Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A11 F142 I0 R1
|
175 |
91.2 |
4812830 |
94.5% |
4548124 |
99.7 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,469,656:1 |
(T)7→8 |
100% |
coding (526/1332 nt) |
gtrS → |
serotype‑specific glucosyl transferase, CPS‑53 (KpLE1) prophage |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,469,649 | 1 | . | T | 96.2%
| 350.0
/ 6.5
| 104 | coding (519/1332 nt) | gtrS | serotype‑specific glucosyl transferase, CPS‑53 (KpLE1) prophage |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/4); new base T (48/52); total (48/56) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.22e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.81e-01 |
Only 100 of 126 total aligned reads displayed.
AATGTTTGCATCATTCTATCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTA‑TTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATATTTTTTTTGATAGACACA > NC_000913/2469550‑2469743
|
tGTTTGCATCATTCTATCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTA‑tt < 1:650958/100‑1 (MQ=255)
tGTTTGCATCATTCTATCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTAATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTA‑tt > 2:1457701/1‑100 (MQ=255)
tGCATCATTCTATCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTA‑tttttt > 2:984078/1‑100 (MQ=255)
catcatTCTATCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTA‑tttttttt < 2:38409/100‑2 (MQ=255)
catcatTCTATCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTA‑tttttttt < 1:2243230/100‑2 (MQ=255)
catcatTCTATCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTA‑tttttttt > 2:618467/1‑99 (MQ=255)
atcatTCTATCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAACAATAATAAATCTATGCTTTTGCTA‑ttttttttc < 2:1571216/100‑3 (MQ=255)
atcatTCTATCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTA‑ttttttt < 1:2037780/98‑1 (MQ=255)
atcatTCTATCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATACAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTA‑ttttttttc < 2:739041/100‑3 (MQ=255)
tcatTCTATCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTAGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTA‑ttttttttcg < 2:397077/100‑4 (MQ=255)
catTCTATCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTA‑ttttttttcgt < 1:1674296/100‑5 (MQ=255)
catTCTATCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTA‑ttttttttcgt < 1:1659060/100‑5 (MQ=255)
atTCTATCAAGAGCAAATAATTATAATTTTCCTTCCAGTTTTGGTTTTTTTAGTAAAATGGAGAAACAAGAACACTATGTTTTTGATT‑tgttttttt > 2:1183019/1‑95 (MQ=255)
atTCTATCAAGAGCAAATAATTATAATTTTACTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTA‑ttttttttcttt > 2:137039/1‑95 (MQ=255)
atTCTATAAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTA‑ttttttttcgtt < 2:314690/100‑6 (MQ=255)
ttCTATCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTg < 1:1636942/100‑1 (MQ=255)
ttCTATCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTg < 1:414161/100‑1 (MQ=255)
ttCTATCAAAAGCAAATAGTTATAATTTTTCTTCCGTTTTTTGTGTATTTATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTA‑ttttttttcg < 2:1259252/97‑4 (MQ=255)
tCTATCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGc > 2:892722/1‑100 (MQ=255)
tCTATCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTA‑ttttttttcttttc > 1:2013578/1‑93 (MQ=255)
cTATCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCt < 1:1075931/100‑1 (MQ=255)
cTATCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCt < 1:1359244/100‑1 (MQ=255)
aTCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCtaa > 1:30316/1‑100 (MQ=255)
gCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATc < 2:771029/100‑1 (MQ=255)
aaaTAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCt < 2:702555/99‑1 (MQ=255)
aaaTAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTa > 2:782125/1‑100 (MQ=255)
aaaTAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTa > 1:1339154/1‑100 (MQ=255)
aaTAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTAc < 1:697794/100‑1 (MQ=255)
aTAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACt < 1:291792/100‑1 (MQ=255)
aTAGTAATATTTTTCCTTCCATTTTTGATGGATTCATTAACATGCAACAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACt < 2:1987360/100‑1 (MQ=255)
tAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACt < 2:1160702/99‑1 (MQ=255)
aGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGAGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGc > 1:1456648/1‑100 (MQ=255)
gTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCt > 1:761610/1‑100 (MQ=255)
gTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCt < 2:1174302/100‑1 (MQ=255)
tataATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCACAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTaa < 1:1303995/100‑1 (MQ=255)
tataATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTACTAATAATATCTACTGCTaa > 1:161758/1‑100 (MQ=255)
taATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTaaaa < 1:242814/100‑1 (MQ=255)
aTTTTCCTTTCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAAt < 1:177634/100‑1 (MQ=255)
aTTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTaaaa > 2:209821/1‑98 (MQ=255)
ttttCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATc < 1:690386/100‑1 (MQ=255)
tccttccATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAAt < 1:1730337/100‑1 (MQ=255)
cttccATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTTGTTTTTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAAttt > 2:789685/1‑100 (MQ=255)
cttccATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAAttt > 1:506458/1‑100 (MQ=255)
cttccATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAAttt > 1:944388/1‑100 (MQ=255)
cttccATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAAttt < 1:1182282/100‑1 (MQ=255)
cttccATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAAttt > 1:1910460/1‑100 (MQ=255)
ttccATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTta < 2:900343/100‑1 (MQ=255)
ccATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTtata < 1:1885315/100‑1 (MQ=255)
cATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTatat > 1:2271577/1‑100 (MQ=255)
tttGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTA‑TTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAAcc < 2:194722/100‑1 (MQ=255)
gtgtATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATCTCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCa > 1:192734/1‑100 (MQ=255)
gtgtATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAAcccc < 1:98833/99‑1 (MQ=255)
gtgtATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCa > 1:1924264/1‑100 (MQ=255)
gtgtATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCCTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCa > 2:1493706/1‑100 (MQ=255)
ctgtATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAACAATCAATTTATATTAAcccc < 2:1456632/98‑1 (MQ=255)
tgtATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCAc > 1:1566254/1‑100 (MQ=255)
gtATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACt < 1:618470/100‑1 (MQ=255)
tATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTa > 1:623033/1‑100 (MQ=255)
aTTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTaa > 1:541961/1‑100 (MQ=255)
aTTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTa > 1:1147600/1‑99 (MQ=255)
tCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCCACTGCTAAAAATCAATTTATATAAACCCCACTaaa > 1:1552869/1‑98 (MQ=255)
cATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAg > 2:1263268/1‑100 (MQ=255)
cATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAg > 1:1018411/1‑100 (MQ=255)
aaaaaaaaaaaaaaaCAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAgt < 2:131248/90‑1 (MQ=255)
aTTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGGTA‑TTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAAATTATATTAACCCCACTAATAgtg < 2:1261778/100‑1 (MQ=255)
ttAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAgtg < 2:1029909/100‑1 (MQ=255)
ttAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAgtg > 1:1545442/1‑100 (MQ=255)
ttAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAgtg < 1:1481729/100‑1 (MQ=255)
aaCATGCAAAAACAATAAATCTATGGTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCCCTAATAgtgt > 1:994750/1‑99 (MQ=255)
aaCATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTa > 1:2059466/1‑100 (MQ=255)
aaCATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAATGTa > 1:1916585/1‑100 (MQ=255)
aTGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTTCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTc > 1:1793002/1‑100 (MQ=255)
cAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCata < 1:233578/100‑1 (MQ=255)
aaaaaCAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCatat < 2:1261207/100‑1 (MQ=255)
aaaCAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCTTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCatatta > 2:1670292/1‑100 (MQ=255)
aaaCAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCatatta > 2:1543416/1‑100 (MQ=255)
aCAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCatattn < 1:878634/98‑2 (MQ=255)
cAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTTGTTGCTAAGAAAATTTAGTGGTAGAAATAAATTTATATTAACCCTACTAATAGTGTAGGCata > 2:2358554/1‑94 (MQ=255)
aaTAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCatattatatt < 1:1876921/100‑1 (MQ=255)
aTAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATAttt > 1:1632470/1‑100 (MQ=255)
tAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATAtttt > 2:2078667/1‑100 (MQ=255)
aaTCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATAtttttt < 1:1833740/100‑1 (MQ=255)
aaTCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATAtttttt < 2:626699/100‑1 (MQ=255)
aTCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATAttttttt < 1:928406/100‑1 (MQ=255)
aTCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATAtttttt < 1:619596/99‑1 (MQ=255)
tCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATAtttttttt < 1:2258794/100‑1 (MQ=255)
tCTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATAtttttttt < 2:799464/100‑1 (MQ=255)
cTATTCTTTTGCTATTTTTTTTCTTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATATTTTTTTTg < 2:313022/100‑1 (MQ=255)
cTATGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATATTTTTTTTg < 1:1493231/100‑1 (MQ=255)
tATGCTTTTTCTATTTTTTTTCCTTACTACTAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATATTTATTTTg < 2:1914971/99‑1 (MQ=255)
aTGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATATTTTTTTTTAt > 1:1760784/1‑100 (MQ=255)
aTGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATATTTTTTTTGAt < 1:587044/100‑1 (MQ=255)
tGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATATTTTTTTTGATa > 1:1288294/1‑100 (MQ=255)
tGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATATTTTTTTTGATa < 1:1273326/100‑1 (MQ=255)
tGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATATTTTTTTTGATa < 1:2315684/100‑1 (MQ=255)
tGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATATTTTTTTTGATa > 1:477326/1‑100 (MQ=255)
tGCTTTTGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATATTTTTTTTGATa < 1:892733/100‑1 (MQ=255)
ttttGCTATTTTTTTTCTTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATATTTTTTTTGATAGac < 2:1153550/100‑1 (MQ=255)
tttGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTATTCCCACTAATAGTGTATTCATATTATATTTTTTTTGATAGaca < 2:2013556/100‑1 (MQ=255)
tGCTATTTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATATTTTTTTTGATAGAcaca < 1:984089/100‑1 (MQ=255)
|
AATGTTTGCATCATTCTATCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTA‑TTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATATTTTTTTTGATAGACACA > NC_000913/2469550‑2469743
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
