Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F14 I0 R1
|
127 |
310.1 |
10402230 |
94.2% |
9798900 |
149.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
235,022 |
G→T |
19.7% |
H68N (CAT→AAT) |
ykfM ← |
lethality reduction protein, putative inner membrane protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 235,022 | 0 | G | T | 19.7%
| 454.8
/ 23.2
| 239 | H68N (CAT→AAT) | ykfM | lethality reduction protein, putative inner membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (118/60); new base T (9/49); total (128/111) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 9.57e-12 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 243 total aligned reads displayed.
CCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGG‑AAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAATGCAGGGAAAAATA > CP009273/234874‑235168
|
ccTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATg < 2:1975741/149‑1 (MQ=255)
ccTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATg < 1:4229617/149‑1 (MQ=255)
aCAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATAtt < 1:1529124/149‑1 (MQ=255)
aaaGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTaa < 1:405623/149‑1 (MQ=255)
aaGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGTTTTAGAATGATTTTTTTATAGTAATTAAAATTAAAAGAATATTTaaa > 1:3521039/1‑149 (MQ=255)
aGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATGAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATAGTAAGTAAAATTAAATGAATATTTaaaa > 2:5041831/1‑149 (MQ=255)
aGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTTTTAATAAATATTTTATTATAGTAATTAAAAATAAAATAATAATTaaaa > 1:940857/1‑149 (MQ=255)
aGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAATAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTaaaa > 2:1096/1‑149 (MQ=255)
ggAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGTTTTATAATGATTTTATTATCGTAAATAAAAATACATGAATATTTaaaaa > 1:1018707/1‑149 (MQ=255)
aGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATTATTTTATTATAGTAATTAAAATTACATGAATATTTaaaaatg > 2:628883/1‑147 (MQ=255)
aGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAgg < 1:3182597/149‑1 (MQ=255)
aGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAgg < 1:3183075/149‑1 (MQ=255)
gCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGG‑a > 2:1275758/1‑149 (MQ=255)
cTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGG‑aa < 1:716356/149‑1 (MQ=255)
tATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTTAGAATGATTTTATTTTAGTTAGTAAAATTAAATGAATATTTaaaaattaaa > 1:3343516/1‑144 (MQ=255)
tATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAATAATGATTTTATTATAGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGG‑aaa > 2:652023/1‑149 (MQ=255)
aTTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACATTCGTTTTTTTTATTAACAAATATTTTATTATAGTTAGAAAAATTACAAAAATATTTAAAAATG‑aaaa > 1:2928252/1‑149 (MQ=255)
ttAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTaaaaat > 2:400175/1‑142 (MQ=255)
aatggTGATATTAAGATAGATTTTATTAAAAATATAATTGTTAGGTGTTTTGTTTTGTCTGTGGCTAAATTGACTACTTTCGTTTTTTTTTTTATTAATTATTTTATTATCTTAAGTAAAATTACATTAATATTTAAAAAGG‑AAAACGa < 1:1746049/146‑1 (MQ=255)
aaaGGTTCTATTACGATAGCAATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGATGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGG‑AAAACGa < 2:4673842/149‑1 (MQ=255)
aaaGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGG‑AAAACGa < 2:718976/149‑1 (MQ=255)
aaaGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGG‑AAAACGa < 2:1787158/149‑1 (MQ=255)
aaGGTGCTATTACGATAGCTATTATTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGG‑AAAACGAc < 2:856417/149‑1 (MQ=255)
aaGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGG‑AAAACGAc > 2:2799201/1‑149 (MQ=255)
aggttatATTACTATAGCTATTATTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCTAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGG‑AAAACGACa < 2:3171961/143‑1 (MQ=255)
aGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTAAAAGAAAATTTAAAAAGG‑AAAACGACa > 1:701102/1‑149 (MQ=255)
gCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGTTTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGG‑AAAACGACATGaa > 2:313233/1‑149 (MQ=255)
cTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATAGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGG‑AAAACGACAAGaaa > 1:2424075/1‑149 (MQ=255)
tATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGG‑AAAACGACATGaaaa > 2:409918/1‑148 (MQ=255)
tACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAATAATTATTTTATTATAGTAAGTAAAAATACATGAATATTTAAAAATG‑AAAACGACAAGAAAACGa > 1:4601870/1‑149 (MQ=255)
ttAGATATTTTTAAAAATATAATATTTTGTTTTATTTTTTTTTCTGTGGCGAATTTGACTACTTTCGTTTTTTTTATTAAGATTTATTTTTTTATCTTAATTAAATTTACTTTATTATTTAAAAAGT‑AACACGACATGAAACCGAAGca < 2:600627/148‑1 (MQ=255)
aTAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGTTTATTAATTATTTTTTTATAGTAATTAAAATTAAATTAATATTTAAAAATG‑AAAAAGACATTAAAACGAAGca > 1:525270/1‑149 (MQ=255)
cTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATTATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGG‑AAAACGACAAGAAACCGAAGCACAGa > 1:4305160/1‑149 (MQ=255)
ttAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGTTTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTAAATGTATATTTAAAAATG‑AAAAAGACATGAAACCGAAGCACAGAATc > 1:2509232/1‑149 (MQ=255)
ttAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGG‑AAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATc > 2:2573776/1‑149 (MQ=255)
aaaaaTATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGTTTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAATG‑AAAAAGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAAAAt > 1:4665015/1‑149 (MQ=255)
aaaaaTATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGTTTAAGAATGATTTTATTATAGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGG‑AAAACGACAAGAAACCGAAGCACAGAATAAACaa > 1:2361604/1‑148 (MQ=255)
aaaaaTATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTAAATGAATATTTAAAAAGG‑AAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACAt > 2:367715/1‑149 (MQ=255)
aaaTATAAGAGTTAGCTTTATTTTTATGTCTGTGGCTAAATTGACTACCTTCTTTTTTTTTATTAATAATGATTTTATTATCTTAAGTAAAATTAAATTAATATTTAAAAAGG‑AAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATtc < 2:2971837/149‑1 (MQ=255)
tataAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGG‑AAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATAAACATTCTcc > 2:3860328/1‑149 (MQ=255)
tataAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATAGTAAGTAAAATTAAATTAATAATTAAAAAGGAAAAACAACA‑GAAAAACAATCACAGAATAAACATTCTcc > 2:1339178/1‑149 (MQ=255)
taAGTGTTCGCTGTATTTTTATGTCTGTGGCGAAATTGACGACCTTCGTTTTTTTGATTAATAATGATTTTATTATCGTAATTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGT‑AAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCaa < 2:1500318/149‑1 (MQ=255)
attatttAGTTGTTTTGTTATGTCTTTGGCTAATTTGACTACCTTCTTTTTTTTTATTAAGATTTATTTTTTTATCTTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGG‑AAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAAt < 1:3894943/144‑1 (MQ=255)
aaGTGTTTGCTTTATTTTTTTGTCTTTGGCTAAATTGACTACATTGGTTTTTTTTATTAATATTGATTTTATTATCTTAAGAAAAATTACATTAATATTTAAAAAGT‑AAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAAt < 1:771711/149‑1 (MQ=255)
aaGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGG‑AAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAAt > 2:1220846/1‑149 (MQ=255)
gagTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGG‑AAAAAGAAAAGAAACCGAAGCACACAATCAACATTCTCCAATCa > 2:3648294/1‑149 (MQ=255)
agTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGTTTTAGTATGATTTTATTATAGTAATTTAAATTAAATGAATTTTTTAAATTG‑TAAAAGACATGAAACAGAAGCACAGGATCAAAATTGTGCAATCAt > 2:4770593/1‑149 (MQ=255)
gTTAGCTTTATTTTTTTGTCTGTGGCTAAATTGACTACATTCTTTTTTTTTATTAATAATTATTTTATTATCTTAATTAAAATTAAATTAATATTTAAAAAGT‑AAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATa < 2:722225/149‑1 (MQ=255)
ttAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATTATTTTATTATAGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGG‑AAAACGACATTAAACCGAAGCACAGAATCAACATTATCCAAtaataa > 2:4842192/1‑149 (MQ=255)
tAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACATTCGTTTTTTTGATTATGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGG‑AAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATaaa < 2:292596/149‑1 (MQ=255)
tGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGG‑AAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAAACATAAAatat > 2:2474427/1‑149 (MQ=255)
ttATTGTTTTGTCTGTGGCTAAATTGACTACCTTCTTTTTTTTGATTAATAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTAAATTAATATTTAAAAAGT‑AAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATAtt < 2:4641740/148‑1 (MQ=255)
aTTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTAAATGAATATTTAAAAATG‑AAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACAATATCCAAAAATAAAATATTTc > 1:2126754/1‑149 (MQ=255)
gTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGTTTTAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGG‑AAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGt > 2:4023899/1‑149 (MQ=255)
gTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAATAATGATTTTATTATCGTAATTAAAATTAAATGAATATTTAAAAAGG‑AAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAAACATAAAAAATTTACGt > 2:3507067/1‑149 (MQ=255)
tttgtgtgtgGCTAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAATAATGATTTTATTATCTTAATTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGG‑AAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTgg < 1:370187/147‑1 (MQ=255)
ttGTCTTTGGCTAATTTTACTACGTTCTTTTTTTTGATTATGATTTATTTTTTTATCTTAATTAAAATTAAATTAATTTTTAAAAAGT‑AAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGa < 1:2790223/148‑1 (MQ=255)
ctCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTTATAATGATTTTTTTATAGTAAATAAAAATACAATAATATTTAAAAATG‑AAAAAGACAAGAAAACGAACCACACAATAAAAATTATACAAAAAAAAAATATTTAAGTGGAGc > 1:1074257/2‑149 (MQ=255)
tCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTAAAAGAATATTTAAAAAGG‑AAAAAGACAAGAAACCGAATCACAAAAACAACAATATACAAACATAAAAAATTTAAGTTGAGCa > 2:4792585/1‑149 (MQ=255)
tgtgGCTAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAATATTGTTTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGATTATTTAAAAAGG‑AAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCAtt < 2:3118085/149‑1 (MQ=255)
aaaTTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATTTTTAAAAAGT‑AAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTtattat < 2:1859205/149‑1 (MQ=255)
aaaTTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGG‑AAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTtattat > 2:1256398/1‑149 (MQ=255)
aaTTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGG‑AAAACGACATTAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATAATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTattatt > 2:1614573/1‑149 (MQ=255)
aaTTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTAATATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGG‑AAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTACAATCATAAAATATTTACGTGGAGCATTTTattatt > 2:2857254/1‑149 (MQ=255)
aTTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGG‑AAAACGAAATTAAAACGAAGCACATAAACAACATTATCCAATAATAAAATATTTAAGTGGATCATTTTattattt > 2:4949623/1‑148 (MQ=255)
tGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGG‑AAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGaa < 2:4182834/149‑1 (MQ=255)
gACTACCTTCGTTTTTTTTATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTTAAATTACATGAATATTTAAAAAAG‑AAAACGACATTAAAACGAACCACATAAAAAACATTAACAAAACAAAAAATAATTACGTTGAGAATTTTATTATTGAat > 2:199879/1‑149 (MQ=255)
ttCTTTTTTTTTATTATTATTTTTTTTTTTATCGTAAGAAAAATTACATTAATATTTAAAAAGC‑AAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAgg < 1:5041706/149‑1 (MQ=255)
tctttttttttATTAATAATTATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATTAATATTTAAAAAGT‑AAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGt < 2:940098/146‑1 (MQ=255)
taTTAATAATTATTTTATTATCTTAAGTAAAATTAAATTAATATTTAAAAAGG‑AAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCgg < 2:5187123/148‑1 (MQ=255)
aTTAAGAATGATTTTATTAGCTTAATTAAAATTAAATGAATATTTAAAAAGT‑AAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGt < 2:4495373/149‑1 (MQ=255)
ttAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGG‑AAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTa > 2:765333/1‑149 (MQ=255)
ttAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGG‑AAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTa > 1:4851322/1‑149 (MQ=255)
tAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGG‑AAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTaa > 2:3448830/1‑149 (MQ=255)
aGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGG‑AAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTaaaa > 2:44211/1‑149 (MQ=255)
aaTTATTTTATTATCTTAATTAAAATTAAATTAATATTTAAAAAGT‑AAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTaaaaaa < 2:4363637/149‑1 (MQ=255)
aaTGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGG‑AAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTaaaaaa > 1:902311/1‑149 (MQ=255)
attaTTTTATTATCTTAATTAAAATTAAATTAATATTTAAAAAGT‑AAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAAc < 2:3101930/146‑1 (MQ=255)
tGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGG‑AAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACa > 2:2274956/1‑149 (MQ=255)
aTTTTATTATCGTAAGTAAATTTACTTTAATATTTAAAAAGG‑AAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACaaa < 2:808170/149‑1 (MQ=255)
ttttATTATCTTAATTAAAATTACTTGGATATTTAAAAAGT‑AAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAtag < 2:196044/149‑1 (MQ=255)
tttATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGG‑AAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAaaga > 2:4314541/1‑149 (MQ=255)
tttATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGG‑AAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAaaga > 2:522567/1‑149 (MQ=255)
ttattaTCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGG‑AAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAaagaa > 2:3318385/1‑149 (MQ=255)
ttaattaaAATTACATTAATATTTAAAAAGT‑AAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGaa < 2:3069982/148‑1 (MQ=255)
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cATGAATATTTAAAAAGG‑AAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGAGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAATGCAGGGAAAaat > 1:3206085/1‑149 (MQ=255)
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CCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGG‑AAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAATGCAGGGAAAAATA > CP009273/234874‑235168
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
