Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A8 F12 I0 R1
|
158 |
5737.7 |
7407908 |
98.3% |
7281973 |
135.6 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP022686 |
1,360,750 |
G→T |
8.2% |
intergenic (‑85/+239) |
kgtP ← / ← rrf |
alpha‑ketoglutarate permease/5S ribosomal RNA |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP022686 | 1,360,750 | 0 | G | T | 8.2%
| 380.1
/ 2.8
| 165 | intergenic (‑85/+239) | kgtP/rrf | alpha‑ketoglutarate permease/5S ribosomal RNA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (53/93); new base T (17/2); total (70/95) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 9.87e-06 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 173 total aligned reads displayed.
CGAGTATCACTACTTGTCAGTTTGCTGTCTGCCGTTACAGTACTTTCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTG‑TTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAGGAGCTTAAGGATAGATTTCTGGTAAGGAGGAAGTATGGAAGTGGGCAATTTGGGGAAGACGTATTCGCTGTTGAATCTGGCTT > NZ_CP022686/1360613‑1360889
|
cgaGTATCACTACTTGTCAGTTTGCTGTCTGCCGTTACAGTACTTTCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATTCTTTTGTCGGTCGCTTTTG‑TTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCa < 4:688063/140‑1 (MQ=255)
cgaGTATCACTACTTGTCAGTTTGCTGTCTGCCGTTACAGTACTTTCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTG‑TTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCa < 3:156589/140‑1 (MQ=255)
cgaGTATCACTACTTGTCAGTTTGCTGTCTGCCGTTACAGTACTTTCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTG‑TTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCa < 3:199860/140‑1 (MQ=255)
cgaGTATCACTACTTGTCAGTTTGCTGTCTGCCGTTACAGTACTTTCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTG‑TTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCa < 2:915206/140‑1 (MQ=255)
cgaGTATCACTACTTGTCAGTTTGCTGTCTGCCGTTACAGTACTTTCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTG‑TTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCa < 1:324964/140‑1 (MQ=255)
cgaGTATCACTACTTGTCAGTTTGCTGTCTGCCGTTACAGTACTTTCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTG‑TTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCa < 4:451615/140‑1 (MQ=255)
cgaGTATCACTACTTGTCAGTTTGCTGTCTGCCGTTACAGTACTTTCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTG‑TTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCa < 5:260232/140‑1 (MQ=255)
cgaGTATCACTACTTGTCAGTTTGCTGGCTGCCTTTAGAGTACTTTCAGCCTTGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCACTGCTTTTGTCGGTCGCTTTTT‑TTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCa < 5:883387/140‑1 (MQ=255)
gTATCACTACTTGTCAGTTTGCTGTCTGCCGTTACAGTACTTTCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTG‑TTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCatat < 2:807454/140‑1 (MQ=255)
gTATCACTACTTGTCAGTTTGCTGTCTGCCGTTACAGTACTTTCAGCCATGCCATTATGGCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGGCGCTTTTG‑TTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCat < 7:620999/138‑1 (MQ=255)
gTATCACTACTTGTCAGTTTGCTGGCTGCCGTTACAGTACTTTCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTG‑TTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCat < 7:685716/138‑1 (MQ=255)
ctTGTCAGGATGCTGGCTGCCGTTACAGTACTTTCAGCCATGCCAATCTGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGGCGGTCGCTTTTG‑TTTATGTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTATGCa < 1:559388/140‑1 (MQ=255)
gTCAGTTTGCTGTCTGCCGTTACAGTACTTTCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTG‑TTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAAcc > 1:703822/1‑140 (MQ=255)
taaGTTTGCTGTCTGCCGTTACAGTACTTTCAGCCATGCCATTATGGCTCCTGACGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTG‑ATTATTTTTTGGTAATAAAAAAGTTATAAATTTTTTGAATATAATTATTCaaa > 8:76931/3‑137 (MQ=255)
tCAGTTTGCTGTCCGCAGGTACAGTACTTTCAGACATGCCATTATTTCTCGTGCCGTATTACAATGCTTTTGTAGGTAGCTTTTG‑TTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATAAATTTGTTGAATATCATTATGCATCCt < 4:169175/140‑1 (MQ=255)
aGTTTGCTGTCTGCCGTTACAGTACTTTCAGCCAAGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTA‑TTTATATTTATGTAATAAAAATGTTATAAATTTGATGCAAATAATAATTCAACCATa > 6:339761/1‑140 (MQ=255)
tttGCTGTCTGCCGTTACAGTACTTTCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCGTTTG‑TTTTTTTTTTGGTTATAAAAATGTTATACATTTTTTGCATATCATTATGCAACCTTaaa > 1:650370/1‑139 (MQ=255)
tttGCTGTCTGCCGTTACAGTACTTTCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCGTTTG‑GTTTTTTTTTGGGATCAAAAATGTTATACATTTGTTGGATATCATTATGCGACCTTAAc > 2:848250/1‑140 (MQ=255)
ttGCTGGCTGCCGTTACAGTACTTTCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTAGGTCGCTTTTG‑TTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAAcc < 2:78192/140‑1 (MQ=255)
tGCTGTCTGCCGTTACAGTACTTTCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCGTTTG‑TTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCTTTTCATTATGCAACCTTAACCa > 6:506590/1‑140 (MQ=255)
tGCTGTCTGCCGTTACAGTACTTTCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCGGTTT‑TTTTTTTTTTTGTTAGAAAAATTTTATAAATTTGTTTGATATCATTATGGAACCATAAc > 7:343436/1‑138 (MQ=255)
tGTCTGCCGTTACAGTACTTTCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTAGCTTTTT‑TTTATTTTTTGGGAAGAAAAATGTTATACAATTTTTGCATATCATTATGAAACCTTAACCAAGa > 4:575935/1‑140 (MQ=255)
tGCCGTTACAGTACTTTCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTG‑TTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAAttt > 4:881323/1‑140 (MQ=255)
cGTTACAGTACTTTCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTT‑TTTATTTTTTTGTAAGAAAAATTTTATACATTTGTTGAATATAATTATGCAACCTTAACCATTAATtta > 7:256348/1‑138 (MQ=255)
cGTTACAGTACTTTCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTG‑TTTTTTTTTTGGTTAGAAAAATTTTTTACATTTGTTGAATATCATTTTGGAAACTTAACAATTAATtta > 8:340706/1‑138 (MQ=255)
tACAGTACTTTCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCTTAATCCAATGCTTTTGTCGGGCGCTTTTG‑TTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATttagttag < 4:349945/140‑1 (MQ=255)
tACAGTACTTTCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTG‑TTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATttagtt < 8:498882/138‑1 (MQ=255)
aCTTTCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTG‑TTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGaa < 3:716248/140‑1 (MQ=255)
aCTTTCAGCCATGACATTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTTTCGGTCGCTTTTG‑TTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGaa < 5:339761/140‑1 (MQ=255)
cTTTCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTG‑TTTATTTTTTGGTTAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATttagttag < 6:543246/133‑1 (MQ=255)
cTTTCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTG‑TTTATTTTTTGGTTAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATttagttag > 5:543246/1‑133 (MQ=255)
cTTTCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTG‑TTTAATTTTTGGTAATAAAAAATTTATAAAATTGTTGCATATATTTATTCAACCTTAACCATGAAATTAGTTATAAGGaaa > 1:12662/1‑140 (MQ=255)
ttCAGCCTAGCCATTATGTCTACTGCCGTAATCCTATGCTTTTGTTGGTCGCTTTTG‑TTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGATTTTAGTTAGCAGGAAAAt < 2:958953/140‑1 (MQ=255)
ttCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTG‑TTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGaaa < 8:250268/138‑1 (MQ=255)
tCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTG‑TTTATATTTTTGTAATATAAATGTTTTACATTTTTTGCATATAATTTTGGAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGGAGGAAAATg > 6:762194/1‑140 (MQ=255)
tCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCAACTCTTTTGTCGGTCGCTTTTG‑ATTAATTTTTGGTAAGAAAAATTTTATACATTTGTTGGATATCATTTTTCAACCATAACCAATAATATATTTAGCAGGAAAATg > 5:291924/1‑140 (MQ=255)
aGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTT‑TTTATTTTTTGGTAAGAAAAAATTTATACATTTTTTGAATATCATTATTCAACCTTAACCATTAAATTATTTAGCAGGATAAtt > 8:773667/1‑137 (MQ=255)
aGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGATTTTG‑TTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTTTTGCATATCATTTAGCAACCTTAAACATGCATTTAGTTATAATGAAAAtt > 8:769131/1‑137 (MQ=255)
catgccatTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCGTTTG‑TTTATTTTTTGGTAAGAAAAAAGTTATACATTTTTTTCATATAATTAATCAACCTTAACCATTAATTTTGTTAGCAGGAAAATGGttat > 2:332736/1‑140 (MQ=255)
tgccatTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTT‑TTTTTTTTTTTGTAATAAAAATTTTATACATTTGTTGGATATAATTAATGAACCATAAACAAGAATTTAGTTTGCAGGATAATTGttattt > 6:184786/1‑139 (MQ=255)
tgccatTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTG‑TTTATTTTTTTGTAAGAAAAAATTTATACAATTTTTTCATATCATTTTTCAAACTTAACCAAGAATTTTTTTAGCAGGAAAATGGttatta > 1:254571/1‑140 (MQ=255)
tgccatTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCGTTTG‑TTTATTTTTTGGGAAGAAAAATTTTATTCATTTTTTTCATATAATTATGGAACCATAACCATTAATTTAGTTTGCAGGAAAATTGttttta > 5:170101/1‑140 (MQ=255)
ccatTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTTTTTTTTTGGTAA‑AAAAAAGTTATAAAATTTTTGGAAATAAATATGCAACCTTAAAAAAGAATTTATTTTGAAGGAAAATTGttatta > 8:469909/1‑138 (MQ=255)
ccatTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTG‑TTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATTTCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAg < 5:46218/140‑1 (MQ=255)
ccatTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTG‑TTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGttatta < 7:469909/138‑1 (MQ=255)
ccatTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTG‑TTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAg < 3:617657/140‑1 (MQ=255)
ccatTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCGTTTT‑TTTTTTTTTTTGTAAGAAAAATGTTATAAAATTTTTTCATATAAATATGCAACCTTTACCATTAATTTATTTATCAGGAAAATGGttatta > 7:766148/1‑138 (MQ=255)
ccatTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCGTTTG‑TTTATTTTTTGGTTATAAAAATGTTATAAATTTTTTTCAAATAATTATGCAACCATAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGttttta > 7:75421/1‑138 (MQ=255)
aTGTCTCCTGGCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCTCTTTTG‑TTTATTTTTTGGTAAGAAAAATTTTATACATTTGTTTTATATCATTTTGCAACCTTAACCATTAATTTATTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAGGAGCt < 4:372939/140‑1 (MQ=255)
aTGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTG‑TTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAGGAGCt > 6:660903/1‑140 (MQ=255)
aTGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCGTTTG‑GTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACAATTTTTGCATATCATTATGGAACCTTAACCATTAATTTAGTTAGCAGGAAAATTGTTATTAAGGAGCt > 4:207008/1‑140 (MQ=255)
tcCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTG‑TTTATTTTTTGGTAATAAAAATTTTATACAATTTTTTCTTATCAATATGAAAACATAACCATGAATTTATTTAGCAGGAAAATGGTTATTAATGATCTTAAgg > 6:689093/1‑140 (MQ=255)
tcCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCGTTTG‑TTTATTTTTTTGTAAGAAAAATTTTATACATTTGTTTCATATAATTATGCAACCTTAACCCTGTATTTAGTTATCAGGAAAATTGTTATTAAGTAGCTTAAgg > 6:23272/1‑140 (MQ=255)
ccTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTT‑TTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACAATTTTTGCATATAATTTTGCAACCTTAACCAAGAATTTAATTATCAGGAAAATGGTTATTAAGGAGCTTAAGGa > 5:460700/1‑140 (MQ=255)
ccTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTG‑TTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAGCCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAGGAGCTTAAGGa > 2:299015/1‑140 (MQ=255)
ccTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTG‑TGTAGTTTTTGGTAAGAAAAATGTGATACAATTTTTGCATATCATTATGGACCCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATTGTAATTAATTAGCGTAATGa > 4:644942/1‑140 (MQ=255)
ccTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGGCGCTTTTG‑TTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAGGAGCTTAAGGa > 1:902028/1‑140 (MQ=255)
tAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTG‑TTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAGGAGCTTAAGGATAGAttt < 3:817547/140‑1 (MQ=255)
tAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCGTTTT‑TTTTTTTTTTTGTTAGAAAAATGTTATACATTTTTTTGATATAATTATGCAACCATAAACATTAATTTAGTTATAAAGAAAATGGTTATTAAGGAGCGTAAAGATAGAttt > 5:184204/1‑140 (MQ=255)
ccAATTCTTTTGTCGGTCGCTTTTG‑TTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAGGAGCTTAAGGATAGATTTCTgg < 2:176206/140‑1 (MQ=255)
ccAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTG‑TTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAGGAGCTTAAGGATAGATTTCTgg < 5:3992/140‑1 (MQ=255)
cAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTG‑TTTTTTTTTTTGTTAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGTAAATGGTTATTAAGTAGCTTAAGGATAGATTTCTGGt < 2:61850/140‑1 (MQ=255)
aaTGCTTTTGTCGGTCGCTTTTG‑TTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAGGAGCTTAAGGATAGATTTCTGGTa < 3:770741/140‑1 (MQ=255)
aTGCTTTTGTCGGTCGCTTTTT‑TTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTTTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTTATGAGGTTTAGGATAGATTTCTGGTat > 4:606288/1‑139 (MQ=255)
aTGCTTTTGTCGGTCGCTTTTG‑TTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAAACTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAGGTGCTTAAGGATAGATTTATGGTaa > 4:893158/1‑140 (MQ=255)
tGCTTTTGTCGGTCGCTTTTT‑TTTTTTTTTTGGTAATAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATAATTATTCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAGGAGCTTAAGGATAGAATTATGGTaat > 1:446835/1‑139 (MQ=255)
gCTTTTGTCGGTGGCTTTTG‑TTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAGGAGCTTAAGGATAGATTTCTGGTaa < 8:800589/138‑1 (MQ=255)
gCTTTTGTCGGTCGCTTTTG‑TTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATAAATTTGTTGCATATAATTATTCAACCTTAAACATGAATTTAGTTATCAGGAAAATGGTTATTAAAGAGCTTAAGGATATATTTGTGTTaa > 8:881179/1‑138 (MQ=255)
gCTTTTGTCGGTCGCGTTTG‑TTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAGGAGCTTAAGGATAGATTTCTGGTAagg < 3:500085/140‑1 (MQ=255)
tttGTGGGTCGGTTTTG‑TTTATTTTTTTGTTAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATGATTATGGAACCTTAACCTTGAATTTAGTTAGCATGAAAATGTTTATTATGGAGATTAAGGATAGATTTCTGGTAaggagg < 1:229542/140‑1 (MQ=255)
tttGTCGGTCGCTTTTG‑TTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATTAATTTAGTTATCAGGAAAATGGTTATTAAGGAGCTAAAGGATAGATTTCTGGTAaggagg < 6:391125/140‑1 (MQ=255)
tttGTCGGTCGCTTTTG‑TTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAGGAGCTTAAGGATAGATTTCTGGTAaggagg < 2:748220/140‑1 (MQ=255)
tttGTCGGTCGCTTTTG‑TTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAGGAGCTTAAGGATAGATTTCTGGTAaggagg < 2:773793/140‑1 (MQ=255)
tttGTCGGTCGCTTTTG‑TTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAGGAGCTTAAGGATAGATTTCTGGTAaggagg < 4:819024/140‑1 (MQ=255)
tttGTCGGTCGCTTTTG‑TTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAGGAGCTTAAGGATAGATTTCTGGTAaggagg < 2:185132/140‑1 (MQ=255)
tttGTCGGTCGCTTTTG‑TTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAGGAGCTTAAGGATAGATTTCTGGTAaggagg < 6:462053/140‑1 (MQ=255)
tttGTCGGTCGCTTTTG‑TTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAGGAGCTTAAGGATAGATTTCTGGTAaggagg < 2:254571/140‑1 (MQ=255)
tttGTCGGTCGCTTTTG‑TTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAGGAGCTTAAGGATAGATTTCTGGTAaggagg < 5:94013/140‑1 (MQ=255)
tttGTCGGTCGCTTTTG‑TTTATTTTTTGGTAACAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATTAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAGGAGCTTAAGGATAGATTTCTGGTAagga < 7:553690/138‑1 (MQ=255)
tttGTCGGGCTCTTTTT‑TTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGGATTTGAATATGCATCATTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAGGAGCTTATGGATAGATTTCTGGTAaggagg < 6:215276/140‑1 (MQ=255)
ttGTCGGTCGCTTTTG‑TTTATTTTTTTGTAAGAAAAATGTTATAAATTTTTTTCATATCATTATGCAACCATAACCATGAATTTAGTTATCAGGAAAAATGTTAATAAGGAGCAGAAGTATAGATTTCTGGTAAggagga > 5:244384/1‑140 (MQ=255)
ttGTCGGTCGCTTTTG‑TTTATTTTTTGGTAATAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATTAATTTAGTTATCAGGAAAATGGTTATTAAGGCTCTTAAGGATATATTTATGGTAAggagga > 6:474728/1‑140 (MQ=255)
tcgCTTTTG‑TTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTTTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGAAGGAAAATTGTTATTAAGGAGCTTAAGGATAGATTTATGGTAAGGAGGAAGTATgg > 2:941714/1‑140 (MQ=255)
gCTTTTG‑TTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAGGAGCTTAAGGATAGATTTCTGGTAAGGAGGAAGTATGGaa < 2:947239/140‑1 (MQ=255)
tG‑TTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAGGAGCTTAAGGATAGATTTCTGGTAAGGAGGAAGTATGGAAGTggg < 5:660903/140‑1 (MQ=255)
tG‑TTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAGGAGCTTAAGGATAGATTTCTGGTAAGGAGGAAGTATGGAAGTg < 8:727792/138‑1 (MQ=255)
tttGGTAAGTAAAATGTTATACATTTGTTGCAAATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAGGAGCTTAAGGATAGATTTCTGGTAAGGAGGAAGTATGGAAGTGGGCAATTTggg < 2:527128/140‑1 (MQ=255)
tttGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAGGAGCTTAAGGATAGATTTCTGGTAAGGAGGAAGTATGGAAGTGGGCAATTTggg < 3:275638/140‑1 (MQ=255)
ggTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAGGAGCTTAAGGATAGATTTCTGGTAAGGAGGAAGTATGGAAGTGGGCAATTTGGGGaa < 5:335456/140‑1 (MQ=255)
tataCATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAGGAGCTTAAGGATAGATTTCTGGTAAGGAGGAAGTATGGAAGTGGGCAATTTGGGGAAGACGTATTCGCTGt < 3:873541/140‑1 (MQ=255)
tataCATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAGGAGCTTAAGGATAGATTTCTGGTAAGGAGGAAGTATGGAAGTGGGCAATTTGGGGAAGACGTATTCGCTGt < 6:325705/140‑1 (MQ=255)
taCATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAGGAGATTAAGGATAGATTTCTGGTAAGGAGGAAGTATGTAAGTGGGCAATTTGGGGAAGACGTATTCGCTGTTg > 4:100000/1‑140 (MQ=255)
taCATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTAAGCAGGAAAATGGTTATTAAGGAGCTTAAGGATAGATTTCTGGTAAGGAGGAAGTATGGAAGTGGGCATTTTGGGGTAGACGTATTCGCTGTTg > 1:117466/1‑140 (MQ=255)
ttttGTTGCATTTCATTATGCAACCTTATCGATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAGGAGCTTAAGGATAGATTTCTGGTAAGGAGGAAGTATGGAAGTGGGCAATTTGGGGAAGACGTATTCGCTGTTGa < 7:165426/137‑1 (MQ=255)
aTTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAGGAGCTTAAGGATAGATTTCTGGTAAGGAGGAAGTATGGAAGTGGGCAATTTGGGGAAGACGTATTCGCTGTTGAAt < 2:601632/140‑1 (MQ=255)
ttgttgCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAGGAGCTTAAGGATAGATTTCTGGTAAGGAGGAAGTATGGAAGTGGGCAATTTGGGGAAGACGTATTCGCTGTTGAATCt > 3:344778/1‑140 (MQ=255)
tgttgCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAGGAGCTTAAGGATAGATTTCTGGTAAGGAGGAAGTATGGAAGTGGGCAATTTGGGGAAGACGTATTCGCTGTTGAATCTg > 2:73337/1‑140 (MQ=255)
gttgCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAGGAGCTTAAGGATAGATTTCTGGTAAGGAGGAAGTATGGAAGTGGGCAATTTGGGGAAGACGTATTCGCTGTTGAATCTgg > 2:863690/1‑140 (MQ=255)
ttgCATATCATTATGCAACCTTAACCATTAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAGGAGCTTAAGGATAGATTTCTGGTAAGGAGGAAGTATGGAAGTGGGCAATTTGGGGAAGACGTATTCGCTGTTGAATCTGGc < 1:782389/140‑1 (MQ=255)
gCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAGGAGCTTAAGGATAGATTTCTGGTAAGGAGGAAGTATGGAAGTGGGCAATTTGGGGAAGACGTATTCGCTGTTGAATCTGGCtt > 1:853091/1‑140 (MQ=255)
|
CGAGTATCACTACTTGTCAGTTTGCTGTCTGCCGTTACAGTACTTTCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTG‑TTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAGGAGCTTAAGGATAGATTTCTGGTAAGGAGGAAGTATGGAAGTGGGCAATTTGGGGAAGACGTATTCGCTGTTGAATCTGGCTT > NZ_CP022686/1360613‑1360889
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
