Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A11 F56 I0 R1
|
215 |
141.2 |
6785521 |
95.3% |
6466601 |
99.8 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,235,689:1 |
+A |
100% |
intergenic (+282/‑217) |
pgi → / → yjbE |
glucosephosphate isomerase/extracellular polysaccharide production threonine‑rich protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,235,685 | 1 | . | A | 93.5%
| 545.4
/ 29.5
| 170 | intergenic (+278/‑221) | pgi/yjbE | glucosephosphate isomerase/extracellular polysaccharide production threonine‑rich protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (5/6); new base A (78/81); total (83/87) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 186 total aligned reads displayed.
CGGCATTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GG‑AAA‑A‑TACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTATATTTGATATTCATT > NC_000913/4235586‑4235779
|
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cGGCATTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑gg < 1:342595/100‑1 (MQ=255)
ggCATTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTCACGGAAATCCTACCGTGAGGTTAATGCTAAAATATATTTTTACTCGTTGTTTATTTG‑GG‑a > 1:231504/1‑100 (MQ=255)
gCATTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GG‑aa < 2:2221591/100‑1 (MQ=255)
tttttttATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GG‑aaa‑aa > 2:2500885/1‑99 (MQ=255)
tttttATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GG‑aaatata > 2:937046/1‑96 (MQ=255)
tttATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GG‑aaa‑aatacg < 2:2140045/100‑6 (MQ=255)
tgtATCAGATAAATCCCCGTGTCTGTAGTTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GG‑aaa‑aatacg > 1:1469736/3‑95 (MQ=255)
ttATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAA‑A‑TACGc > 2:2475852/1‑100 (MQ=255)
tATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAA‑A‑TACGCa < 1:653942/100‑1 (MQ=255)
tATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAA‑A‑TACGCa < 1:125731/100‑1 (MQ=255)
cataTAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAA‑A‑TACGCAGAt < 1:120815/97‑1 (MQ=255)
cAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAA‑A‑TACGCAGAt > 1:3324348/1‑100 (MQ=255)
cAGATAAATCACCTTGTCTGTAATTTAAAGGAAATCATAACGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAA‑A‑TACGCAg < 1:1365490/98‑1 (MQ=255)
aGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAA‑A‑TACGCAGAtt < 1:2440869/100‑1 (MQ=255)
aGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAA‑A‑TACGCAGAtt > 2:3203652/1‑100 (MQ=255)
aGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAA‑A‑TACGCAGAtt > 2:2802733/1‑100 (MQ=255)
aGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAA‑A‑TACGCAGAtt > 1:2859178/1‑100 (MQ=255)
aGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAA‑A‑TACGCAGAtt > 1:3240142/1‑100 (MQ=255)
aGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAA‑A‑TACGCAGAtt > 1:1878867/1‑100 (MQ=255)
gATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAA‑A‑TACGCAGATTa > 2:1422906/1‑100 (MQ=255)
tAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAA‑A‑TACGCAGATTAAt > 1:2925435/1‑100 (MQ=255)
tAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GG‑AAATA‑TATGCAGAtt < 1:1774389/97‑1 (MQ=255)
aaaTCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAA‑A‑TACGCAGATTAAtt < 1:2686340/100‑1 (MQ=255)
aaTCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAA‑A‑TACGCAGATTAATTg > 1:1070404/1‑100 (MQ=255)
aaTCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAA‑A‑TACGCAGATTAATTg > 1:65616/1‑100 (MQ=255)
aTCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAA‑A‑TACGCAGATTAATTGc > 1:1074461/1‑100 (MQ=255)
aTCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAA‑A‑TACGCAGATTAATTGc < 1:1409831/100‑1 (MQ=255)
ccccTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAA‑A‑TACGCAGATTAATTGCtt > 1:1300591/1‑100 (MQ=255)
ccccTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAA‑A‑TACGCAGATTAATTGCtt > 2:2061178/1‑100 (MQ=255)
ccccTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAA‑A‑TACGCAGATTAATTGCtt < 1:21860/100‑1 (MQ=255)
cccTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAA‑A‑TACGCAGATTAATTGc < 1:457809/97‑1 (MQ=255)
ttGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAA‑A‑TACGCAGATTAATTGCTTTTGt < 2:267341/100‑1 (MQ=255)
ttGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTCTTTATTTC‑GGAAAA‑A‑TACGCAGATTAATTGCTTTTGt < 1:1818109/100‑1 (MQ=255)
tGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAA‑A‑TACGCAGATTAATTGCTTTTGtt < 2:3243838/100‑1 (MQ=255)
gTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAA‑A‑TACGCAGATTAATTGCTTTTGttt < 1:2069264/100‑1 (MQ=255)
cTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAA‑A‑TACGCAGATTAATTGCTTTTGttttt > 1:314428/1‑100 (MQ=255)
cTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAA‑A‑TACGCAGATTAATTGCTTTTGttttt > 2:1319511/1‑100 (MQ=255)
tGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAA‑A‑TACGCAGATTAATTGCTTTTGTtttta < 1:2330468/100‑1 (MQ=255)
tGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAA‑A‑TACGCAGATTAATTGCTTTTGTtttta < 1:1588487/100‑1 (MQ=255)
gTAATTTTACGGAAATCATACCGTGAGGTTATTCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAA‑A‑TACGCAGATTAATTGCTTTTGTttttat < 2:2097512/100‑1 (MQ=255)
tAATCTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAA‑A‑TACGCAGATTAATTGCTTTTGTttttatt < 2:3144706/100‑1 (MQ=255)
aTTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAA‑A‑TACGCAGATTAATTGCTTTTGtttttttttt > 1:1267906/1‑100 (MQ=255)
taccGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAA‑A‑TACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAg < 2:1993540/97‑1 (MQ=255)
cGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAA‑A‑TACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGttt > 2:62968/1‑100 (MQ=255)
cGGAAATCATACAGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAA‑A‑TACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGttt > 2:2223798/1‑100 (MQ=255)
ggAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAA‑A‑TACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTa > 1:3341800/1‑100 (MQ=255)
ggAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAA‑A‑TACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTa > 1:1787873/1‑100 (MQ=255)
gAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAA‑A‑TACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTAt < 2:1235429/100‑1 (MQ=255)
aaaTCATCCCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAA‑A‑TACGCAGATTAACTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTAt > 1:2342211/1‑99 (MQ=255)
aTCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTTTTTCTGA‑AAA‑A‑TACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGtt < 1:1880412/94‑1 (MQ=255)
tCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GG‑AAA‑A‑TACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGAttt > 2:1494990/1‑100 (MQ=255)
aTACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAA‑A‑TACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGAtttt > 1:878516/1‑100 (MQ=255)
aTACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GG‑AAA‑A‑TACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGAttttt < 2:1538059/100‑1 (MQ=255)
tACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAA‑A‑TACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGAttttt > 2:844407/1‑100 (MQ=255)
tACCGCGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAA‑A‑TACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGAttttt < 1:393119/100‑1 (MQ=255)
aCCGTGACGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAA‑A‑TACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTa > 2:1776765/1‑100 (MQ=255)
ccGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAA‑A‑TACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTAt > 2:2750131/1‑100 (MQ=255)
cGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAA‑A‑TACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTAtt < 2:2912447/100‑1 (MQ=255)
cGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAA‑A‑TACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTAtt < 1:482243/100‑1 (MQ=255)
tGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAA‑A‑TACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTg > 2:2621239/1‑99 (MQ=255)
aGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAA‑A‑TACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTa < 2:256777/100‑1 (MQ=255)
aGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAA‑A‑TACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTa < 2:1806382/100‑1 (MQ=255)
ggTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAA‑A‑TACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTAt < 2:2241290/100‑1 (MQ=255)
ggTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAA‑A‑TACGCAGATTAATAGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTAt > 1:1582136/1‑100 (MQ=255)
tCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAA‑A‑TACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAat < 2:1141019/100‑1 (MQ=255)
tCCTAAAATAGATTTTTAATAGTTGTTTATTTC‑GGAAAA‑A‑TACGCAGATTAAGTGCTTTTGTTTTTATTTGAAGTTTATGATTTTTATTGTTAttt > 1:1952283/1‑96 (MQ=255)
cTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAA‑A‑TACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTCTGATTTTTATTGTTATTTAAttat > 1:850863/1‑100 (MQ=255)
cTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAA‑A‑TACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAatat < 2:330270/100‑1 (MQ=255)
cTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAA‑A‑TACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAatat < 2:3084554/100‑1 (MQ=255)
cTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAA‑A‑TACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAatat > 2:1316516/1‑100 (MQ=255)
tAAAATATATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAA‑A‑TACTCAGATTAATTTCTTTGGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAata < 1:1327635/98‑1 (MQ=255)
tAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCTGA‑AAA‑A‑TACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAatat < 1:1143015/99‑1 (MQ=255)
aaTAGATTTTTTATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAA‑A‑TACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGt < 1:490885/100‑1 (MQ=255)
aaTAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAA‑A‑TACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGt > 2:1961547/1‑100 (MQ=255)
aGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAA‑A‑TACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGa < 1:16407/100‑1 (MQ=255)
aGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAA‑A‑TACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGa < 1:517843/100‑1 (MQ=255)
gATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAA‑A‑TACGCAGGTTAATTGATTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGTTTTTTTTTGTTATTTAAATTTACGtt > 1:2454624/1‑97 (MQ=255)
gATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAA‑A‑TACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGaa > 2:771575/1‑100 (MQ=255)
gATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAA‑A‑TACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGaa > 1:2242353/1‑100 (MQ=255)
gATTTTTAATCGTGGTTTATTTC‑GG‑AAA‑ACTACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGTTTTTTATTGTTATTTAACTATAAGTTGa > 1:2181249/1‑99 (MQ=255)
tttttAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAA‑A‑TACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAAc < 1:2832933/100‑1 (MQ=255)
tttttAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAA‑A‑TACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAAc < 2:1081769/100‑1 (MQ=255)
tttttAATCGTTGGTTATTTC‑GGAAAA‑A‑TACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAAc < 2:1966159/100‑1 (MQ=255)
ttttAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAA‑A‑TACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACt < 2:1154989/100‑1 (MQ=255)
ttAATCGTTGTTTATTTC‑GGAAAA‑A‑TACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTta < 2:1160261/100‑1 (MQ=255)
ttAATCGTTGTTTATTTC‑GG‑AAA‑A‑TACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTtat < 2:929180/100‑1 (MQ=255)
tCGTTGTTTATTTC‑GGAAAA‑A‑TACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTATAtt < 2:1782567/100‑1 (MQ=255)
tCGTTGTTTATTTC‑GGAAAA‑A‑TACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTATAtt > 2:2449883/1‑100 (MQ=255)
gttgttTATTTC‑GGAAAA‑A‑TACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTATATTTg > 1:3205488/1‑100 (MQ=255)
tgttTATTTC‑GGAAAA‑A‑TACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTATATTTGat < 2:3063766/100‑1 (MQ=255)
tgttTATTTC‑GGAAAA‑A‑TACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTATATTTGat < 1:2824407/100‑1 (MQ=255)
gttTATTTC‑GGAAAA‑A‑TACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTATATTTGata < 1:1319507/100‑1 (MQ=255)
gttTATTTC‑GGAAAA‑A‑TACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTATATTTGata > 1:1358064/1‑100 (MQ=255)
gttTATTTC‑GGAAAA‑A‑TACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTATATTTGata > 2:1876853/1‑100 (MQ=255)
ttATTTC‑GGAAAA‑A‑TACTCAGATTAATTTCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTATATTTGATatt < 1:2726978/100‑1 (MQ=255)
tATTTC‑GGAAAA‑A‑TACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTTCAACTTATAtttaaataac < 2:2906010/100‑8 (MQ=37)
tATTTC‑GGAAAA‑A‑TACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTATATTTGATattc < 2:2770176/100‑1 (MQ=255)
aTTTC‑GGAAAA‑A‑TACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTATATTTGATattca < 1:1316512/100‑1 (MQ=255)
tttC‑GGAAAA‑A‑TACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTATATTTGATattcat < 1:1157732/100‑1 (MQ=255)
|
CGGCATTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTC‑GG‑AAA‑A‑TACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTATATTTGATATTCATT > NC_000913/4235586‑4235779
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
