAGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCGTTGta > 1:28078/1‑140 (MQ=255)
|
GCGATGATTCAGCTTCCTGCAGTCTGGCTTTCGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCGTTGTA > NZ_CP022686/2147976‑2148253
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
