Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A11 F212 I0 R1
|
246 |
122.0 |
6097616 |
93.1% |
5676880 |
99.8 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,712,306:1 |
(T)7→8 |
100% |
intergenic (+148/‑463) |
nth → / → dtpA |
DNA glycosylase and apyrimidinic (AP) lyase (endonuclease III)/dipeptide and tripeptide permease A |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,712,299 | 1 | . | T | 91.8%
| 263.3
/ 16.8
| 85 | intergenic (+141/‑470) | nth/dtpA | DNA glycosylase and apyrimidinic (AP) lyase (endonuclease III)/dipeptide and tripeptide permease A |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (3/4); new base T (40/37); total (44/41) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.10e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
TTATCCTCTTTTAAAACATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATT‑G‑TTT‑T‑TTT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAATCAGGTTAAAATCATTT > NC_000913/1712200‑1712393
|
ttATCCTCTTTTAAAACATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATT‑g < 2:1154724/100‑1 (MQ=255)
ccTCTTTTAAAACATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATT‑G‑ttt‑t > 1:2926099/1‑100 (MQ=255)
ctctTTTAAAACATCTTTTTAATTTTAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATT‑G‑ttt‑t‑t > 2:2746864/1‑100 (MQ=255)
ctctTTTAAAACATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATT‑G‑ttt‑t‑t > 1:711425/1‑100 (MQ=255)
ctctTTTAAAACATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCATTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATT‑A‑ttt‑t‑t > 1:2899617/1‑100 (MQ=255)
tctTTTAAAACATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATT‑G‑ttt‑t‑tt > 1:2521156/1‑100 (MQ=255)
ctTTTAAAACATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATT‑G‑ttt‑t‑ttt < 1:77243/100‑1 (MQ=255)
ttttAAAACATCTTTTTAATGTTAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATT‑G‑ttt‑t‑tttt < 1:2685257/100‑2 (MQ=255)
ttttAAAACATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATT‑G‑TTT‑T‑TTT‑a > 1:1234584/1‑100 (MQ=255)
tttAAAATATTTTTTTAACTTCAATTAAGCCATTGCTTAGCATTATCATCAGGTAATCTGTTTGCGGATAACCAAAAATGCATGTTAATT‑G‑ttt‑t‑tttta < 2:1413492/100‑3 (MQ=255)
tttAAAACATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATT‑G‑ttt‑t‑tttta > 2:1389509/1‑98 (MQ=255)
tttAAAACATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATT‑G‑ttt‑t‑tttta > 1:78362/1‑98 (MQ=255)
ttAAAACATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATT‑G‑TTTGT‑TTT‑aa < 2:216023/100‑1 (MQ=255)
tAAAACATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCAGTTTGAGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATT‑G‑ttt‑t‑ttttaat > 1:1786683/1‑96 (MQ=255)
aaaaCATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCAGATAACCAAAAATGCAGGTTAATT‑G‑ttt‑t‑ttttaata < 2:2926067/100‑6 (MQ=255)
aaaCATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATT‑GTTTT‑T‑TTT‑AATAg < 2:989830/100‑1 (MQ=255)
aaaCATCTTTTTAACGTCAATGATGCAATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATT‑G‑ttt‑t‑tttta > 2:756511/1‑94 (MQ=255)
tCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATT‑GTTTT‑T‑TTT‑AATAGCGaaa > 2:2374758/1‑100 (MQ=255)
tttttAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATACAGGTTAATT‑GTTTT‑T‑TTT‑AATAGCGAAAtt > 1:1975670/1‑100 (MQ=255)
tAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATT‑GTTTT‑T‑TTT‑AATAGCGAAATTTTCt < 1:878691/100‑1 (MQ=255)
tAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGAAAAAAAAAAAAAATGCAGGTTAATT‑GTTTT‑T‑TTT‑AATAGCGAAATTTTCt < 2:208866/100‑1 (MQ=255)
cAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTGATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATT‑GTTTT‑T‑TTT‑AATAGCGAAATTTTCTattcat > 2:2984135/1‑100 (MQ=255)
tgatgCCATTGCTTAGCGTTATTATTAGGTAATCTGTTTGTGGATAAACAAAAATGCAGGTTAATT‑GTTTT‑T‑TTT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCg < 1:993883/100‑1 (MQ=255)
atgCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATT‑GTTTT‑T‑TTT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTg < 1:1673245/100‑1 (MQ=255)
ccATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATT‑GTTTT‑T‑TTT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATc < 2:2478902/100‑1 (MQ=255)
cATTGCTTATCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATT‑GTTTT‑T‑TTT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCa < 2:655506/100‑1 (MQ=255)
cATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATT‑GTTTT‑T‑TTT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCa > 2:3034142/1‑100 (MQ=255)
cATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATT‑GTTTT‑T‑TTT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCa > 1:1176568/1‑100 (MQ=255)
aTTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATT‑GTTTT‑T‑TTT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCaa < 2:2420029/100‑1 (MQ=255)
ttGCTTAGCGTTATGATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAGAATGCAGGTTAATT‑GTTTT‑T‑TTT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCat < 2:1107058/99‑2 (MQ=255)
tGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATT‑GTTTT‑T‑TTT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGa > 1:2827851/1‑100 (MQ=255)
gCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATT‑GTTTT‑T‑TTT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGAt > 1:2974241/1‑100 (MQ=255)
cTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATT‑GTTTT‑T‑TTT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATc > 1:1395823/1‑100 (MQ=255)
ttAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATT‑GTTTT‑T‑TTT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCa < 2:2870350/100‑1 (MQ=255)
ttAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATT‑GTTTT‑T‑TTT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCa < 2:202533/100‑1 (MQ=255)
tAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATT‑GTTTT‑T‑TTT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCAc > 1:1827579/1‑100 (MQ=255)
tAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATT‑GTTTT‑T‑TTT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCAc < 1:1693795/100‑1 (MQ=255)
ctttATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATT‑GTTTT‑T‑TTT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGa < 1:1920070/97‑1 (MQ=255)
cGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATT‑GTTTT‑T‑TTT‑AATAGCAAAATTTTATATTCATTCGTGATCAAGATCACGAt > 1:1904040/1‑100 (MQ=255)
ttttcatcaTTTAATCAGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATT‑GTTTT‑T‑TTT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTTGTGATCAAGATCACGATGc < 2:535661/97‑1 (MQ=255)
ttATCATCTGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATT‑GTTTT‑T‑TTT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCTTGATCACGaat < 1:194654/99‑3 (MQ=255)
ttATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATT‑GTTTT‑T‑TTT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCTTGATCACGaatg < 1:1939967/100‑4 (MQ=255)
catcaGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATT‑GTTTT‑T‑TTT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTc > 1:803633/1‑100 (MQ=255)
catcaGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATT‑GTTTT‑T‑TTT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTc > 2:873572/1‑100 (MQ=255)
catcaGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATT‑GTTTT‑T‑TTT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTc > 1:2602394/1‑100 (MQ=255)
atcaGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCCGGTTAATT‑GATTT‑T‑TTT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATAACGATACTGTc > 1:1167787/1‑99 (MQ=255)
atcaGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATT‑GTTTT‑T‑TTT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCg > 2:2941731/1‑100 (MQ=255)
atcaGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATT‑GTTTT‑T‑TTT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCg < 2:2825121/100‑1 (MQ=255)
tcaGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATT‑GTTTT‑T‑TTT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCg > 1:1557277/1‑99 (MQ=255)
tcaGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATT‑GTTTT‑T‑TTT‑AATAGCAAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTATctc > 2:288744/1‑98 (MQ=255)
ggTGATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATT‑GTTTT‑T‑TTT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAAt < 1:2984168/100‑1 (MQ=255)
ggTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATT‑GTTTT‑T‑TTT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTTTCGCAAt < 1:1588933/100‑1 (MQ=255)
ggTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATT‑GTTTT‑T‑TTT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAAt > 1:1898975/1‑100 (MQ=255)
ggTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATT‑GTTTT‑T‑TTT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAAt > 2:46570/1‑100 (MQ=255)
ggTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATT‑GTTTT‑T‑TTT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAAt > 1:2250791/1‑100 (MQ=255)
ggTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATT‑GTTTT‑T‑TTT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAAt > 1:52471/1‑100 (MQ=255)
atcttCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATT‑GTTTT‑T‑TTT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATg < 1:1962597/96‑1 (MQ=255)
tAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATT‑GTTTT‑T‑TTT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGt < 1:334246/100‑1 (MQ=255)
tAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATT‑GTTTT‑T‑TTT‑AATAGCGAAATTCTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATg < 1:1387482/99‑1 (MQ=255)
aaTCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATT‑GTTTT‑T‑TTT‑ATTTTTGAAATATTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGt > 2:689011/1‑99 (MQ=255)
aaTCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATT‑GTTTT‑T‑TTT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTa > 1:2944878/1‑100 (MQ=255)
aaTCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATT‑GTTTT‑T‑TTT‑AATAGCGAAATTTTATATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTa > 2:786800/1‑100 (MQ=255)
aaTCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGCGAATT‑G‑TTT‑T‑TTTGAATAGCGTAATTTTCGATTCATTCTTGACCAAGATCACGATTCTGTCGCAATGTa > 2:1766008/1‑100 (MQ=255)
aTCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGTTGTTTAATT‑TTTTT‑T‑TTT‑AATAGTGAAATTTTCTAGTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTaa < 1:131807/100‑1 (MQ=255)
tctgTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATT‑GTTTT‑T‑TTT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTaaa < 1:380394/97‑1 (MQ=255)
tCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATT‑GTTTT‑T‑TTT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATgagat > 2:1962574/1‑96 (MQ=255)
tCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATT‑GTTTT‑T‑TTT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTaaa > 2:2089983/1‑100 (MQ=255)
ccGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATT‑GTTTT‑T‑TTT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTaaaa > 1:1604902/1‑100 (MQ=255)
ccGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATT‑GTTTT‑T‑TTT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTaaa < 2:1440972/99‑1 (MQ=255)
cGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATT‑GTTTT‑T‑TTT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTaaaaa > 2:326286/1‑100 (MQ=255)
gTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATT‑GTTTT‑T‑TTT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAAc > 1:84563/1‑100 (MQ=255)
tttGCGGATAACCAAAAAAAAAGGTTAATA‑G‑TTT‑TATTT‑AATAGACAAATATTCTATTCATTCATGCTAAACAACACGATGCTCTAGCAATGTAAAAACa > 2:604382/1‑100 (MQ=255)
tGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATT‑GTTTT‑T‑TTT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACAtt > 1:2006324/1‑100 (MQ=255)
gCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATT‑GTTTT‑T‑TTT‑AATAGCGAAATTTTTTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTg < 1:774362/100‑1 (MQ=255)
gCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATT‑GTTTT‑T‑TTT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACAtt > 1:577257/1‑99 (MQ=255)
ggATAACCAAAAATGCAGGTTAATT‑GTTTT‑T‑TTT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCa > 1:1141536/1‑100 (MQ=255)
ggATAACCAAAAATGCAGGTTAATT‑GTTTT‑T‑TTT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCa > 1:2623954/1‑100 (MQ=255)
ggATAACCAAAAATGCAGGTTAATT‑GTTTT‑T‑TTT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCa < 1:472673/100‑1 (MQ=255)
gATAACCAAAAATGCAGGTTAATT‑GTTTT‑T‑TTT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCaa < 2:298070/100‑1 (MQ=255)
gATAACCAAAAATGCAGGTTAATT‑GTTTT‑T‑TTT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCa < 1:1522883/99‑1 (MQ=255)
aTAACCAAAAATGCAGGTTAATT‑GTTTT‑T‑TTT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTg < 2:852540/96‑1 (MQ=255)
tAACCAAAAATGCAGGTTAATT‑GTTTT‑T‑TTT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAg < 1:2394473/99‑1 (MQ=255)
aCCAAAAATGCAGGTTAATT‑GTTTT‑T‑TTT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAAt > 1:1249974/1‑100 (MQ=255)
aCCAAAAATGCAGGTTAATT‑GTTTT‑T‑TTT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAAt > 2:1714648/1‑100 (MQ=255)
aCCAAAAATGCAGGTTAATT‑GTTTT‑T‑TTT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAAt > 1:2482499/1‑100 (MQ=255)
ccAAAAATGCAGGTTAATT‑G‑TTT‑T‑TTT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAATCa < 2:2521127/100‑1 (MQ=255)
cAAAAATGCAGGTTAATT‑GTTTT‑T‑TTT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAATCa > 1:550102/1‑100 (MQ=255)
aaaaaTGCAGGTTAATT‑GTTTT‑T‑TTT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAATCAg > 2:462239/1‑100 (MQ=255)
aaaaaTGCAGGTTAATT‑G‑TTT‑T‑TTT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAATCAgg < 2:1234572/100‑1 (MQ=255)
aTGCAGGTTAATT‑GTTTT‑T‑TTT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAATCAGGTTa < 2:3034130/100‑1 (MQ=255)
tGCAGGTTAATT‑GTTTT‑T‑TTT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAATCAGGTTaa > 1:1728229/1‑100 (MQ=255)
aGGTTAATTCT‑TTT‑T‑TTT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTTGTCATCATGATCACGATTAAAAAAAAAAAAAAAAACATTGCAAGAATCAGGTTaaaa < 2:38745/99‑1 (MQ=255)
aGGTTAATT‑GTTTT‑T‑TTT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGTTCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAATCAGGTTAAAAt < 1:772017/100‑1 (MQ=255)
ggTTAATT‑GTTTT‑T‑TTT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAATCAGGTTAAAATc < 2:785164/100‑1 (MQ=255)
ggTTAATT‑GTTTT‑T‑TTT‑AATAACGAAATTTTCTATTAATAAGTGATCAATATCACGATGCTGTCGAAATGTAAAAACATTGCAAAAATCAAATTAAAATc > 2:881788/1‑100 (MQ=255)
ttAATT‑GTTTT‑T‑TTT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAATCAGGTTAAAATCAt < 2:2602362/100‑1 (MQ=255)
tAATT‑GTTTT‑T‑TTT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAATCAGGTTAAAATCAtt < 1:1757631/100‑1 (MQ=255)
aaTT‑GTTTT‑T‑TTT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAATCAGGTTAAAATCAttt < 1:554444/100‑1 (MQ=255)
aaTT‑GTTTT‑T‑TTT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAATCAGGTTAAAATCAttt > 1:1569538/1‑100 (MQ=255)
|
TTATCCTCTTTTAAAACATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATT‑G‑TTT‑T‑TTT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAATCAGGTTAAAATCATTT > NC_000913/1712200‑1712393
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
