Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A12 F204 I1 R1
|
117 |
93.2 |
4682243 |
93.4% |
4373214 |
99.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,235,689 |
+A |
intergenic (+282/‑217) |
pgi → / → yjbE |
glucosephosphate isomerase/extracellular polysaccharide production threonine‑rich protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,235,685 | 1 | . | A | 98.4%
| 422.0
/ ‑0.3
| 122 | intergenic (+278/‑221) | pgi/yjbE | glucosephosphate isomerase/extracellular polysaccharide production threonine‑rich protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/2); new base A (56/63); total (57/65) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.99e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.93e-01 |
Only 100 of 134 total aligned reads displayed.
GGCATTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GG‑AAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTATATTTGATATTCATTCCAA > NC_000913/4235587‑4235783
|
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gCATTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GG‑aa < 2:2006149/100‑1 (MQ=255)
aTTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GG‑aaaa > 1:209577/1‑100 (MQ=255)
tttttttATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GG‑aaaaa > 1:1834331/1‑99 (MQ=255)
ttttttATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GG‑AAAATa < 2:2227301/100‑1 (MQ=255)
tttttATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GG‑aaaaata > 2:346858/1‑97 (MQ=255)
tttttATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GG‑aaaaata < 2:2220453/100‑4 (MQ=255)
ttttATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTACTCGTTGTTTATTTC‑GG‑aaaaatac > 1:24915/1‑96 (MQ=255)
tttATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GG‑aaaaatacg > 1:1844402/1‑95 (MQ=255)
tATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAAATACGCa < 2:1406784/100‑1 (MQ=255)
cAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAAATACGCAGAt < 1:775834/100‑1 (MQ=255)
cAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAAATACGCAGAt < 1:515718/100‑1 (MQ=255)
aGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAAATACGCAGAtt > 1:677786/1‑100 (MQ=255)
aTAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAAATACGCAGATTaa > 2:1555153/1‑100 (MQ=255)
aTAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAAATACGCACATTa > 2:2228222/1‑99 (MQ=255)
tAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAAATACGCAGATTAAt > 2:849756/1‑100 (MQ=255)
tAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAAATACGCAGATTAAt > 2:851312/1‑100 (MQ=255)
aaaTCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAAATACGCAGATTAAtt < 2:1762450/100‑1 (MQ=255)
aaaTCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAAATACGCAGATTAAtt < 2:2026215/100‑1 (MQ=255)
aaTCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAAATACGCAGATTAATTg > 2:1756528/1‑100 (MQ=255)
aTCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAAATACGCAGATTAATTGc > 2:122695/1‑100 (MQ=255)
aTCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAAATACGCAGATTAATTGc > 1:451731/1‑100 (MQ=255)
tCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAAATACGCAGATTAATTGCt < 2:531515/100‑1 (MQ=255)
ccTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAAATACGCAGATTAATTGCtttt > 1:1832404/1‑100 (MQ=255)
tGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGtt < 2:1546031/100‑1 (MQ=255)
tGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGtt < 1:778244/100‑1 (MQ=255)
gTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGttt < 2:2294019/100‑1 (MQ=255)
gTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGttt < 2:1147749/100‑1 (MQ=255)
cTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGttttt > 2:875703/1‑100 (MQ=255)
cTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGttttt < 2:34524/100‑1 (MQ=255)
cTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGttttt > 1:1302508/1‑100 (MQ=255)
gTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTttttat < 1:913563/100‑1 (MQ=255)
tAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTttttatt < 1:2204566/100‑1 (MQ=255)
aaTTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTttttattt < 1:25323/100‑1 (MQ=255)
aTTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTttttatttt > 1:204261/1‑100 (MQ=255)
aTTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTttttatttt > 1:849531/1‑100 (MQ=255)
tttAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTttttatttta > 2:1196706/1‑100 (MQ=255)
tttAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTttttatttta < 1:1231560/100‑1 (MQ=255)
tAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAg > 1:2133007/1‑100 (MQ=255)
aaCGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGt < 2:2070411/100‑1 (MQ=255)
aaCGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGt < 2:895185/100‑1 (MQ=255)
aaCGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGt > 1:178428/1‑100 (MQ=255)
cGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGttt > 1:1550051/1‑100 (MQ=255)
cGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGttt > 2:1733534/1‑100 (MQ=255)
aaTCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGa > 1:663499/1‑100 (MQ=255)
atcttACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGAt < 2:718204/96‑1 (MQ=255)
aTACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCTTTGTTTATTTC‑TGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGAtttt < 2:1729554/100‑1 (MQ=255)
tACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGAttttt > 1:1790279/1‑100 (MQ=255)
tACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGAttttt < 1:658499/100‑1 (MQ=255)
tACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGAtagat > 1:718205/1‑96 (MQ=255)
aCCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTa > 1:1000642/1‑100 (MQ=255)
ccGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTAt > 1:1694583/1‑100 (MQ=255)
ccGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTAt < 2:2119509/100‑1 (MQ=255)
cGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTAtt < 2:641066/100‑1 (MQ=255)
cGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTAtt < 2:178426/100‑1 (MQ=255)
gTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTg < 2:1520981/100‑1 (MQ=255)
tGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGt < 2:509810/100‑1 (MQ=255)
aGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTa < 2:2133000/100‑1 (MQ=255)
cgatcTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTaa < 2:144325/96‑1 (MQ=255)
aaTCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGCAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTaa > 2:1249941/1‑100 (MQ=255)
tCCTAAAATAGATTTATAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAat < 1:2296888/100‑1 (MQ=255)
ccTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAata > 2:209209/1‑100 (MQ=255)
ccTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAata > 2:192985/1‑100 (MQ=255)
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cTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAatat > 2:102780/1‑100 (MQ=255)
tAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAAtata > 2:1984532/1‑100 (MQ=255)
aaaaTAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTaaagatcg > 1:144327/1‑95 (MQ=255)
aaaTAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAg > 1:1295071/1‑100 (MQ=255)
aaaTAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAg < 2:2276557/100‑1 (MQ=255)
aaTAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGt < 1:1249944/100‑1 (MQ=255)
tAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTg > 2:1274769/1‑100 (MQ=255)
tAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTg > 2:461955/1‑100 (MQ=255)
gATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTTTTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTTATTTTAAGt > 2:2127806/1‑96 (MQ=255)
tttttAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAAc < 1:1555157/100‑1 (MQ=255)
tttttAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAAATACGCAGAGTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAAc < 1:2228230/100‑1 (MQ=255)
ttttAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACt < 2:663498/100‑1 (MQ=255)
tttAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACtt < 2:1834326/100‑1 (MQ=255)
tttAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACtt > 2:79061/1‑100 (MQ=255)
tAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTtat < 1:346860/100‑1 (MQ=255)
tAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTtat < 2:1844397/100‑1 (MQ=255)
ttgttgttTATTTCTGA‑AAAATATGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTTCAACTTATAtt < 2:24914/98‑1 (MQ=255)
cGTTGTTTATTTC‑GGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTATAttt > 2:113100/1‑100 (MQ=255)
gttgttTATTTC‑GGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTTCAACTTATAttta < 1:285160/100‑2 (MQ=255)
gttgttTATTTC‑GGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTATATTTg > 2:85977/1‑100 (MQ=255)
gttgttTATTTC‑GGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTATATTTg > 2:1629741/1‑100 (MQ=255)
ttgttTATTTC‑GGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTATATTTGa < 2:1832399/100‑1 (MQ=255)
ttgttTATTTC‑GGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTATATTTGa < 2:500449/100‑1 (MQ=255)
tgttTATTTC‑GGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTATATTTGat < 2:1971475/100‑1 (MQ=255)
gttTATTTC‑GGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTATAtttaaat < 2:2032818/100‑5 (MQ=255)
gttTATTTC‑GGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTATATTTGata < 1:179080/100‑1 (MQ=255)
gttTATTTC‑GGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTATATTTGata < 1:102782/100‑1 (MQ=255)
gttTATTTC‑GGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTATATTTGata > 2:1058103/1‑100 (MQ=255)
ttATTTC‑GGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTATATTTGATatt < 2:2109180/100‑1 (MQ=255)
ttATTTC‑GGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTATATTTGATatt > 1:603419/1‑100 (MQ=255)
tATTTC‑GGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTATATTTGATattc < 1:1196709/100‑1 (MQ=255)
tATTTC‑GGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTATATTTGATattc > 1:92927/1‑100 (MQ=255)
aTTTC‑GGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACttatattttatattta > 2:807956/1‑98 (MQ=255)
tttC‑GGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTATATTTGATattcat > 1:356237/1‑100 (MQ=255)
ttC‑GGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTATATTTGATattcatt < 1:1163813/100‑1 (MQ=255)
gg‑AAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAATTTGAAACTTATATTTGATATTAATTTCaa > 2:1219426/1‑100 (MQ=255)
|
GGCATTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GG‑AAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTATATTTGATATTCATTCCAA > NC_000913/4235587‑4235783
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
