Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A12 F133 I1 R1
|
102 |
83.9 |
4092546 |
96.1% |
3932936 |
99.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,235,689 |
+A |
intergenic (+282/‑217) |
pgi → / → yjbE |
glucosephosphate isomerase/extracellular polysaccharide production threonine‑rich protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,235,685 | 1 | . | A | 94.2%
| 345.8
/ 13.5
| 103 | intergenic (+278/‑221) | pgi/yjbE | glucosephosphate isomerase/extracellular polysaccharide production threonine‑rich protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (2/4); new base A (42/55); total (44/59) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 108 total aligned reads displayed.
GGCATTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTT‑CGG‑AAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTATATTTGATATTCA > NC_000913/4235587‑4235777
|
ggCATTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTT‑CGG‑a < 2:648453/100‑1 (MQ=255)
ggCATTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTT‑CGG‑a > 1:2022311/1‑100 (MQ=255)
gCATTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTT‑CGG‑aa > 1:95605/1‑100 (MQ=255)
gCATTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTT‑CGG‑aa < 2:1522548/100‑1 (MQ=255)
cATTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTCAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTT‑CGG‑aaa > 2:2001683/1‑100 (MQ=255)
ttATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTT‑CGGAAAAATACGc > 2:55005/1‑100 (MQ=255)
ttATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTT‑CGGAAAAATACGc < 1:1925178/100‑1 (MQ=255)
tATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTT‑CGGAAAAATACGCa < 2:434117/100‑1 (MQ=255)
aTCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTT‑CGGAAAAATACGCAg < 2:1950292/100‑1 (MQ=255)
aTCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTT‑CGGAAAAATACGCAg > 1:1417661/1‑100 (MQ=255)
tCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTAATT‑AAAAAAAATACGCAGa < 2:1180639/100‑1 (MQ=255)
cAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTT‑CGGAAAAATACGCAGAt < 2:1019871/100‑1 (MQ=255)
aGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTT‑CGGAAAAATACGCAGAtt > 2:902217/1‑100 (MQ=255)
aGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTT‑CGGAAAAATACGCAGAtt > 1:376041/1‑100 (MQ=255)
aGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTT‑CGGAAAAATACGCAGAtt > 2:881135/1‑100 (MQ=255)
aGATAAAGCCCGTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTGTAATCGTTGTTTATTT‑CGGAAAAATACGCAGAtt > 2:1077970/1‑100 (MQ=255)
gatctaTCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTT‑CGGAAAAATACGCAGATTa < 2:1943162/95‑1 (MQ=255)
gATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTT‑CGGAAAAATACGCAGATTa < 2:515343/100‑1 (MQ=255)
tAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTT‑CGGAAAAATACGCAGATTAAt < 1:2001701/100‑1 (MQ=255)
tAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTT‑CGGAAAAATACGCAGATTAAt > 1:314459/1‑100 (MQ=255)
aaaTCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTT‑CGGAAAAATACGCAGATTAAtt > 1:1477159/1‑100 (MQ=255)
aaTCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTT‑CGGAAAAATACGCAGATTAATTg < 1:1792092/100‑1 (MQ=255)
aTCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTT‑CGGAAAAATACGCAGATTaagatc > 1:1943180/1‑96 (MQ=255)
aTCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTT‑CGGAAAAATACGCAGATTAATTGc > 2:720094/1‑100 (MQ=255)
ccccTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTT‑CGGAAAAATACGCAGATTAATTGCtt < 2:1842143/100‑1 (MQ=255)
cccTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTT‑CGGAAAAATACGCAGATTAATTGCttt < 1:928240/100‑1 (MQ=255)
cccTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTT‑CGGAAAAATACGCAGATTAATTGCttt > 2:151821/1‑100 (MQ=255)
cccTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTT‑CGGAAAAATACGCAGATTAATTGCt < 2:717149/98‑1 (MQ=255)
gTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTT‑CGGAAAAATACGCAGATTCATTGCTTTTGttt < 1:1372131/100‑1 (MQ=255)
gTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTT‑CGGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGttt < 1:831311/100‑1 (MQ=255)
tCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTT‑CGGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGtttt < 1:1256192/100‑1 (MQ=255)
tCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTCGTTTATTT‑CGGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGtttt < 2:1113747/100‑1 (MQ=255)
cTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTT‑CGGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGttttt > 2:2012873/1‑100 (MQ=255)
gTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTT‑CGGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTttttat < 1:993942/100‑1 (MQ=255)
aTTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTT‑CGG‑AAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTttttatttta > 1:1208625/1‑100 (MQ=255)
tttAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTT‑CGGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTttttatttta < 2:221706/100‑1 (MQ=255)
tttAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTT‑CGG‑AAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTaa < 2:1299532/100‑1 (MQ=255)
aaCGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTT‑CGGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGt > 2:1867806/1‑100 (MQ=255)
aaCGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTT‑CGGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGt > 1:1070793/1‑100 (MQ=255)
aCGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTT‑CGGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGtt < 1:902220/100‑1 (MQ=255)
aCGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTT‑CGGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGtt > 1:624558/1‑100 (MQ=255)
cGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTT‑CGGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGttt > 2:1616172/1‑100 (MQ=255)
cGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTT‑CGGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGttt < 2:1682458/100‑1 (MQ=255)
cGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTT‑CGGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGttt > 2:1326388/1‑100 (MQ=255)
cGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTT‑CGGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGttt > 2:1019177/1‑100 (MQ=255)
ggAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTT‑CGGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTa > 2:679301/1‑100 (MQ=255)
gAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTT‑CGGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTAt < 2:1310822/100‑1 (MQ=255)
aaaTCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTT‑CGGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATg > 1:1270195/1‑100 (MQ=255)
tCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTT‑CGGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGAtt > 1:1232951/1‑100 (MQ=255)
cATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTT‑CGGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGAttt < 2:2022293/100‑1 (MQ=255)
aTACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTT‑CGGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGAtttt < 1:1615557/100‑1 (MQ=255)
aTACCGTGAGATTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCTTTGTTTATTT‑CGG‑AAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGAttttt < 2:242912/100‑1 (MQ=255)
tACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTT‑CGGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGAttttt < 1:699150/100‑1 (MQ=255)
tACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTT‑CGGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGAttttt > 1:61881/1‑100 (MQ=255)
ccGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTT‑TGGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTAt < 2:344495/100‑1 (MQ=255)
ccGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTT‑CGGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTAt < 1:1850709/100‑1 (MQ=255)
cGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATATTTAATAGTTGTTTATTT‑CGGAAAAATACGCAGATTAATTGCATTTGTTTTTATTTTAAGTTTATAAtttttct > 2:1850499/1‑97 (MQ=255)
gTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTT‑CGGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTg > 2:224907/1‑100 (MQ=255)
gTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTT‑CGGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTg < 1:32471/100‑1 (MQ=255)
gTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTT‑CGGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTg > 2:1641478/1‑100 (MQ=255)
tGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTT‑CGGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGt < 1:1424594/100‑1 (MQ=255)
gAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTT‑CGGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGtt < 1:876708/100‑1 (MQ=255)
gAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTT‑CGGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGtt < 1:55005/100‑1 (MQ=255)
aGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTT‑CGGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTa < 1:847178/100‑1 (MQ=255)
ggTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTT‑CGGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTAt > 2:582896/1‑100 (MQ=255)
gTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTT‑CGGAAAAATACTCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTAtt < 2:1362566/100‑1 (MQ=255)
tAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTT‑CGGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTa > 1:116500/1‑100 (MQ=255)
tAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTT‑CGGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTa < 2:293086/100‑1 (MQ=255)
aaTCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTT‑CGGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTaa < 1:989667/100‑1 (MQ=255)
aTCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTT‑CGGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTaaa < 1:1003160/100‑1 (MQ=255)
tCCTAAAATAGATTTTTAATCTTTTTTTATTT‑CGGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAat > 2:1152388/1‑100 (MQ=255)
ccTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTT‑CGGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAata > 2:637471/1‑100 (MQ=255)
ccTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTT‑CGGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAata < 1:582898/100‑1 (MQ=255)
ccTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTT‑CGGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAata < 1:720096/100‑1 (MQ=255)
ccTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTT‑CGG‑AAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATTATTTTTATTTTTATTTAAatat > 1:344115/1‑100 (MQ=255)
cTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTT‑CGGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAatat > 2:1614070/1‑100 (MQ=255)
aaaaTATATTTTTAATCTTTGTTTATTT‑CGGAAAAATACGAATATTAATTGCTTTTTTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAAtata < 2:401979/99‑1 (MQ=255)
aaaTAGATTTTTAATCGTTGTTTATTT‑CGGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAg < 1:806554/100‑1 (MQ=255)
aaTAGATTTTTAATCGTTGTTTATTT‑CGGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGt < 1:1641491/100‑1 (MQ=255)
aTAGATTTTTAATCTTTGTTTATTT‑CGGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGtt < 2:712909/100‑1 (MQ=255)
gATTTTTAATCGTTGTTTATTT‑CGGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGaa > 1:63971/1‑100 (MQ=255)
tttttAATCGTTGTTTATTTAAGA‑AAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAAc < 2:138584/100‑1 (MQ=255)
tttAATCGTTGTTTATTT‑CGGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACtt < 2:1474245/100‑1 (MQ=255)
tAATCGTTGTTTATTT‑CGGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTCTTATTTAAATATAAGTTGAAACTtat < 1:1240392/100‑1 (MQ=255)
tCGTTGTTTATTT‑CGGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTATAtt > 1:222405/1‑100 (MQ=255)
tCGTTGTTTATTT‑CGGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTATAtt > 1:967107/1‑100 (MQ=255)
cGTTGTTTATTT‑CGGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTATAttt < 1:224908/100‑1 (MQ=255)
ttgttTATTT‑CGGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTATATTTGa < 2:1166053/100‑1 (MQ=255)
tgttTATTT‑CGGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTATATTTggt < 1:1386482/100‑3 (MQ=255)
tgttTATTT‑CGGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTATATTTGat < 1:1867823/100‑1 (MQ=255)
tgttTATTT‑CGGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTACATTTGat < 1:1077975/100‑1 (MQ=255)
gttTATTT‑CGGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTATATTTGata < 2:95604/100‑1 (MQ=255)
tttATTT‑CGGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTATATTTGata < 2:1417652/99‑1 (MQ=255)
ttATTT‑CGGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTATATTTGATatt < 2:1891286/100‑1 (MQ=255)
ttATTT‑CGGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTATATTTGATatt > 2:837863/1‑100 (MQ=255)
tATTT‑CGGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTTCAACTTATAtttaaataac < 1:637473/100‑8 (MQ=37)
aTTT‑CGGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGTAACTTATATTTTATtttca > 2:955317/1‑100 (MQ=255)
aTTT‑CGGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTATATTTGAttttta > 2:505160/1‑98 (MQ=255)
aTTT‑CGGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTATATTTGATattca > 2:1839144/1‑100 (MQ=255)
aTTT‑CGGAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTATATTTGATattca > 1:910027/1‑100 (MQ=255)
|
GGCATTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTT‑CGG‑AAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTATATTTGATATTCA > NC_000913/4235587‑4235777
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
