Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A11 F56 I1 R1
|
155 |
65.2 |
3164312 |
95.9% |
3034575 |
99.8 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,235,689 |
+A |
intergenic (+282/‑217) |
pgi → / → yjbE |
glucosephosphate isomerase/extracellular polysaccharide production threonine‑rich protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,235,685 | 1 | . | A | 92.5%
| 285.1
/ 17.1
| 93 | intergenic (+278/‑221) | pgi/yjbE | glucosephosphate isomerase/extracellular polysaccharide production threonine‑rich protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (3/4); new base A (37/49); total (40/53) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 102 total aligned reads displayed.
CGGCATTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑G‑AAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTATATTTGATATTCATTCCAAT > NC_000913/4235586‑4235784
|
cGGCATTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑g‑g < 2:532274/100‑1 (MQ=255)
cATTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑G‑aaa > 2:1444041/1‑100 (MQ=255)
aTTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑G‑aaaa > 1:1090257/1‑100 (MQ=255)
ttttttATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑G‑aaaaat < 2:840502/100‑3 (MQ=255)
ttttttATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑G‑aaaaat > 1:144160/1‑98 (MQ=255)
ttttATCAGATCAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAAAAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑G‑aaaaatac > 2:830713/1‑96 (MQ=255)
tttATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑G‑aaaaatacg < 2:1264469/100‑6 (MQ=255)
tttATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑G‑aaaaatacg > 1:1461453/1‑95 (MQ=255)
cAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGAt > 1:341678/1‑100 (MQ=255)
cAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑G‑AAAATACGCAGAtt > 2:549936/1‑100 (MQ=255)
aGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGAtt < 2:479709/100‑1 (MQ=255)
aGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGAtt < 2:790635/100‑1 (MQ=255)
aGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGAtt > 2:810634/1‑100 (MQ=255)
tAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAAt > 2:498894/1‑100 (MQ=255)
tAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAAt < 2:1367878/100‑1 (MQ=255)
aaTCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTg < 2:70340/100‑1 (MQ=255)
aaTCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTg < 2:1467754/100‑1 (MQ=255)
cccTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCttt < 1:1527265/100‑1 (MQ=255)
cccTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCttt < 1:894450/100‑1 (MQ=255)
cccTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCttt < 1:162727/100‑1 (MQ=255)
ctgttatGTAATTTAACTGAAATCACTTTTTTTGCTTAACCGTAAAATAGATTTGTAATCGTTGTTTATTTCTG‑A‑AAAATACGCAGATTAATTGCt < 2:1446841/90‑1 (MQ=255)
cTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTg > 2:1344659/1‑100 (MQ=255)
tCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGtttt < 2:1371914/100‑1 (MQ=255)
cTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGttttt < 2:591500/100‑1 (MQ=255)
cTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGttttt > 2:777063/1‑100 (MQ=255)
tGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTtttta > 1:734279/1‑100 (MQ=255)
gTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTttttat < 1:304695/100‑1 (MQ=255)
gTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTttttat < 2:784085/100‑1 (MQ=255)
tAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGACTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTttttatt < 2:1008574/100‑1 (MQ=255)
tttAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑G‑AAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTaa < 1:893974/100‑1 (MQ=255)
ttAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTaa > 2:106101/1‑100 (MQ=255)
ccgatcttCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGtt < 2:611644/93‑1 (MQ=255)
aCGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGtt > 1:148906/1‑100 (MQ=255)
cGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGttt > 1:1312512/1‑100 (MQ=255)
cGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGttt > 1:1554835/1‑100 (MQ=255)
cGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑G‑AAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTa > 1:297748/1‑100 (MQ=255)
ggAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTa > 1:1164196/1‑100 (MQ=255)
ggAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTa < 2:567826/100‑1 (MQ=255)
gAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATTGTTTTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGttt < 2:1514490/98‑1 (MQ=255)
aaaTCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTAt > 1:1102828/1‑99 (MQ=255)
aaaTCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATg > 1:688123/1‑100 (MQ=255)
aaTCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGa > 1:1330458/1‑100 (MQ=255)
tCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGttagatcgg > 1:611646/1‑93 (MQ=255)
aCCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTa > 2:904654/1‑100 (MQ=255)
ccGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTAt > 1:1140336/1‑100 (MQ=255)
ccGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTA‑A‑AAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTAt < 2:187922/100‑1 (MQ=255)
cGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTAtt < 1:173919/100‑1 (MQ=255)
gTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTg < 1:1452351/100‑1 (MQ=255)
gTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTg < 1:411421/100‑1 (MQ=255)
gTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTg < 1:1552303/100‑1 (MQ=255)
tGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGt > 1:735047/1‑100 (MQ=255)
tGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGt < 1:261522/100‑1 (MQ=255)
gAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGtt > 2:252866/1‑100 (MQ=255)
aGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTa < 2:1408886/100‑1 (MQ=255)
ggTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTAt > 1:1005916/1‑100 (MQ=255)
ggTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTAt < 2:563034/100‑1 (MQ=255)
ggTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAAATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTCTGTTTTTTATTg > 1:1495893/1‑96 (MQ=255)
tAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTa < 1:1440370/100‑1 (MQ=255)
tAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTa < 1:1210753/100‑1 (MQ=255)
aaTCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTaa > 2:100463/1‑100 (MQ=255)
aTCCTAAAATAGGTTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTaaa < 2:210350/100‑1 (MQ=255)
aTCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTaaa > 2:588829/1‑100 (MQ=255)
aTCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTaaa < 1:795402/100‑1 (MQ=255)
tCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAat < 2:1330451/100‑1 (MQ=255)
tCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAat < 2:332731/100‑1 (MQ=255)
ccTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTTTTATTTAAata > 2:647251/1‑100 (MQ=255)
ccTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAata < 1:101801/100‑1 (MQ=255)
ccTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAata > 1:39105/1‑100 (MQ=255)
cTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAatat > 2:888888/1‑100 (MQ=255)
cTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAatat < 2:1461445/100‑1 (MQ=255)
aaaaTAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTTCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATaa > 2:1095166/1‑100 (MQ=255)
aaaaTAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTAATGTTTTTTATTGTTATTTAAATATaa > 2:1014861/1‑100 (MQ=255)
aaaTAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAg < 1:552691/100‑1 (MQ=255)
aaTAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTCTTTAAATATAAGt < 1:1073233/100‑1 (MQ=255)
tAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGTAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTg < 2:1075360/100‑1 (MQ=255)
aGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGa < 2:187753/100‑1 (MQ=255)
aGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGa > 1:1447618/1‑100 (MQ=255)
gATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGaa < 1:1182208/100‑1 (MQ=255)
gATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGaa < 1:305531/100‑1 (MQ=255)
aTTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑A‑AAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGaaa < 2:600673/100‑1 (MQ=255)
tttttAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCATATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAAc < 2:1090252/100‑1 (MQ=255)
tttttAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAAc > 2:234329/1‑100 (MQ=255)
tttttAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAAc < 2:39105/100‑1 (MQ=255)
tttttAATCGTTGTTTATTTC‑G‑G‑AAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATCTTAGTTGAAACt > 2:1254838/1‑100 (MQ=255)
ttccgatctgttTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTta < 1:520989/92‑1 (MQ=255)
ttAATCGTTTTTTATTTT‑G‑GAAAAATGTGGAGATTGATTGCTGTTGTTTTTATTTTAATTTTATGTGTTTTATTGTTAGTTATATATTAGTTGAAAc < 2:1492370/97‑1 (MQ=255)
aaTCGTTTTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTTCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTtata < 2:734277/100‑1 (MQ=255)
aTCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTatat > 1:686649/1‑100 (MQ=255)
aTCGTTGCTTATTTC‑GCA‑AAAATACGCAGATTAATTTCTTTTGTTTTTATTTTACGTTTATAATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTatat < 2:685083/100‑1 (MQ=255)
tCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTATAtt < 2:1355955/100‑1 (MQ=255)
tCGTTGTTTATTTC‑G‑G‑AAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTTCAACTTATAttt < 2:442144/100‑1 (MQ=255)
tgttTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTATATTTGat < 2:688121/100‑1 (MQ=255)
tgttTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTATATTTGat < 2:32442/100‑1 (MQ=255)
tgttTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTATATTTGat > 1:891975/1‑100 (MQ=255)
gttTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTtaagatcgg > 2:520988/1‑91 (MQ=255)
gttTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTATATTTGata > 2:819467/1‑100 (MQ=255)
ttATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTATATTTGATatt > 2:457720/1‑100 (MQ=255)
tATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTATATTTGATattc > 2:112469/1‑100 (MQ=255)
tATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTATATTTGATatt > 2:681308/1‑99 (MQ=255)
g‑AAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTATATTTGATATTCATTCCAAt < 1:1444049/100‑1 (MQ=255)
|
CGGCATTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑G‑AAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTATATTTGATATTCATTCCAAT > NC_000913/4235586‑4235784
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
