Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A30 F12 I0 R1
|
192 |
11691.1 |
8856334 |
98.4% |
8714632 |
135.4 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP022686 |
2,148,115 |
T→G |
14.8% |
L126R (CTG→CGG) |
panF → |
sodium/pantothenate symporter |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP022686 | 2,148,115 | 0 | T | G | 14.8%
| 261.6
/ 9.1
| 163 | L126R (CTG→CGG) | panF | sodium/pantothenate symporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (35/98); new base G (23/6); total (59/104) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.56e-07 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 179 total aligned reads displayed.
GATGATTCAGCTTCCTGCAGTCTGGCTTTCGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCGTTGT > NZ_CP022686/2147978‑2148252
|
gatgatTCAGCTTCCTGCAGTCTGTCTTTCGATAGGTATTCTAGTCAAATAATTAGCAATTATTGCGCGCCGCATCAATACGGTTACGCTGAACGATAATCTGTTTGCAAGCTACCAGAGTAGTGGTCTGGGGttgct > 2:649512/1‑138 (MQ=255)
atgatTCAGCTTCCTGCAGGCTGGCTTTCGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGtggctg < 2:463314/138‑1 (MQ=255)
gatTCAGCTTCCTGCAGTCTGGCTTTCGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGGgtgggtggggt > 6:273182/1‑137 (MQ=255)
atTCAGCTTCCTGCAGTCTGGCTTTCGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTATGGTGTGGCTGGCgag > 8:610972/1‑140 (MQ=255)
aGCTTCCTGCAGTCTGGCTTTCGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCGTCTGGTGTGGGGGGCgaggttg > 6:608997/1‑140 (MQ=255)
aGCTTCCTGCAGTCTGGCTTTCGCTCGGTATGCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCgagtttg < 7:235447/140‑1 (MQ=255)
cTTCCTGCAGTCTGGCTTTCGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACACTGCGGTGACGCGGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCGTCTGGTGTGGCGGGGgaggttgat > 6:670838/1‑139 (MQ=255)
cTTCCTGCAGTCTGGCTTTCGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTAGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTTGCTGGGgagtttg > 2:468310/1‑138 (MQ=255)
cTTCCTGCAGTCTGGCGTTCGCTCGGTATTCTCTGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCgagtttg < 1:909316/138‑1 (MQ=255)
accTGCAGTCTGGCTTTCGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGAGACTCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCGACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCgagtttgag < 4:788911/137‑1 (MQ=255)
cTGCAGTCTGGCTTTCGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTGTGCTGGGTGGGCGGGGgagtttgagtttt > 8:247379/1‑139 (MQ=255)
cTGCAGTCTGGCTTTCGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCgagtttgagtt < 4:283473/138‑1 (MQ=255)
cTGCAGTCTGGCTTTAGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCTCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCGTGTGGTGTGGCTGGCgatttttagtttt > 6:1084529/1‑139 (MQ=255)
cTGCAGGCTGGCTTTCGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACACTGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGagtttgagtttg < 5:167167/140‑1 (MQ=255)
cAGTCTGGCTTTCGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCGTGTGGTGTGGCGGGGGagtttgagtttgg > 3:221165/1‑137 (MQ=255)
aGTCTGGCTTTCGCTCGGTATTCTCGGCAATAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGACCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGAGAGTTTGAGTTTGCTgg < 7:344863/140‑1 (MQ=255)
tCTGGCTTTCGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGATGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGtt < 8:1002050/140‑1 (MQ=255)
tGGCTTTCGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTGTGGGTGGGGTGGCGCGGTTGAGTTTGGTGGTTgg > 8:30117/1‑139 (MQ=255)
tGGCTTTCGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGtt < 3:580825/138‑1 (MQ=255)
gCTTTCGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTGTTCTGGTGTGGCGGGCGAGTTTTAGTTTGCTGGGTgg > 3:433818/1‑137 (MQ=255)
gCTTTCGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTGTGGTGGGGGGGGCGTGTTTGAGTTTGGTGGTTgg > 2:883869/1‑137 (MQ=255)
gCTTTCGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGGCGTGTGGGGTGGGTGGGGTGTTTTTGTTTTGTGGTTgg > 3:231668/1‑137 (MQ=255)
cGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCTGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGcgttcg < 1:222286/138‑1 (MQ=255)
cGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGcgttcgtt < 7:479567/140‑1 (MQ=255)
cGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGcgttcg < 2:191920/138‑1 (MQ=255)
tCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCGTCGGGGGGTGGGGGCGGGTTTGAGTTTGGTGGGTGGGGTGGTTg > 1:1131939/1‑138 (MQ=255)
ggTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTGGTCGGGTGTGGGGGGGGGGGTTTTGTTTTGTGGTTGCGGTAGTTGGTgg > 7:489525/1‑139 (MQ=255)
tATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGc < 4:1101340/138‑1 (MQ=255)
tATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGc < 4:937010/138‑1 (MQ=255)
ttCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCGTCGTGTGTGTCTGGGGCGTTTGTGTTTGGAGGGTGGGGTCGGGGGTGCgg > 1:687426/1‑137 (MQ=255)
tcAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATTCGGTGACGCTGTACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCATAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTTAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGTTGCGATGACCg < 1:94033/137‑1 (MQ=255)
gCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTGTGGTGGTGCTGGCGAGTTTGAGGTTGCTGGTTGCGTTGGTTGGTGCGTTGGCCGTg > 6:381077/1‑140 (MQ=255)
gCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCg < 2:977920/138‑1 (MQ=255)
gCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCg < 2:410366/138‑1 (MQ=255)
gCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTg < 6:1034893/140‑1 (MQ=255)
gCAAGAAGTGCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGGTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTg < 7:110210/140‑1 (MQ=255)
aagaagTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTGGTCTGGTGTGGCTGGGGAGATTGAGTTTGAGGGTTGGGTTGGTTTGTGCGATGGCCGTg > 1:107271/1‑138 (MQ=255)
gaagTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTGGGGGGGTGTGGGGGGGGAGTTTGTGTTTGGTGGTTGGGGTGGTTGGGGGGGTGTCCGTggc > 3:942860/1‑136 (MQ=255)
gaagTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCGTCTGGTGTGGGGGGCGAGTTTGAGTTTGGTGGTTGGGTTAGGTGGGGCGCTGACCGTggc > 4:304234/1‑136 (MQ=255)
gCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATcgg < 8:709609/140‑1 (MQ=255)
ccgcTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCAGGTGTGGGTGGCGCTTTTGAGTTTGGTGGTTTCGTTAGTTGGTGCGATGACCGTGCAGGTTTTAGGCGGTgcgacccagc > 6:882167/1‑133 (MQ=255)
gcTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTGGTGTGGGGTGGGTGGGGCGTTTGAGTTTGGTGGTTGGGGTGGTTGGTGCGGTGGCCGTGCAGTTTTTCGGCGGGGCGCGCcggc > 2:215044/1‑138 (MQ=255)
gcTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGGGGCTGGGGAGTTTGAGTTTGGGGGTTGCGGTAGTTGGTGCGATGACCGTGCAGGTTTTCGGCGGTGCGCGCcggc > 4:470907/1‑138 (MQ=255)
tGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCGTCGGGGGTGGCCGGCGAGTTTGTGTTTGGTGGTTGCGTGCGTTGGGGCGATGGCCGGGGAGTTTATAGGCGGGGCGCGCCGGCTGGAAACcg > 7:818223/1‑140 (MQ=255)
gCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACcgc < 5:829664/140‑1 (MQ=255)
cGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGCTGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACcgcg < 6:4643/140‑1 (MQ=255)
cGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACcg < 1:422302/138‑1 (MQ=255)
cGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGGGGGTGGCGAGTTTTGGTTTGGTGGGTGGGGTGGTTGGTGGGATGTCCGGGGCGTTTTTAGGGGGTGCGCGCCGGCTGGAAACcccg > 8:816095/1‑140 (MQ=255)
gACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCATCGGGGGTGGCGGGCGACTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGAACGTGCAGTATATCGGCGGTGCGCGCCTGCAGGAAACcgccgc > 4:699718/1‑138 (MQ=255)
aCGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCggg < 6:1077718/140‑1 (MQ=255)
cGCTGAACGATATGCTGGTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGcggcgg < 1:303478/138‑1 (MQ=255)
gCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCGGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTa < 6:206523/140‑1 (MQ=255)
cTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTGTTGTGGTTTGGGTGGCGAGTTTTTTTTTGCTTGTTGCGTTAGTTGTTGGGATGACAGTTGAGTTTTTCGGAGGTTCGCGACTGCTGGAAAACgcggggtgt > 4:437407/1‑133 (MQ=255)
cagaCGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGGCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTAtt < 5:592892/137‑1 (MQ=255)
cGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTGTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGATGTTTCTGGTTTCGTTCGTTGGTGCGATTACCGTGCAGTTTATAGGCGGTGCGCGCCTGCGGGAAACCGCGGCCGGGAttac > 2:247476/1‑136 (MQ=255)
tatGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTGTTGTGGGGTGGCGGGCGAGGTTGTGTTTGGTGGTTGCGGTGGGTGGTGCGGTGACCGTGCAGTTTTTAGGCGGGGCGCGCCGGCTGGAAACCCCGGCGGGTATTACTTAtt > 8:33899/1‑139 (MQ=255)
gCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGa < 1:317267/138‑1 (MQ=255)
gCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCGTGTGGTGTGGGTGGGGAGTTTGTGTTTGCTGGGTGCGTTGGTTTGGGCGGTGACCCTGGAGTTTATAGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCCCGGCGGGGTTTACTTAtta > 2:300880/1‑136 (MQ=255)
tGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGaaa < 1:45168/138‑1 (MQ=255)
tttGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGGGGGCGAGTTTTTGTTTTCTGGTTGCGTTGGGTGGTGGGTTGTCCGTGCAGGTTTTAGGCGGTGCGGGCCGGGTGGTAACCGCGGCGGGTATTGCTTTTGTAAccag > 6:592892/1‑138 (MQ=255)
tGCCCGCTACCAGAGTCGTGATGTGGTGTGGCTGGCGGTTTTGTGTTTGGTGGGTTAGTTGGTTTGGGGGATGAACGTGAAGTTTTTAGGGAGTTCTCGCCTGGAGGTTACCGGCGCGGGGATTGCTGATGAACCCgg > 2:538461/1‑138 (MQ=255)
cccGCTACCAGAGTCTTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGGTGCGTGCGTTGGTGAGTTGAGCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCATGCTGGAATCCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGgc < 2:185920/138‑1 (MQ=255)
ccAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGAttt < 5:266623/140‑1 (MQ=255)
ccgagTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTGGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGAtttt < 7:62940/138‑1 (MQ=255)
agagTCGTCTTGTGGTGTGGCTGGCGTGTTTGAGTTTGCTGGTTGCTTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGGGGCGGGTATTCCTTATGAAACCTGGCTGCTGATTTTc < 7:1054198/140‑1 (MQ=255)
agagTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGAttt < 3:615484/138‑1 (MQ=255)
gtcgtcTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGt < 8:489525/140‑1 (MQ=255)
tcgtcTTATGGTGTGGGTGGGGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGGGGTAGTTGGTGGGATGGCCCTGCAGGTTATAGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCCGCGGGTATTACTTATGTAAACGGGCTGCTGATTTTAGGtt > 6:122970/1‑139 (MQ=255)
ggtcgtcTGGTGTGGCTGGCGAGGTTGAGTTTGAGGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACAGTGCAGTTTCTCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTAt < 7:509602/139‑1 (MQ=255)
ggtcTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGGTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGt < 1:619924/137‑1 (MQ=255)
cgtcTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGGGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCggg < 1:343690/138‑2 (MQ=255)
cgtcTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTGGCTGGTTGCGGTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTAt < 5:329685/140‑1 (MQ=255)
cgtcTACTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGt < 2:741073/138‑1 (MQ=255)
gtcgtcTTGTGTGGCGGGCGAGGTTTAGTTTGCTGGTTGCGTTAGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATAGGCGGTGCGCCCCGGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTACTTATGAAAACCGGCTGCTGATTTTAGGTAta > 6:1058919/1‑139 (MQ=255)
tcttctGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCa < 5:669762/140‑1 (MQ=255)
gttgtGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGTTGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTAATCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAg < 5:827678/136‑1 (MQ=255)
cttctGGTGTGGGGGGCGAGGTTGAGTTTTCGGGTTGCGTTCGTTGGTGCGTTGACCCGGCAGTTTATACGCCGTGCGCTCCTGCGGGTAACCGCCGGGGGTCATACATTTGAAAACCGGCAGCTGATTTTCGGTAtg > 2:854320/1‑137 (MQ=255)
tctGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAg < 1:354579/138‑1 (MQ=255)
tctGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAg < 3:1100979/138‑1 (MQ=255)
tctGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCa < 8:798570/140‑1 (MQ=255)
tctGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGGGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCa < 8:618714/140‑1 (MQ=255)
tctGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGGTTGCTGGTTGCGTTCGGTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGGGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCGGCTGATTTTCGGTATCAGCa < 6:75067/140‑1 (MQ=255)
tggtggGGCTGGCGAGTTTGACGTTGCTGGGTGCGGTCGTTGGTGCGAGGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCGGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTAAGAATCCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCa < 2:1130029/138‑1 (MQ=255)
tggtggGGCTGGCGAGTATGTCTTTGCTGGTTGCGTTCGTTTGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCTGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCAtt < 8:372237/140‑1 (MQ=255)
tGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTTCTGGTTGCGTTAGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCAGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCAtt > 6:704751/1‑140 (MQ=255)
tGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCa < 4:699099/138‑1 (MQ=255)
tGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCAtt < 6:383151/140‑1 (MQ=255)
tGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGGGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCa < 4:1089729/138‑1 (MQ=255)
tGGTGTGGCGGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGGTCGTGGGTGCGATGACCGTGCCGTTTAGCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCTGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCa < 4:993922/138‑1 (MQ=255)
tgtgGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTg < 1:198285/138‑1 (MQ=255)
tgtgGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGCTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCg < 7:530815/140‑1 (MQ=255)
ggtgGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGTGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCg < 8:165990/139‑1 (MQ=255)
ggtgGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCg < 7:828981/139‑1 (MQ=255)
gttgctgggGAGTTTGAGTTTGCTTGGTGCGTTGGTTGGGGCGCTGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTTGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAATCCGTGCAGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGc < 3:897955/135‑1 (MQ=255)
tggctggcGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCGtt > 6:930462/1‑140 (MQ=255)
gctggcGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCGtt > 1:400677/1‑138 (MQ=255)
gctggcGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCGt > 8:405955/1‑137 (MQ=255)
gctggcGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACAGTGCAGTTTATCGGCGGTGATCGACTGCTGGAAAACGCGGCGTGTATTACTTATTAAACAGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCGtt > 4:461013/1‑138 (MQ=255)
tggcGATTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCTTGCAGTTTATCGGCGGTGAGCTCCTGCTTGAAACCGCGGCGGGTATTACTTATGAAACCGAGCTGCTGATTTTCGGAATCAGCATTGAGATGt > 4:237063/1‑138 (MQ=255)
tggcGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATc < 1:714217/56‑1 (MQ=255)
|
GATGATTCAGCTTCCTGCAGTCTGGCTTTCGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCGTTGT > NZ_CP022686/2147978‑2148252
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
