Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A7 F2 I0 R1
|
252 |
7301.5 |
9636800 |
98.5% |
9492248 |
135.6 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP022686 |
1,360,750 |
G→T |
10.7% |
intergenic (‑85/+239) |
kgtP ← / ← rrf |
alpha‑ketoglutarate permease/5S ribosomal RNA |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP022686 | 1,360,750 | 0 | G | T | 10.7%
| 484.5
/ 7.2
| 207 | intergenic (‑85/+239) | kgtP/rrf | alpha‑ketoglutarate permease/5S ribosomal RNA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (61/116); new base T (25/5); total (86/121) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.61e-07 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 217 total aligned reads displayed.
CGAGTATCACTACTTGTCAGTTTGCTGTCTGCCGTTACAGTACTTTCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAGGAGCTTAAGGATAGATTTCTGGTAAGGAGGAAGTATGGAAGTGGGCAATTTGGGGAAGACGTATTCGCTGTTGAATCTGGCTT > NZ_CP022686/1360613‑1360889
|
cgaGTATCACTACTTGTCAGTTTGCTGTCTGCCGTTACAGTACTTTGATACATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATttgttg < 1:427095/138‑1 (MQ=255)
cgaGTATCACTACTTGTCAGTTTGCTGTCTGCCGTTACAGTACTTTCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATttgttg < 1:582407/138‑1 (MQ=255)
cgaGTATCACTACTTGTCAGTTTGCTGTCTGCCGTTACAGTACTTTCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCa < 4:1206142/140‑1 (MQ=255)
cgaGTATCACTACTTGTCAGTTTGCTGTCTGCCGTTACAGTACTTTCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCa < 3:822777/140‑1 (MQ=255)
cgaGTATCACTACTTGTCAGTTTGCTGTCTGCCGTTACAGTACTTTCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCa < 7:439136/140‑1 (MQ=255)
cgaGTATCACTACTTGTCAGTTTGCTGTCTGCCGTTACAGTACTTTCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCa < 8:264930/140‑1 (MQ=255)
cgaGTATCACTACTTGTCAGTTTGCTGTCTGCCGTTACAGTACTTTCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGGCGCTTTTGTTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCa < 4:698547/140‑1 (MQ=255)
cgaGTATCACTACTTGTCAGGTTGCTGTCTGCCGTTACAGTACTTTCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCa < 5:823601/140‑1 (MQ=255)
cgaGTAGCACTCCTTGTCAGTTTGCTGTCTGCCGTTACAGTACTTTCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCa < 8:1104808/140‑1 (MQ=255)
gTATCACTACTTGTCAGTTTGCTGTCTGCCGTTACAGTACTTTCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCatat < 4:473156/140‑1 (MQ=255)
aTCACTACTTGTCAGTTTTCTGTCTGCCGTTACAGTACTTTCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGGTTATTTTTTGGTAAGAATAATGTTATACATTTGTTGCatat < 1:503877/138‑1 (MQ=255)
aTCACTACTTGTCAGTTTGCTGTCTGCCGTTACAGTACTTTCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCatat < 2:878044/138‑1 (MQ=255)
tactTGTCAGTTTGCTGTCTGCCGTTACAGTACTTTCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCAGTAATCCAATGCTTTTGGCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTGTTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTa < 1:1062716/138‑1 (MQ=255)
aactTGTCAGTTTGCTGTCTGCCGTTACAGTACTTTCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTATg < 3:995/139‑1 (MQ=255)
actTGTCAGTTTGCTGTCTGCCGTTACAGTACTTTCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTATGc < 3:372455/140‑1 (MQ=255)
actTGTCAGTTTGCTGTCTGCCGTTACAGTACTTTCAGCCATGCCACTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTATGc < 3:513679/140‑1 (MQ=255)
ctTGTCAGTTTGCTGTCTGCCGTTACAGTACTTTCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTTTTTTTTTTTTTGTAATTAAAATGTTATACATTTTTTTCAAATCATTAttga > 7:1092954/1‑137 (MQ=255)
ctTGTCAGTTTGCTATCTGCCGTTACAGTACTTTCAGCCATGCCAGTATGTCTCATGCCGTAATCAAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTTGTAAGAAAAATGTTATACAATTGTTGAATATCATTATGCa > 8:345791/1‑140 (MQ=255)
ctTGTCAGTTAGCTGTCTGCCGTTACAGTACTTTCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTAATTTTTTTGTAATAAAAATTTTATACATTTTTTTCAAATAAATATGcg > 3:608189/1‑139 (MQ=255)
tGTCAGTTTGCTGTCTGCCGTTACAGTACTTTCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTTTTTTTTTGTAAGAAAAATTTTTTACATTTTTTGCATATAATTATTCaaa > 4:570973/1‑139 (MQ=255)
tGTCAGTTTGCTGTCTGCCGTTACAGTACTTTCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCGTTTTTTTTTTTTTTTGTTATAAAAATTTTATACATTTTTTGCAAATAATTAttgaac > 7:57733/1‑135 (MQ=255)
tGTCAGTTTGCTGTCTGCCGTTACAGTACTTTCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCGTTTGTTTATTTTTTGGTTATAAAAATGTTATACAATTGTTTCATATAATTATGCa > 1:450379/1‑138 (MQ=255)
tCAGTTTGCTGTCTGCCGTTACAGTACTTTCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTTGTTAGAAAAATGTTATTCATTTTTTTCATATCATTATGCAAc > 1:1193312/1‑138 (MQ=255)
tCAGTTTGCTGTCTGCCGTTACAGTACTTTCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTGGTTAGAAAAAATTTTTAAAATTGTTTCAATTCATTAATCAAc > 1:484099/1‑138 (MQ=255)
tCAGTTTGCTGTCTGCCGTTACAGTACTTTCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAAcca > 6:340416/1‑139 (MQ=255)
tCAGTTTGCTGTCTGCCGTTACAGTACTTTCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCt < 6:651966/140‑1 (MQ=255)
cAGTTTGCTGTCTGCCGTTACAGTACTTTCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTTTTTTTTGGTAAGAAAAATTTTATACATTTTTTGAATATAATTATGCAAcc > 2:557008/1‑138 (MQ=255)
cAGTTTGCTGTCTGCCGTTACAGTACTTTCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTGTTAATAAAAATTTTATACATTTTTTGAATATAATTATGCAAcc > 2:150500/1‑138 (MQ=255)
cAGTTTGCTGTCTGCCGTTACAGTACTTTCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGGTTTTTTTTTTGTAAGAAAAATGTTATACATTTTTTTCATATCATTATGCAAcc > 2:156373/1‑138 (MQ=255)
aGTTTGCTGTCTGCCGTTACAGTACTTTCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTGTTTTTTATTTTTTGGTTATAAAAATGTTTTACATTTTTTTCATATAAATATGCAACCGTa > 6:55687/1‑140 (MQ=255)
tGCTGTCTGCCGTTACAGTACTTTCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATAATTATGCAACCTTAACCa > 3:248162/1‑140 (MQ=255)
tCTGCCGTTACAGTACTTTCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTTGTTAAAAAAATGTTTTTAATTTTTTTCATATCATTATGCCACCATAACCAAGa > 1:1226675/1‑138 (MQ=255)
tGCCGTTACAGTACTTTCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGGTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATAATTATGCAAACTTAACCATGAAttt > 8:642483/1‑140 (MQ=255)
tACAGTACTTTCAGCCATTCCTTTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATttagttag < 6:955026/140‑1 (MQ=255)
tACAGTACTTTCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATttagttag < 5:368664/140‑1 (MQ=255)
tACAGTACTTTCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATttagtt < 2:601166/138‑1 (MQ=255)
cTTTCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTTTTGCATATCATTATGCAACCGTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGaaa > 4:105201/1‑140 (MQ=255)
cTTTCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTGTATTTTTTTGTAAAAAAAATTTTTTAAATTTTTTGCATATGATTATTGAACCTTAAGCATGTATTTAGTTATGAGGaaa > 3:189918/1‑140 (MQ=255)
ttCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAAt < 8:119855/140‑1 (MQ=255)
cAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAAt < 2:286483/138‑1 (MQ=255)
cAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATgg < 4:140386/140‑1 (MQ=255)
aGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACAATTTTTGGATATCAATTTGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAAtt > 2:1148853/1‑137 (MQ=255)
tgccatTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTGGTAAGAAAAATTTTATACATTTTTTGCATATAATTATGCAAACTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGgtattt > 6:422836/1‑139 (MQ=255)
tgccatTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCGTTTGGTTATTTTTTGGTAAGTAAAATTTTATTACTTTTTTGGGTATCATTATGCAACCATAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGttattt > 7:957213/1‑139 (MQ=255)
gccatTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTaa > 5:962922/1‑140 (MQ=255)
ccatTATGTCTCCTGCCTTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGttatta < 2:973579/138‑1 (MQ=255)
ccatTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGttatta < 1:158688/138‑1 (MQ=255)
ccatTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAg < 8:232154/140‑1 (MQ=255)
ccatTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTAATTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGttatta < 2:725227/138‑1 (MQ=255)
ccatTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCGTTTGTTTTTTTTTTTGTTAGAAAAATTTTTTACATTTTTTTCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTATTTATCAGGAAAATGGttatta > 1:536246/1‑138 (MQ=255)
ccatTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCGTTTGTTTATTTTTTGTTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATAATTATGAAACCTTAACCATGAATTTTGTTAGCAGGAAAATGGTTATTaat > 3:854917/1‑139 (MQ=255)
catTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTaa < 2:1059992/138‑1 (MQ=255)
ttATGTCTCCTGCCGTAATCCGATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAGGAg < 7:1122473/140‑1 (MQ=255)
aTGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTATTCAAACTTAACCATGAATTTAGTTAGCAAGAAAATGGTTATTTAGGTGCt > 6:1049681/1‑140 (MQ=255)
gTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAGGAGCt < 1:588169/138‑1 (MQ=255)
ccTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAGGAGCTTAAg < 1:810910/138‑1 (MQ=255)
ccTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAGGAGCTTAAGGa < 3:73183/140‑1 (MQ=255)
tGCCGTAATCCTATGCTTTTGGAGGTCGCGTTTGTTTTGTTTTTGGTCAGATTAATGTTTTTGATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTATCCCTGAATTTAGTTAGCAGGAATATGGTTATTAAGGAGGTTAAGGa < 2:419740/138‑1 (MQ=255)
tGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTTTTTTTTGGTATGGAAAATGTTATACATTTTTTGCATATCATTATGCACACTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTAATGGGCTGAAGGAtt > 8:726246/1‑139 (MQ=255)
tGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTTTAAATTTGTTTCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTTGTTAGCAGGTAAATGGTTATTTAGGAGCTTAAGGAtt > 6:1172822/1‑139 (MQ=255)
ccGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCa > 4:747897/1‑71 (MQ=255)
cGTAATCCAATGCTTTTGTAGGTGTCTTTTGTTTATTTTTTGTTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGAATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAGGAGCTTAAGGATAGAt < 4:334957/140‑1 (MQ=255)
tAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAGGAGCTTAAGGATAGAttt < 6:962922/140‑1 (MQ=255)
tAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAGGAGCTTAAGGATAGAttt < 4:877402/140‑1 (MQ=255)
aTCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAGGAGCTTAAGGATAGATTTCt < 3:692062/140‑1 (MQ=255)
aTCCAATGCTTTTGTCGGTCGCGTTTTTTTATTTTTTTGTTAGAAAAATGTTATAAATTTTTTTCATATAAATATTCAAACATAACCATGAATTTATTTAGCAGGAAAAATGTTTTTAAGGTGCTTTAGGATAGATTTCt > 7:36502/1‑140 (MQ=255)
aTCCAATGCTTTTGTCGGTCGCGTTTGTTTTTTTTTTGGTTATAAAAATGTTTTAAATTTTTTGCATATCATTATGGAACCTTAACCAAGAATTTAGTTATCAGGTAAATTGGTATTTATGTGCGTAAGTATAGATTTCt > 7:183148/1‑140 (MQ=255)
cAATGCTGTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAGGAGCTTAAGGATAGATTTCTGGt < 5:186526/140‑1 (MQ=255)
aaTGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAGGAGCTTAAGGATAGATTTCTGGTa < 7:1033910/140‑1 (MQ=255)
tGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTTTTTTTTGGTTAGAAAAATTTTATACATTTTTTGCATATAATTATGCACCCTTAACCATGAAATTAGTTTGCAGGAAAATGGTTATTTAGGACCATAAGGATATATTTCTGGGAag > 5:195459/1‑140 (MQ=255)
tGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTTTTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTTTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAGGAGCTTAAGGATAGATTTCTGGTAag > 3:277779/1‑140 (MQ=255)
gCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTATGAAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAGGAGCTTAAGGATAGATTTCTGGTAagg < 5:131908/140‑1 (MQ=255)
ttttTCGTTCTCTTGTGTATAATTTATTTTAAGAAAAATTTTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCATGAAAATGGTTATTAATGAGCTTAAGGATAGATTTCTGGTAaggagg < 5:497623/140‑1 (MQ=255)
tttGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTAATGAGCTTAAGGATAGATTTCTGGTAagga < 1:495428/138‑1 (MQ=255)
tttGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAGGAGCTTAAGGATAGATTTCTGGTAaggagg < 6:1021576/140‑1 (MQ=255)
tttGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAGGAGCTTAAGGATAGATTTCTGGTAaggagg < 5:636153/140‑1 (MQ=255)
tttGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTATCCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAGGAGCTTAAGGATAGATTTCTGGTAaggagg < 5:324094/140‑1 (MQ=255)
tttGTCGGGCGCTTTTGTTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTGATTCATTTGTTTCATAGCATTATGCTACCTTAACCAAGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAGGAGCTTAATGATAGATTTCTGTTAaggagg < 3:1168270/140‑1 (MQ=255)
cggtcgCTTTTGTTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTAAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAGGAGCTTAAGGATAGATTTCTGGTAAGGAGGAAGTa < 5:882569/140‑1 (MQ=255)
ggcgCTTTTGTTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAGGAGCTTAAGGATAGATTTCTGGTAAGGAGGAAGTATg < 6:19907/138‑1 (MQ=255)
gcgtttGTTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAGGAGCTTAAGGATAGATTTCTGGTAAGGAGGAAGTATGGaa < 5:245688/137‑1 (MQ=255)
tattatTTGGTAAGAAAAATGTTATTTATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGATTTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAGGAGTTTAAGGATAGATTTCTGGTAAGGAGGAAGTATGGAATTGGGGAAt < 6:470233/140‑1 (MQ=255)
ggTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTTCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAGGAGCTTAAGGATAGATTTCTGTTAAGGAGGAAGTATGGAAGTGGGCAATTTgggg < 2:1201244/138‑1 (MQ=255)
ggTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAGGAGCTTAAGGATAGATTTCTGGTAAGGAGGAAGTATGGAAGTGGGCAATTTGGGGaa > 5:746784/1‑140 (MQ=255)
aTGTTATACATTTGTTGCATATCATTATGCATCCTTAACCATGAATTTAGTTAGGAGGAAAATGGTTATTAAGGAGCTTAAGGATAGATTGCTGGGAAGGAGGAAGTATGGAAGTGGGCAATTTGGGGAAGACGTAGTCg < 8:625962/140‑1 (MQ=255)
taCATTTGTTGCATATCATTATGCACCCTTAGCCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAGGAGCTTAAGGATAGATTTCTGGTAAGGAGGAAGTATGGAAGTGGGCAATTTGGGGAAGACGTATTCGCTGTTg > 3:315243/1‑140 (MQ=255)
taCATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAACATGGTTATTAAGGAGCTTAAGGATAGATGTCTGGTAAGGAGGAAGTATGGAAGTGGGCAATTTGGGGAAGACGTATTCGCTGTTg > 7:871833/1‑140 (MQ=255)
taCATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAGGAGCTTAAGGATAGATTTCTGGTAAGGAGGAAGTATGGAAGTGGGCAATTTGGGGAAGACGTATTCGCTGTTg > 3:553523/1‑140 (MQ=255)
cATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAGGAGCTTAAGGATAGATTTCTGGTAAGGAGGAAGTATGGAAGTGGGCAATTTGGGGAAGACGTATTCGCTGTTg < 1:179219/138‑1 (MQ=255)
aTTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAGGAGCTTAAGGATAGATTTCTGGTAAGGAGTAAGTATGGAAGTGGGCAATTTGGGGAAGACGTATTCGCTGTTGAAt < 8:46157/140‑1 (MQ=255)
aTTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAGGAGCTTAAGGATAGATTTCTGGTAAGGAGGAAGTATGGAAGTGGGCAATTTGGGGAAGACGTATTCGCTGTTGa < 2:37697/138‑1 (MQ=255)
aTTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAGGAGCTTAAGGATAGATTTCTGGTAAGGAGGAAGTATGGAAGTGGGCAATTTGGGGAAGACGTATTCGCTGTTGAAt < 5:419568/140‑1 (MQ=255)
aTTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAGGAGCTTAAGGATAGATTTCTGGTAAGGAGGAAGTATGGAAGTGGGCAATTTGGGGAAGACGTATTCGCTGTTGAAt < 3:1033233/140‑1 (MQ=255)
aTTTGTTGCATATCATTATGCAACATTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAGGAGCTTAAGGATAGATTTCTGGTAAGGAGGAAGTATGGAAGTGGGCAATTTGGGGAAGACGTATTCGCTGTTGa < 1:1146304/138‑1 (MQ=255)
tttGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATTAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAGGAGCTTAAGGATAGATTTCTGGTAAGGAGGAAGTATGGAAGTGGGCAATTTGGGGAAGACGTATTCGCTGTTGAATc < 7:726675/140‑1 (MQ=255)
tttGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATTAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAGGAGCTTAAGGATAGATTTCTGGTAAGGAGGAAGTATGGAAGTGGGCAATTTGGGGAAGACGTATTCGCTGTTGAATc < 3:925189/140‑1 (MQ=255)
tgttgCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTAATGAGCTTAAGGATAGATTTCTGGTAAGGAGGAAGTATGGAAGTGGGCAATTTGGGGAAGACGTATTCGCTGTTGAATCTg < 6:845547/140‑1 (MQ=255)
ttgCATATCATTATTCAACCTTAACCATGTATTTATTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAGGAGCTTAAGGATAGATTTCTGGTAAGGAGGAAGTATGGAAGTGGGCATTTTGGTGAAGACGTATTCGCTGTTGAATCTg < 1:980110/138‑1 (MQ=255)
ttgCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAGGAGCTTAAGGATAGATTTCTGGTAAGGAGGAAGTATGGAAGTGGGCAATTTGGGGAAGACGTATTCGCTGTTGAATCTGGc < 8:405759/140‑1 (MQ=255)
ttgCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAGGAGCTTAAGGATAGATTTCTGGTAAGGAGGAAGTATGGAAGTGGGCAATTTGGGGAAGACGTATTCGCTGTTGAATCTGGc < 8:496706/140‑1 (MQ=255)
|
CGAGTATCACTACTTGTCAGTTTGCTGTCTGCCGTTACAGTACTTTCAGCCATGCCATTATGTCTCCTGCCGTAATCCAATGCTTTTGTCGGTCGCTTTTGTTTATTTTTTGGTAAGAAAAATGTTATACATTTGTTGCATATCATTATGCAACCTTAACCATGAATTTAGTTAGCAGGAAAATGGTTATTAAGGAGCTTAAGGATAGATTTCTGGTAAGGAGGAAGTATGGAAGTGGGCAATTTGGGGAAGACGTATTCGCTGTTGAATCTGGCTT > NZ_CP022686/1360613‑1360889
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
