Sample Resequencing Stats

Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
ALE, Flask, Isolate Predicted Mutations Mean Coverage Total Reads Percent Mapped Mapped Reads Average Read Length
A1 F52 I0 R1 39 94.7 2129336 96.2% 2048421 141.0

Breseq alignment

BRESEQ :: Evidence
Predicted mutation
evidence seq id position mutation freq annotation gene description
RA USA300TCH1516_ALE 512,643 A→G 43.0% intergenic (+711/‑6052) recR → / → speA_2 Recombination protein RecR/Arginine decarboxylase

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*USA300TCH1516_ALE512,6430AG43.0% 80.0 / 213.2 184intergenic (+711/‑6052)recR/speA_2Recombination protein RecR/Arginine decarboxylase
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base A (52/52);  new base G (43/36);  total (96/88)
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.54e-01
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.11e-01

Only 100 of 188 total aligned reads displayed.

GTGTAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAAC‑AACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACATTATTTAGTATTTATGAGCTAATCAAACATCATAA  >  USA300TCH1516_ALE/512505‑512783
                                                                                                                                           |                                                                                                                                            
gtgtAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAAC‑AACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTtaat                                                                                                                                            >  1:889986/1‑141 (MQ=255)
gtgtAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAAC‑AACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTtaat                                                                                                                                            >  1:575340/1‑141 (MQ=255)
    aagttaagctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATaaa                                                                                                                                         <  1:692841‑M1/29‑1 (MQ=255)
     aTTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAAC‑AACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAAt                                                                                                                                       >  1:840347/1‑141 (MQ=255)
      tttttACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAAC‑AACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATg                                                                                                                                      >  1:135179/1‑141 (MQ=255)
       ttttACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAAC‑AACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGt                                                                                                                                     >  1:670282/1‑141 (MQ=255)
           gctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttgcgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGtata                                                                                                                                  <  1:157165‑M1/36‑1 (MQ=255)
           gctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGtata                                                                                                                                  >  1:885633‑M1/106‑141 (MQ=255)
           aCTGTTGTTAAGCCGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAAC‑AACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTAtaa                                                                                                                                 <  2:408041/141‑1 (MQ=255)
            ctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcaggtttttaaccaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGGTGATAAAATGGAtaa                                                                                                                                 <  2:418677‑M1/37‑1 (MQ=255)
            cTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAACAC‑AACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTAtaat                                                                                                                                >  1:995522/1‑141 (MQ=255)
            cTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAAC‑AACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTAtaat                                                                                                                                >  1:752810/1‑141 (MQ=255)
              gttgttAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGTGGTAAACAAAAC‑AACTTAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAATATTTTTTGACTTAAATGTTAATAAAATGTAtaatta                                                                                                                              <  2:331853/141‑1 (MQ=255)
              gttgttAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAAC‑AACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTAtaatta                                                                                                                              >  2:781025/1‑141 (MQ=255)
               cttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTAtaatta                                                                                                                              <  2:194429‑M1/40‑1 (MQ=255)
                ttagcgtggatggtagtcgaacttacgttccgctagagtatatcgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTAtaattaa                                                                                                                             >  2:578953‑M1/101‑141 (MQ=255)
                tgagcatccaaggaagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgatgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTAtaattaa                                                                                                                             >  2:522226‑M1/101‑141 (MQ=255)
                 tagcgtccatagtagtcgaactaacattccgctagagtagaacgatgccaagcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaaaaaacaaaaaaaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTAtaattaat                                                                                                                            >  2:355950‑M1/100‑141 (MQ=255)
                 gttAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAAC‑AACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATaattaatt                                                                                                                           <  1:184816/141‑1 (MQ=255)
                  ttAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAAC‑AACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTc                                                                                                                          >  2:171844/1‑141 (MQ=255)
                    tgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagattagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCt                                                                                                                         >  1:366003‑M1/97‑141 (MQ=255)
                          tttGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAAC‑AACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGt                                                                                                                  >  2:799132/1‑141 (MQ=255)
                          tttGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAAC‑AACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGt                                                                                                                  >  2:268494/1‑141 (MQ=255)
                           ggtagtcgaacttacgttccgctagagtaggacgttgccaggcagttttttaaacaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTATTGTcggg                                                                                                                  <  2:647066‑M1/52‑2 (MQ=255)
                                  gaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGaaaa                                                                                                           >  1:263823‑M1/83‑141 (MQ=255)
                                    acttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAAt                                                                                                         >  1:618783‑M1/81‑141 (MQ=255)
                                      tataGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAAC‑AACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGaa                                                                                                      >  1:85946/1‑141 (MQ=255)
                                        acgtgccgccagagtagaaagatgccaggcagttttttaatcaacttttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAAc                                                                                                     >  2:543900‑M1/77‑141 (MQ=255)
                                         cgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACa                                                                                                    <  1:419001‑M1/66‑1 (MQ=255)
                                          gtcccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaataaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACAt                                                                                                   >  2:210589‑M1/75‑141 (MQ=255)
                                          gTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAAC‑AACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATCATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACAtt                                                                                                  >  1:123940/1‑141 (MQ=255)
                                           tatttattTGTTGAGGCAAACAAAAC‑AACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTTTCGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCTGTAAGAAAAATGAACATTg                                                                                                 <  1:637475/141‑1 (MQ=255)
                                            tccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTg                                                                                                 >  1:985107‑M1/73‑141 (MQ=255)
                                               tatttGTTGAGGCAAACAAAAC‑AACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGaaaa                                                                                             <  2:725871/141‑1 (MQ=255)
                                                 tttGTTGAGGCAAACAAAAC‑AACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACt                                                                                           <  2:808487/141‑1 (MQ=255)
                                                  agagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAGGAAAAATGAACTttgaaagct                                                                                           <  2:285991‑M1/75‑4 (MQ=255)
                                                   gagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTg                                                                                          <  2:516455‑M1/76‑1 (MQ=255)
                                                   aagtagaacgttgctaggcagttttttaataaaaaaaaaaaaaaaaaataaaatggacaagatagAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTg                                                                                          >  2:790820‑M1/66‑141 (MQ=255)
                                                      tagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAACTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAAt                                                                                       >  1:303784‑M1/63‑141 (MQ=255)
                                                      tagaaagttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAAt                                                                                       >  1:1063505‑M1/63‑141 (MQ=255)
                                                       gAGGCAAACAAAAC‑AACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATCTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTCAGAAAACTGAACATCGAAAACTGAATGa                                                                                     >  2:977074/1‑141 (MQ=255)
                                                          gCAAACAAAAC‑AACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACaa                                                                                  >  1:234192/1‑141 (MQ=255)
                                                            aaacaaaac‑aACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAata                                                                                <  1:522628/141‑1 (MQ=255)
                                                               gccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATg                                                                              <  1:1063202‑M1/88‑1 (MQ=255)
                                                               aaaaac‑aaCTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGt                                                                             <  1:501733/140‑1 (MQ=255)
                                                               aaaaac‑aaATCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGt                                                                             <  1:484692/140‑1 (MQ=255)
                                                                aaaacaaACTCAACCTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGTTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGt                                                                             <  2:833327/141‑1 (MQ=255)
                                                                 caggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTc                                                                            <  1:906619‑M1/90‑1 (MQ=255)
                                                                  aggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCa                                                                           >  1:413362‑M1/51‑141 (MQ=255)
                                                                   ggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAACTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGACCATTGAACACTGAATGACAATATGTCaa                                                                          >  1:686641‑M1/50‑141 (MQ=255)
                                                                           tttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAAtt                                                                  <  2:310007‑M1/100‑1 (MQ=255)
                                                                           aactTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTAGAAAGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAAtt                                                                  <  2:844616/141‑1 (MQ=255)
                                                                                aaGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCaaa                                                             <  2:1056437/141‑1 (MQ=255)
                                                                                 aGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAAGTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCaaaa                                                            <  1:796731/141‑1 (MQ=255)
                                                                                   aattttggttaaaaaataaactgggccctataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCaaaaaa                                                          <  2:1023472‑M1/108‑1 (MQ=255)
                                                                                   aaaTAACTTGAATTACAAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCaaaaaa                                                          >  1:528286/1‑141 (MQ=255)
                                                                                    aaTAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAAc                                                         <  2:889493/141‑1 (MQ=255)
                                                                                    aaTAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAAc                                                         >  1:940384/1‑141 (MQ=255)
                                                                                        tggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTaa                                                     <  1:446415‑M1/113‑1 (MQ=255)
                                                                                         ggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACgtacc                                                    <  2:668611‑M1/114‑3 (MQ=255)
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                                                                                                                   tAAAAAGGTATTGGCTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCGTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACATTATTTAGTAt                          <  2:103798/141‑1 (MQ=255)
                                                                                                                   aAAAAAGTTATTGAATTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATACGTCAAAGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACATTATTTCGTAt                          >  2:645901‑M1/2‑141 (MQ=255)
                                                                                                                     aaaaGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACATTATTTAGTAttt                        >  2:493703/1‑141 (MQ=255)
                                                                                                                         gTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACATTATTTAGTATTTATGa                    <  1:198880/141‑1 (MQ=255)
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                                                                                                                                           |                                                                                                                                            
GTGTAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAAC‑AACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACATTATTTAGTATTTATGAGCTAATCAAACATCATAA  >  USA300TCH1516_ALE/512505‑512783

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑

GATK/CNVnator alignment

N/A