Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A28 F11 I0 R1
|
246 |
10296.8 |
9866480 |
98.4% |
9708616 |
135.7 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP022686 |
2,148,115 |
T→G |
11.3% |
L126R (CTG→CGG) |
panF → |
sodium/pantothenate symporter |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP022686 | 2,148,115 | 0 | T | G | 11.3%
| 350.1
/ 4.1
| 195 | L126R (CTG→CGG) | panF | sodium/pantothenate symporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (37/128); new base G (21/7); total (59/136) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.23e-07 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 217 total aligned reads displayed.
GCGATGATTCAGCTTCCTGCAGTCTGGCTTTCGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGG‑AAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCGTTGTA > NZ_CP022686/2147976‑2148253
|
gatgatTCAGCTTCCTGCAGTCTGGCTTTCGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGtggct > 5:316327/1‑138 (MQ=255)
tgatTCAGCTTCCTGCAGTCTGGCTTTCGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGtggctgg > 6:18833/1‑138 (MQ=255)
tCAGCTTCCTGCAGTCTGGCTTTCGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCgagtt < 3:1073937/140‑1 (MQ=255)
tCCTGCAGTCTGGCTTTCGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTGATCGGGTGTGGCGGGCgagtttgat > 5:490441/1‑137 (MQ=255)
tGCAGTCTGGCTTTCGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGGGagtttgagtttgg > 4:171525/1‑139 (MQ=255)
tGCAGTCTGGCTTTCGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTATGGTGTGGCTGGGgcgtttgtgttttg > 4:605659/1‑138 (MQ=255)
tGCAGTCTGGCTTTCGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTATGGTGTGGCGGGCGagtttgtgtttgg > 4:689420/1‑139 (MQ=255)
tGCAGTCTGGCTTTCGCTCGGTATTCTCGGAAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTGTTCTGGTGTGGCTGGCgaggttgaggtttg > 2:58777/1‑138 (MQ=255)
tCTGGCTTTCGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCGTGTGGTTTGGGTGGCGAGTTTGATTTTTGTGGtt > 2:377333/1‑140 (MQ=255)
ggCTTTCGCTCGGTATTCTCGGCATGACGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTTAGTTTGCTGGTTg < 5:588738/138‑1 (MQ=255)
tCGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCGTCTGGTTGGGCTGGCGAGTTTGTGGTTGCTGGTTGcgttcgt > 2:168549/1‑140 (MQ=255)
cGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGcgttcgtt < 8:687629/140‑1 (MQ=255)
cGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGcgttcgtt < 2:287564/140‑1 (MQ=255)
cGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGcgttcgtt < 1:617377/140‑1 (MQ=255)
cGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGcgttcg < 5:1156572/138‑1 (MQ=255)
gCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCTCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCGTCTGGAGTGGCAGGCGCGTTTGAGTATTATGGTTGggttggttt > 4:1153406/1‑139 (MQ=255)
cTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTGGTGTGGTGTGGGTGGCGAGGGTGAGGTTGGTGGTTGcggtcctt > 6:1089356/1‑138 (MQ=255)
ggTATTGTCGGCAATAAGTTCGGAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGATCGATATGCTGTTTGCCCGCTACTAGAGTGGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCTTTTGTGc < 3:1199487/140‑1 (MQ=255)
tATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGc < 5:157031/138‑1 (MQ=255)
tctcGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGa < 2:1049319/140‑1 (MQ=255)
gCAAGATGTTCGCTATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGATTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTg < 7:727763/140‑1 (MQ=255)
gCAAGAAGTTCGCACTTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTg < 2:1271799/140‑1 (MQ=255)
gCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCg < 6:846535/138‑1 (MQ=255)
gCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTg < 2:746732/140‑1 (MQ=255)
gCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTg < 4:396572/140‑1 (MQ=255)
gCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTg < 1:1034121/140‑1 (MQ=255)
gCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTg < 7:374096/140‑1 (MQ=255)
gCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTg < 1:195558/140‑1 (MQ=255)
gCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGGTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTg < 2:1122926/140‑1 (MQ=255)
gCAAGAAGTGCGCAATTCTTGCGCGCAGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTg < 8:576432/140‑1 (MQ=255)
agaagTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAg < 3:970105/140‑1 (MQ=255)
gaagTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTGTTCTGGGGTGGCTGGGGCGTTTGAGTTTGCTGGTTGGGTTCGTTGGTGGGATGACCGTGCAGt > 4:1209926/1‑140 (MQ=255)
aagTTCGCAATTCTTGCGCTCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGtt < 7:16244/140‑1 (MQ=255)
gTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGCCCGTGCAGtttt > 3:273211/1‑139 (MQ=255)
gTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGACCGCTACCAGAGTCGTGTTCTGGTGTGGGTGGGGAGTATGTTTTTTGGGGTTTCGTTGGTTGGTTCGATGAGCCGGCAGtttt > 3:587793/1‑139 (MQ=255)
gCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGTTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGGCTTCTGTTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTTCGTTCGTTGGTGCGATGACGGTGCAGTTTATc < 6:961449/138‑1 (MQ=255)
gCAAATCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATc < 6:69814/138‑1 (MQ=255)
tGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCAGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTAGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTCTCGGCGGTgcgc < 8:553287/140‑1 (MQ=255)
cgcTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCGGGCGAGTTTGAGTTTGCGGGTTGCGTTCGTTGGTGCGCTGACCGTGCAGTTTATAGGGGGTGCGCGCctgcg > 2:257829/1‑139 (MQ=255)
cGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTGGTCTGGGGTGGCGGGCGAGTTTGAGTTTGGTGGGTTCGTTAGTTGGTGCGATGTCCGTGCAGTTTATAGGCGGTGCGCGCAGGCTGG‑AAACcgcg > 4:1163678/1‑140 (MQ=255)
cGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTGGTATGGTGGGGCTTGCGAGTTTTGGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCCTGCAGTTTATAGGGGGTGCGCGCCTGCTGG‑AATCcgcg > 8:356583/1‑140 (MQ=255)
cGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTGTGGGGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGGTGGTTGGGGTGGTTGGTTCGATGAACCTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCAGCGGG‑AAAAcgcg > 7:1151222/1‑140 (MQ=255)
cGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGG‑AAACcgcg < 4:512428/140‑1 (MQ=255)
cGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGG‑AAACcgcg < 1:1184922/140‑1 (MQ=255)
cGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGG‑AAACcgcg < 2:468817/140‑1 (MQ=255)
cGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGG‑AAACcg < 5:271844/138‑1 (MQ=255)
gTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCGTCTGGGGTGGGGGGGGCGTTTGTGTTTTGGGGTTGGGGTCGGTTGGGGGATGGGCGGGGAGTTTTTAGGCGGGGCGCGCCGGCTGG‑AAACCccggg > 1:432319/1‑139 (MQ=255)
gACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCGTCTGGGGTGGCTGGGGAGTTTGCGTTTTGTTGTTGGGTTCGTTGGTGCGAGTAACGTTCAGTTTTTAGGAGGTGCGCGCCGGGAGG‑AAACAgaggc > 6:419827/1‑138 (MQ=255)
aCGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCGTATGGTGTGGGGGGGGAGGTTGAGTTTGGTGGTTGGGTTAGGTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCGGCTGG‑AAAACccggcg > 6:768573/1‑138 (MQ=255)
aCGCTGAACGATATGCGGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGGCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTGTGAGGTTGCTGGTGGCGTTCGTTTGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGG‑AAACCgcggcg < 6:904534/138‑1 (MQ=255)
gCTGAACGATATGCTGATTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCGGGGTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGG‑AAACCGCGGCGGGTa < 4:521289/140‑1 (MQ=255)
tGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTAACAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGGTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGG‑AAACCGCGGCGGGTa < 5:1089356/138‑1 (MQ=255)
aaCGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCGTCGTGTGTTGGGGGCGCGGTTTAGTTTTGTGGGTGCGGTCGTTGGTGGGCTGACCGTGCAAGTTATCGGCGGTGCGCCCCGGCTGGAAAACCCCGGCgggggtcc > 2:837744/1‑135 (MQ=255)
aaCGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCGTATGGTGTGGGTGGCGAGTTTTTGTTTGGTGGTTGGGTTGGTTGGTGGGATGACCGTGCAGGTTATAGGCGGTGCGCGCCTGCGGG‑GAAACCCCGCGGGTAttac > 4:1064688/1‑138 (MQ=255)
gATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGG‑AAACCGCGGCGGGTATTCCTTa < 2:239162/140‑1 (MQ=255)
tatGCTGTTTGACCGCTACCAGAGTCGTCGTATGGTGTTGGTGGCGAGTTTGAGTTTGGTGGTTTCGGTCGTTTGTGCGATGACCGTGCAGTTTATATGCGGGGCGCGCCTGCTGT‑AAAACGCGGCGGGTATTCCGTAtt > 8:349834/1‑139 (MQ=255)
gCTGTTTGCCCGCTACCAGCGTCGTCTTCTGGGGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTGGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGTCGGTGCGCGCCTGCTGG‑AAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGaaa < 2:1211575/140‑1 (MQ=255)
tGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCGGGTGGTGGGGGGGGCGAGTTTGAGGTTGCTGGGTGGGTTAGTTGGTGCGGTGGCCGTGCAGTTTTTCGGCGGTGCGCGCCGGCTGG‑AAACCGCGGCGGGGTTTCCTTATGaaaac > 2:1194317/1‑138 (MQ=255)
ttGCCCGCTACCAGAGTCGTGGTGTGGTGGTGCGTGCGGGTTTGGGTTTGGTGGGTTGGGTCGTTGGTGGGGTGACAGTGCAGTTTATCGGGGGTGCGCGCCAGCAGG‑AAACACCGGCGGGTAGTGATTATTaaaaaggg > 8:82653/1‑135 (MQ=255)
ttGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGGTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGG‑AAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCggg < 1:1013956/140‑1 (MQ=255)
tGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTTAGTTTGCTGGTTGCGGTCGTTGGGGCGATGACCGTGCAGTTTATAGGCGGTGCGCGCCGGCGGG‑AAACCGCGGCGGGTATTACGTATGAAACCGGgc > 8:171321/1‑140 (MQ=255)
gCCCGCTA‑CAGAGTCGTAGTATGGTGTGGCTTGGGAGTTTTATGTTTCTAGTTGCGTTCGTTGGTGCGAGTACCGTGGCGTGTATAGTCGGTGCGCGCCAGCTGG‑AAACCACGGCGGGGTGTACTTATGAGAGCgggggg > 4:98897/1‑137 (MQ=255)
cTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGG‑AAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGa < 2:944843/140‑1 (MQ=255)
aCCAGAGTCGTGGTGGGGGGTGGGGGGCGAGTTTGAGGTTGGTGGGTGGGTTGGGTGGTGCGATGGCCGGGGAGGTTATAGGCGGTGCGCGCCTGCTGG‑AAACCGCGGCGGGGATTGCTTATTTAACCGGgctgcggt > 6:236014/1‑135 (MQ=255)
ccAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTGCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGG‑AAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGAttt < 8:1015251/140‑1 (MQ=255)
cAGAGTCGCCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTGTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGCGCGCTGACCGTGCACTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGG‑AAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAACCCGGGCGGCTGAtttt < 4:299456/140‑1 (MQ=255)
cgtcTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACAGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGG‑AAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTAt < 2:527445/140‑1 (MQ=255)
cgtcTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTATGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGG‑AAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTAt < 2:411611/140‑1 (MQ=255)
tctGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGG‑AAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCa < 7:1165612/140‑1 (MQ=255)
tctGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGG‑AAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCa < 3:512499/140‑1 (MQ=255)
tctGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTAGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGG‑AAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCa < 7:291742/140‑1 (MQ=255)
tctGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGGTCGTTGGGGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGG‑AAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAg < 5:903849/138‑1 (MQ=255)
tctGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGGTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGG‑AAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCa < 3:944755/140‑1 (MQ=255)
tctGGTGTGGCTGGCGAGTTGGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGG‑AAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAg < 5:744735/138‑1 (MQ=255)
tctGGTGGGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGG‑AAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCa < 1:837744/140‑1 (MQ=255)
tctGGTGGGGCGGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGGTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGT‑AAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAg < 6:375122/138‑1 (MQ=255)
ctGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGG‑AAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCAt < 3:1029564/140‑1 (MQ=255)
tGGTGTGGCTGGCGAGTTTTAGTTTGCTGGTTGCGGTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGG‑AAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCAtt < 3:774934/140‑1 (MQ=255)
tGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTTGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGG‑AAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCAtt < 7:82653/140‑1 (MQ=255)
tGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGG‑AAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCa < 6:491605/138‑1 (MQ=255)
tGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGG‑AAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCAtt < 3:681026/140‑1 (MQ=255)
tGGTGTGGCTGGCGAGTGTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGG‑AAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGACACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCAtt < 8:61364/140‑1 (MQ=255)
tGGTGTGGCGGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGG‑AAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCAtt < 1:265748/140‑1 (MQ=255)
tGGTGTGGCGGGCGAGTTTGAGATTGCTGGTTGCTTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCATGCTGG‑AAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCAtt < 4:870145/140‑1 (MQ=255)
tGGGGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGG‑AAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCa < 6:733670/138‑1 (MQ=255)
gtgtGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTTCTTTCGTTTGTTCGATTACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGG‑AAACCGCGGCGGGTATTACTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATAAGCATTGc > 1:728677/1‑140 (MQ=255)
tgtgGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGG‑AAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCg < 1:644877/140‑1 (MQ=255)
tgtgGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGG‑AAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCg < 2:42179/140‑1 (MQ=255)
tgtgGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGG‑AAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCg < 4:1081098/140‑1 (MQ=255)
tgtgGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGAGCAGTTTATCGGCGGGGCGCGCCTGCTGG‑AAACCGCGGCGGGTATTCATTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCg < 7:596815/140‑1 (MQ=255)
ggtgGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGG‑AAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGca < 1:540960/139‑2 (MQ=255)
gtgGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGG‑AAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCGt < 8:250102/140‑1 (MQ=255)
gtgGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTGCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGG‑AAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCGt < 1:697546/140‑1 (MQ=255)
tggctggcGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGG‑AAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCGtt > 8:89006/1‑140 (MQ=255)
tggctggcGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGG‑AAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCGtt < 8:409678/140‑1 (MQ=255)
gctggcGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGG‑AAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTAt < 1:138576/126‑1 (MQ=255)
gctggcGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGG‑AAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCGtt > 5:805027/1‑138 (MQ=255)
ctggcGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCATGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGG‑AAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCGTTGta < 1:930606/140‑1 (MQ=255)
tggcGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGG‑AAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGt > 5:260937/1‑122 (MQ=255)
tggcGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGG‑AAACCGCGGCGGGTATTCCATATGAAACCGGGCTGCTGATATTCGGTATCAGCATTGCGTTGt > 5:965617/1‑138 (MQ=255)
|
GCGATGATTCAGCTTCCTGCAGTCTGGCTTTCGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGG‑AAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCGTTGTA > NZ_CP022686/2147976‑2148253
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
