Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A11 F142 I1 R1
|
99 |
64.8 |
3148104 |
96.3% |
3031624 |
99.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,235,689 |
+A |
intergenic (+282/‑217) |
pgi → / → yjbE |
glucosephosphate isomerase/extracellular polysaccharide production threonine‑rich protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,235,685 | 1 | . | A | 97.7%
| 296.5
/ ‑0.2
| 87 | intergenic (+278/‑221) | pgi/yjbE | glucosephosphate isomerase/extracellular polysaccharide production threonine‑rich protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (2/0); new base A (41/44); total (43/44) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.41e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.25e-01 |
GCATTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGG‑AA‑AATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTATATTTGATATTCATT > NC_000913/4235588‑4235779
|
gCATTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGG‑aa > 1:1162644/1‑100 (MQ=255)
gCATTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGG‑aa < 1:1199500/100‑1 (MQ=255)
aTTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGG‑aa‑aa > 2:1573297/1‑100 (MQ=255)
tttttttATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGG‑aa‑aaa < 1:1244887/100‑2 (MQ=255)
ttttttATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGG‑aa‑aaat < 1:402723/100‑3 (MQ=255)
tttATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATCCCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGG‑aa‑aaatacg < 2:1004298/100‑6 (MQ=255)
tttATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGG‑aa‑aaatacg > 1:636163/1‑95 (MQ=255)
ttATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGGAAA‑AATACGc < 1:1296919/100‑1 (MQ=255)
tCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGGAAA‑AATACGCAGa < 1:1152955/100‑1 (MQ=255)
cAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGGAAA‑AATACGCAGAt > 2:460772/1‑100 (MQ=255)
aGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGGAAA‑AATACGCAGAtt > 1:136890/1‑100 (MQ=255)
gATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGGAAA‑AATACGCAGATTa > 1:889228/1‑100 (MQ=255)
aTAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGGAAA‑AATACGCAGATTaa < 2:563615/100‑1 (MQ=255)
tAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGGAAA‑AATACGCAGATTAAt < 2:1366405/100‑1 (MQ=255)
aaTCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGGAAA‑AATACGCAGATTAATTg > 1:233132/1‑100 (MQ=255)
cccTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGGAAA‑AATACGCAGATTAATTGCttt > 1:1416804/1‑100 (MQ=255)
cccTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGGAAA‑AATACGCAGATTAATTGCttt < 2:749453/100‑1 (MQ=255)
cTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGGAAA‑AATACGCAGATTAATTGCTTTTg < 1:87626/100‑1 (MQ=255)
cTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGGAAA‑AATACGCAGATTAATTGCTTTTg > 1:1286206/1‑100 (MQ=255)
cTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGGAAA‑AATACACAGATTAATTGCTTTTg < 2:1037781/100‑1 (MQ=255)
tCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGGAAA‑AATACGCAGATTAATTGCTTTTGtttt < 1:554812/100‑1 (MQ=255)
cTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGGAAA‑AATACGCAGATTAATTGCTTTTGttttt > 2:1247887/1‑100 (MQ=255)
cTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGGAAA‑AATACGCAGATTAATTGCTTTTGttttt > 1:1268535/1‑100 (MQ=255)
cTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGGAAA‑AATACGCAGATTAATTGCTTTTGttttt < 2:867208/100‑1 (MQ=255)
cTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGGAAA‑AATACGCAGATTAATTGCTTTTGttttt > 1:480177/1‑100 (MQ=255)
cTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGGAAA‑AATACGCAGATTAATTGCTTTTGttttt < 1:695473/100‑1 (MQ=255)
tGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGGAAA‑AATACGCAGATTAATTGCTTTTGTtttta < 2:860524/100‑1 (MQ=255)
tGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGGAAA‑AATACGCAGATTAATTGCTTTTGTtttta > 1:719929/1‑100 (MQ=255)
gTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGGAAA‑AATACGCAGATTAATTGCTTTTGTttttat > 1:1047591/1‑100 (MQ=255)
tAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGGAAA‑AATACGCAGATTAATTGCTTTTGTttttatt < 2:1523724/100‑1 (MQ=255)
aaTTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGGAAA‑AATACGCAGATTAATTGCTTTTGTttttattt < 2:1451822/100‑1 (MQ=255)
tttAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGGAAA‑AATACGCAGATTAATTGCTTTTGTttttatttta > 1:309084/1‑100 (MQ=255)
tttAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGGAAA‑AATACGCAGATTAATTGCTTTTGTttttatttta > 1:429622/1‑100 (MQ=255)
tttAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGGAAA‑AATACGCAGATTAATTGCTTTTGTttttatttta < 2:269342/100‑1 (MQ=255)
ttAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGGAAA‑AATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTaa > 1:612268/1‑100 (MQ=255)
tAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGGAAA‑AATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAg < 2:1446982/100‑1 (MQ=255)
tAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGGAAA‑AATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAg < 2:1559608/100‑1 (MQ=255)
cGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGGAAA‑AATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGttt > 2:977564/1‑100 (MQ=255)
gAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGGAAA‑AATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTAt < 1:1149794/100‑1 (MQ=255)
aaaTCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGGAAA‑AATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATg < 2:198702/100‑1 (MQ=255)
aTACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGGAAA‑AATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGAtttt < 2:989244/100‑1 (MQ=255)
aTACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGGAAA‑AATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGAtttt < 1:974903/100‑1 (MQ=255)
aTACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGGAAA‑AATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGAtttt < 1:1219644/100‑1 (MQ=255)
aCCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGGAAA‑AATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTa > 2:772855/1‑100 (MQ=255)
aCCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGGAAA‑AATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTa < 2:680480/100‑1 (MQ=255)
ccGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGGAAA‑AATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTAt > 2:1280695/1‑100 (MQ=255)
ccGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGGAAA‑AATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTAt < 1:433085/100‑1 (MQ=255)
ccGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGGAAA‑AATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTAt > 2:1534637/1‑100 (MQ=255)
gTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGGAAA‑AATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTg > 1:138779/1‑100 (MQ=255)
gTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGGAAA‑AATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTg < 2:1286197/100‑1 (MQ=255)
tGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGGAAA‑AATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGt < 1:1573307/100‑1 (MQ=255)
aGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGGAAA‑AATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTa < 2:558658/100‑1 (MQ=255)
ggTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGGAAA‑AATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTAt > 2:1245132/1‑100 (MQ=255)
ggTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGG‑AA‑AATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTAtt > 2:1461244/1‑100 (MQ=255)
gTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGGAAA‑AATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTAtt > 1:1175720/1‑100 (MQ=255)
tAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGGAAA‑AATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTa < 1:1247139/100‑1 (MQ=255)
tAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGGAAA‑AATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTa < 1:455971/100‑1 (MQ=255)
aTCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGGAAA‑AATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTaaa < 1:1279785/100‑1 (MQ=255)
tCCTAAAATAGAGTTTTAATCGTTGTTTATTTCGGAAA‑AATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAat < 2:53227/100‑1 (MQ=255)
ccTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGGAAA‑AATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAata > 1:572726/1‑100 (MQ=255)
cTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGGAAA‑AATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAatat > 1:641418/1‑100 (MQ=255)
cTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGGAAA‑AATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAatat > 1:640255/1‑100 (MQ=255)
cTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGGAAA‑AATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAatat > 2:1078058/1‑100 (MQ=255)
cTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGGAAA‑AATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAatat > 2:1078075/1‑100 (MQ=255)
aaaaTAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGGAAA‑AATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATaa < 1:795507/100‑1 (MQ=255)
aaaTAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGGAAA‑AATACGCAGATTTATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAg < 2:363947/100‑1 (MQ=255)
aaTAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGGAAA‑AATATTCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAg < 2:936201/99‑1 (MQ=255)
aaTAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGGAAA‑AATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGt < 2:1420762/100‑1 (MQ=255)
aaTAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTAGGAAA‑AATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGt < 2:1365504/100‑1 (MQ=255)
aTAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGGAAA‑AATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGtt > 1:759861/1‑100 (MQ=255)
tAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGGAAA‑AATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTg < 2:429620/100‑1 (MQ=255)
gATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGGAAA‑AATACGTAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGaa < 2:829831/100‑1 (MQ=255)
gATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGGAAA‑AATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGGTTTTTATTGTTATTTAAATATAAGtt > 2:1541800/1‑97 (MQ=255)
gATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGGAAA‑AATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGaa > 1:456076/1‑100 (MQ=255)
tttttAATCGTTGTTTATTTCGGAAA‑AATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAAc > 1:80744/1‑100 (MQ=255)
ttttAATCGTTGTTTATTTCGGAAA‑AATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACt > 2:1373951/1‑100 (MQ=255)
ttttAATCGTTGTTTATTTCGGAAA‑AATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACt > 2:1373733/1‑100 (MQ=255)
ttttAATCGTTGTTTATTTCGGAAA‑AATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACt > 2:804970/1‑100 (MQ=255)
ttttAATCGTTGTTTATTTCGGAAA‑AATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACt > 2:723334/1‑100 (MQ=255)
tAATCGTTGTTTATTTCGGAAA‑AATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTtat > 2:281721/1‑100 (MQ=255)
aaTCGTTGTTTAGTTCGGAAA‑AAGACGCAGGTTAATTGATTTTGTGTTTAATTTCAATATATGATTTTTATTGTTATTTGAATATAAGTGGaaatt > 2:1004526/1‑94 (MQ=255)
aTCGTTGTTTATTTCGGAAA‑AATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTatat > 2:177391/1‑100 (MQ=255)
aTCGTTGTTTATTTCGGAAA‑AATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTatat > 2:855247/1‑100 (MQ=255)
tCGTTGTTTATTTCGGAAA‑AATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTATAtt > 2:1000286/1‑100 (MQ=255)
gttgttTATTTCGGAAA‑AATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTATATTTg < 2:480174/100‑1 (MQ=255)
attgttTATTTCGT‑AACAATAAGCAGATCAAATACTTTTGATTTTATTTTAAGTTTATTACTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTtata > 2:247838/2‑96 (MQ=255)
ttgttTATTTCGGAAA‑AATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTATATTTGa < 2:641415/100‑1 (MQ=255)
tgttTATTTCGGAAA‑AATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTATATTTGat < 2:1556496/100‑1 (MQ=255)
tgttTATTTCGGAAA‑AATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTATATTTGa < 2:640252/99‑1 (MQ=255)
gttTATTTCGGAAA‑AATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTATATTTGata < 2:1126869/100‑1 (MQ=255)
ttATTTCGGAAA‑AATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTATATTTGATatt < 2:87107/100‑1 (MQ=255)
aTTTCGGAAA‑AATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTATATTTGATattca > 1:208871/1‑100 (MQ=255)
ttCGGAAA‑AATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTATATTTGATattcatt > 1:129055/1‑100 (MQ=255)
ttCGGAAA‑AATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTATATTTGATattcatt < 2:1510832/100‑1 (MQ=255)
|
GCATTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGG‑AA‑AATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTATATTTGATATTCATT > NC_000913/4235588‑4235779
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
