Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A11 F212 I1 R1
|
174 |
80.0 |
3892211 |
96.7% |
3763768 |
99.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,469,656 |
(T)7→8 |
coding (526/1332 nt) |
gtrS → |
serotype‑specific glucosyl transferase, CPS‑53 (KpLE1) prophage |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,469,649 | 1 | . | T | 84.5%
| 310.5
/ 52.7
| 103 | coding (519/1332 nt) | gtrS | serotype‑specific glucosyl transferase, CPS‑53 (KpLE1) prophage |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (10/6); new base T (39/48); total (49/54) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.77e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.14e-01 |
Only 100 of 116 total aligned reads displayed.
TGTTTGCATCATTCTATCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTA‑TTTT‑TT‑T‑CGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATATTTTTTTTGATAGACACA > NC_000913/2469552‑2469743
|
tGTTTGCATCATTCTATCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTA‑tt < 2:1014947/100‑1 (MQ=255)
tGTTTGCATCATTCTATCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTA‑tt > 2:1660405/1‑100 (MQ=255)
ttGCATCATTCTATCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTA‑tttt‑t > 2:756199/1‑100 (MQ=255)
ttGCATCATTCTATCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTA‑tttt‑t < 1:1524995/100‑1 (MQ=255)
ttGCATCATTCTATCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTA‑tttt‑t > 2:946638/1‑100 (MQ=255)
ttGCATCATTCTATCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCCTTTGCTA‑tttt‑t > 2:1778475/1‑100 (MQ=255)
gCATCATTCTATCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTA‑tttt‑tt‑t < 2:975524/100‑1 (MQ=255)
gCATCATTCTATCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTA‑tttt‑tt‑t < 2:673921/100‑1 (MQ=255)
catcatTCTATCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTA‑tttt‑tt‑tt > 2:431253/1‑99 (MQ=255)
atcatTCTATCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTA‑tttt‑tt‑ttc < 2:695778/100‑3 (MQ=255)
atTCTATCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTA‑TTTT‑TT‑T‑CGTTg < 1:756198/100‑1 (MQ=255)
tCTATCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTT‑TT‑T‑CGTTgn < 1:1872924/100‑2 (MQ=255)
tCTATCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTT‑TT‑T‑CGTTGc < 1:1932745/100‑1 (MQ=255)
tCTATCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTT‑TT‑T‑CGTTGc < 2:789495/100‑1 (MQ=255)
cTATCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTT‑TT‑T‑CGTTGCt > 2:932501/1‑100 (MQ=255)
aTCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTT‑TT‑T‑CGTTGCtaa < 1:1550165/100‑1 (MQ=255)
cAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTT‑TT‑T‑CGTTGCtaata > 2:529817/1‑100 (MQ=255)
cAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTT‑TT‑T‑CGTTGCtaata > 2:1125792/1‑100 (MQ=255)
cAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTT‑TT‑T‑CGTTGCtaata > 2:1041739/1‑100 (MQ=255)
aaGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTT‑TT‑T‑CTTTGCtaataa > 2:1414262/1‑100 (MQ=255)
agagCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGTTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTT‑TT‑T‑CGTTGCTaataat > 1:39185/1‑100 (MQ=255)
agagCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTT‑TT‑T‑CGTTTCtaataa > 2:450644/1‑99 (MQ=255)
agagCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTT‑TT‑T‑CGTTGCTaataat > 1:999733/1‑100 (MQ=255)
agagCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTT‑TT‑T‑CGTTGCTaataat > 1:21071/1‑100 (MQ=255)
gagCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTT‑TT‑T‑CGTTGCTAataata < 2:1648694/100‑1 (MQ=255)
gCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTCTGCTATTTTT‑TT‑T‑CGTTGATAATAatat > 1:1172444/1‑99 (MQ=255)
aaTAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTT‑TT‑T‑CGTTGCTAATAATATCTAc < 1:185031/100‑1 (MQ=255)
gTTATAATTTTCCTTCCATTTTTTGTGTATTGATTAATATGCAAAAACAATAAATCTGTGCTTTTGCTATTTTT‑TT‑T‑CGTTTCTAATAATATCTACTTCt < 1:568751/100‑1 (MQ=255)
gTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTT‑TT‑T‑CGTTGCTAATAATATCTACTGCt < 2:138118/100‑1 (MQ=255)
tataATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTA‑TTTT‑TT‑T‑CGTTGCTAATAATATCTACTGCTaaa > 2:760708/1‑100 (MQ=255)
ataATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTT‑TT‑T‑CGTTGCTAATAATATCTACTGCTaaa < 1:989875/100‑1 (MQ=255)
taATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTT‑TT‑T‑CGTTGCTAATAATATCTACTGCTaaaa < 2:30812/100‑1 (MQ=255)
naaTTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTT‑TT‑T‑CGTTGCTAATAATATCTACTGCTaaaa > 2:369783/2‑100 (MQ=255)
aaTTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTT‑TT‑T‑CGTTGCTAATAATATCCACTGCTaaaaa > 2:1683308/1‑100 (MQ=255)
aTTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTT‑TT‑T‑TTTTTTTTATAATATATACTGCTAAAAAt > 1:1116090/1‑100 (MQ=255)
aTTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTA‑TTTT‑TT‑T‑CGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATc > 2:1300695/1‑100 (MQ=255)
ttttCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTATCATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTA‑TTTTGTT‑T‑CGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATc < 1:1172189/100‑1 (MQ=255)
ccttccATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTT‑TT‑T‑CGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAAtt < 1:750829/100‑1 (MQ=255)
ccttccATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTT‑TT‑T‑CGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAAtt < 1:1505900/100‑1 (MQ=255)
ccttccATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTA‑TTTT‑TT‑T‑CGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAAttt > 2:641689/1‑100 (MQ=255)
cttccATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTA‑TTTT‑TT‑T‑CGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTta > 2:562688/1‑100 (MQ=255)
ttccATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTA‑TTTT‑TT‑T‑CGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTtat > 1:530087/1‑100 (MQ=255)
tccATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTT‑TT‑T‑CGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTtat > 2:1568962/1‑100 (MQ=255)
tccATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTT‑TT‑T‑CGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTta < 1:932500/99‑1 (MQ=255)
ctttgttttGTGTATTCAGTAACATGCAAAAACAATATTTCTATGCTTTTGCTATTTTT‑TT‑T‑CGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTtata < 2:1330810/95‑1 (MQ=255)
ccATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTT‑TT‑T‑CGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTtata < 2:1346085/100‑1 (MQ=255)
ccATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTT‑TT‑T‑CGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTtata < 2:421862/100‑1 (MQ=255)
ttttGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTT‑TT‑T‑CGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTaa > 1:1253095/1‑100 (MQ=255)
ttttGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTT‑TT‑T‑CGTTACTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTaa < 1:1041738/100‑1 (MQ=255)
tttGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTT‑TT‑T‑CGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTaa < 1:781429/99‑1 (MQ=255)
ttgtgtATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTA‑TTTT‑TTAT‑CGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAAcc < 1:1660395/97‑1 (MQ=255)
ggTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTT‑TT‑T‑CGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAAcccc < 2:957444/100‑1 (MQ=255)
ggTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTT‑TT‑T‑CGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAAcccc < 2:182869/100‑1 (MQ=255)
ggTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTT‑TT‑T‑CGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAAcccc < 1:1249963/100‑1 (MQ=255)
ggTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTA‑TTTT‑TT‑T‑CGTTGCTAATAATATCTACTGTTAAAAATCCATTTATATTAACCCCa > 1:334482/1‑100 (MQ=255)
gtATTCATTAACATGCAAAAACAATCAATCTATGCTTTTGCTATTTTT‑TT‑T‑CGTTACTAATAATATCTACTGCTAACAATCAATTTATATTAACCCCACt > 1:1668232/1‑100 (MQ=255)
gtATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTT‑TT‑T‑CGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACt < 1:548440/100‑1 (MQ=255)
ttCATTAACATGCAAAAACAATGAATCTATGCTTTTGCTATTTTT‑TT‑T‑CGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAAt > 1:1127213/1‑100 (MQ=255)
ctCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTT‑TT‑T‑CGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAAt < 2:1563143/99‑1 (MQ=255)
tCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTA‑TTTT‑TT‑T‑CGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAg < 2:1431606/100‑1 (MQ=255)
tccgatcttGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTT‑TT‑T‑CGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCACTTTATATTAACCCCACTAATAg < 1:1128533/92‑1 (MQ=255)
cATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTA‑TTTT‑TT‑T‑CGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAgt > 1:173084/1‑100 (MQ=255)
ttAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTT‑TT‑T‑CGTTGCTAATAATAACTAATGATAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAgtg < 1:560677/100‑1 (MQ=255)
ttAACATGCAAAAACAATAAATCGATGCTGTTGCGATTTTT‑TT‑T‑CGTTTCTAATAATATCTACTGGTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAg > 2:875759/1‑98 (MQ=255)
aaCATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTT‑TT‑T‑CGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTa > 1:1701048/1‑100 (MQ=255)
aTGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTT‑TT‑T‑CGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTc > 1:971371/1‑100 (MQ=255)
aTGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTT‑TT‑T‑CGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTc > 2:622687/1‑100 (MQ=255)
aTGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTA‑TTTT‑TT‑T‑CGTTGCTAATAATAACTAATAATAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCa < 1:513561/100‑1 (MQ=255)
tGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTT‑TT‑T‑CGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCa < 2:21071/100‑1 (MQ=255)
gCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTT‑TT‑T‑CGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCat > 2:680205/1‑100 (MQ=255)
gCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTT‑TT‑T‑CGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCat > 1:1417597/1‑100 (MQ=255)
gCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTA‑TTTT‑TT‑T‑CGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCata > 1:1853283/1‑100 (MQ=255)
cAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTT‑TT‑T‑CGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCata > 2:552309/1‑100 (MQ=255)
cAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTT‑TT‑T‑CGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCata < 1:862712/100‑1 (MQ=255)
aaaaaCAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTT‑TT‑T‑CGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCatat < 2:1205868/100‑1 (MQ=255)
aaaaCAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTT‑TT‑T‑CGTTGTTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCatatt > 1:303752/1‑100 (MQ=255)
aaaaCAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTT‑TT‑T‑CGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCatatt > 1:14961/1‑100 (MQ=255)
aaaCAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTT‑TT‑T‑CGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCatatta < 2:61198/100‑1 (MQ=255)
aaaCAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTT‑TT‑T‑CGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCatatta < 2:991456/100‑1 (MQ=255)
aaCAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTT‑TT‑T‑CGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCatattat > 2:1215581/1‑100 (MQ=255)
naaTAAATCTATGCTTTTGCTA‑TTTT‑TT‑TCCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCatattatat > 1:505269/2‑100 (MQ=255)
cAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTT‑TT‑T‑CGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCatattatat > 1:1107516/1‑100 (MQ=255)
cAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTT‑TT‑T‑CGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCatattatat < 2:476466/100‑1 (MQ=255)
aaTCTATGCTTTTGCTATTTTT‑TT‑T‑CGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATAtttttt > 2:1246014/1‑100 (MQ=255)
aaTCTAAGCTTTTGCTATTTTT‑TT‑T‑CGTTGCTAATAAAAAAAACAAAAAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATAtctttt < 1:1261501/100‑1 (MQ=255)
tCTATGCTTTTGCTATTTTT‑TT‑T‑CGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATAtttttttt < 2:182974/100‑1 (MQ=255)
tCTATGCTTTTGCTATTTTT‑TT‑T‑CGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATAtttttttt < 1:1614268/100‑1 (MQ=255)
cTATGCTTTTGCTATTTTT‑TT‑T‑CGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATAtttttttg > 1:938874/1‑98 (MQ=255)
cTATGCTTTTGCTATTTTT‑TT‑T‑CGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATATTTTTTTTg < 1:1215578/100‑1 (MQ=255)
tATGCTTTTGCTATTTTT‑TT‑T‑CGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATATTTTTTTTg < 1:362179/99‑1 (MQ=255)
tATGCTTTTGCTATTTTT‑TT‑T‑CGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATATTTTTTTTGa > 1:162111/1‑100 (MQ=255)
aTGCTTTTGCTATTTTT‑TT‑T‑CGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTATCCCCACTAATAGTGTATTCATATTATATTTTTTTTGAt < 1:1293901/100‑1 (MQ=255)
aTGCTTTTGCTATTTTT‑TT‑T‑CGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATATTTTTTTTGAt < 1:1857258/100‑1 (MQ=255)
tGCTTTTGCTATTTTT‑TT‑T‑CGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATATTTTTTTTGATa < 1:1349884/100‑1 (MQ=255)
cTTTTGCTA‑TTTT‑TT‑T‑CGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATATTTTTTTTGATAGac < 2:1253642/100‑1 (MQ=255)
ttttGCTATTTTT‑TT‑T‑CGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATATTTTTTTTGATAGan < 1:369781/100‑2 (MQ=255)
tttGCTATTTTT‑TT‑T‑CGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATATTTTTTTTGATAGaca < 1:1681938/100‑1 (MQ=255)
ttGCTATTTTT‑TT‑T‑CGTTGCTAATAATATCTACTGCTATAAATTAATTTATCTTAACCCCATTAATCGTGAATTCATATTATATTTTATTTTATAGaa > 1:1442118/1‑97 (MQ=255)
ttGCTATTTTT‑TT‑T‑CGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATATTTTTTTTGATAGacac < 1:1611536/100‑1 (MQ=255)
ttGCTATTTTT‑TT‑T‑CGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATATTTTTTTTGATAGacac < 2:1127214/100‑1 (MQ=255)
|
TGTTTGCATCATTCTATCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTA‑TTTT‑TT‑T‑CGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATATTTTTTTTGATAGACACA > NC_000913/2469552‑2469743
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
