Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A11 F256 I1 R1
|
186 |
136.5 |
6958264 |
92.1% |
6408561 |
99.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,235,689 |
+A |
intergenic (+282/‑217) |
pgi → / → yjbE |
glucosephosphate isomerase/extracellular polysaccharide production threonine‑rich protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,235,685 | 1 | . | A | 94.5%
| 614.1
/ 27.9
| 199 | intergenic (+278/‑221) | pgi/yjbE | glucosephosphate isomerase/extracellular polysaccharide production threonine‑rich protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (2/9); new base A (74/114); total (76/123) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.11e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 213 total aligned reads displayed.
CGGCATTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GG‑A‑AAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTATATTTGATATTCATT > NC_000913/4235586‑4235779
|
cGGCATTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTATTTGTTTTTTATTTC‑gg > 1:370203/1‑100 (MQ=255)
ggCATTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GG‑a > 1:1104533/1‑100 (MQ=255)
cATTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GG‑a‑aa > 2:1302833/1‑100 (MQ=255)
ttttttATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GG‑a‑aaaat < 2:1149060/100‑3 (MQ=255)
ttttATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GG‑a‑aaaatac > 1:2649810/1‑96 (MQ=255)
ttATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAA‑AAATACGc < 2:2221832/100‑1 (MQ=255)
aTCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAA‑AAATACGCAg > 2:811180/1‑100 (MQ=255)
aTCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAA‑AAATACGCAg > 2:3281833/1‑100 (MQ=255)
tCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAA‑AAATACGCAGa > 2:389646/1‑100 (MQ=255)
cAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAA‑AAATACGCAGAt > 2:170133/1‑100 (MQ=255)
cAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAA‑AAATACGCAGAt > 1:2807430/1‑100 (MQ=255)
aGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAA‑AAATACGCAGAtt < 1:2623869/100‑1 (MQ=255)
gATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTCAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAA‑AAATACGCAGa > 1:68330/1‑97 (MQ=255)
gATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAA‑AAATACGCAGATTa < 2:2834516/100‑1 (MQ=255)
tAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAA‑AAATACGCAGATTAAt > 1:2964555/1‑100 (MQ=255)
ntCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAA‑AAATACGCAGATTAATTGc > 1:2929771/2‑100 (MQ=255)
cttccgatctCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAA‑AAATACGCAGATTAATTGc < 2:419493/91‑1 (MQ=255)
ccccTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAA‑AAATACGCAGATTAATTGCtt < 1:2475298/100‑1 (MQ=255)
cccTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAA‑AAATACGCAGATTAATTGCttt < 1:1784414/100‑1 (MQ=255)
cccTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAA‑AAATACGCAGATTAATTGCttt < 2:112814/100‑1 (MQ=255)
ccTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAA‑AAATACGCAGATTAATTGCtttt < 1:253961/100‑1 (MQ=255)
cTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAA‑AAATACGCAGATTAATTGCTTTTg > 2:618432/1‑100 (MQ=255)
ttGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAA‑AAATACGCAGATTAATTGCTTTTGt < 1:2358375/100‑1 (MQ=255)
gTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAA‑AAATACGCAGATTAATTGCTTTTGttt < 2:1679561/100‑1 (MQ=255)
gTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAA‑AAATACGCAGATTAATTGCTTTTGttt < 1:3185890/100‑1 (MQ=255)
gTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAA‑AAATACGCAGATTAATTGCTTTTGtt < 2:2990583/99‑1 (MQ=255)
cTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAA‑AAATACGCAGATTAATTGCTTTTGttttt > 1:564924/1‑100 (MQ=255)
gTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAA‑AAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTttttat < 2:929741/100‑1 (MQ=255)
aaTTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAA‑AAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTttttattt > 2:180761/1‑100 (MQ=255)
aaTTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAA‑AAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTttttattt < 2:2575675/100‑1 (MQ=255)
tttAACGGAAATTATACCGTGGGGTTAATCCTACAATAGATTGTTAATCGTTGTTTATTTT‑TGAA‑AAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTttttatttt < 1:1618174/99‑1 (MQ=255)
tAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAA‑AAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAg < 1:2780303/100‑1 (MQ=255)
ggAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAA‑AAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTa < 2:3029567/100‑1 (MQ=255)
ggAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑AAAA‑AAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTa < 1:2316182/100‑1 (MQ=255)
gAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAA‑AAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTAt > 1:1915919/1‑100 (MQ=255)
gAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAA‑AAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTAt > 2:1188063/1‑100 (MQ=255)
gAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAA‑AAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTAt < 1:2910564/100‑1 (MQ=255)
aaaTCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAA‑AAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATg < 1:889620/100‑1 (MQ=255)
tACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAA‑AAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGAttttt < 1:914385/100‑1 (MQ=255)
tACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAA‑AAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGAttttt > 2:2076222/1‑100 (MQ=255)
aCCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAA‑AAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTa < 1:2854040/100‑1 (MQ=255)
ccGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAA‑AAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTAt > 1:1669351/1‑100 (MQ=255)
ccGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAA‑AAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTAt > 2:2264718/1‑100 (MQ=255)
ccGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAA‑AAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTAt > 1:1757065/1‑100 (MQ=255)
ccGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAA‑AAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTAt < 1:1172163/100‑1 (MQ=255)
gTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAA‑AAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTg > 2:3011613/1‑100 (MQ=255)
gTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAA‑AAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTg < 2:3212685/100‑1 (MQ=255)
gTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAA‑AAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTg > 2:2850862/1‑100 (MQ=255)
gTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAA‑AAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTg > 1:2981546/1‑100 (MQ=255)
gAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAA‑AAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGtt < 1:2264686/100‑1 (MQ=255)
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aGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCTTA‑A‑AAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTa < 1:1395406/100‑1 (MQ=255)
ggTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAA‑AAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTa < 1:3419917/99‑1 (MQ=255)
ggTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAA‑AAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTAt > 2:358591/1‑100 (MQ=255)
gTTAATGCTAAAATAGATTTTTAATCGTTTTTTATTTC‑GGAA‑AAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTGAAGTTTATGATTTTTATTGTTAtt < 1:99389/100‑1 (MQ=255)
gTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAA‑AAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTAtt < 1:964919/100‑1 (MQ=255)
gTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAA‑AAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTAtt > 1:449400/1‑100 (MQ=255)
ttAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAA‑AAATACGCAGATTAATTGTTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTAttt < 1:2459394/100‑1 (MQ=255)
aaTCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAA‑AAATACGCAGATTAATTGTTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTaa < 1:1534450/100‑1 (MQ=255)
tCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTTTTTATTTC‑GGAA‑AAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAat < 1:1695509/100‑1 (MQ=255)
tCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAA‑AAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAat < 2:1235153/100‑1 (MQ=255)
ccTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAA‑AAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAata > 1:3209777/1‑100 (MQ=255)
ccTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAA‑AAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAata < 1:3391674/100‑1 (MQ=255)
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cTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAA‑AAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAatat > 2:442602/1‑100 (MQ=255)
tAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAA‑AAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAAtata < 2:675549/100‑1 (MQ=255)
aaaaTAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCTGT‑A‑AAATGCGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATaa < 1:2555865/100‑1 (MQ=255)
aaaTAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAA‑AAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAg < 2:1104547/100‑1 (MQ=255)
aaaTAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAA‑AAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAg < 2:2600027/100‑1 (MQ=255)
aTAGATTTTTAATCGTTTTTTATTTT‑GGAA‑AAATACGCAGATTAATTGTTTTTGTTTTTATATTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAg < 1:832753/98‑1 (MQ=255)
tAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAA‑AAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTg < 1:408098/100‑1 (MQ=255)
aGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAA‑AAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTgn < 2:2929818/100‑2 (MQ=255)
aGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAA‑AAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGa < 2:212010/100‑1 (MQ=255)
aTTTTTAATCGTTGTTTATTTCTGA‑A‑AAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAACTATAAGTTGaa < 1:2669625/99‑1 (MQ=255)
tttttAATCGTTGTTTATTTC‑GGAA‑AAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAAc < 2:393513/100‑1 (MQ=255)
tttttAATCGTTGTTTATTTC‑GGAA‑AAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAAc < 1:2183452/100‑1 (MQ=255)
ttttAATCGTTGTTTATTTC‑GGAA‑AAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACt < 1:2762671/100‑1 (MQ=255)
ttttAATCGTTGTTTATTTC‑GGAA‑AAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACt < 2:1430775/100‑1 (MQ=255)
tAATCGTTGTTTATTTC‑GGAA‑AAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTtat < 1:395886/100‑1 (MQ=255)
taTCGGTGTTTATTTC‑GT‑ATAAATACGTAGATTATTTGCTTTTTTGTTTATTTTAGTTTTATGATATTTATGGTTATTTAAATATAATTTTCAACTtat < 1:3318037/98‑1 (MQ=255)
aTCGTTGTTTATTTC‑GGAA‑AAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTatat < 2:2172606/100‑1 (MQ=255)
cGTTGTTTATTTC‑GGAA‑AAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTATAttn < 2:2015659/100‑2 (MQ=255)
cGTTGTTTATTTC‑GGAA‑AAATACGCAGATTAATAGCTTTTGTTTTTTTTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTatat > 1:658399/1‑98 (MQ=255)
gttgttTATTTC‑GGAA‑AAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTATATTTg < 2:1761861/100‑1 (MQ=255)
gttgttTATTTC‑GGAA‑AAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTATATTTg > 1:1016080/1‑100 (MQ=255)
gttgttTATTTC‑GGAA‑AAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTATATTTg < 2:3363316/100‑1 (MQ=255)
tgttTATTTC‑GG‑A‑AAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTATATTTGata > 1:416950/1‑100 (MQ=255)
gttTATTTC‑GGAA‑AAATACGCCGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTATATTTGata > 1:557573/1‑100 (MQ=255)
tttATTTC‑GGAA‑AAATACGCAGATTAATTGTTATTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTTCAACTTATAtttaaata < 1:1330943/100‑6 (MQ=37)
tttATTTC‑GGAA‑AAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTATATTTGatat > 1:73045/1‑100 (MQ=255)
ttATTTC‑GGAA‑AAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTTCAACTTATAtttaaataa < 1:2058311/100‑7 (MQ=37)
ttATTTC‑GGAA‑AAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTATATTTGATatt < 1:1261519/100‑1 (MQ=255)
ttATTTC‑GGAA‑AAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTATATTTGATatt < 1:2531727/100‑1 (MQ=255)
tATTTC‑GGAA‑AAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTTCAACTTATAtttaaataac < 2:2363228/100‑8 (MQ=37)
tATTTC‑GGAA‑AAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTATATTTGATattc < 1:1137187/100‑1 (MQ=255)
tttC‑GGAA‑AAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTATATTTGATattcat < 1:1383718/100‑1 (MQ=255)
tttC‑GGAA‑AAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTATATTTGATattcat < 2:3376560/100‑1 (MQ=255)
ttC‑GGAA‑AAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTTCAACTTATAtttaaataacaat < 2:3217212/100‑11 (MQ=25)
ttC‑GGAA‑AAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTTCAACTTATAtttaaataacaat < 2:953703/100‑11 (MQ=25)
ttC‑GGAA‑AAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTATATTTGATattcatt < 1:271977/100‑1 (MQ=255)
|
CGGCATTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GG‑A‑AAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTATATTTGATATTCATT > NC_000913/4235586‑4235779
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
