Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F434 I0 R1
|
1130 |
215.9 |
7031662 |
97.1% |
6827743 |
147.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
235,022 |
G→T |
21.2% |
H68N (CAT→AAT) |
ykfM ← |
lethality reduction protein, putative inner membrane protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 235,022 | 0 | G | T | 21.2%
| 391.2
/ 26.3
| 224 | H68N (CAT→AAT) | ykfM | lethality reduction protein, putative inner membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (89/74); new base T (15/42); total (104/120) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.42e-04 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 228 total aligned reads displayed.
CTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAATGCAGGGAAAAATAA > CP009273/234875‑235169
|
cTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATg < 1:722101/148‑1 (MQ=255)
tgtgACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGa > 2:2640858/1‑148 (MQ=255)
tgACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAat < 2:3313659/148‑1 (MQ=255)
gACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAata < 2:3097234/148‑1 (MQ=255)
gACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAata < 2:1349986/148‑1 (MQ=255)
cAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑ATACATGAATAtt > 2:713516/1‑148 (MQ=255)
aaGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTaa > 2:366627/1‑148 (MQ=255)
aaGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTaa > 2:1464211/1‑148 (MQ=255)
aGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACGACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTaaa < 2:3101097/148‑1 (MQ=255)
ggAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTaaaa < 1:794985/148‑1 (MQ=255)
gAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTAAATGAATATTTaaaaa > 2:263380/1‑148 (MQ=255)
gAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTAAATGAATATTTaaaaa > 2:2035264/1‑148 (MQ=255)
aGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATA‑TTAAAAAgg < 2:802997/148‑1 (MQ=255)
tATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGTTTAATAATTATTTTTTTATAGTAATTAAAA‑ATAAATGAATATTTAAAAATGaa > 1:75545/1‑148 (MQ=255)
tATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTTAGAAATATTTTATTATAGTAATTAAAA‑TTAAATGAATATTTAAAAATGaa > 1:1616621/1‑148 (MQ=255)
aTTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGaaa < 1:1788078/148‑1 (MQ=255)
aTTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGaaa < 2:2763918/148‑1 (MQ=255)
aTTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGaaa < 1:750415/148‑1 (MQ=255)
aTTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGaaa < 1:2507719/148‑1 (MQ=255)
ttAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGaaaa < 2:1108274/148‑1 (MQ=255)
aGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAATGAAAACGAc > 2:3499782/1‑148 (MQ=255)
gTGCTATTACTATAGTTATTATTAAAAATATAAGTGTTAGTTGTATTGTTATGTCTGTGGCTAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTAAGAATGTTTTTATTATCGTAATTAAAT‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACAt < 2:2102995/148‑1 (MQ=255)
tATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCTTATGTAAAA‑TTACATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGaaa < 2:1734352/148‑1 (MQ=255)
tACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGTTTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAATGAAAACGACATGAAACCg > 1:3491071/1‑148 (MQ=255)
tACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTGTTTTTGTTTAAGAATTATTTTTTTTTATTAATTAAAA‑TTAAATTAATATTTAAAAAGGAAAAAGACATGaaaaac > 1:632535/1‑145 (MQ=255)
gATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTAAGAATTATTTTATTATCGTAATTAAAA‑TTAAATTAATATTTAAAAATGAAAAAGACATGAAAACGAAg > 1:3439170/1‑148 (MQ=255)
aTAGCTATTATTAAAAATATAAGATTTAGCTTTATTGTTATTTCTGTGGCTAAATTGACTACCTTATTTTTTTTTTTTAAGAATGATTTAATTATCGTAATTAAAT‑TTACATCAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGc < 2:1961605/148‑1 (MQ=255)
aTAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTAAGAATGATTTTATTATAGTAAGTAAAA‑TTAAATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACAAGAAAACGAAGc > 1:2333509/1‑148 (MQ=255)
tAGATATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTTTTTTTTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCTTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAATTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGca < 2:1426249/148‑1 (MQ=255)
gCTTTTAGTAAAAATATATGTGTTAGCTGTTTTGTTTTGTGTGTGGCTATATTGACTACCTTCTTTTTTTTGATTAAGATTTTTTTTATTATCTTAATTAAAA‑TTACATTAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGcaca < 1:276953/148‑1 (MQ=255)
attattAAAAATATAATAGTTCGGTTTTTTTTTATGTCTGTGGCTAATTTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTAAGAATTATTTTATTATCGTAATTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGaa < 2:158044/148‑1 (MQ=255)
aTTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTAAAAAATAATTTAATATCCTAACTAAAA‑AAACAATAAAAATTAAAAAATAAAAAGAAAATAAACACAAACACAGaa > 1:3040618/1‑148 (MQ=255)
ttattaAAAATATATGAGTTTGCTGTATTTTTATGTCTGTGGCTAAATTGAATACCTTCTTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCTTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAAt < 2:3366924/148‑1 (MQ=255)
ttAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATAGTTAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAAACGAAGCACAGaaa > 1:1714698/1‑147 (MQ=255)
tAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTGTTTTTTTTTTAGAATTATTTTTTTTTAGTTAGTAAAA‑TTAAATTAATAATTTAAAATGAAAAAGACATGAAACCGAAGCACACaaac > 1:3285728/1‑146 (MQ=255)
tAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTGTTTTTTATTAAGAATTATTTTATTATAGTAATTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGAAATGAAACCCAAGCACACAATc > 1:1849148/1‑148 (MQ=255)
attAAAAATATAAGAGTTAGCTTTTTTTTTATGTCTGTGGCTAAATTGACTACATTCGTTTTTTTTATTAATAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATTAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCa < 2:1404346/146‑1 (MQ=255)
ataaaaaaTATAAGATTTTGCTTTTTTGTTTTGTATGTGGCGAATTTGACTACCTTCTTTTTTTTTATTAAGAATTATTTTATTATCTTAATTAAAA‑TTAAATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCa < 2:2381652/145‑1 (MQ=255)
ttAAAAATATAAGATTTCGCTGTTTTTTTTTGTGTGTGGCTAATTTGACTACCTTCTTTTTTTTTATTATTATTTTTTTTATTATCTTAATTAAAA‑TTAATTGAATTTTAAAAAAGCAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCaa < 1:1108969/147‑1 (MQ=255)
gTAAAATTATATGATTTTGATGTATTGTTATGTCTGTGGATAAATTGAATACATTCTTTTTTTTGATTAAGAATTATTTTATTATCGTAAGTAAAT‑TTACATGAATTTTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCaa < 2:2817885/148‑1 (MQ=255)
gTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCTAAATTGACTACCTTCTTTTTTTTGATTAAGAATTATTTTATTATCGTAATTAAAA‑TTAAATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCaa < 2:783525/148‑1 (MQ=255)
tAAAATTATAAGTTTTAGCTTTTTTTTTTTGTCTGTGGCTAATTTGACTACCTTCTTTTTTTTTATTAAGAATTATTTTTTTATCTTAATTAAAT‑TTAAATTAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAAc < 2:2970416/148‑1 (MQ=255)
tAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAAc > 2:749434/1‑148 (MQ=255)
aaaTATACGCGTTCGCTGTATTTTTATGTCTGTGGCTAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTAAGAATGATTTTATTATCTTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTAAAAATGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACAtt < 1:875524/148‑1 (MQ=255)
atatAATCGTTAGCTTTATTGTTATGTCTGTGGCTAAATTGACTACCTTAGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATtct < 2:3454182/148‑1 (MQ=255)
atatAATAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAATAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATtct < 2:528120/148‑1 (MQ=255)
atatAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATTATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATTAATATTTAAAAAGGAAAACGAAATGAAACCGAAGCACAGAAACAACAAtct > 1:1169338/1‑148 (MQ=255)
taAGAGTTAGCTGTTTTTTTATGTCGGTGGCGAAATGGACTACCTTCTTTTTTTTGATTAACAATTTTTTTTTTATCTTATGTANAA‑TTAAATCAATATTTAAAAAGTANAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCa < 1:211449/148‑1 (MQ=255)
atgagTTTGGTGTATTGTTATGTCTGTGGCTAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTAAGAATGATTTTATTATCGTAATTAAAA‑TTAAATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCaa < 2:1293368/146‑1 (MQ=255)
agagTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTTTTAATAATTATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAAACGAAGCACAGAATCAACAATATCCAAt > 1:2878156/1‑148 (MQ=255)
ttGTATTGTTATGTATGTGGCTAATTTTAATACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCTAAATTAAAA‑TTACATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAat < 2:3457926/147‑1 (MQ=255)
cTGTTTTGTTTTGACTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATTATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAat < 2:2869640/148‑1 (MQ=255)
gttttGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCTTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAatat < 2:2928290/145‑1 (MQ=255)
ttttttATGTCTGTGGCTAAATTGAATACGTTGTTTTTTTTGATTAATATTTATTTTATTATCTTAATTAAAA‑TTACATGATTATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATAttt < 1:1949606/144‑1 (MQ=255)
ttATGTTTGTGGCAAAATTGAAAACTTTTTTTTTTTTTATTAACATTTTTTTTTTTATCTTAATTAAAA‑TTAAATTAATATTAAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGt < 1:2417713/148‑1 (MQ=255)
tATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTg > 2:573037/1‑148 (MQ=255)
ttttgtgtgGCTAATTTTAATACCTTTTTTTTTTTTTTTAATATTTATTTTATTATCTTAATTAAAA‑TAAATTTAATTTTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTgg < 1:2818954/143‑1 (MQ=255)
ttGTCTGTGGATAAATTGACTACCTTCTTTTTTTTTATTAATATTTTTTTTTTTATATTAATTAAAA‑TTAAATTATTATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTgg < 1:988397/147‑1 (MQ=255)
tCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTTTTAAGAATGATTTTATTATGGTAAGTAAAA‑ATAAAAGAATATTTAAAAAAGAAAAACACAAGAAAACGAAACACAAAAAAAAAAATAAACAAAAATAAAAAATTTACGTGGGGc > 1:1391251/1‑148 (MQ=255)
cTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTAAGAATGATTTTATTATAGTAAGTAAAA‑TTAAATGAATATTTAAAAAGGAAAAAGACATGAAACCGAACCACAAAAAAAACATTATCACATCATAAAATAATTACGTGGAGCa > 1:2255066/1‑148 (MQ=255)
gtgGCTAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCAtt < 2:1011639/148‑1 (MQ=255)
cGAAATTGACTACCTTCTTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCTTAATTAAAA‑TTAAATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTttat < 2:1263220/148‑1 (MQ=255)
agAAATTGACTACCTTCTTTTTTTTTATTAAGAATGATTTTATTATCTTAAGTAAAA‑TTACATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTttat < 2:2024182/147‑1 (MQ=255)
aaTTGACTACCTTCGTTTTTTTGTTTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTAAATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACAAGAAACCCAAGCACAGAATCAACAATATACAATCAAAAAAAATTTACGGGGAGCATTTtattat > 1:574978/1‑148 (MQ=255)
aaTTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTACGTGGAGCATTTtattat > 2:2919101/1‑148 (MQ=255)
aaTTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAATAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCAAATAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTACGTGGAGCATTTtattat > 2:2224706/1‑148 (MQ=255)
ttGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATAGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTg > 2:1683658/1‑148 (MQ=255)
cccTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGAAAAA‑TTACATTAATATTTAAAAAGCAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAAtata < 2:3246507/147‑1 (MQ=255)
ccTTCGTTTTTTTTATTAAGAATTATTTTATTATCTTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATag < 2:1314530/148‑1 (MQ=255)
tctttttttttATTATGAATTATTTTATTATCTTAATTAAAT‑TTACATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATAAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAgg < 2:454360/145‑1 (MQ=255)
ttttttttATTAAGAATGATTTTATTATCTTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGACACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGttt < 2:1169338/148‑1 (MQ=255)
tttttttGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTAAATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGttt < 2:2333509/148‑1 (MQ=255)
ttttttGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTa > 2:2571364/1‑148 (MQ=255)
ttttttATTAATAATTATTTTATTATC‑TAAATAAAATTTAAATTAATATTAAAAAAGAAACACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTaa < 1:1524820/148‑1 (MQ=255)
tttaTTAATAATTATTTTATTATCTTAATTAAAA‑TTAAATGAATATTTAAAAAGCAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTc < 1:3347759/145‑1 (MQ=255)
tttaTTAATAATGATTTTATTATCTTAATTAAAA‑TTACATTAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTc < 2:834505/145‑1 (MQ=255)
gATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCg > 1:754051/1‑148 (MQ=255)
aTTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCgg > 1:2565392/1‑148 (MQ=255)
ttAATAATTATTTTTTTTTCTTAATTAAAT‑TTAAATGAATATTTAAAAAGCAACACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGt < 1:366627/148‑1 (MQ=255)
ttAATAATGTTTTTATTATCGTAATTAAAA‑TTACATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGt < 1:1999893/148‑1 (MQ=255)
ttAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGt > 1:2644349/1‑148 (MQ=255)
tGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAAc > 2:2265995/1‑148 (MQ=255)
tttttATTATCTTAATTAAAA‑TTAAATTAATATTTAAAATGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACaa < 1:1315924/147‑1 (MQ=255)
tttATTATCTTAATTAAAT‑TTAATTTAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAaag < 1:1700166/148‑1 (MQ=255)
attttCTTAATTAAAT‑TTAAATTAATATTAAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAaagaag < 1:3380238/148‑1 (MQ=255)
ttatCTTAATTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGc < 1:3157211/148‑1 (MQ=255)
tatCTTAATTAAAA‑TTAAATGAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCa < 1:524057/148‑1 (MQ=255)
tatCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCa > 1:1880475/1‑148 (MQ=255)
atCTTAAGTAAAA‑TTACATTAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCAt < 2:1551665/148‑1 (MQ=255)
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ttACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAATGCAGGGaa > 2:871979/1‑148 (MQ=255)
tGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAATGCAGGGAAAaata > 1:1926004/1‑148 (MQ=255)
tGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAATGCAGGGAAAaata > 2:3482803/1‑148 (MQ=255)
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CTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAATGCAGGGAAAAATAA > CP009273/234875‑235169
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
