Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A11 F56 I0 R1
|
215 |
141.2 |
6785521 |
95.3% |
6466601 |
99.8 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,712,306:1 |
(T)7→8 |
100% |
intergenic (+148/‑463) |
nth → / → dtpA |
DNA glycosylase and apyrimidinic (AP) lyase (endonuclease III)/dipeptide and tripeptide permease A |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,712,299 | 1 | . | T | 96.3%
| 268.0
/ 3.0
| 80 | intergenic (+141/‑470) | nth/dtpA | DNA glycosylase and apyrimidinic (AP) lyase (endonuclease III)/dipeptide and tripeptide permease A |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/3); new base T (47/30); total (47/33) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.64e-02 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 |
TTATCCTCTTTTAAAACATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTG‑‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAATCAGGTTAAAATCATTT > NC_000913/1712200‑1712393
|
ttATCCTCTTTTAAAACATCTTTTTAACGTCAGTGATGCGATGGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTg < 1:2374203/100‑1 (MQ=255)
ttATCCTCTTTTAAAACATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTg > 1:2795366/1‑100 (MQ=255)
aTCCTCTTTTAAAACATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTG‑‑tt > 2:1737999/1‑100 (MQ=255)
tCCTCTTTTAAAACATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTG‑‑tt‑t > 1:2311410/1‑100 (MQ=255)
ccTCTTTTAAAACATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTG‑‑tt‑tt > 2:1845031/1‑100 (MQ=255)
ctctTTTAAAACATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTG‑‑tt‑ttt > 1:1693428/1‑100 (MQ=255)
ctTTTAAAACATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTG‑‑tt‑ttttt > 2:2923689/1‑100 (MQ=255)
ttttAAACCATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTG‑‑tt‑tttttt < 2:1906699/100‑2 (MQ=255)
ttttAAAACATTTTTTTAACGTCAATGATGTCATTGCTTAGTGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTG‑‑tt‑tttttt < 1:1024041/100‑2 (MQ=255)
ttttAAAACATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTG‑‑tt‑tttttt < 1:2855046/100‑2 (MQ=255)
ttttAAAACATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTG‑‑tt‑tttttt < 2:2017164/100‑2 (MQ=255)
tttAAAACATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTG‑‑tt‑tttttta < 2:273990/100‑3 (MQ=255)
tttAAAACATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTG‑‑tt‑tttttta < 2:85061/100‑3 (MQ=255)
ttAAAACATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTG‑‑tt‑ttttttaa < 2:2777282/100‑4 (MQ=255)
tAAAACATCGTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTAAGCGTTATCATCAGTTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTG‑‑tt‑ttttttaat < 1:1532382/100‑5 (MQ=255)
aaCATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGc < 2:717209/100‑1 (MQ=255)
cATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGa > 2:195505/1‑100 (MQ=255)
tttttAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAAtt > 2:139123/1‑100 (MQ=255)
tttttAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAAtt > 2:2604990/1‑100 (MQ=255)
ttttAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAAttt > 1:3294623/1‑100 (MQ=255)
ttAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTc < 2:1807041/100‑1 (MQ=255)
ttAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATATTc > 1:1945028/1‑100 (MQ=255)
tAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCt < 2:1707490/100‑1 (MQ=255)
aaCGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTa < 2:1645794/100‑1 (MQ=255)
aaCGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTa < 2:1358707/100‑1 (MQ=255)
aCGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTat > 1:3268980/1‑100 (MQ=255)
aCGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATACTCAGGTAATCCGTTTGCTGATAACCAAAAATGCATGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTa < 1:2207066/99‑1 (MQ=255)
cgatgatgatgCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCGAAAATGCAGGTGAATTG‑‑TTGTTTTTAATAGCGAACTTTTCt < 1:2028889/92‑1 (MQ=255)
cGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTATTATCGAAATTTTCTat > 1:1267295/1‑99 (MQ=255)
cGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTatt > 1:251750/1‑100 (MQ=255)
cGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTatt > 2:225983/1‑100 (MQ=255)
tCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTattca > 2:2664617/1‑100 (MQ=255)
tCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTattca < 2:2794787/100‑1 (MQ=255)
tCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTattca > 1:485578/1‑100 (MQ=255)
cAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTcagctgtt < 2:191815/100‑8 (MQ=255)
cAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTattcat > 2:1419223/1‑100 (MQ=255)
atgCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGt < 2:1873033/99‑1 (MQ=255)
tgCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGa > 1:2105337/1‑100 (MQ=255)
gCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGAt < 2:379380/100‑1 (MQ=255)
gCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGAt < 2:942627/100‑1 (MQ=255)
ccATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATc > 2:816385/1‑100 (MQ=255)
cATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATTCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCa < 1:1626439/100‑1 (MQ=255)
cATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCa > 2:1131323/1‑100 (MQ=255)
cATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCa > 2:2814898/1‑100 (MQ=255)
ttGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAg < 1:2820609/100‑1 (MQ=255)
ttGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAg > 1:3214714/1‑100 (MQ=255)
gCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGAt > 2:2398984/1‑100 (MQ=255)
cTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATGCGTGATCAAGATc > 2:1969883/1‑100 (MQ=255)
ttAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCa < 1:2461492/100‑1 (MQ=255)
tctgCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTACAAAAAACAAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCa < 1:813429/97‑1 (MQ=255)
tAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCAc < 2:655168/100‑1 (MQ=255)
gCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGAtcaagatcaaga > 2:813432/1‑100 (MQ=255)
gCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGa > 1:2266029/1‑100 (MQ=255)
cGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCAcca < 2:2297746/99‑3 (MQ=255)
cGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTG‑‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATg < 1:91422/100‑1 (MQ=255)
gTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATg > 1:238306/1‑100 (MQ=255)
ttATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGc < 2:708009/100‑1 (MQ=255)
ttATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGc < 2:822335/100‑1 (MQ=255)
catcaGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATATAGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCt > 1:800373/1‑97 (MQ=255)
catcaGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATTCTGTc > 1:2996580/1‑100 (MQ=255)
atcaGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCg < 1:195505/100‑1 (MQ=255)
atcaGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCg > 2:3234016/1‑100 (MQ=255)
atcaGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCg > 2:2131221/1‑100 (MQ=255)
atcaGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCg < 2:2203668/100‑1 (MQ=255)
atcaGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGAAGCTGTc > 1:1442342/1‑99 (MQ=255)
atcaGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGAAGGATAATTGTTTT‑TTTTTAATAGCGCAATTTTATAATAATACGTGTTCCAGATCACGATACTGt > 1:2606059/1‑99 (MQ=255)
tcaGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTCTTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGc < 2:3214742/100‑1 (MQ=255)
aGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCaa > 2:3086448/1‑100 (MQ=255)
ggTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAAt > 2:1454136/1‑100 (MQ=255)
gTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATg > 1:553466/1‑100 (MQ=255)
tAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGt > 1:470037/1‑100 (MQ=255)
naTCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTa > 1:1562068/2‑100 (MQ=255)
aTCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTaa < 2:1578249/100‑1 (MQ=255)
ttGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACAt < 1:2610249/100‑1 (MQ=255)
cGGATAATCCAAAATCCAGGTTAATTG‑‑TTAATTCTACTATACAAATTCTTTATTCATTCTAAATCAAGATCACGAGGCTGTCGCAATGTAAAAACATTg < 1:2826090/99‑1 (MQ=255)
cGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATATCTAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGc > 2:311289/1‑100 (MQ=255)
ggATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCa > 1:405024/1‑100 (MQ=255)
aaCCAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTTTTTTTTTAATCTTCTATTCAGTAGTGATCAAGAGCACGATTATGTTGCAATTTAAAAACAtttaaatat > 1:1524902/1‑93 (MQ=255)
aCCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGaa > 2:3341152/1‑100 (MQ=255)
aCCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGaa > 2:1312451/1‑100 (MQ=255)
aCCAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAAt > 2:105915/1‑100 (MQ=255)
aCCAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAAt > 2:2440932/1‑100 (MQ=255)
ccAAAAATGCGGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAATc > 1:3112690/1‑100 (MQ=255)
ccAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGAACAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAATc > 2:1048437/1‑100 (MQ=255)
cAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAATCa > 2:2097045/1‑100 (MQ=255)
cAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAATCa > 2:17071/1‑100 (MQ=255)
aaaaaTGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAATCAg > 2:1393818/1‑100 (MQ=255)
aaaaTGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATATTGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAATCa > 1:1119235/1‑98 (MQ=255)
aaaTGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAATCAGGt < 1:242895/100‑1 (MQ=255)
aaaTGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAATCAGGt < 1:2796454/100‑1 (MQ=255)
aTGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAATCAGGTTa < 2:1231890/100‑1 (MQ=255)
tGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAATCAGGTTaa < 2:453269/100‑1 (MQ=255)
tGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAATCAGGTTaa > 1:431868/1‑100 (MQ=255)
tAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTGTATATTCATTCGTTATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAATCAGGTTAAAATCAtt < 1:1083474/100‑1 (MQ=255)
aaTTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAATCAGGTTAAAATCAttt < 2:271664/100‑1 (MQ=255)
|
TTATCCTCTTTTAAAACATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTG‑‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAATCAGGTTAAAATCATTT > NC_000913/1712200‑1712393
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
