Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A11 F256 I1 R1
|
186 |
136.5 |
6958264 |
92.1% |
6408561 |
99.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,712,306 |
(T)7→8 |
intergenic (+148/‑463) |
nth → / → dtpA |
DNA glycosylase and apyrimidinic (AP) lyase (endonuclease III)/dipeptide and tripeptide permease A |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,712,299 | 1 | . | T | 94.8%
| 382.3
/ 12.4
| 115 | intergenic (+141/‑470) | nth/dtpA | DNA glycosylase and apyrimidinic (AP) lyase (endonuclease III)/dipeptide and tripeptide permease A |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (4/2); new base T (58/51); total (62/53) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.85e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 144 total aligned reads displayed.
TTATCCTCTTTTAAAACATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTG‑T‑T‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAATCAGGTTAAAATCATTT > NC_000913/1712200‑1712393
|
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tATCCTCTTTTAAAACATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTG‑t > 2:2401855/1‑100 (MQ=255)
aTCCTCTTTTAAAACATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTG‑t‑t > 2:1735974/1‑100 (MQ=255)
tCCTCTTTTAAAACATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTG‑t‑t‑t < 2:1977459/100‑1 (MQ=255)
tCCTCTTTTAAAACATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTG‑t‑t‑t < 1:652289/100‑1 (MQ=255)
ccTCTTTTAAAACATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTG‑t‑t‑tt > 2:1491769/1‑100 (MQ=255)
ctctTTTAAAACATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTG‑t‑t‑ttt < 2:766207/100‑1 (MQ=255)
tctTTTAAAACATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTG‑t‑t‑tttt < 2:3314172/100‑1 (MQ=255)
ctTTTAAAACATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTG‑t‑t‑ttttt > 2:1012811/1‑100 (MQ=255)
ttttAAAACATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTG‑t‑t‑tttttt < 1:223387/100‑2 (MQ=255)
ntttAAAACATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTG‑t‑t‑tttttt > 2:1833619/2‑99 (MQ=255)
tttAAAACATCTTTTTAACGTCAATGTTGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTG‑t‑t‑tttttta < 2:3173929/100‑3 (MQ=255)
tttAAAACATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATTCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTG‑t‑t‑tttttta > 1:2445257/1‑98 (MQ=255)
tttAAAACATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTG‑t‑t‑tttttta > 1:120069/1‑98 (MQ=255)
tAAAACATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTG‑t‑t‑ttttttaat < 2:420031/100‑5 (MQ=255)
aaaaCATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTACCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGCTAAAAAAAAATCCAGCTTACttt‑t‑t‑ttttttaat > 1:682650/1‑95 (MQ=255)
aaaCATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTT‑T‑TTTTTAATAg < 1:988407/100‑1 (MQ=255)
aaaCATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTG‑t‑t‑ttttttaatan < 1:1735950/100‑7 (MQ=255)
aaCATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTTATCCGTTTAAAAAAAAAAAAAAATGCAGGTTAATTGTT‑T‑TTTTTAATAGc < 1:1174665/100‑1 (MQ=255)
cATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTT‑T‑TTTTTAATAGCGa > 2:828498/1‑100 (MQ=255)
cTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTT‑T‑TTTTTAATAGCGAAAt > 1:2839486/1‑100 (MQ=255)
cTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTT‑T‑TTTTTAATAGCGAAAt > 2:3370994/1‑100 (MQ=255)
cTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTT‑T‑TTTTTAATAGCGAAAt > 2:1306632/1‑100 (MQ=255)
tttAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCAGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTT‑T‑TTTTTAATAGCGAAAtttt > 2:2005688/1‑100 (MQ=255)
ttAACGTCAATGATGCCATTTCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAAACAAAAATGCAGGTTAATTGTT‑T‑TTTTTTATAGTTAAAtttt > 1:3123375/1‑99 (MQ=255)
ttAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTT‑T‑TTTTTAATAGCGAAATTTTc < 1:2754696/100‑1 (MQ=255)
aCGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTT‑T‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTat > 2:2943312/1‑100 (MQ=255)
aCGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTT‑T‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTat > 1:2553347/1‑100 (MQ=255)
gTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTT‑T‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTattn < 1:1833594/100‑2 (MQ=255)
gTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTT‑T‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTattc > 2:1314618/1‑100 (MQ=255)
tCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTT‑T‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTattca > 1:237948/1‑100 (MQ=255)
cAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTT‑T‑TTTTTATTAGCTAAATTTTCTattcat > 1:1185038/1‑100 (MQ=255)
aaTGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTT‑T‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTattcatt > 1:2979721/1‑100 (MQ=255)
tgatgCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTT‑T‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCg > 2:1932997/1‑100 (MQ=255)
tgatgCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTT‑T‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCg < 1:2884333/100‑1 (MQ=255)
gatgCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTT‑T‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGt < 1:2401822/100‑1 (MQ=255)
tgCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTT‑T‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGa > 2:1915353/1‑100 (MQ=255)
gCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTT‑T‑TTTTTAATAGCTAAATTTTCTATTCATTCGTGAt > 1:1294481/1‑100 (MQ=255)
ccATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTT‑T‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATc > 2:263820/1‑100 (MQ=255)
ccATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTT‑T‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATc > 2:623300/1‑100 (MQ=255)
ccATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTT‑T‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATc < 2:902369/100‑1 (MQ=255)
ccATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTG‑T‑T‑TTTTTAATATCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCa > 1:1012505/1‑100 (MQ=255)
aTTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTT‑T‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCaa > 2:3163075/1‑100 (MQ=255)
tGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCTGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTT‑T‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGa < 1:2156130/100‑1 (MQ=255)
tGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTT‑T‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCaaca < 2:2353021/100‑3 (MQ=255)
tGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTT‑T‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGa < 2:2953573/100‑1 (MQ=255)
tGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTT‑T‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGa < 2:2631301/100‑1 (MQ=255)
tGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTT‑T‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGa < 1:566077/100‑1 (MQ=255)
tGCTTAGCGTTATAATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTT‑T‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGa < 1:2462397/100‑1 (MQ=255)
gCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTT‑T‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGAt > 1:102842/1‑100 (MQ=255)
gCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTT‑T‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGAt > 1:2811267/1‑100 (MQ=255)
gCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTT‑T‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGAt > 1:1849526/1‑100 (MQ=255)
ttAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTT‑T‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCa > 2:2428517/1‑100 (MQ=255)
ttAGCGTTATCATCAGGTAATACGTTTAAAAAAAAAAAAAAATGCAGGTTAATTGTT‑T‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATcttgatca < 1:1259721/100‑8 (MQ=255)
tAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTT‑T‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCAc > 1:2191514/1‑100 (MQ=255)
tAGCGTTATCATCACCTAATCCCTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTT‑T‑TTTTTAATAGTGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCAc < 2:3299267/100‑1 (MQ=255)
aGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTT‑T‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACg < 1:734118/100‑1 (MQ=255)
aGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTAAAAAAAAAAAAAAAATGCAGGTTAATTGTT‑T‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCAc < 1:256518/99‑1 (MQ=255)
gCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTT‑T‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGa > 1:1425884/1‑100 (MQ=255)
gTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTT‑T‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCTTGATCACGaat < 2:2793279/100‑3 (MQ=255)
ttATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTT‑T‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGc > 2:2221981/1‑100 (MQ=255)
ttATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTT‑T‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGc < 1:2159163/100‑1 (MQ=255)
tATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTT‑T‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCt > 2:2211591/1‑100 (MQ=255)
atcatcAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTT‑T‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTg < 2:2506648/100‑1 (MQ=255)
tcatcaGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTT‑T‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCTTGATCACGaatgaat < 1:2495756/100‑7 (MQ=255)
catcaGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTG‑TCT‑TTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGt > 1:1929921/1‑99 (MQ=255)
atcaGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTT‑T‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTTATCAAGATCACGATGCTGTCg > 1:449616/1‑100 (MQ=255)
atcaGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTT‑T‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCg > 2:3101364/1‑100 (MQ=255)
atcaGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTT‑T‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCg < 2:237951/100‑1 (MQ=255)
atcaGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTT‑T‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACCATGCTGTc > 1:1662873/1‑99 (MQ=255)
tcaGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTT‑T‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGc > 2:2888799/1‑100 (MQ=255)
caGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTT‑T‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGCTGCTGTCGCa > 2:1878579/1‑100 (MQ=255)
caGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTT‑T‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCa > 2:1087219/1‑100 (MQ=255)
tAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTT‑T‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGt > 1:3188634/1‑100 (MQ=255)
aaTCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTT‑T‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTa > 2:2711286/1‑100 (MQ=255)
cGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTT‑T‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTaaaa < 1:2894451/99‑1 (MQ=255)
gTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTT‑T‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAAc > 2:1487205/1‑100 (MQ=255)
gTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTT‑T‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAAc < 2:681007/100‑1 (MQ=255)
tttGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTT‑T‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACa > 2:3112591/1‑100 (MQ=255)
ttaTAACCATAAAGGCAGGTTAATTG‑TGG‑TTTTTAATAGCTAAAGGTTCTATGCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCa < 2:286681/98‑1 (MQ=255)
ggATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTT‑T‑TTTTTTTTTTCTAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCa > 1:3068681/1‑100 (MQ=255)
ggATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTT‑T‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCa < 2:73731/100‑1 (MQ=255)
tAACCAAAAATGCAGGTTAATTG‑T‑TGTTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATTAAGATCAGGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCaa < 1:2964088/98‑1 (MQ=255)
aCCAAAAATGCAGGTTAATTGTT‑T‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAAt > 1:1003865/1‑100 (MQ=255)
aCCAAAAATGCAGGTTAATTGTT‑T‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAAt > 2:295094/1‑100 (MQ=255)
ccAAAAATGCAGGTTAATTGTT‑T‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAATc < 1:2491027/100‑1 (MQ=255)
ccAAAAATGCAGGTTAATTGTT‑T‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAATc > 1:2591002/1‑100 (MQ=255)
ccAAAAATGCAGGTTAATTGTT‑T‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAATc > 2:1401853/1‑100 (MQ=255)
cAAAAATGCAGGTTAATTGTT‑T‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAATCa > 2:1175518/1‑100 (MQ=255)
cAAAAATGCAGGTTAATTGTT‑T‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTCCAAGAATCa > 1:2750079/1‑100 (MQ=255)
cAAAAATGCAGGTTAATTG‑T‑T‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAATCAg > 1:3453166/1‑100 (MQ=255)
cgatctcAGGTTAATTGTT‑T‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAATCAgg < 2:393447/94‑1 (MQ=255)
aaaaTGCAGTTTAATTGTT‑T‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAATCAgg < 1:1400216/100‑1 (MQ=255)
aaaTGCAGGTTAATTGTT‑T‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAATCAGGt < 1:945848/100‑1 (MQ=255)
tGCAGGTTAATTGTT‑T‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAATCAGGttn < 1:2831138/99‑2 (MQ=255)
cAGGTTAATTGTT‑T‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAATCAggagatcg > 1:393442/1‑94 (MQ=255)
aGGTTAATTGTT‑T‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACAATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAATCAGGTTAAAAt > 1:2226124/1‑100 (MQ=255)
ggTTAATTGTT‑T‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTAGCAATGTAAAAACATTACATTAATCAGGTTaaaa > 1:2056499/1‑98 (MQ=255)
gTTAATTGTT‑T‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAATCAGGTTAAAATCa > 2:1636940/1‑100 (MQ=255)
tAATTGTT‑T‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAATCAGGTTAAAATCAtt < 2:2071609/100‑1 (MQ=255)
|
TTATCCTCTTTTAAAACATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTG‑T‑T‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAATCAGGTTAAAATCATTT > NC_000913/1712200‑1712393
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
