Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F17 I0 R1
|
93 |
279.2 |
9183790 |
95.6% |
8779703 |
149.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
235,019 |
C→A |
32.6% |
V69L (GTA→TTA) |
ykfM ← |
lethality reduction protein, putative inner membrane protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 235,019 | 0 | C | A | 32.6%
| 349.8
/ 74.9
| 240 | V69L (GTA→TTA) | ykfM | lethality reduction protein, putative inner membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (82/72); new base A (41/44); total (123/117) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.00e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 245 total aligned reads displayed.
TATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAATGCAGGGAAAAA > CP009273/234871‑235166
|
tatCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATATCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTAc < 2:3846504/149‑1 (MQ=255)
atCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACa < 1:2732654/149‑1 (MQ=255)
tCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACAt < 1:4282830/149‑1 (MQ=255)
ccTGTGACAACAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATg < 1:3893455/149‑1 (MQ=255)
tgtgACACAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGaa < 2:2743067/149‑1 (MQ=255)
tgACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATAGTAATTAAAATTAAATGAata > 1:661410/1‑149 (MQ=255)
aCAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATAtt < 1:1767971/149‑1 (MQ=255)
aaaGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTaa < 2:558510/149‑1 (MQ=255)
aaGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTAATAATTATTTTATTATAGTAATTAAAATTAAATGAATATTTaaa > 1:1436721/1‑149 (MQ=255)
aaGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTaaa < 1:2801227/149‑1 (MQ=255)
gAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGTTTAAGAATGATTTTATTATAGTAAGTAAAATTAAATGAATAATTAAAAAg > 1:3362693/1‑149 (MQ=255)
aGCTATTACAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAgg < 2:3192561/149‑1 (MQ=255)
aGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTAAGAATGATTTTATTATATTAAGTAAAATTAAATTAATATTTaaaaatg > 2:2680805/1‑147 (MQ=255)
cTATTAAAGGTTCTATTAAGATATCTATTAGTAAAAATATAAGTGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGaa < 2:295190/149‑1 (MQ=255)
cTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTTTTAATAATGATTTTATTATAGTAAGTAAAAATACAATAATATTTAAAAATGaa > 1:500920/1‑149 (MQ=255)
cTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGaa < 2:2255377/149‑1 (MQ=255)
cTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGaa < 2:3021814/149‑1 (MQ=255)
cTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGACTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGaa < 2:3680876/149‑1 (MQ=255)
tATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGaaa < 2:3332612/149‑1 (MQ=255)
aTTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTTTTTATAATTATTTTATTATAGTAATTAAAATTAAATTAATAATTAAAAATGaaaa > 1:3494787/1‑149 (MQ=255)
aTTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATTAATTTATTATCGTAAGTAAAATTAAATTAATATTTAAAAATTaaaa > 1:3210860/1‑149 (MQ=255)
aTTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGaaaa < 1:2975740/149‑1 (MQ=255)
aTTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTGTTTTTTTTTTAGAATGTTTTTATTTTATTTATTAAAAATAAATGAATATTTAAAAATGaaaa > 1:80051/1‑149 (MQ=255)
ttAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAAc < 2:2058837/149‑1 (MQ=255)
tAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTTTTAAGAATTATTTTATTATAGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGaaaaag > 1:1855604/1‑147 (MQ=255)
aaaGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTAAGAATTATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAATGAAAAAGa > 1:2511542/1‑149 (MQ=255)
aaaGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGa < 2:3728663/149‑1 (MQ=255)
aGGTGCTATTACGATTGGTATTAGTAAAAATATAATAGTTAGCTGTATTGTTATTTCTTTTGCGAAATTGACTACATTCTTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACa < 2:4034937/149‑1 (MQ=255)
aGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATAGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACa > 2:618670/1‑149 (MQ=255)
ggTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTTTTAAGAATGATTTTATTATAGTAAGTAAAAATACAAGAATATTTAAAAATTaaaaaaaaaa > 1:819146/1‑143 (MQ=255)
gCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATAGTAAGTAAAATTAAATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGaa > 2:1171871/1‑149 (MQ=255)
agatattatTAAAAATATAATAGTTAGCTGTATTTTTATGTCTGTGGCTAATTTTACTACTTTCTTTTTTTTTATTAAGATTGTTTTTATTATCTTAATTAAAATTACATTAATATTAAAAAAGTAACACGACATGAAACCGAAGcaca < 1:2619288/146‑1 (MQ=255)
aGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTAATAATGATTTTATTATAGTAAGTAAAATTACATGAATAATTAAAAATGAAAACTACATGAAACCGAAAcaca > 2:3456504/1‑149 (MQ=255)
gCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTAATAATGATTTTATTATAGTAAATAAAATTAAATGAATATTTAAAAATGAAAACCACAAGAAACCGAAGcacat > 2:3108771/1‑148 (MQ=255)
gCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGTTTAATAAAGATTTTTTTATAGTAATTAAAATTAAAATAATATTTAAAAATGAAAAAGAAAAGAAACCCAAAcacac > 1:2371749/1‑148 (MQ=255)
tATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCTAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGATTGTTTTTATTATCTTAAGTAAAATTACATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGaa < 2:1837576/149‑1 (MQ=255)
aTTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAATAAATATTTTATTATAGTAAGTAAAATTAAAAGAATAATTAAAAATGAAAAAGACAAGAAAACCAAGCACAGAAt > 1:3960662/1‑149 (MQ=255)
ttataaaaaaTATAAGTTTTTGGTTTATTTTTTTGTCTGGGGCTAATTTGACAACCTTGTTTTTTTTTTTTAATATTTTTTTTATTATCTTAATAAAAATTAAATTAATTTTAAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATc < 1:137441/144‑1 (MQ=255)
ttAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAAAGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTAAATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATTAAACCGAATCACAGAATc > 2:100313/1‑149 (MQ=255)
aGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTTACTACCTTCTTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAATTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCaa < 2:1781656/149‑1 (MQ=255)
aGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAATAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAATGAAAAAGACATGAAAACGAATCACAGAATaaa > 1:2581540/1‑149 (MQ=255)
aGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTGTTTTTGATTAATAATTATTTTATTATAGTAAGTAAAAATAAATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATTAAAACGAAGCACCGAATaaa > 1:2582923/1‑149 (MQ=255)
tAAAATTATTAGAGTTTGGTTTTTTTTTTTGTGTGTGGTTATTTTGACTACTTTGTTTTTTTTTTTTAATATTTTTTTTTTTTTCTTATGTAAATTTAATTTTTTATTTAAATTGTAACACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACa < 1:4358490/149‑1 (MQ=255)
tAAAAATATTTGTTTTAGCTTTTTTGTTTTTTCTGTGGTTAATTTGATTACTTTCTTTTTTTTGTTTTTGATTGTTTTTTTTTTCGTAAGTAAATTTATATTAATTTTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACa < 2:528810/149‑1 (MQ=255)
tAAAAATATATGTGTTAGCTTTTTTTTTATGTCTGTGGCTAATTTTAATACATTCTTTTTTTTGATTAATAATTATTTTATTATGTTAATTAAAATTAAATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACa < 2:935089/149‑1 (MQ=255)
aaaaaTTTTTGAGTTCGCTTTTTTTTTTTGTCGGTGGCTAATTTGACTACCTTGGTTTTTTTGATTAAGATTGATTTTATTATCGTAATTAAATTTACTTGAATATTTAAAATGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACAt < 1:4045594/149‑1 (MQ=255)
atatAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAAATATTTTATTATCGTAAGTAAAATTAAAAGAATATTTAAAAAGGAAAAACACAAGAAACCCAAGCACAGAATCAACaaaaac > 1:1723812/1‑144 (MQ=255)
ataAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAATGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACAATCTCCa > 2:1402027/1‑149 (MQ=255)
ataAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATTAAACCGAATCACAGAATCAACATTCTCCa > 2:129739/1‑149 (MQ=255)
gagTTAGCTTTTTTTTTTTGTCTGTGCCTAATTTGACTACCTTCGTTTTTTTGATAAATAATGATTTTATTATCGTAATTAAAATTAAATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCa < 1:1500593/149‑1 (MQ=255)
agTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACAATCTCCAATCAt > 2:2016064/1‑149 (MQ=255)
gTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTAAATGAAAATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAAACAACATTCTCCAataata > 1:2226994/1‑149 (MQ=255)
ttAGCTGTATTTTTTTGTCTGTGGCGAAATGGACTACCTTCTTTTTTTTTATTAAGAATGATTTTATTATCGTATGTAAAATTAAATGAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATaa < 2:1645824/149‑1 (MQ=255)
tgCTGTATTTTTTTTTCTGGGGCTAATTTGACTACCTTCTTTTTTTTGATTAACATTTTTTTTATTATCTTAATTAAAATTAAATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATaaaa < 1:4109215/148‑1 (MQ=255)
tGTTTTTTTATTTCTGTGGCTAATTTGACTACATTTTTTTTTTTTATTAATATTTTTTTTATTATCTTAATTAAATTTAAATTAATTTTAAAAAATTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAatat < 1:3516387/149‑1 (MQ=255)
gTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTTTTAAGAATTATTTTATTATAGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAAACCAAGCACAGAAAAAACAATATCCAATAAAAAAATAtt > 1:1014303/1‑149 (MQ=255)
gTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATAGTAAGTAAAATTAAATGAATATTTAAAAAGGAAAAAGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACAATAACCAATAAAAAAATAtt > 1:3713953/1‑149 (MQ=255)
tATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATAttt > 2:330015/1‑149 (MQ=255)
aTTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGTTTAATAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATTAATATTTAAAAATGAAAACGACAAGAAAACGAAGCACAGAATCAACATTATCCAATCAAAAAATAatta > 1:354288/1‑148 (MQ=255)
tttttttgtgtgtgGCTAATTTTACTACATTGTTTTTTTTTTTTAATAATTTTTTTTTTATCTTATTAAAATTTAATTTATTATTTAAAATGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTcc < 1:1004750/143‑1 (MQ=255)
ttATGTCTGTGGCTAATTTTACTACCTACTTTTTTTTTTTTAAGATTTTTTTTTTTATCGTAATTAAAATTACATCAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTg < 2:3894943/149‑1 (MQ=255)
ttGTTTGTGGCTATTTTGACTACCTTTTTTTTTTTTATTATTTTTTTTTTTTTTTTCTTATTAAAATTTAATTTAATATTAAAAAATGAACACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGa < 1:3109515/148‑1 (MQ=255)
aTGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTATCCAATCAAAAAAAATTTCCGTGGa > 2:3610047/1‑149 (MQ=255)
tCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCa > 2:4094246/1‑149 (MQ=255)
gtgGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGTTTAAGAATGATTTTATTTTAGTAAGTAAAATTAAAGGAATATTTAAAAAAGAAAACGACAAGAAACCCAAGCACACAATAAACAATATCCAATCAAAAAATATTTAAGTGGGGCCttt > 1:1603593/1‑149 (MQ=255)
gctaatttGACTACTTTCGTTTTTTTTTTTAATAATTATTTTTTTATCGTATTTAAAATTAAATTAATATTAAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTttat < 1:684678/143‑1 (MQ=255)
acttatttttttttATTAATATTTTTTTTATTATCTTAATTAAAATTACATTAATATTAAAAAAGCAACACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATaga < 1:1930714/143‑1 (MQ=255)
ttCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCTTAATTAAATTTACATGAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAgg < 2:2371749/149‑1 (MQ=255)
tCGTTTTTTTTATTAATAATTATTTTATAATCTTAATTAAATTTACATTAATATTAAAAAAGTAACACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGt < 1:3553781/149‑1 (MQ=255)
tCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGt > 1:2535059/1‑149 (MQ=255)
tCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGt > 2:2362623/1‑149 (MQ=255)
tttttttttttTAAAATTTATTTTATAAGCGTAATTAAAATAAATTTAAAATTTAAAAAGCAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGttt < 1:1202164/148‑1 (MQ=255)
ttttttttGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGttt < 2:156141/148‑1 (MQ=255)
gTTTTTTTGTTTAATAATGTTTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATTAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGttt < 1:752897/149‑1 (MQ=255)
ttttttATTAATAATGATTTTATTATCTTAATTAAAATTACATTAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAAc < 1:4525743/149‑1 (MQ=255)
tttGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTc > 2:478269/1‑149 (MQ=255)
tttGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTc > 2:4454351/1‑149 (MQ=255)
tttataaaGAATTATTTTATTATCGTAATAAAAATTACATGAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTcc < 1:3697190/143‑1 (MQ=255)
gATTAAGATTTATTTTTTTATCGTATTTAAAATTACATTAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCgg < 1:1779902/149‑1 (MQ=255)
aTTAATAATGATTTTATTATATTAATTAAATTTAATTTAATATTTAAAATGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGt < 1:616409/149‑1 (MQ=255)
aTTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGt > 2:1767112/1‑149 (MQ=255)
ttAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTa > 2:2453186/1‑149 (MQ=255)
ttAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTa > 1:3310914/1‑149 (MQ=255)
ttAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTa > 2:1366551/1‑149 (MQ=255)
atcaTTTTATTATCTTAATTAAAATTACATTAATTTTTAAAAAGCAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAAc < 1:2091659/146‑1 (MQ=255)
aTGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAAc > 2:1919426/1‑149 (MQ=255)
tGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACa > 1:1261297/1‑149 (MQ=255)
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TATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAATGCAGGGAAAAA > CP009273/234871‑235166
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
