Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A12 F204 I1 R1
|
117 |
93.2 |
4682243 |
93.4% |
4373214 |
99.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,469,656 |
(T)7→8 |
coding (526/1332 nt) |
gtrS → |
serotype‑specific glucosyl transferase, CPS‑53 (KpLE1) prophage |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,469,649 | 1 | . | T | 96.1%
| 356.0
/ 6.9
| 103 | coding (519/1332 nt) | gtrS | serotype‑specific glucosyl transferase, CPS‑53 (KpLE1) prophage |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (1/3); new base T (44/55); total (45/58) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.30e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.08e-01 |
Only 100 of 120 total aligned reads displayed.
GTTTGCATCATTCTATCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTA‑TTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATATTTTTTTTGATAGACACA > NC_000913/2469553‑2469743
|
gTTTGCATCATTCTATCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTTTTTTATTTTTTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTA‑ttt > 2:1914911/1‑100 (MQ=255)
tttGCATCATTCTATCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTA‑tttt < 2:1650882/100‑1 (MQ=255)
ttGCATCATTCTATCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTA‑ttttt > 2:458143/1‑100 (MQ=255)
gCATCATTCTATCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTA‑ttttttt > 1:486998/1‑100 (MQ=255)
gCATCATTCTATCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTA‑ttttttt < 1:960377/100‑1 (MQ=255)
catcatTCTATCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTTTTTTTTTTTTTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTA‑tttttttt > 2:332468/1‑99 (MQ=255)
catcatTCTATCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTA‑tttttttt > 1:1739706/1‑99 (MQ=255)
atcatTCTATCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTA‑ttttttttc < 1:2324807/100‑3 (MQ=255)
atcatTCTATCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTA‑ttttttttc > 1:2068072/1‑98 (MQ=255)
atcatTCTATCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTA‑ttttttttc < 1:1470064/100‑3 (MQ=255)
atcatTCTATCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTA‑ttttttttc < 1:75038/100‑3 (MQ=255)
tcatTCTATCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCGATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTA‑ttttttttcg > 2:1255011/1‑97 (MQ=255)
tcatTCTATCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTA‑ttttttttcg < 1:2063469/100‑4 (MQ=255)
ttCTTTTAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTGCCATGGTTTGTGCATTAAAAAAAAAAAAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTA‑ttttttttcgt < 2:2223448/98‑5 (MQ=255)
ttCTATCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTg < 1:432425/100‑1 (MQ=255)
tCTATCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGc < 1:53383/100‑1 (MQ=255)
aTCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCtaa > 1:2229300/1‑100 (MQ=255)
aTCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCtaa > 1:1845861/1‑100 (MQ=255)
aTCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCtaa > 2:2260921/1‑100 (MQ=255)
cAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCTTTGTtaata > 2:541320/1‑100 (MQ=255)
cAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCtaata < 2:921113/100‑1 (MQ=255)
aaGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCtaataa > 2:58208/1‑100 (MQ=255)
aaGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCtaataa < 1:2260929/100‑1 (MQ=255)
agagCAAATAGTTATAATTTTTCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTaataat < 1:1257554/100‑1 (MQ=255)
gagCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAataata < 1:2184129/100‑1 (MQ=255)
aaTAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTAc > 1:1730517/1‑100 (MQ=255)
aaTAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTAc > 1:1652827/1‑100 (MQ=255)
aTAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACt < 2:16420/100‑1 (MQ=255)
aTAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACt < 2:18517/100‑1 (MQ=255)
ttATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTa > 2:1540138/1‑100 (MQ=255)
ataATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTaaa < 1:1204454/100‑1 (MQ=255)
ataATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTaaa > 1:852336/1‑100 (MQ=255)
ataATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTaaa > 1:1189579/1‑100 (MQ=255)
ataATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTaaa > 1:204926/1‑100 (MQ=255)
taATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTaaaa < 2:1936749/100‑1 (MQ=255)
taATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTaaaa < 1:2304419/100‑1 (MQ=255)
taATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTaaaa > 1:716651/1‑100 (MQ=255)
aTTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAAt < 1:1372339/100‑1 (MQ=255)
aTTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAAt < 1:858974/100‑1 (MQ=255)
tttCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCa > 1:2319518/1‑100 (MQ=255)
tccttccATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAAt < 2:778526/100‑1 (MQ=255)
tccttccATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAAt < 1:1267949/100‑1 (MQ=255)
tccttccATTTTTGGTGTATACATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAAt < 2:2041179/100‑1 (MQ=255)
ttccATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTta < 2:486996/100‑1 (MQ=255)
tccATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTtat < 1:1698193/100‑1 (MQ=255)
tccATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTtat < 1:819069/100‑1 (MQ=255)
cATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTatat > 1:928100/1‑100 (MQ=255)
tttGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAAc > 1:483955/1‑100 (MQ=255)
ttGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAAcc > 1:1272359/1‑100 (MQ=255)
ttGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAAcc < 2:204924/100‑1 (MQ=255)
ttGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAAcc < 2:2229292/100‑1 (MQ=255)
ggTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCCATTTATATTAAcgcc > 2:85953/1‑100 (MQ=255)
ggTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTA‑TTTTTTTTTTTTCTTTTTATATATACTTCTAAAAATTAATTTatat > 2:774443/1‑92 (MQ=255)
gtATTCATTAACATGCAAAAACAATAATTCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCAc < 1:1285831/99‑1 (MQ=255)
gtATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACt < 2:912229/100‑1 (MQ=255)
gtATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACt < 2:1132099/100‑1 (MQ=255)
gtATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACt < 2:1035981/100‑1 (MQ=255)
tATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTa < 1:340963/100‑1 (MQ=255)
ttCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAAt > 2:1601480/1‑100 (MQ=255)
tCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTTTTTTTTTATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATa > 2:1895496/1‑100 (MQ=255)
tCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATa < 2:1189576/100‑1 (MQ=255)
cATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATa > 2:1501286/1‑99 (MQ=255)
cATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAg > 2:2187303/1‑100 (MQ=255)
cATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAg < 1:2076997/100‑1 (MQ=255)
cATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAg > 2:613573/1‑100 (MQ=255)
aTTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACACCACTtata > 2:2138117/1‑98 (MQ=255)
tAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAgtgt > 1:1454511/1‑100 (MQ=255)
aaCATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAgagat > 1:299353/1‑96 (MQ=255)
cATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTAtt > 2:513784/1‑100 (MQ=255)
cATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTAtt < 1:513786/100‑1 (MQ=255)
aTGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTc > 1:1186194/1‑100 (MQ=255)
tGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCa > 2:805180/1‑100 (MQ=255)
tGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCa > 2:1396708/1‑100 (MQ=255)
gCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCat > 1:1486053/1‑100 (MQ=255)
cAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTTTTTTCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCata > 2:663043/1‑100 (MQ=255)
cAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCata > 2:1976428/1‑100 (MQ=255)
cAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCata < 2:1272356/100‑1 (MQ=255)
cAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCata > 1:1560928/1‑100 (MQ=255)
cAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTAGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCata < 1:1639590/100‑1 (MQ=255)
aaaCAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTTTTTTTTTTTAATATCTACTGCTAAAAATTAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCttatt > 2:790841/1‑99 (MQ=255)
aaCAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATTATTTTATATTAACCCCACTATTATTTTTTTCatattat > 2:850761/1‑100 (MQ=255)
aaTAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCatattatatt < 1:604400/100‑1 (MQ=255)
aaaTCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATAttttt < 1:1016185/100‑1 (MQ=255)
aTCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATAttttttt < 2:1486049/100‑1 (MQ=255)
tCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATAtttttttt > 2:574767/1‑100 (MQ=255)
tCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATAtttttttt < 2:1194435/100‑1 (MQ=255)
cTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATATTTTTTTTg < 2:1913635/100‑1 (MQ=255)
cTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATATTTTTTTTg < 1:280788/100‑1 (MQ=255)
cTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATATTTTTTTTg < 1:453520/100‑1 (MQ=255)
tATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATATTTTTTTTGa < 1:1437209/100‑1 (MQ=255)
tGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATATTTTTTTTGATa < 2:917769/100‑1 (MQ=255)
tGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATATTTTTTTTGATa < 2:9428/100‑1 (MQ=255)
gCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCATTAATAGTGTATTCATATTATATTTTTTTTGAt > 2:1222688/1‑98 (MQ=255)
cTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATATTTTTTTTGATAg < 2:1533340/99‑1 (MQ=255)
cTTTTGCTA‑TTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATATTTTTTTTGATAGac < 1:1153336/100‑1 (MQ=255)
tttGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATATTTTTTTTGATAGaca < 2:1845856/100‑1 (MQ=255)
tttGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATATTTTTTTTGATAGaca > 1:2275583/1‑100 (MQ=255)
ttGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCTCTAATAGTGTATTCATATTATATTTTTTTTGATAGacac < 1:458145/100‑1 (MQ=255)
ttGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATATTTTTTTTGATAGacac < 2:510733/100‑1 (MQ=255)
tGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATATTTTTTTTGATAGAcaca < 2:1987517/100‑1 (MQ=255)
|
GTTTGCATCATTCTATCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTA‑TTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATATTTTTTTTGATAGACACA > NC_000913/2469553‑2469743
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
