Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F309 I0 R1
|
1697 |
197.2 |
6627756 |
95.7% |
6342762 |
147.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
235,019 |
C→A |
30.0% |
V69L (GTA→TTA) |
ykfM ← |
lethality reduction protein, putative inner membrane protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 235,019 | 0 | C | A | 30.0%
| 288.0
/ 41.1
| 190 | V69L (GTA→TTA) | ykfM | lethality reduction protein, putative inner membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (68/59); new base A (35/28); total (103/87) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.77e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 194 total aligned reads displayed.
ATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAATGCAGGGAAAAA > CP009273/234872‑235166
|
atCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTAc < 2:2143936/148‑1 (MQ=255)
ccTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACAt > 2:1549400/1‑148 (MQ=255)
cTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATAGTAATTAAAATTAAATg > 2:1227191/1‑148 (MQ=255)
tgtgACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAATAATGATTTTATTATCTTAATTAAAATTACATGa > 2:443938/1‑148 (MQ=255)
gtgACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGTTTAAGAATTATTTTTTTATATTAAGTAAAATTAAATGaa > 1:1684802/1‑148 (MQ=255)
tgACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGTTTAATAATTATTTTATTATAGTAAGTAAAAATAAATTaaa > 1:405232/1‑147 (MQ=255)
tgACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAat < 2:1240538/148‑1 (MQ=255)
gACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAata < 1:1933863/148‑1 (MQ=255)
aCAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAatat < 2:117578/148‑1 (MQ=255)
ggAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTTTTAATAATTATTTTATTATAGTAAGTAAAATTAAATTAAAATTTaaaa > 1:626926/1‑148 (MQ=255)
gAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTGTTTTTGATTAAGAATTATTTTATTATAGTAATTAAAAATAAATGAATAATTaaaaa > 1:1148320/1‑148 (MQ=255)
gCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTTTTAATAATTATTTTATTATAGTAAGTAAAATTAAAATAATAATTaaaaaat > 1:1184600/1‑146 (MQ=255)
gCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGTTTTATAATTATTTTATTATCTTAATTAAAAATAAATTAAAATTTaaaaatt > 1:1975301/1‑146 (MQ=255)
cTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACAACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTAAATGAATATTTAAAAATGa > 2:228805/1‑148 (MQ=255)
tATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGaa < 1:188391/148‑1 (MQ=255)
aatAAAGGTGCTATTCCGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGTTTATTTAAAAAGGaaa < 2:2038392/146‑1 (MQ=255)
aTTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGaaa > 2:3286497/1‑148 (MQ=255)
aTTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGaaa < 1:967448/148‑1 (MQ=255)
ttAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAATGaaaa > 2:5412/1‑148 (MQ=255)
aaaGGTGCTATTACGATAGCTATTATTAAAAATATAAGAGTTAGCTTTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACg < 1:488540/148‑1 (MQ=255)
aaaGGTGCTATTACGATAGATATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTTTTGTTATGTCTGTGGCGAAATTTACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACg < 2:2163992/148‑1 (MQ=255)
aaaGGTGCTATTACGATAGATATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACg < 2:2163989/148‑1 (MQ=255)
aGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTTATAAATATTTTATTATAGTAAGTAAAATTAAATGAATATTTAAAAATTAAAAAGAc > 1:2079251/1‑148 (MQ=255)
aGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATAGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGAc > 1:1589011/1‑148 (MQ=255)
ggTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTAAGAATTATTTTATTATAGTAATTAAAATAAAATTAATATATAAAAAAGAAAAAGACa > 1:377349/1‑148 (MQ=255)
ggTGATATTACGATAGCTATTTTTAAAAATATAATATTTAGGTTTATTGTTATGTGTGTGGCTAATTTGAATACCTTCTTTTTTTTGATTAATAATTATTTTATTATCGTATGTAAAATTAAATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACa < 2:1200994/148‑1 (MQ=255)
atATTACTATATCTATTATTAAAAATTTATGAGTTAGGTTTTTTGTTTTTTCTGTGGCTAATTTGACTACCTTCTTTTTTTTTATTAATATTTATTTTATTATCTTAAGTAAAATTACATGAATATTAAAAAAGGAAAACGACATGaa < 2:689821/147‑1 (MQ=255)
aCGTTAGATATTTTTAAAATTATATGTTTTAGCTTTTTTTTTTTGTGTGTGGCTAATTTGACTACCTTCGTTTTTTTTTTTAAGATTTATTTTATTTTCTTAATTAAAATTAAATTAATATTTAAAATGTAAAACGACATGAAACCGa < 2:636145/148‑1 (MQ=255)
aTAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTTTTAAGAATTATTTTATTATAGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAAACGaacc > 1:2955774/1‑146 (MQ=255)
tAGATATTATTAAAAATATAAGTTTTAGGTGTATTTTTATGTCTGTGGCTAAATTGACTACCTTCTTTTTTTTTATTAAGAATGATTTTATTTTCGTATTTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGca < 2:1194679/148‑1 (MQ=255)
ttatattatTAAAAATATAAGTTTTAGTTTTTTTTTTATGTCTGTGGCTAATTTGACTACCTTCTTTTTTTTGATTAACAATTTTTTTATTATCTTAATAAAATTTAAATTAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGcac < 1:1049624/145‑1 (MQ=255)
cttttAGTAAAAATATAAGATTTAGCTTTTTTTTTTTGTCTTTGGCGAAATTGACTACCTTGTTTTTTTTTATTAATAATGATTTTATTATCGTAATTAAAATTAAATGAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAg < 2:1975301/145‑1 (MQ=255)
cTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATAGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAAAGACATGAAAACGAAGCACAg > 2:3221378/1‑148 (MQ=255)
attttattaAAAATTTATGTTTTTGCTTTTTTTTTATTTGTGTGGCTAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATAAATATTTTTTTTTTTATCTTAATTAAAATTAATTGAATATTTAAAAAGCAAAACGACATGAAACCGAAGCACAg < 2:1184600/145‑1 (MQ=255)
aTTAGTAAAAATATAATATTTAGCTTTTTTTTTATGTATGTGGATAAATTGACTACCTTCTTTTTTTTTATTAAGAATTATTTTATTATCGTAATTAAAATTACATTAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGaa < 2:1292111/148‑1 (MQ=255)
ttAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGTTTAAGAATTATTTTATTATCGTAATTAAAATTAAATTAATATTTAAAAATGAAAACGAAAAGAAACCCAAGCACAGaaa > 1:2894721/1‑147 (MQ=255)
ttAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGTTTAAGAATGATTTTATTTGCGTTAGTAAAATTTCATGGATTTTTAAAAAGGGGAACGGCCGGACACCGTAGcaccggct > 1:2894325/1‑143 (MQ=255)
ttAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAAt > 2:2196448/1‑148 (MQ=255)
tAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTTTTAATAATTATTTTATTATAGTTAATAAAATTAAATTAAAATTTAAAAAATAAAAAGACATTAAAACCAAACACAGAAACaaa > 1:3090046/1‑147 (MQ=255)
tAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATTATTTTATTATCGTAAGTAAAATTAAATTAAAATTTAAAAATTAAAACGACAAGAAAACGAAGCACAGAATaaaa > 1:1600551/1‑147 (MQ=255)
atatAAGATTTAGCTTTATTGTTATGTCTGGGGCTAAATTGAGTACATTCGTTTTTTTGATTAAGATTGATTTTATTATCTTAATTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATtct < 2:1741660/148‑1 (MQ=255)
taAGAGTTAGCTTTATTGTTATGTTTGTGGCGAATTTGACTACCTTCTTTTTTTTGATTAATAATTATTTTATTATCTTAATTAAATTTAAATTAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCa < 1:2117383/148‑1 (MQ=255)
aaGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATTATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACATAATCAACATTCTCCaa > 2:890311/1‑148 (MQ=255)
agtgTTAGCTTTTTTGTTATGTCTGTGGCTAAATTTACTCCCTTCGTTTTTTTGATTAAGATTTATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTAAAAAAGCAACACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAAt < 1:1632718/145‑1 (MQ=255)
agTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATAGTAAGTAAAATTAAATGAATATTTAAAAAGGAAAAAGACATGAAACCGAAGCACACAAACAAAAATCTCCaaaaa > 1:3242468/1‑145 (MQ=255)
ttAGCTTTTTTTTTTTGTCTGTGGCTAAATTGACTACCTTCTTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCTTAAGTAAATTTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATa < 2:2332135/148‑1 (MQ=255)
tAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAATAATTATTTTTTTATAGTAATTAAAATTAAATGAATATTTAAAAAGGAAAAAGACATGAAAACCAAGCAAAGAATAAACATTAAACAAtaataa > 1:2662884/1‑148 (MQ=255)
cTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCTTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAat < 2:509079/148‑1 (MQ=255)
cTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAat > 2:2984605/1‑148 (MQ=255)
tGTATTTTTTTTTCTGTGGCTAATTTGACTACCTTTGTTTTTTTTTTTAATATTTTTTTTTTTATCGTATTTAAATTTACATTAATTTTTAAAATGTAACACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAata < 1:1044955/148‑1 (MQ=255)
tGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAata < 2:815774/148‑1 (MQ=255)
gTATTTTTATGTTTGTGGCGAAATTGACTACATTCGTTTTTTTGATTAATATTGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAatat < 2:538429/148‑1 (MQ=255)
gTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGAATACGTTCTTTTTTTTGATTAATATTGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAatat < 2:2353373/148‑1 (MQ=255)
tATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATAGTAAGTAAAATTACATGCATATTTAAAAAGGAAAAAGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACAATCTCCAATAATAAAATAtt > 2:1699258/1‑148 (MQ=255)
ttGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATTAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTc < 2:3288250/148‑1 (MQ=255)
gTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTAAGAATTATTTTATTATAGTAAGTAAAATTAAATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACAAGAAAACCAAGCACACAAAAAAAAATATCCAAAAATAAAATATTTACGTGGAg > 1:997188/1‑148 (MQ=255)
gTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGTTTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGTAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTGCGTGGAg > 2:2363988/1‑148 (MQ=255)
gTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAAAGACATGAAAACGAAGCACAGAATCAACATTATCCAATAATAAAAAATTTACGTGGAg > 2:2577111/1‑148 (MQ=255)
ggCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCAtttt > 2:1112720/1‑148 (MQ=255)
gctaatttGACTCCGTTGTTTTTTTTTATTAATATTTATTTTTTTATCTTAATAAAATTTAAATGAATATTTAAAAAGAAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTtta < 1:928360/142‑1 (MQ=255)
taaaTTGACTACCTTCTTTTTTTTTATTAACAATTATTTTATTATCGTATGTAAAATTACATTAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTttatt < 2:2047474/147‑1 (MQ=255)
caaaTTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAATAATGATTTTATCATCGTAAGAAAAATTAAATGAATATTTAAAAAGTAACACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTttatt < 1:3264528/147‑1 (MQ=255)
aTTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGGCCTGAAACCGAAGCACAGAATCAACCTTCTGCAATAATAAAATAGTTCGGTGGAGGATTtgattgtg > 2:1783645/1‑145 (MQ=255)
ttcacaaCCTTCTTTTTTTTGATTAACAATTTTTTTATTATCTTAATAAAAATTAAATGAATATTAAAAAAGCAACACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTg < 1:179154/142‑1 (MQ=255)
ttGACTACCTTCTTTTTTTTGATTAAGAATTATTTTATTATCTTAATTAAAATTAAATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTg < 1:1849625/148‑1 (MQ=255)
tGACTACCTTCTTTTTTTTGATTAAGAATTATTTTTTTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGa < 2:696340/148‑1 (MQ=255)
tacaaCCTTCTTTTTTTTTATTAATAATTATTTTATTATCTTAATTAAAATTACATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGaa < 2:405077/144‑1 (MQ=255)
aCTACCTTCTTTTTTTTGATTAAGAATTATTTTATTATCTTAATTAAAATTACATTAATATTAAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAat < 1:2285064/148‑1 (MQ=255)
aCTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATTAATATTAAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAat < 1:261300/148‑1 (MQ=255)
tACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCTTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAatat < 2:1474800/148‑1 (MQ=255)
tACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATAGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTATCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAatat > 2:1293520/1‑148 (MQ=255)
aCCTTCGTTTTTTTGATTAATAATTATTTTATTATCGTAAGTAAAAATAAAAGAATATTTAAAAATGAAAACGAAATTAAACCGAATCACAGAAACAAAAATATCCAAACAAAAAAAATTTAACTGGAGCAATTTATTATTTAAaata > 2:57204/1‑148 (MQ=255)
ccTTCGTGTTTTTGTTTAATAATTATTTTATTATAGTAAGTAAAATTAAATGAATAATTAAAAAGGAAAAAGACAAGAAAACCAAGCACAGAAAAAACATTATACAATAATAAAATAATTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAataaat > 2:280087/1‑145 (MQ=255)
tcttttttttGATTAAAAATTATTTTTTAACCTTACTAAAAATTAATTTAATATTAAAAAAGCAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAgg < 1:3149387/145‑1 (MQ=255)
tCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAgg < 2:2876622/148‑1 (MQ=255)
cGTTTTTTTGATTAACAATGATTTTATTATCGTAATAAAAATTACATGAATATTAAAAAAGCAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGt < 1:1200418/148‑1 (MQ=255)
ttttttTATTAATATTTATTTTATTATATTAATAAAAATTAAATTAATATTAAAAAAGCAACACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTa < 1:312221/148‑1 (MQ=255)
ttttTATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAAc < 2:2422131/148‑1 (MQ=255)
taTTAATAATGATTTTATTATCTTAATTAAAATTAAATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCg < 1:2483316/147‑1 (MQ=255)
gATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCg > 1:1212280/1‑148 (MQ=255)
ttAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGt > 1:860876/1‑148 (MQ=255)
ttAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGt > 1:2516739/1‑148 (MQ=255)
aaTGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTaaaaa > 2:3072934/1‑148 (MQ=255)
tGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAAc > 2:2126556/1‑148 (MQ=255)
tGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAAc > 1:2390139/1‑148 (MQ=255)
aTTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACaa > 2:434052/1‑148 (MQ=255)
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cATTAATATTAAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAATGCAGGGaaaaa < 2:3090186/148‑1 (MQ=255)
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ATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAATGCAGGGAAAAA > CP009273/234872‑235166
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
