Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A11 F256 I0 R1
|
328 |
102.7 |
5123138 |
93.4% |
4785010 |
99.8 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,235,689:1 |
+A |
100% |
intergenic (+282/‑217) |
pgi → / → yjbE |
glucosephosphate isomerase/extracellular polysaccharide production threonine‑rich protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,235,685 | 1 | . | A | 94.4%
| 338.1
/ 12.2
| 107 | intergenic (+278/‑221) | pgi/yjbE | glucosephosphate isomerase/extracellular polysaccharide production threonine‑rich protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (2/4); new base A (50/51); total (52/55) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.79e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 114 total aligned reads displayed.
CGGCATTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑G‑AAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTATATTTGATATTCATTCCA > NC_000913/4235586‑4235782
|
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cATTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑G‑aaa > 1:1034506/1‑100 (MQ=255)
cATTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑G‑aaa > 1:709628/1‑100 (MQ=255)
ttttttATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑G‑aaaaat > 1:2442454/1‑98 (MQ=255)
ttttttATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑G‑aaaaat < 1:2330854/100‑3 (MQ=255)
tttttATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑G‑aaaaata > 1:1576225/1‑97 (MQ=255)
aTCAGATAAAGCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCa < 2:2179737/99‑1 (MQ=255)
cAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGAt > 2:348919/1‑100 (MQ=255)
cAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGAt > 1:2144984/1‑100 (MQ=255)
aGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGAtt < 1:1428865/100‑1 (MQ=255)
aaaTCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAAtt < 1:1345636/100‑1 (MQ=255)
aaaTCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATAACGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAAtt < 1:2288091/100‑1 (MQ=255)
aaTCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTg > 1:1362929/1‑100 (MQ=255)
gTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGttt < 2:265654/100‑1 (MQ=255)
cTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGttttt > 2:1728453/1‑100 (MQ=255)
cTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGttttt > 2:2367262/1‑100 (MQ=255)
gTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTttttat > 2:2037002/1‑100 (MQ=255)
gTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTttttat > 1:1849528/1‑100 (MQ=255)
gTAATTTAACGGAAATCATACCGAGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTtttta > 2:2125218/1‑99 (MQ=255)
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tAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTttttatt > 2:2551900/1‑100 (MQ=255)
agttAAGGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATGGTTGTTTAAAAA‑A‑AAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTttttatttt < 2:53362/98‑1 (MQ=255)
tttAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTttttatttta > 2:6570/1‑100 (MQ=255)
tttAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTttttatttta < 1:1776337/100‑1 (MQ=255)
ttAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAGTCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTaa > 1:1559878/1‑100 (MQ=255)
aaCGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACTCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTaatt < 1:1726491/100‑3 (MQ=255)
aaCGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGt < 1:50359/100‑1 (MQ=255)
aCGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGtt < 1:723924/100‑1 (MQ=255)
ggAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTa > 2:1366008/1‑100 (MQ=255)
ggAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTa > 1:1453802/1‑100 (MQ=255)
ggAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTa > 1:1980195/1‑100 (MQ=255)
gAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTAt < 2:1811473/100‑1 (MQ=255)
gAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTAt < 1:1567570/100‑1 (MQ=255)
aaTCATACTGTGTTGTTAATCCTCAAAGAGATTTTTCATCGTTGTTTATTTC‑C‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTCTTATTTTAAGTTTATg < 2:1520439/99‑1 (MQ=255)
aaTCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGa < 1:1404491/100‑1 (MQ=255)
aaTCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGa > 1:120618/1‑100 (MQ=255)
aaTCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGa < 1:766230/100‑1 (MQ=255)
tCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGAtt > 2:1383351/1‑100 (MQ=255)
aTACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGAtttt > 1:1936352/1‑100 (MQ=255)
aTACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGATTTTGTTTTTCTTTTAAGTTCATGAttt > 2:2493214/1‑99 (MQ=255)
tACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGAttttt > 1:1447256/1‑100 (MQ=255)
aCCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTa < 2:1294553/100‑1 (MQ=255)
ccGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTAt < 2:2425960/100‑1 (MQ=255)
cGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTAtt < 2:741985/100‑1 (MQ=255)
gTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTAtt < 2:2314070/99‑1 (MQ=255)
gTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTg < 1:1459709/100‑1 (MQ=255)
gTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTg > 1:1767194/1‑100 (MQ=255)
gTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTg < 2:709621/100‑1 (MQ=255)
gAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGtt < 1:1577233/100‑1 (MQ=255)
ggTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTGTTGTTAt > 1:1775983/1‑100 (MQ=255)
ggTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTAt > 2:2464215/1‑100 (MQ=255)
ggTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTAt < 1:2147419/100‑1 (MQ=255)
gTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTAtt > 2:1858637/1‑100 (MQ=255)
gTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTAtt > 1:780211/1‑100 (MQ=255)
ttAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTAttt < 1:1563302/100‑1 (MQ=255)
tAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTAtttn < 2:2020354/100‑2 (MQ=255)
tAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTa < 1:385063/100‑1 (MQ=255)
tAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTa < 1:998117/100‑1 (MQ=255)
tCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAat < 1:689241/100‑1 (MQ=255)
tCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAat > 1:1165099/1‑100 (MQ=255)
ccTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAGTTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAata > 1:1699810/1‑100 (MQ=255)
cTAAAATAGATTTTTAATCGTTTTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGTAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAata < 2:1531248/99‑1 (MQ=255)
cTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCTG‑A‑AAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAata < 2:654198/99‑1 (MQ=255)
cTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAatat > 1:1914460/1‑100 (MQ=255)
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aaaaTAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATaa > 1:1756205/1‑100 (MQ=255)
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aaaTAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAg < 1:2146554/100‑1 (MQ=255)
aaaTAGATTTTTAATCGTGATTGATTTC‑G‑G‑AAAATACTCAGATTAATTACTTTTACTTTTATTTTAACATTATGATTTTTAATGTTATTTATATATAAGt > 2:1631717/1‑100 (MQ=255)
aaTAGATTTTTAATCGTTGTTTTTTTC‑G‑GAAAAATACGTAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAg < 2:2419285/99‑1 (MQ=255)
aTAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGtt < 1:122312/100‑1 (MQ=255)
tAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTTAATATAATTTg > 2:797876/1‑100 (MQ=255)
aGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGa < 1:901847/100‑1 (MQ=255)
gATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGaa < 1:1058313/100‑1 (MQ=255)
gATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGaa < 1:388043/100‑1 (MQ=255)
gATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGaa > 2:224385/1‑100 (MQ=255)
gATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGaa < 2:2383994/100‑1 (MQ=255)
gATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGaa > 2:2389172/1‑100 (MQ=255)
aTTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGa > 2:2417335/1‑98 (MQ=255)
tttttAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAAc < 2:1634522/100‑1 (MQ=255)
ttttAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACt > 2:1786175/1‑100 (MQ=255)
ttttAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACt > 1:927989/1‑100 (MQ=255)
tttAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACtt > 1:604562/1‑100 (MQ=255)
tAATCGTTGTTTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTtat < 2:1688713/100‑1 (MQ=255)
gttgttTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTTATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTATAttt < 2:604555/99‑1 (MQ=255)
gttgttTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTGTTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTATATTTg < 2:1775970/100‑1 (MQ=255)
gttTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTATATTTGata < 2:2120401/100‑1 (MQ=255)
gttTATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTATATTTGata > 1:734325/1‑100 (MQ=255)
tttattta‑G‑GAAAAATACGCATATTAATTGCTTTTTTTTTTATTTTAAGTTTATTATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTATATTTGat < 2:482957/98‑1 (MQ=255)
tttATTTC‑GTA‑AAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTTCAACTTATAtttaaat < 2:113876/99‑5 (MQ=37)
ttATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTATATTTGATatt > 1:1524431/1‑100 (MQ=255)
ttATTTA‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTATATTTGATatt < 1:18608/100‑1 (MQ=255)
tATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTTCAACTTATAtttaaataac < 1:2339727/100‑8 (MQ=37)
tATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTATATTTGATattc < 1:1554091/100‑1 (MQ=255)
tATTTC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTATATTTGATatt > 2:2196920/1‑99 (MQ=255)
tttC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTATATTTGATattcat > 1:804784/1‑100 (MQ=255)
tttC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTATATTTGATattcat < 2:780204/100‑1 (MQ=255)
ttC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTATATTTGATattcatt > 1:333320/1‑100 (MQ=255)
ttC‑G‑GAAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTATATTTGATattcatt > 1:1282840/1‑100 (MQ=255)
c‑G‑G‑AAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTATATTTGATATTCATTCCa > 1:1296318/1‑100 (MQ=255)
|
CGGCATTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑G‑G‑AAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTATATTTGATATTCATTCCA > NC_000913/4235586‑4235782
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
