Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A19 F166 I1 R1
|
27 |
92.7 |
1999278 |
95.2% |
1903312 |
141.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP000730 |
584,121 |
G→T |
intergenic (+205/‑67) |
rplA → / → rplJ |
ribosomal protein L1/ribosomal protein L10 |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP000730 | 584,121 | 0 | G | T | 100.0%
| 230.8
/ NA
| 77 | intergenic (+205/‑67) | rplA/rplJ | ribosomal protein L1/ribosomal protein L10 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base T (50/27); total (50/27) |
TAATTTCCAAGTTATATTACTTATTGTGATTATTTTACCTAAGACAGTAGGAGTTATTTATAACTTAAAATTTATCCTGCCGAGGCTAAAATTGACTTGAACGTGATGATCTATGATCTTTCAAGCACTTTTTGCCGTGGGTAGAAAGTGCTTTTTTTATTAATTTTAAAAAAAGCACCAAAAATTTAAATGGAGGTGTCTGAATGTCTGCTATCATTGAAGCTAAAAAACAACTAGTTGATGAAATTGCTGAGGTACTATCAAATTCAGTT > CP000730/583985‑584256
|
tAATTTCCAAGTTATATTACTTATTGTGATTATTTTACCTAAGACAGTAGAAGTTATTTATAACTTAAAATTTATCCTGCCGAGGCTAAAATTGACTTGAACGTGATGATCTATGATCTTTCAACTAATTTTTGTCTTggg > 2:898634/1‑141 (MQ=255)
tAATTTCCAAGGTATATTACTTATTGTGATTATTTTACCTAAGACAGTAGGAGTTATTTATAACTTAAAATTTATCCTGCCGAGGCTAAAATTGACTTGAACGTGATGATCTATGATCTTTCAAGCACTTTTTGCATTggg > 2:871674/1‑141 (MQ=255)
aaTTTCCAAGTTATATTACTTATTGTGATTATTTTACCTAAGACAGTAGGAGTTATTTATAACTTAAAATTTATCCTGCCGAGGCTAAAATTGACTTGAACGTGATGATCTATGATCTTTCAAGCACTTTTTGCCTTGGGt > 1:577919/1‑141 (MQ=255)
aTTTCCAAGTTATATTACTTATTGTGATTATTTTACCTAAGACAGTAGGAGTTATTTATAACTTAAAATTTATCCTGCCGAGGCTAAAATTGACTTGAACGTGATGATCTATGATCTTTCAAGCACTTTTTGCCTTGGGTa > 1:785279/1‑141 (MQ=255)
tttCCAAGTTATATTACTTATTGTGATTATTTTACCTAAGAACGTAGGAGTTATTTATAACTTAAAATTTATCATGCCGAGGCTAAAATTGACTTGCACGTGATGATCTATGGTCTTTAAAGCCATTTTTGTCTTTGGTAg > 2:520001/1‑141 (MQ=255)
tCCAAGTTATATTACTTATTGTTATTATTTTACCTAAGACAGTAGGAGTTATTTATAACTTAAAATTTATCCTGCCGAGGCTAAAATTGACTTGAACGTGATGATCTATGATCTTTCAAGCACTTTTTGCCTTGGGTAGaa < 1:597799/141‑1 (MQ=255)
tCCAAGTTATATTACTTATTGTGATTATTTTACCTAAGACAGTCGGGGTTATTTATAACTTAAAATTTATCCTGCCGAGGCTAAAATTGACTTGAACGTGATGATCTATGATCTTTCAAGCACTTTTTGCCTTGGGTAGaa < 1:819134/141‑1 (MQ=255)
tCCAAGTTATATTACTTATTGTGATTATTTTACCTAAGACAGTAGGAGTTATTTATAACTTAAAATTTATCCTGCCGAGGCTAAAATTGACTTGAACGTGATGATCTATGATCTTTCAAGCACTTTTTGCCTTGGGTAGaa < 1:240885/141‑1 (MQ=255)
tCCAAGTTATATTACTTATTGTGATTATTTTACCTAAGACAGTAGGAGTTATTTATAACTTAAAATTTATCCTGCCGAGGCTAAAATTGACTTGAACGTGATGATCTATGATCTTTCAAGCACTTTTTGCCTTGGGTAGaa < 1:252280/141‑1 (MQ=255)
tCCAAGTTATATTACTTATTGTGATTATTTTACCTAAGACAGTAGGAGTTATTTATAACTTAAAATTTATCCTGCCGAGGCTAAAATTGACTTGAACGTGATGATCTATGATCTTTCAAGCACTTTTTGCCTTGGGTAGaa < 1:662312/141‑1 (MQ=255)
ccAAGTTATATTACTTATTGTGATTATTTTACCTAAGACAGTAGGAGTTATTTATAACTTAAAATTTATCCTGCCGAGGCTAAAATTGACTTGAACGTGATGATCTATGATCTTTCAAGCACTTTTTGCCTTGGGTAGaaa > 2:475867/1‑141 (MQ=255)
ccAAGTTATATTACTTATTGTGATTATTTTACCTAAGACAGTAGGAGTTATTTATAACTTAAAATTTATCCTGCCGAGGCTAAAATTGACTTGAACGTGATGATCTATGATCTTTCAAGCACTTTCTGCCTTGGGTAGaaa > 1:204735/1‑141 (MQ=255)
cAAGTTATATTACTTATTGTGATTATTTTACCTAAGACAGTAGGAGTTATTTATAACTTAAAATTTATCCTGCCGAGGCTAAAATTGACTTGAACGTGATGATCTATGATCTTTCAAGCACTTTTTGCCTTGGGTAGAAAg > 2:614795/1‑141 (MQ=255)
aGTTATATTACTTATTGTGATTATTTTACCTAAGACAGTAGGAGTTATTTATAACTTAAAATTTATCCTGCCGAGGCTAAAATTGACTTGAACGTGATGATCTATGATCTTTCAAGCACTTTTTGCCTGGGGTAGAAAGTg > 1:379278/1‑141 (MQ=255)
atatTACTTATTGTGATTATTTTACCTAAGACAGTAGGAGTTATTTATAACTTAAAATTTATCCTGCCGAGGCTAAAATTGACTTGAACGTGATGATCTATGATCTTTCAAGCACTTTTTGCCTTGGGTAGAAAGTGCttt > 1:934345/1‑141 (MQ=255)
atatTACTTATTGTGATTATTTTACCTAAGACAGTAGGAGTTATTAATAACTTAAAATTTATCCTGCCGAGGCTAAAATTGACTTGAACGTGATGATCTATGATCTTTCAAGCACTTTTTGCCTTGGGTAGAAAGTGCttt > 1:776305/1‑141 (MQ=255)
tatTACTTATTGTGATTATTTTACCTAAGACAGTAGGAGTTATTTATAACTTAAAATTTATCCTGCCGAGGCTAAAATTGACTTGAACGTGATGATCTATGATCTTTCAAGCACTTTTTGCCTTGGGTAGAAAGTGCtttt > 1:330580/1‑141 (MQ=255)
tattattTTACCAAAGCCAGTAGGAGTTATTTATAACTTAACATCTCTCCTGGCGAGGCTAAAATTGACTTGCACGTGCTTATCTATGTTGTTTCAAGCACTTTTTGCCTTGGGTAGAAAGTGCTTTTTTTATTAATTTTa < 2:648536/140‑1 (MQ=255)
gATTATTTTACCTAAGACAGTAGGAGTTATTTATAACTTAAAATTTATCCTGCCGAGGCTAAAATTGACTTGAACGTGATGATCTATGATCTTTCAAGCACTTTTTGCCTTGGGTAGAAAGTGCTTTTTTTATTAATTTTa < 1:186660/141‑1 (MQ=255)
gATTATTTTACCTAAGACAGTAGGAGTTATTTATAACTTAAAATTTATCCTGCCGAGGCTAAAATTGACTTGAACGTGATGATCTATGATCTTTCAAGCACTTTTTGCCTTGGGTAGAAAGTGCTTTTTTTATTAATTTTa < 1:452387/141‑1 (MQ=255)
gATTAGTTTACCTAAGACAGTAGGAGTTCTTTATAACTTAAACTTTACCCTGCCGCGGCTAAAATTGACTTGAACGTGAGGATCTAGGTTCTTTCAAGCACTTTTGGCCTTGGGTAGAAAGTGCTTTTTTTATTAATTTTa < 1:226806/141‑1 (MQ=255)
attattGTACCTAAGACAGTAGGAGTTATTTATAACTTAAAATTTATCCTGCCGAGGCTAAAATTGACTTGAACGTGATGATCTATGATCTTTCAAGCACTTTTTGCCTTGGGTAGAAAGTGCTTTTTttaaaattaataa < 2:8848/141‑11 (MQ=255)
tttACCTAAGACAGTAGGAGTTATTTATAACTTAAAATTTATCCTGCCGAGGCTAAAATTGACTTGAACGTGATGATCTATGATCTTTCAAGCACTTTTTGCCTTGGGTAGAAAGTGCTTTTTTTATTAATTTTaaaaaaa > 2:59885/1‑141 (MQ=255)
tttACCTAAGACAGTAGGAGTTATTTATAACTTAAAATTTATCCTGCCGAGGCTAAAATTGACTTGAACGTGATGATCTATGATCTTTCAAGCACTTTTTGCCTTGGGTAGAAAGTGCTTTTTTTATTAATTTTaaaaaaa > 2:499021/1‑141 (MQ=255)
ccTAAGACAGTAGGAGTTATTTATAACTTAAAATTTATCCTGCCGAGGCTAAAATTGACTTGAACGTGATGATCTATGATCTTTCAAGCACTTTTTGCCTTGGGTAGAAAGTGCTTTTTTTATTAATTTTAAAAAAAGCAc > 1:572516/1‑141 (MQ=255)
tAAGACAGTTGGAGTTATTTATAACTTAAAATTTATCCTGCCGAGGCTAAAATTGACTTGAACGTGATGATCTATGATCTTTCAAGCACTTTTTGCCTTGGGTAGAAAGTGCTTTTTTTATTAATTTTAAAAAAAGCAcaa < 2:464043/141‑3 (MQ=255)
tAAGACAATAGGAGATATATAAAACAAAAAATAAAACCTGCCGAGGCTAAAATTGACTTGAACGTGATGATCTATGATCTTTCAAGCATTTTTTGCCTTGGGTAGAAAGTTCTTTTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAGCACCa < 2:998438/141‑1 (MQ=255)
cAGTAGGAGTTATTTATAACTTAAAATTTATCCTGCCGAGGCTAAAATTGACTTGAACGTGATGATCTATGATCTTTCAAGCACTTTTTGCCTTGGGTAGAAAGTGCTTTTTTTATTAATTTTAAAAAAAGAACCAAAAAt > 2:806136/1‑141 (MQ=255)
aGTAGGAGTTATTTATAACTTAAAATTTATCCTGCCGAGGCTAAAATTGACTTGAACGTGATGATCTATGATCTTTCAAGCACTTTTTGCCTTGGGTAGAAAGTGCTTTTTTTATTAATTTTAAAAAAAGCACCAAAAAtt > 1:200232/1‑141 (MQ=255)
aGTAGGAGTTATTTATAACTTAAAATTTATCCTGCCGAGGCTAAAATTGACTTGAACGTGATGATCTATGATCTTTCAAGCACTTTTTGCCTTGGGTAGAAAGTGCTTTTTTTATTAATTTTAAAAAAAGCACCAAAAAtt < 2:785279/141‑1 (MQ=255)
aGGAGTTATTTATAACTTAAAATTTATCCTGCCGAGGCTAAAATTGACTTGAACGTGATGATCTATGATCTTTCAAGCACTTTTTGCCTTGGGTAGAAAGTGCTTTTTTTATTAATTTTAAAAAAAGCACCAAAAATTTaa > 2:173450/1‑141 (MQ=255)
aGGAGTTATTTATAACTTAAAATTTATCCTGCCGAGGCTAAAATTGACTTGAACGTGATGATCTATGATCTTTCAAGCACTTTTTGCCTTGGGTAGAAAGTGCTTTTTTTATTAATTTTAAAAAAAGCACCAAAAAGTTaa > 2:271635/1‑141 (MQ=255)
aGGAGTTATTTATAACTTAAAATTTATCCTGCCGAGGCTAAAATTGACTTGAACGTGATGATCTATGATCTTTCAAGCACTTTTTGCCTTGGGTAGAAAATGCTTTTTTTATTAATTTTCAAACACGCACCAAAAATGTaa > 2:629056/1‑141 (MQ=255)
gAGTTATTTGTGACTTAAAAGGGATCCTGCCGAGGCTAAAATTGACTTGAACGTGATGGTCTATGATCTTTCAAGCACTTTTTGCCTTGGGTAGAAAGTGCTTTTTTTATTAATTTTAAAAAAAGCACCAAAAATTTAAAt > 2:752657/1‑141 (MQ=255)
gAGTTATTTATAACTTAAAATTTATCCTGCCGAGGCTAAAATTGACTTGAACGTGATGATCTATGATCTTTCAAGCACTTTTTGCCTTGGGTAGAAAGTGCTTTTTTTATTAATTTTAAAAAAAGCACCAAAAATTTAAAt > 2:733807/1‑141 (MQ=255)
gAGTTATTTATAACTTAAAATTTATCCTGCCGAGGCTAAAATTGACTTGAACGTGATGATCTATGATCTTTCAAGCACTTTTTGCCTTGGGTAGAAAGTGCTTTTTTTATTAATTTTAAAAAAAGCACCAAAAATTTAAAt > 2:363997/1‑141 (MQ=255)
aGTTATTTATAACTTAAAATTTATCCTGCCGAGGCTAACATTGACTTGAACGTGATGATCTATGGTCTTTCAAGCAATTTTTTTTTTTGTATGAAAGTGATTTTTGTATTATCTTTAGATAATGCAGCaacgagttatatg > 2:269374/1‑130 (MQ=255)
tataACTTAAAATTTATCCTGCCGAGGCTAAAATTGACTTGAACGTGATGATCTATGATCTTTCAAGCACTTTTTGCCTTGGGTAGAAAGTGCTTTTTTTATTAATTTTAAAAAAAGCACCAAAAATTTAAATGGAGgtgt > 2:814133/1‑141 (MQ=255)
tataACTTAAAATTTATCATGGCGAGGCTAAAATTGACTTGAACGTGATGAGCTATGATCTTTCAAGCACTTTTTGCCTTGGGTAGAACGTGCTTTTTTTATTAATTTTAAAAAAAGCACCAAAAATTTAAATGGAGgtgt > 2:706875/1‑141 (MQ=255)
tAAAATTTATCCTGCCGAGGCTAAAATTGACTTGAACGTGATGATCTATGATCTTTCAAGCACTTTTTGCCTTGGGTAGAAAGTGCTTTTTTTATTAATTTTAAAAAAAGCACCAAAAATTTAAATGGAGGTGTCTGAATg < 2:330580/141‑1 (MQ=255)
aaTTTATCCTTCCGAGGCTAAAATTGACTAGAACGTGATGATCTATGATCGTTCAAGCACTTTTTGCCTTGGGTAGAAAGTGCTTTTTTTATTAATTTTAAAAAAAGCACCAAAAATTTAAATGGAGGTGTCTGAATGTCt > 2:731751/1‑141 (MQ=255)
aaTTTATCCTGCCGAGGCTAAAATTGACTTGAACGTGATGATCTATGATCTTTCAAGCACTTTTTGCCTTGGGTAGAAAGTGCTTTTTTTATTTATTTTAAAAAAAGCACCAAAAATTTAAATTGAGGTGTATGAATGTCt > 2:128665/1‑141 (MQ=255)
aTTTATCCTGCCGAGGCTAAAATTGACTTGAACGTGATGATCTATGATCTTTCAAGCACTTTTTGCCTTGGGTAGAAAGTGCTTTTTTTATTAATTTTAAAAAAAGCACCAAAAATTTAAATGGAGGTGTCTGAATGTCtt > 2:736343/1‑140 (MQ=255)
aTTTATCCTGCCGAGGCTAAAATTGACTTGAACGTGATGATCTATGATCTTTCAAGCACTTTTTGCCTTGGGTAGAAAGTGCTTTTTTTATTAATTTTAAAAAAAGCACCAAAAATTTAAATGGAGGTGTCTGAATGTCTg < 1:614795/141‑1 (MQ=255)
tATCCTGCCGAGGCTAAAATTGACTTGAACGTGATGATCTATGATCTTTCAAGCACTTTTTGCCTTGGGTAGAAAGTGCTTTTTTTATTAATTTTAAAAAAAGCACCAAAAATTTAAATGGAGGTGTCTGAATGTCTGCTa < 2:490066/141‑1 (MQ=255)
aTCCTGCCGAGGCTAAAATTGACTTGAACGTGATGATCTATGATCTTTCAAGCACTTTTTGCCTTGGGTAGAAAGTGCTTTTTTTATTAATTTTAAAAAAAGCCCCAAAAATTTAAATGGAGGTGTCTGAATGTCTGCTAt > 1:926696/1‑141 (MQ=255)
aTCCTGCCGAGGCTAAAATTGACTTGAACGTGATGATCTATGATCTTTCAAGCACTTTTTGCCTTGGGTAGAAAGTGCTTTTTTTATTAATTTTAAAAAAAGCACCAAAAATTTAAATGGAGGTGTCGGAATGTATGCTAt > 1:831208/1‑141 (MQ=255)
aTCCTGCCGAGGCTAAAATAGACTTGAACGTGATGATCTATGATCTTTCAAGCACTTTTTGCCTTGGGTAGAAAGTGCTTTTTTTATTAATTTTAAAAAAAGCACCAAAAATTTAAATGGAGGTGTCTGAATGTCTGCTAt > 1:593973/1‑141 (MQ=255)
tCCTGCCGAGGCTAAAATTGACTTGAACGTGATGATCTATGATCTTTCAAGCACTTTTTGCCTTGGGTAGAAAGTGCTTTTTTTATTAATTTTAAAAAAAGCACCAAAAATTTAAATGGAGGTGTCTGAATGTCTGCTATc > 1:855858/1‑141 (MQ=255)
cGAGGCTAAAATTGACTTGAACGTGATGATCTATGATCTTTCAAGCACTTTTTGCCTTGGGTAGAAAGTGCTTTTTTTATTAATTTTATAGAAAGCACCAAAACCTTAAATGGAGGTGTCTGAATGTCTGCTATCATTGaa > 1:875227/1‑141 (MQ=255)
cGAGGCTAAAATTGACTTGAACGTGATGATCTATGATCTTTCAAGCACTTTTTGCCTTGGGTAGAAAGTGCTTTTTTTATTAATTTTAAAAAAAGCACCAAAAATTTAAATGGAGGTGTCTGAATGTCTGCTATCATTGaa > 2:87574/1‑141 (MQ=255)
gAGGCTAAAATTGACTTGAACGTGATGATCTATGATCTTTCAAGCACTTTTTGCCTTGGGTAGAAAGTGCTTTTTTTATTAATTTTAAAAAAAGCACCAAAAATTTAAATGGAGGTGTCTGAATGTCTGCTATCATTGAAg < 2:156303/141‑1 (MQ=255)
ggCTAAAATTGACTTGAACGTGATGATCTATGATCTTTCAAGCACTTTTTGCCTTGGGTAGAAAGTGCTTTTTTTATTAATTTTAAAAAAAGCACCAAAAATTTAAATGGAGGTGTCTGAATGTCTGCTATCATTGAAGCt < 2:917407/141‑1 (MQ=255)
ggCTAAAATTGACTTGAACGTGATGATCTATGATCTTTCAAGCACTTTTTGCCTTGGGTAGAAAGTGCTTTTTTTATTAATTTTAAAAAAAGCACCAAAAATTTAAATGGAGGTGTCTGAATGTCTGCTATCATTGAAGCt < 1:190689/141‑1 (MQ=255)
ggCTAAAATTGACTTGAACGTGATGATCTATGATCTTTCAAGCACTTTTTGCCTTGGGTAGAAAGTGCTTTTTTTATTAATTTTAAAAAAAGCACCAAAAATTTAAATGGAGGTGTCTGAAGGTCTGCTATCATTGAAGCt > 1:296460/1‑141 (MQ=255)
ggCTAAAATTGACTTGAACGTGAGGATCTATGATCTTTCAAGCACTTTTTGCCTTGGGTAGAAAGTGCTTTTTTTATTAATTTTAAAAAAAGCACCAAAAATTTAAATGGAGGTGTCTGAATGTCTGCTATCATTGAAGCt < 2:667022/141‑1 (MQ=255)
cTAAAATTGACTTGAACGTGATGATCTATGATCTTTCAAGCACTTTTTGCCTTGGGTAGAAAGTGCTTTTTTTATTAATTTTAAAAAAAGCACCAAAAATTTAAATGGAGGTGTCTGAATGTCTGCTATCATTGCAGCTaa > 2:503503/1‑141 (MQ=255)
cTAAAATTGACTTGAACGTGATGATCTATGATCTTTCAAGCACTTTTTGCCTTGGGTAGAAAGTGCTTTTTTTATTAATTTTAAAAAAAGCACCAAAAATTTAAATGGAGGTGTCTGAATGTCTGCTATCATTGAAGCTaa > 1:347398/1‑141 (MQ=255)
cTAAAATTGACTTGAACGTGATGATCTATGATCTTTCAAGCACTTTTTGCCTTGGGTAGAAAGTGCTTTTTTTATTAATTTTAAAAAAAGCACCAAAAATTTAAATGGAGGTGTCTGAATGTCTGCTATCATTGAAGCTaa > 1:175885/1‑141 (MQ=255)
cTAAAATTGACTTGAACGTGATGATCTATGATCTTTCAAGCACTTTTTGCCTTGGGTAGAAAGTGCTTTTTTTATTAATTTTAAAAAAAGCACCAAAAATTTAAATGGAGGAGTCTGAATGTCTGCTATCATTGAAGCTaa > 2:788737/1‑141 (MQ=255)
aaaaTTTACTTGAACGTGATGATCTATGATCTTTCAAGCACTTTTTGCCTTGGGTAGAAAGTGCTTTTTTTATTAATTTTAAAAAAAGCACCAAAAATTTAAATGGAGGTGTCTGAATGTCTGCTATCATTGAAGCTaaaa < 2:265828/141‑1 (MQ=255)
aattGAATGTGATGATCTATGATCTTTCAACGACTTTTTGCCTTGGGTAGAAAGTGCTTTTTTTATTAATTTTAAAAAAAGCACCAAAAATTTAAATGGAGGTGTCTGAATGTCTGCTATCATTGAAGCTAAAAAACAACt < 2:72588/139‑1 (MQ=255)
cTTGAACGTGATGATCTATGATCTTTCAAGCACTTTTTGCCTTGGGTAGAAAGTGCTTTTTTTATTAATTTTAAAAAAAGCACCAAAAATTTAAATGGAGGTGTCTGAATGTCTGCTATCATTGAAGCTAAAAAACAACTa > 1:407418/1‑141 (MQ=255)
tgatctatgatctTTCAAGCACTTTTTTTTTTTTTTTTAAAGTGCTTTTTTTATTAATTTTAAAAAAAGCAGCAAAAATTTAAATGGAGGTGTCTGAATGTCTGCTATCATTGAAGCTAAAAAACAACTAGTTGATGAAAt > 2:760913/1‑141 (MQ=255)
tgatctatgatctTTCAAGCACTTTTTGCCTTGGGTAGAAAGTGCTTTTTTTATTAATTTTAAAAAAAGCACCAAAAATTTAAATGGAGGTGTCTGAATGTCTGCTATCATTGAAGCTAAAAAACAACTAGTTGATGAAAt > 2:41491/1‑141 (MQ=255)
ttggtctTTCAAGCACTTTTTGCCTTGGTTAGGAAGTGCTTTTTTTATTAATTTTAAAAAAAGCACCAAAAATTTAAATGGAGGTGTCTGAATGTCTGCTATCATTGAAGCTAAAAAACAACTAGTTGATGAAATTGCTGa < 2:297101/137‑1 (MQ=255)
ctTTCAAGCACTTTTTGCCTTGGGTAGAAAGTGCTTTTTTTATTAATTTTAAAAAAAGCACCAAAAATTTAAATGGAGGTGTCTGAATGTCTGCTATCATTGAAGCTAAAAAACAACTAGTTGATGAAATTGCTGAGGTAc > 2:150234/1‑141 (MQ=255)
aaGCACTTTTTGCCTTGGGTAGAAAGTGCTTTTTTTATTAATTTTAAAAAAAGCACCAAAAATTTAAATGGAGGTGTCTGAATGTCTGCTATCATTGAAGCTAAAAAACAACTAGTTGATGAAATTGCTGAGGTACTATCa < 1:806136/141‑1 (MQ=255)
aaGCACTTTTTGCCTTGGGTAGAAAGTGCTTTTTTTATTAATTTTAAAAAAAGCACCAAAAATTTAAATGGAGGTGTCTGAATGTCTGCTATCATTGAAGCTAAAAAACAACTAGTTGATGAAATTGCTGAGGTACTATCa > 2:409343/1‑141 (MQ=255)
gcgcTTTTTGCGTTGGGTAGATAGTGCTTTTTTTATTAATTTTAAAAAAAGCACCAAAAATTTAAATGGAGGTGTCTGAATGTCTGCTATCATTGAAGCTAAAAAACAACTAGTTGATGAAATTGCTGAGGTACTATCaaa < 1:332538/138‑1 (MQ=255)
gCACTTTTTTCTTTTTGTAGAAAGTGCATTTTTTATTAATTTTAAAAAAAGCACCAAAAATTTAAATGGAGGTGTCTGAATGACTGCTATCATTGAAGCCAAAAAACTACTAGTTGATGAAATTGCTGAGGTGTAATCaaa > 2:363124/1‑141 (MQ=255)
gCACTTTATGTCTTGCGTCGAAAGTGCTTTTTTTATTAATTTTAAAAAAAGCACCAAAAACTTAAATGGAGGTGTCTGAATGTCCGCTATCATTGAAGCTAAAAAACAACTAGTTGATGAAATTGCTGAGGTACTATCaaa < 1:1755/141‑1 (MQ=255)
acattttttACCTTGAGTAGAAAGTGCTTTTTTAAAAAAATAAAAAAAAAGCACCAAAAATTTAAATGGAGGTGTCTGAATGTCTGCTATCATTGAAGCTAAAAAACAACTAGTTGATGAAATTGCTGAGGTACTATCaaa < 2:873404/137‑1 (MQ=255)
ttttGCCTTGGGTAGAAAGTGCTTTTTTTTTTTTTTTTTAAAAAAGCACCAACAATTTAAATGGAGGTGTCTGAATGTCTGCTATCATTGAAGCTAACAATCAACTAGTTCATGAAATTTCTGAGGTACTCTCAAATTCat > 2:54271/1‑140 (MQ=255)
tttGCCTTGGGTAGAAAGTGCTTTTTTTTTTATTTTTAAAAAAAGCACCAAAAATTTAAATTGAGGTGTCTGAATGTCTGCTATCATTGTAGCTCAAAAACAACTAGTTGATGAAATTGCTGAGGTAGTATCAAATTCatt > 2:837348/1‑139 (MQ=255)
tttGCCTTGGGTAGAAAGTGCTTTTTTTATTAATTTTAAAAAAAGCACCAAAAATTTAAATGGAGGTGTCTGAATGTCTGCTATCATTGAAGCTAAAAAACAACTAGTTGATGAAATTGCTGAGGTACTATCAAATTCAGt > 1:962498/1‑141 (MQ=255)
ttGCCTTGGGTAGAAAGTGCTTTTTTTATTAATTTTAAAAAAAGCACCAAAAATTTAAATGGAGGTGTCTGAATGTCTGCTATCATTGAAGCTAAAAAACAACTAGTTGATGAAATTGCTGAGGTACTATCAGATTCAGtt > 1:324437/1‑141 (MQ=255)
|
TAATTTCCAAGTTATATTACTTATTGTGATTATTTTACCTAAGACAGTAGGAGTTATTTATAACTTAAAATTTATCCTGCCGAGGCTAAAATTGACTTGAACGTGATGATCTATGATCTTTCAAGCACTTTTTGCCGTGGGTAGAAAGTGCTTTTTTTATTAATTTTAAAAAAAGCACCAAAAATTTAAATGGAGGTGTCTGAATGTCTGCTATCATTGAAGCTAAAAAACAACTAGTTGATGAAATTGCTGAGGTACTATCAAATTCAGTT > CP000730/583985‑584256
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
