Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F52 I0 R1
|
779 |
320.1 |
10410758 |
96.6% |
10056792 |
149.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
235,019 |
C→A |
26.5% |
V69L (GTA→TTA) |
ykfM ← |
lethality reduction protein, putative inner membrane protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 235,019 | 0 | C | A | 26.5%
| 297.0
/ 34.4
| 184 | V69L (GTA→TTA) | ykfM | lethality reduction protein, putative inner membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (58/71); new base A (19/36); total (77/107) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.97e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 188 total aligned reads displayed.
ATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGT‑AAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAATGCAGGGAAAAAT > CP009273/234872‑235167
|
atCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGT‑AAAATTACa < 2:4603666/149‑1 (MQ=255)
tCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGT‑AAAATTACAt < 1:3778702/149‑1 (MQ=255)
ccTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGT‑AAAATTACATg < 1:1662640/149‑1 (MQ=255)
cTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGT‑AAAATTACATGa < 1:2460604/149‑1 (MQ=255)
tgACAACAGCAGCTATAAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTATTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGT‑AAAATTACATGAata < 2:3498248/149‑1 (MQ=255)
tgACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATAGTAAGT‑AAAATTACATGAata > 2:517004/1‑149 (MQ=255)
aCAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAATAATTATTTTATTATAGTAATT‑AAAATTACATTAATAtt > 1:649907/1‑149 (MQ=255)
cAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGT‑AAAATTACATGAATAttt < 1:3422716/149‑1 (MQ=255)
cAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGT‑AAAATTACATGAATAttt < 1:3422950/149‑1 (MQ=255)
aaaaGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAATAATGATTTTATTATAGTAAGT‑AAAATTAAAAGAATATTTa > 1:1866006/1‑149 (MQ=255)
aaaaGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGT‑AAAATTACATGAATATTTa < 2:3333529/149‑1 (MQ=255)
aGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGT‑AAAATTACATGAATATTTAAAAAgg < 1:3984633/149‑1 (MQ=255)
aGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGT‑AAAATTACATGAATATTTAAAAAgg < 1:1340441/149‑1 (MQ=255)
cTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGT‑AAAATTACATGAATATTTAAAAAGGaa < 1:2696073/149‑1 (MQ=255)
tATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGT‑AAAATTACATGAATATTTAAAAAGGaaa < 2:4886651/149‑1 (MQ=255)
ttAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGT‑AAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAAc < 2:4176536/149‑1 (MQ=255)
ttACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTGTTTTTGTTTAATAATTATTTTATTATAGTAATT‑AAAATTAAATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACAAGaaaacc > 1:550700/1‑146 (MQ=255)
tACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAATAATTATTTTATTATAGTAATT‑AAAAATAAATTAATATTTAAAAATGAAAAATACATGAAAcaca > 1:5014769/1‑146 (MQ=255)
aCGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAATTTGACTCCCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGT‑AAATTTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGaa < 2:2601079/149‑1 (MQ=255)
attgCTTTTATTAAAAATATAATTTTTAGCTTTATTTTTTTGTCTGTGGCTAAATTGACTACCTTCTTTTTTTTTATTAATATTTATTTTATTATGGTAATT‑AAATTTAAATGAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGca < 2:1890107/146‑1 (MQ=255)
aTAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATTATTTTATTATAGTAAGT‑AAAATTAAAAGAATATTTAAAAATGAAAACGACATGAAACCGAAGca > 1:2542692/1‑149 (MQ=255)
tAGCTTTTTTTAAAAATATAATAGTTTGCTGTTTTGTTTTGTCTGTGGCTAATTTGACTACGTTCTTTTTTTTTATTAATAATTTTTTTATTATCTTATGT‑AAAATTACTTTAATTTTTAAAATGTAAAACGACATGAAACCGAAGcac < 2:4401623/149‑1 (MQ=255)
aGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTAATAATGATTTTATTATAGTAAGT‑AAAATTAAAAGAAAATTTAAAAAGGAAAACGACAAGAAACCCAACcaca > 1:2609731/1‑149 (MQ=255)
aGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAATAATTATTTTATTATAGTAAGT‑AAAATTAAATTAATATTTAAAAATGAAAACGACCTTAAAACGAAGcaca > 1:2345358/1‑149 (MQ=255)
gCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGT‑AAAAATACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACAAGAAACCGAAGCACAg > 1:2577380/1‑149 (MQ=255)
ttttAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCTTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGT‑AAATTTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCa < 1:1248301/146‑1 (MQ=255)
ttgTAAAAATATAAGTGTTAGCTGTTTTGTTTTGTCTGTGGCGAATTTGACTACTTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGT‑AAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCa < 2:3534797/147‑1 (MQ=255)
ttaaaaaaTATATGTTTTCGCTGTTTTGTTTTGTGTGTGTCTAATTTGAATACCTTCTTTTTTTTTATTAATATTTTTTTTTTTATCGTAATA‑AAATTTAAATTAATATTTAAAAATTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCaa < 1:2234169/146‑1 (MQ=255)
attAAAAATATATGTTTTTGCTGTATTGTTTTGTGTGGGGCTAAATTGACTACCTTCTTTTTTTTGATTAATAATTTTTTTATTATCGTAAGT‑AAAATTACATTAATATTTAAAATGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCaa < 1:2052852/147‑1 (MQ=255)
aGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGT‑AAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCaa > 2:2901294/1‑149 (MQ=255)
gTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGT‑AAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAAc > 1:296517/1‑149 (MQ=255)
gTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGT‑AAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGACCAGAATCAAc > 2:5131871/1‑149 (MQ=255)
tAAAATTATATTTGTTTGGTGTTTTTTTTTGTGTGTGGCTAATTTGACTACTTTGTTTTTTTTTTTTAAGATTTTTTTTTTTTTGTTATTT‑AAATTTACATTAATTTTTAAAATGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACa < 1:4464268/149‑1 (MQ=255)
aaaaaTATAAGAGTTCGCTTTATTGTTATGTGTGTGGCGAATTTGACTACCTTCGTTTTTTTGATAAAGAATTATTTTATTATCTTAAGT‑AAAATTACATTAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACAt < 2:471848/149‑1 (MQ=255)
aaaTATAATTGTTTGTTTTTTTTTTTTGTCGGGGGCTAATTTGACTACCTTCTTTTTTTTTATAAATAATGTTTTTTTTATCTTAATT‑AAAATTAAATTAATATTTAAAAAGCAACACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATtc < 1:1508014/149‑1 (MQ=255)
tataAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATAGTAAGT‑AAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAAACAACATTCTcc > 2:4848432/1‑149 (MQ=255)
tataAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATAGTAAGT‑AAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGAAATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTATcc > 2:4805704/1‑149 (MQ=255)
ataAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTAAGAAAGATTTTATTATCGTAAATAAAAATTAAAT‑AAAATTTAAAAAGGAAAACGAAAATAAAAAGAAGCACAGAAACAACAAtctcaa > 1:1131804/1‑147 (MQ=255)
ataAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGT‑AAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCa > 2:2011237/1‑149 (MQ=255)
taAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGT‑AAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATAAACATTCTCaaa > 2:4997282/1‑149 (MQ=255)
aagttttAGCTTTTTTTTTTTTTGTGTGGCTAATTTGAATACCTTCTTTTTTTTTATTAAGATTTATTTTATTATCGTATTT‑AAAATTACTTGAATATTTAAAATGTAACACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAAt < 1:3310205/144‑1 (MQ=255)
agTTAGCTTTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAATAATTATTTTATTATCTTAAGT‑AAATTTACATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCAt < 1:295423/149‑1 (MQ=255)
ttAGCTGTATTGTTTTGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAATT‑AAAATTACATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATaa < 2:2449235/149‑1 (MQ=255)
aGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGTTTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGT‑AAAAATAAATGAATATTTAAAAAAGAAAAAGACATGAAAACGAAGCACAGAATCAACAATCTCCAATCaaaaaa > 1:4492871/1‑149 (MQ=255)
gTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGT‑AAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATAtt > 2:1305770/1‑149 (MQ=255)
tttttttATGTGTGGGGCTAAATTGAATACCTTCTTTTTTTTGATTAAGAATGTTTTTTTTATCGTAATT‑AAAATTAAATTAATTTTTAAAATGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATAttt < 1:4693236/144‑1 (MQ=255)
tATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGTTTAAGAATTATTTTATTATCGTAAGT‑AAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATAttt < 2:162673/149‑1 (MQ=255)
tttttATGTCTGTGGCTAAATTTACTACCTTCTTTTTTTTTATTAATAATTATTTTATTATCTTAATT‑AAAATTACATTAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTcc < 2:2194825/146‑1 (MQ=255)
ttATGTCTGTGGCTAAATTGACTACCTTGTTTTTTTTGATTAATATTGTTTTTATTATCGTAATT‑AAAATTAAATGAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTg < 1:5086122/149‑1 (MQ=255)
tATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGT‑AAAATTACATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAAAATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTgg > 2:4131694/1‑149 (MQ=255)
ttttCTGTGGCTAAATTGACTACCTTCTTTTTTTTGATTAAGAATTATTTTATTATCTTAATT‑AAATTTAATTTAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGa < 2:104021/146‑1 (MQ=255)
aggTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGT‑AAATTTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGa < 2:103996/147‑1 (MQ=255)
tGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGT‑AAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAg > 2:3350506/1‑149 (MQ=255)
gtatgtgGCTAAATTGACTACCTTCTTTTTTTTTATTAATAATGATTTTATTATCGTAAGT‑AAAATTACATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGc < 2:4199041/146‑1 (MQ=255)
gTCTGTGGCTAATTTGACTACTTTGTTTTTTTTTATTATTAATTTTTTTTTTATCGTAATT‑AAAATTAAATCAATATTTAAAATTTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGc < 1:924848/149‑1 (MQ=255)
gTCTGTGGCTAAATTTACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGT‑AAAATTACATGAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGc < 2:4199034/149‑1 (MQ=255)
tCTGTGCCCAAATTCACTACATTCGTTTTTTTGATTAAGAATTATTTTATTAACTTAATT‑AAAATTACATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCa < 2:3300301/149‑1 (MQ=255)
tgtgGCTAATTTGACTACCTTCTTTTTTTTGATTAATAATTATTTTATTATCTTAATT‑AAAATTAAATGAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCAtt < 1:233552/149‑1 (MQ=255)
tgtgGCTAATTTGACTACATTCTTTTTTTTTATTAATAATTATTTTATTATCTTAATT‑AAAATTAAATGAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCAtt < 1:2835835/149‑1 (MQ=255)
tgtgGCTAAATTGACTACTTTGTTTTTTTTTATTAATATTTATTTTATTATCTTAATA‑AAATTTAAATGAATATTTAAAATGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCAtt < 1:3069302/149‑1 (MQ=255)
tgtgGCTAAATTGAATACCTTCTTTTTTTTTATAAATAATGATTTTATTATCTTAATT‑AAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCAtt < 2:3909783/149‑1 (MQ=255)
tgtgGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGT‑AAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAAACATAAAATATTTCCGTGGAGCAtt > 1:5170536/1‑149 (MQ=255)
gggCTAATTTTACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGATTTATTTTATTATCGTAAGT‑AAATTTACATTAATATTTAAAATGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCAtttt < 2:929112/148‑1 (MQ=255)
ctaaaTTGACTACATTCTTTTTTTTTATTAATAATTATTTTATTATCTTAAGT‑AAAATTACATGAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTttatt < 2:2528773/147‑1 (MQ=255)
aaTTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAATT‑AAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTattatt < 2:765895/149‑1 (MQ=255)
tGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGT‑AAAATTACTTGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGaa < 2:2379684/149‑1 (MQ=255)
ggACTACCTTCTTTTTTTTTATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGT‑AAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGaa < 2:4982522/148‑1 (MQ=255)
ctcctttCGTTTTTTTTATTAATATTTATTTTATTATCTTACTT‑AAATTTACATCAATATTTAAAATGCAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAatat < 1:2237720/144‑1 (MQ=255)
cTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAATT‑AAAATTACATGAATATTTAAAATGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATagag < 2:1131804/149‑1 (MQ=255)
ttCTTTTTTTTGATTAAGAATTATTTTATTATCGTAAGT‑AAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAgg < 2:1578921/149‑1 (MQ=255)
tttttttttATTAACAATGATTTTATTATCGTAAGT‑AAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGttt < 2:1494623/148‑1 (MQ=255)
gTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGT‑AAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGttt > 2:2668991/1‑149 (MQ=255)
gTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGT‑AAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGttt < 2:810072/149‑1 (MQ=255)
gTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGT‑AAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGttt > 1:4656260/1‑149 (MQ=255)
tttttttGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGT‑AAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAAAGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTa > 2:2545755/1‑149 (MQ=255)
ttttttATTAATATTTATTTTATTATCGTAATT‑AAAATTACATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAAc < 1:1105953/149‑1 (MQ=255)
ttttATTAAGAATTTTTTTATTATCTTAATT‑AAAATTAAATTAATATTTAAAAAGCAACACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTc < 1:3479516/149‑1 (MQ=255)
aaGAATGATTTTATTATCTTAATA‑AAAATTAAATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTaaa < 1:4024023/149‑1 (MQ=255)
aaGAATGATTTTATTATCGTAAGT‑AAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTaaa > 2:2820152/1‑149 (MQ=255)
ttgtttttttTATCTTAATT‑AAAATTACATTAATATTAAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAAc < 1:617919/145‑1 (MQ=255)
aTGTTTTTATTATCGTAATT‑AAAATTAAATTAATATTTAAAATGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAAc < 1:816444/149‑1 (MQ=255)
aTGATTTTATTATCGTAAGT‑AAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGAATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAAc > 2:231610/1‑149 (MQ=255)
ttttATTATCTTAATT‑AAAATTACATGAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAaag < 2:1963946/149‑1 (MQ=255)
tattatCGTAAGT‑AAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAaagaag > 2:2363023/1‑149 (MQ=255)
tagtaatt‑aaAATTAAATTAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTg < 1:4941585/147‑1 (MQ=255)
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cATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAATGCAGGGAAAaat > 2:184140/1‑149 (MQ=255)
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ATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGT‑AAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAATGCAGGGAAAAAT > CP009273/234872‑235167
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
