Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A7 F13 I0 R1
|
230 |
5035.0 |
9125430 |
98.4% |
8979423 |
135.8 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP022686 |
1,360,750 |
G→T |
9.6% |
intergenic (‑85/+239) |
kgtP ← / ← rrf |
alpha‑ketoglutarate permease/5S ribosomal RNA |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP022686 | 1,360,750 | 0 | G | T | 9.6%
| 470.7
/ 3.5
| 209 | intergenic (‑85/+239) | kgtP/rrf | alpha‑ketoglutarate permease/5S ribosomal RNA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (65/116); new base T (26/2); total (91/118) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.43e-09 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 216 total aligned reads displayed.
GACGAGTATCACTACTTGTCAGTTTGCTGTCTGCCGTTACAGTACTTTCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAGGAGCTTAAGGATAGATTTCTGGTAAGGAGGAAGTATGGAAGTGGGCAATTTGGGGAAGACGTATTCGCTGTTGAATCTGGC > NZ_CP022686/1360611‑1360887
|
cgaGTATCACTACTTGTCAGTTTGCTGTCTGCCGTCACAGTACTTTCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCa < 2:215308/140‑1 (MQ=255)
gTATCACTACTTGTCAGTTTGCTGTCTGCCGTTACAGTACTTTCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTGGTATGAAAAATGTTATACATTTGTTGCatat < 2:154517/140‑1 (MQ=255)
aTCTCTACTTGTCAGTTTGCTGTCTGCCGTTACAGTACTTTCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCatat < 7:1034035/138‑1 (MQ=255)
aTCACTACTTGTCAGTTTGCTGTCTGCCGTTACAGTACTTTCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCTTAATACCATGCTTTTGTCGTTCGCGTTTGTTTATTTTTTTGTAATTAAAATGGTATACATTTGTTGCatatga > 1:701152/1‑138 (MQ=255)
aTCACTACTTGTCAGTTTGCTGTCTGCCGGTACAGTACTTTCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGACGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCTCTTTTTTTTATTTTTTGTTAAGAAATATGTTATACATTTGTTGCATATCa < 1:909968/140‑1 (MQ=255)
cACTACTTGTCAGTTTGCTGTCTGCCGTTACAGTACTTTCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGGATATCAtt > 4:368403/1‑140 (MQ=255)
cACTACTTGTCAGTTTGCTGGCTGCCGTTACAGTACTTTCAGCCATGCCAATATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCGTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCAtt < 3:224708/140‑1 (MQ=255)
ctactTGTCAGTTTGCTGTCTGCCGTTACAGTACTTTCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCGTTTGTTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCAatat > 2:980036/1‑140 (MQ=255)
ctactTGTCAGTATGCTGTCTGCCGTTACAGTACTTTCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTAt < 5:138171/140‑1 (MQ=255)
tactTGTCAGTTTGCTGTCTGCCGTTACAGTACTTTCAGCCATGCCATTCTGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTATg < 3:874163/140‑1 (MQ=255)
tactTGTCAGTTTGCTGTCTGCCGTTACAGTACTTTCAGCCATGCCATTATGACTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTATg < 3:212347/140‑1 (MQ=255)
tactTGTCAGTTTGCTGGCTGCCGTTACAGTACTTTCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTATg < 3:119880/140‑1 (MQ=255)
tactTGTCAGTTTGCAGTCTTCCGGTACAGTCCTTTCAGCCAAGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGGCGCTTTTGTTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTATg < 5:279619/140‑1 (MQ=255)
actTGTCAGTTTGCTGTCAGCCTTTACAGTACTTTCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGGCGCTTTTGTTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTAt < 7:76720/138‑1 (MQ=255)
ctTGTCAGTTTGCTGTCTGCCGTTACAGTACTTTCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCGTTTGTTTATTTTTTTGTAAAAAAAATGTTATACATTTTTTGCATATCAATATGCa > 5:697861/1‑140 (MQ=255)
tGTCAGTTTGCTGTCTGCCGTTACAGTACTTTCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTGGTAATAAAAATGTTATACATTTGTTTCATATCATTATGCAAc > 4:1002436/1‑140 (MQ=255)
tGTCAGTTTGCTGTCTGCCGTTACAGTACTTTCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTAGTTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAAc > 3:933140/1‑140 (MQ=255)
tGTCAGTTTGCTGTCTGCCGTTACAGTACTTTCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCGTTTGTTTTTTTTTTGGTTACAAAAATTTTTTACATTTGTTGCATATCATTATGGAAc > 6:690804/1‑140 (MQ=255)
tGTCAGTTTGCTGTCTGCCGTTACAGTACTTTCAGCCATGCCAATATGTCTCCTGACGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTGGTAAGAAAAAATTTATAAATTTTTTTCAAATAATTATGCAAc > 2:46442/1‑140 (MQ=255)
gTCAGTTTGCTGTCTGCCGTTACAGTACTTTCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTTTTTTTTGGTTAGAAAAATGTTATACATTTTTTGCATATAATTATGGAAcc > 6:509557/1‑140 (MQ=255)
gTCAGTTTGCTGTCTGCCGTTACAGTACTTTCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTGGTTAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTATTCAAcc > 1:898008/1‑140 (MQ=255)
gTCAGTTTGCTGTCTGCCGTTACAGTACTTTCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGATTTTGTTTTTTTTTTGGTTATAAAAAAGTTATTAAATTTTTGCATATCAATATTCATcc > 6:138171/1‑140 (MQ=255)
tCAGTTTGCTGTCTGCCGTTACAGTACTTTCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAAc < 8:64020/138‑1 (MQ=255)
tCAGTTTGCTGTCTGCCGTTACAGTACTTTCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCGTTTGTTTTTTTTTTTGTAAGAAAAATGTTATAAATTTTTTGCATATAATTATTCAAc > 7:192897/1‑138 (MQ=255)
cAGTTTGCTGTCTGCCGTTACAGTACTTTCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCAAGGCGTGTGTCGGTCGCGTTTTTTTATTTTTTGGTAATAAAAAATTTATACATTTTTTGAATATCATTAAGCAAcc > 7:316058/1‑138 (MQ=255)
cAGTGTGCTGGCTGCCGTTACAGTACTTTCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAAcc < 7:868077/138‑1 (MQ=255)
tGCTGTCTGCCGTTACAGTACTTTCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCGTTTGTTTATTTTTTTGTAAGAAAAATGTTATACAATTTTTTCCTATCATTTTGCAACCATAAc > 7:518457/1‑138 (MQ=255)
cGTTACAGTACTTTCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTGGTTATAAAAATGTTTTAAATTTTTTTCATATAATTATTAAACCATAAACATGAATttatt > 1:24816/1‑138 (MQ=255)
tACAGTACTTTCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCACTGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATttagttag < 2:297681/140‑1 (MQ=255)
tACAGTACTTTCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATttagttag < 3:304931/140‑1 (MQ=255)
tACAGTACTTTCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATttagtt < 8:423736/138‑1 (MQ=255)
aCAGTACTTTCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTTGTTAGAAAAATTTTATACATTTGTTTCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATttagtta > 7:719701/1‑138 (MQ=255)
aCAGTACTTTCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTTTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATttagtta > 8:261689/1‑138 (MQ=255)
aatttCATCAATGCTATTATGGCTCCTTACGTAATCCTATGCTTTTGTCGTTGGCTTTTGTTTATTTTTTTGTAAGAAATATGTTATAAATTTTTTGAATATCATTATGCAACCTTAACGATGAATTTAGTTAGCAgg < 7:836103/136‑1 (MQ=255)
aCTTTCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGGTTTTGGTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGaa < 6:761286/140‑1 (MQ=255)
cTTTCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTTTTTTATTTTTTGTATTAAAAATTGTTTAAATTTGTTGAATATCATTATGAAACGATTACAATGTATTTAGTTTGGAGGaaa > 1:582729/1‑140 (MQ=255)
ttCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTGGTAAGTAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCTTGAATTTAGTTAGCAGGAAAAt < 3:565725/140‑1 (MQ=255)
ttCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAAt < 4:446991/140‑1 (MQ=255)
ttCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAAt < 1:1057786/140‑1 (MQ=255)
tCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTTTTTGATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCATGAAAAtt > 4:202731/1‑139 (MQ=255)
tCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGATTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTTGTAAGAAAAATTGTAAACAATTTTTTAATTAAAATTTAGAACCATAACCATGAATTTTTTTAACAGGTAAATg > 3:1147481/1‑140 (MQ=255)
tgccatTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCGTTTTTTTATTTTTTGGTTATAAAAATGTTATACAATTGTTGCATATCATTATGCAAACTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGTAAAATGGttatta > 6:833967/1‑140 (MQ=255)
tgccatTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCGTTTGTTTTTTTTTTTGGAAGAAAAATGTTAAACATTTTTTGCAAATAATTTAGAAACCTTTAAAATGAATTTAGTTATCCTGATAATTGttaatt > 3:143262/1‑137 (MQ=255)
tgccatTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCGTTTGTTTATTTTTTTGGAAGAAAAATGTTTTACATTTGTTGGATTTAATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGGCGGAAAATGGtttttt > 3:1047666/1‑139 (MQ=255)
ccatTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCCTTATGCAACCTTAAACAGGAATTTAGTTTGCAGGAAAATTGtgatta > 8:179241/1‑138 (MQ=255)
catTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTaa < 7:203840/138‑1 (MQ=255)
ttATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCGTTTTTTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTTTTTCATATAATTTTTCAACCATAACCATTAATTTATTTATCAGGAAAATGGTTATTAATGAg > 6:108624/1‑140 (MQ=255)
tGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTTGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAGGAGc < 7:922958/138‑1 (MQ=255)
gTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTTTCGGTCGCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAGAAAAAATTTTTTCAATTTTTTAATATCATTATTAAAACATAAACAGTAATTTTTTTATAAGGTATATGTTTATTaatgtgtt > 7:390614/1‑132 (MQ=255)
tcCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTTTTTATTTTTTTGTAAGAAAAATGTTTAACATTTGTTGCAGTTGAATATGCCTCCTTAACCAATAATTTAGTTAGCATGAAAATGGTTTTTAATGTACTTaaag > 5:355554/1‑138 (MQ=255)
tcCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCGTTTGTTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAGGTGCTTAAgg > 1:375890/1‑140 (MQ=255)
ccTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAGGAGCTTAAGGa < 3:830025/140‑1 (MQ=255)
ccTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAGGAGCTTAAGGa < 5:152074/140‑1 (MQ=255)
cGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAGGAGCTTAAGGATAg < 7:154695/138‑1 (MQ=255)
tAATCCAATGGTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTATTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAGGAGCTTAAGGATAGAt < 7:1060977/138‑1 (MQ=255)
tAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTTCATATCATTTTGCAACCTTTAACATGAATTTATTTAGCAGGAAAATGGTTATTTAGGAGCGTAAGGATAGAttt > 2:125128/1‑140 (MQ=255)
aaTCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTTCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAGGAGCTTAAGGATAGAtt < 7:889796/138‑1 (MQ=255)
aTCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTTTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTATCAGGAAAATGGTTATTAAGGAGCTTAATGATAGATTTCt > 2:1090844/1‑140 (MQ=255)
aTCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAGGAGCTTAAGGATAGATTTCt < 2:335417/140‑1 (MQ=255)
aTCCAATGCTTTTGTCGGTCGCGTTTGTTTTTTTTTTGGGTAGAAAAATTTTATACATTTTTTGCAGATAATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATTGTTTTTATGGAGCTTTATGATAGAtttat > 4:770632/1‑138 (MQ=255)
cAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTTTACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAGGAGCTTAAGGATAGATTTCTGGt < 5:787421/140‑1 (MQ=255)
cAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAGGAGCTTAAGGATAGATTTCTGGt < 5:25920/140‑1 (MQ=255)
aTGCTTTTGTCGGTCGCTTTTTTTTATTTTTTTGTTAGAAAAATGTTATAAATTTGTTGGATATCATTATTAAACATTAACAAATAATTTATTTAACAGGAAAAAGGTTAATAATGAGCTTAAGCAAAGATTTCttttaa > 4:129564/1‑135 (MQ=255)
aTGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTTTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGAAGGAAAATGGTTATTAAGGAGCTTTAGGATAGATTTCTGGTaa > 4:714523/1‑140 (MQ=255)
aTGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTATCAGGAAAATGGTTATTAAGGAGCTTAATGATATATTTCTTGTaa > 6:982918/1‑140 (MQ=255)
aTGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGGTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATAAATTTTTTGCATATCATTATGCAACCATAACCAAGAATTTATTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAAGATCTTAAGGATATATTTATGTTaa > 2:668644/1‑140 (MQ=255)
tGCTTTTGTCGGTCGCGTTTGTTTATTTTTTGGTAAGCAAAATTTTATACATTTGTTTCATATCATTATGCCACCTTAACCATTAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAGGAGCTTAAGGATATATTTCTTGTaat > 6:593188/1‑139 (MQ=255)
gCTTTTGTCGGTCGCTTTTTTTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGAATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAGGAGCTTAAGGATAGATTTCTGGTAagg < 3:430257/140‑1 (MQ=255)
gCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAGGAGCTTAAGGATAGATTTCTGGTaa < 8:973117/138‑1 (MQ=255)
gttttGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTTGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAGGAGCTTAAGGATAGATTTCTGGTAagga < 5:74165/139‑1 (MQ=255)
tttGTCGGTCTCTTTTGTTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAGGAGCTTAAGGATAGATTTCTGGTAaggagg < 2:927819/140‑1 (MQ=255)
tttGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTATTCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAGGAGCTTAAGGATAGATTTCTGGTAaggagg < 1:483965/140‑1 (MQ=255)
tttGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAGGAGCTTAAGGATAGATTTCTGGTAaggagg < 5:108624/140‑1 (MQ=255)
tttGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAGGAGCTTAAGGATAGATTTCTGGTAaggagg < 5:523423/140‑1 (MQ=255)
tttGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAGGAGCTTAAGGATAGATTTCTGGTAaggagg < 5:714476/140‑1 (MQ=255)
tttGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAGGAGCTTAAGGATAGATTTCTGGTAagga < 7:475819/138‑1 (MQ=255)
ttGTCGGTCGCGTTTGTTTATTTTTTGGTAATAAAAATGTTATACATTTTTTGCATATAATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAGGAGCTTAAGGATAGATTTCTGGTAAggagga > 1:846415/1‑140 (MQ=255)
gtcgCTTTTGTTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAAACTTAACCATGAATTTATTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAGGAGCTTAAGGATAGATTTCTGGTAAGGAGGAAGTATg > 6:908855/1‑140 (MQ=255)
tcgCTTTTGTTTATTTTTTTGTTATAAAAATTTTATAAATTTGTTTCATATAATTATGCAACCTTAACCAAGAAATTATTTAGAAGGAAAATTTTTATTAATGAGCTTAAGGATATATTTATGGTAAGGAGGAAGTATgt > 3:862527/1‑139 (MQ=255)
gCTTTTGTTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTCTACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAGGAGCTTAAGGATAGATTTCTGGTAAGGAGGAAGTATGGaa < 2:505492/140‑1 (MQ=255)
ggtttGTTTATTTTTTGTTAAGAAATATGTTATACATTTGTTGCTTTTCATTATGCAACCTTAACCTTTAATTTAGTTAGCAGGAATATGTTTATTAAGGAGCTTATGGATATATTTCTGGTAAGGAGGATGTATGTAAg < 5:462915/138‑1 (MQ=255)
tttGTTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTTCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGAAGGAAAATGGTTATTAAGGAGCTTAAGGATAGATTTCTGGTAAGGAGGAAGTATGGAAg < 8:295940/138‑1 (MQ=255)
ttGGTAAGAAAAATGTTATTCATTTTTTGCATATCATTATGCAACATTAGCCATGATTTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTTAGGAGCTTAAGGTTAGATTTCTGGTAAGGAGTAATGATGTATGTGGGGATTTTgggg < 6:1019472/140‑1 (MQ=255)
ttGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAGGAGCTTAAGGATAGATTTCTGGTAAGGAGGAAGTATGGAAGTGGGCAATTTgggg < 1:513048/140‑1 (MQ=255)
ttGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAGGAGCTTAAGGATAGATTTCTGGTAAGGAGGAAGTATGGAAGTGGGCAATTTgggg < 3:388366/140‑1 (MQ=255)
ttGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAGGAGCTTAAGGATAGATTTCTGGTAAGGAGGAAGTATGGAAGTGGGCAATTTgggg < 2:748099/140‑1 (MQ=255)
ggTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTATGCGACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAGGAGCTTAAGGATAGATTTCTGGTAAGGAGGAAGTATGGAAGTGGGCAATTTGGGGaa < 3:694696/140‑1 (MQ=255)
aaTGTTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAGGAGCTTAAGGATAGATTTCTGGTAAGGAGGAAGTATGGAAGTGGGCAATTTGGGGAAGACGTATTc < 6:211312/140‑1 (MQ=255)
tataCATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAGGAGCTTAAGGCTAGATTTCTGGTAAGGAGGAAGTATGGAAGTGGGCAATTTGGGGAAGACGTATTCGCTGt < 2:195253/140‑1 (MQ=255)
taCATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAGGAGCTTAAGGATAGATTTCTGGTAAGGAGGAAGTATGGAAGTGGGCAATTTGGGGAAGACGTATTCGCTGTTg < 6:544467/140‑1 (MQ=255)
taCATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAGGAGCTTAAGGATAGATTTCTGGTAAGGAGGAAGTATGGAAGTGGGCAATTTGGGGAAGACGTATTCGCTGTTg > 3:50122/1‑140 (MQ=255)
aTTTGTTGCATTTCATTAAGGAAACTTTACGATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAGGAGCTTAAGGATAGATTTCTGGTAATGAGGAAGTATGGAAGTGGGCAATTTGGGGAAGACGTATTCGCTGTTGa < 8:113825/138‑1 (MQ=255)
aTTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAGGAGCTTAAGGATAGATTTCTGGTAAGGAGGAAGTATGGAAGTGTGCAATTTGGGGAAGACGTATTCGCTGTTGAAt < 4:924853/140‑1 (MQ=255)
aTTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAGGAGCTTAAGGATAGATTTCTGGTAAGGAGGAAGTATGGAAGTGGGCAATTTGGGGAAGACGTATTCGCTGTTGAAt < 3:129564/140‑1 (MQ=255)
aTTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAGGAGCTTAAGGATAGATTTCTGGTAAGGAGGAAGTATGGAAGTGGGCAATTTGGGGAAGACGTATTCGCTGTTGAAt < 1:542241/140‑1 (MQ=255)
aTTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAGGAGCTTAAGGATAGATTTCTGGTAAGGAGGAAGTATGGAAGTGGGCAATTTGGGGAAGACGTATTCGCTGTTGAAt < 5:1044023/140‑1 (MQ=255)
aTTTGTGGCTGATCATTATGCAACCTTAACCATGCACTTAGTAAGCAGGAAAATGGTTAGTAAGGAGCTTCAGGATAGCTTTCTGGGAAGGAGGAAGTATGGAAGTGGGCAATTTGGGGAAGACGTATTCGCGGTTGa < 8:879494/138‑1 (MQ=255)
ttgttgCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAGGAGCTTAAGGATAGATTTCTGGTAAGGAGGAAGTATGGAAGTGGGCAATTTGGGGAAGACGTATTCGCTGGTGAATCt > 6:350929/1‑140 (MQ=255)
gttgCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAGGAGCTTAAGGATAGATTTCTGGTAAGGAGGAAGTATGGAAGTGGGCAATTTGGGGAAGACGTATTCGCTGTTGAATCTgg > 3:1135916/1‑140 (MQ=255)
ttgCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAGGAGCTTAAGGATAGATTTCTGGTAAGGAGGAAGTATGGAAGTGGGCAATTTGGGGAAGACGTATTCGCTGTTGAATCTGGc < 6:312671/140‑1 (MQ=255)
|
GACGAGTATCACTACTTGTCAGTTTGCTGTCTGCCGTTACAGTACTTTCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAGGAGCTTAAGGATAGATTTCTGGTAAGGAGGAAGTATGGAAGTGGGCAATTTGGGGAAGACGTATTCGCTGTTGAATCTGGC > NZ_CP022686/1360611‑1360887
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
