Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A12 F133 I0 R1
|
200 |
171.4 |
8351354 |
94.3% |
7875326 |
99.8 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,712,306:1 |
(T)7→8 |
100% |
intergenic (+148/‑463) |
nth → / → dtpA |
DNA glycosylase and apyrimidinic (AP) lyase (endonuclease III)/dipeptide and tripeptide permease A |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,712,299 | 1 | . | T | 94.8%
| 310.8
/ 9.8
| 97 | intergenic (+141/‑470) | nth/dtpA | DNA glycosylase and apyrimidinic (AP) lyase (endonuclease III)/dipeptide and tripeptide permease A |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (2/3); new base T (40/52); total (42/55) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.13e-01 |
Only 100 of 113 total aligned reads displayed.
TTATCCTCTTTTAAAACATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTG‑TTTTT‑TT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAATCAGGTTAAAATCATTT > NC_000913/1712200‑1712393
|
ttATCCTCTTTTAAAACATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTg < 2:2056826/100‑1 (MQ=255)
ttATCCTCTTTTAAAACATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTg < 1:1594180/100‑1 (MQ=255)
tCCTCTTTTAAAACATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTG‑ttt > 1:3200548/1‑100 (MQ=255)
ccTCTTTTAAAACATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCATGTAATCCGTTTGCGGGTAACCAAAAAGGCAGGTTAATTG‑tttt > 2:1385239/1‑100 (MQ=255)
ctTTTAAAACATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTG‑ttttt‑tt > 2:1049740/1‑100 (MQ=255)
ttttAAAACATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTG‑ttttt‑ttt > 1:3636514/1‑99 (MQ=255)
ttttAAAACATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTG‑ttttt‑ttt < 2:1092596/100‑2 (MQ=255)
ttAATACATCTTTTTTACGTCAATGAGGCCATTGCTTAGCTTTATCATCAGGTAATCTGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGGTAATTG‑ttttt‑ttt < 2:360212/98‑2 (MQ=255)
ttAAAACATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTG‑ttttt‑tttaa < 1:2325260/100‑4 (MQ=255)
tAAAACATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCATGTAATCCGTTTGCAGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTG‑ttttt‑tttaat < 2:1618387/100‑5 (MQ=255)
tAAAACATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTG‑ttttt‑tttaat < 1:2013198/100‑5 (MQ=255)
aaaaaCATCTTTTTAACGTCAATGATGCCTTTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGACAACCAAAAATGCAGGTTAATTG‑ttttt‑tttaat < 2:2500313/99‑5 (MQ=255)
aaaaCATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTG‑ttttt‑tttaata > 1:3490414/1‑95 (MQ=255)
aaaCATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTTTT‑TT‑AATAg > 1:1614513/1‑100 (MQ=255)
aaaCATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTTTT‑TT‑AATAg > 2:3600709/1‑100 (MQ=255)
aaaCATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTTTT‑TT‑AATAg < 1:3436756/100‑1 (MQ=255)
cATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTTTT‑TT‑AATAGCg > 2:3409125/1‑99 (MQ=255)
cATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTTTT‑TT‑AATAGCGa > 1:2298442/1‑100 (MQ=255)
aTCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTTTT‑TT‑AATAGCGaa > 1:4122234/1‑100 (MQ=255)
tCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTTTT‑TT‑AATAGCGaaa < 2:3258516/100‑1 (MQ=255)
ttAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTTTT‑TT‑AATAGCGAAATTTTc < 1:1920724/100‑1 (MQ=255)
tAACGTCATTGATGCCATTGCTTAGCTTTATCACCGCGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCATGTTAATTGTTTTTT‑TT‑AATAGCGAAATTTTc < 2:1299560/99‑1 (MQ=255)
tAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCGTCAGGTGATTCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTTTT‑TT‑AATAGCGAAATTTTCt < 2:2924720/100‑1 (MQ=255)
tAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTTTT‑TT‑AATAGCGAAATTTTCt > 2:441306/1‑100 (MQ=255)
tAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTTTT‑TT‑AATAGCGAAATTTTCt < 1:2341165/100‑1 (MQ=255)
aaCGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCTAAAATGCAGGTTAATTGTTTTTT‑TT‑AATAGCGAAATTTTCt < 2:2272692/99‑1 (MQ=255)
aCGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTTTT‑TT‑AATAGCGAAATTTTCTat > 1:430052/1‑100 (MQ=255)
cGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTTTT‑TT‑AATAGCGAAATTTTCTatt < 1:2276882/100‑1 (MQ=255)
cGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTTTT‑TT‑AATAGCGAAATTTTCTatt < 1:3161677/100‑1 (MQ=255)
cGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTTTT‑TT‑AATAGCGAAATTTTCTatt > 1:969919/1‑100 (MQ=255)
cGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTTTT‑TT‑AATAGCGAAATTTTCTatt > 1:2943383/1‑100 (MQ=255)
cGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTTTT‑TT‑AATAGCGAAATTTTCTatt < 2:2808582/100‑1 (MQ=255)
cAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTTTT‑TT‑AATAGCGAAATTTTCTattcat > 1:1247195/1‑100 (MQ=255)
aaTGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTTTT‑TT‑AATAGCGAAATTTTCTattcatt < 2:1248556/100‑1 (MQ=255)
atgatgCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTTTT‑TT‑AATAGCGAAATTTTCTattcattc > 1:4026529/1‑100 (MQ=255)
tgatgCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTTTT‑TT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCg < 2:3577366/100‑1 (MQ=255)
tgatgCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTTTT‑TT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCg < 1:1664240/100‑1 (MQ=255)
gatgCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTTTT‑TT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGt < 2:1619701/100‑1 (MQ=255)
gatgCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTTTT‑TT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGt < 1:1009484/100‑1 (MQ=255)
atgCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGAGGATAAACAAAAATGCAGGTTAATTGTTTTTT‑TT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTg < 2:1462735/100‑1 (MQ=255)
tgCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTTTT‑TT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGa > 2:1807140/1‑100 (MQ=255)
tgCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTTTT‑TT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGa < 1:2235533/100‑1 (MQ=255)
gCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTTTT‑TT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGAt > 1:72102/1‑100 (MQ=255)
gCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTTTT‑TT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGAt < 2:2643588/100‑1 (MQ=255)
gCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTTTT‑TT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGAt < 2:2978901/100‑1 (MQ=255)
gCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTTTT‑TT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGAt < 1:3075010/100‑1 (MQ=255)
aTTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTTTT‑TT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCaa < 1:750795/100‑1 (MQ=255)
gattAGCTTTATCATCAGGTAATCCGTTTGGTGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTTTT‑TT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGAt < 2:4165235/98‑1 (MQ=255)
cTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTTTT‑TT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATcttgatc < 1:2523809/100‑7 (MQ=255)
ttAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTTTT‑TT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATc < 2:64574/99‑1 (MQ=255)
ttAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTTTT‑TT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCa < 1:405110/100‑1 (MQ=255)
tAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTTTT‑TT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCTTGATCAc < 1:1188811/100‑1 (MQ=255)
aGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTTTT‑TT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACg > 2:1970567/1‑100 (MQ=255)
aGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGACAAGCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTTTT‑TT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGAGTAAGATCACg > 2:2738904/1‑100 (MQ=255)
gCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAACAATGCAGGTTAATTGTTTTTT‑TT‑ATTAGCGATTTTTTCTATTCATTCGTGATTATGATCAc > 2:2681788/1‑98 (MQ=255)
gCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTTTT‑TT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGa > 2:508669/1‑100 (MQ=255)
gCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTTTT‑TT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGa < 1:1857948/100‑1 (MQ=255)
cGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACAAAAAATGCAGGTTAATTGTTTTTT‑TT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGAt > 1:484995/1‑100 (MQ=255)
ttATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTTTT‑TT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCTTGATCACGaatg < 1:2381274/100‑4 (MQ=255)
ttATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTTTT‑TT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGc < 2:1539370/100‑1 (MQ=255)
ttATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTTTT‑TT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGc < 2:3645225/100‑1 (MQ=255)
atcatcGGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTTTT‑TT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTg > 1:3114270/1‑100 (MQ=255)
tcatcaGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTTTT‑TT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGt < 1:1213445/100‑1 (MQ=255)
atcaGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTTTT‑TT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCg > 2:1046681/1‑100 (MQ=255)
atcaGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTTTT‑TT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCg > 2:104573/1‑100 (MQ=255)
tcaGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTTTT‑TT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCg < 1:226669/99‑1 (MQ=255)
tcaGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTTTT‑TT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGc < 2:3391516/100‑1 (MQ=255)
aGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTTTT‑TT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTTGTGATCAAGATCACGATGCTGTc > 2:2365877/1‑96 (MQ=255)
aGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGCTTAATTGTTTTTT‑TT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACTATGTTGTCGCa < 2:2188613/99‑1 (MQ=255)
ggTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTTTT‑TT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAAt > 1:3676969/1‑100 (MQ=255)
ggTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTTTT‑TT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAAt > 1:2779065/1‑100 (MQ=255)
gTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTTTT‑TT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATg < 1:2368313/100‑1 (MQ=255)
tattctgTTTGTGGATAATCAAAAATGTAGTTTAATTGTTTTTT‑TT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTTGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGTAATGt < 2:1421586/94‑1 (MQ=255)
tAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTTTT‑TT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGt < 2:1425044/100‑1 (MQ=255)
tAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTG‑TTTTT‑TT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTa > 1:548674/1‑100 (MQ=255)
aaTCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTTTT‑TT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTa < 1:55771/100‑1 (MQ=255)
aTCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTTTT‑TT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTaa > 2:2002096/1‑100 (MQ=255)
tacGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTG‑TTTTT‑TTGAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTaaa > 1:2810347/3‑100 (MQ=255)
tCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTTTT‑TT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTaaa > 1:4070746/1‑100 (MQ=255)
ccGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTTTT‑TT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTaaaa > 1:2625840/1‑100 (MQ=255)
ttGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTTTT‑TT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACAt < 2:1403608/100‑1 (MQ=255)
cGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTTTT‑TT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGc > 2:3249128/1‑100 (MQ=255)
cGGATAACCAAAAATGCAAGTTAATTGTTTTTT‑TT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTg > 2:854442/1‑99 (MQ=255)
aTAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTTTT‑TT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAg < 1:1472302/100‑1 (MQ=255)
tAACCAAAAAGGCATGTTAATTTTTTTTT‑TT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGa < 1:1385247/100‑1 (MQ=255)
aaCCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTTTT‑TT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGaa > 1:2763997/1‑100 (MQ=255)
aaCCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTTTT‑TT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGAGCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGaa < 2:3820673/100‑1 (MQ=255)
aCCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTTTT‑TT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAAt > 1:2716824/1‑100 (MQ=255)
aCCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTTTT‑TT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAAt > 1:121682/1‑100 (MQ=255)
aCCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTTTT‑TT‑AATAGCGAAATTCTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAAt > 1:3819544/1‑100 (MQ=255)
caaatgtGCAGGTTAATTG‑TTTTTGTG‑AATAGCGATAGTTTCGATTCATTCGTTATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAGCATTGCaa < 2:3880459/88‑1 (MQ=255)
cAAAAATGCAGGTTAATTGTTTTTT‑TT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAATCa < 2:1083107/100‑1 (MQ=255)
aaaTGCAGGTTAATTGTTTTTT‑TT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAATCAGGt < 1:1138278/100‑1 (MQ=255)
aaaTGCAGGTTAATTGTTTTTT‑TT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAATCAGGt < 1:777700/100‑1 (MQ=255)
gCAGGTTAATTG‑TTTTT‑TT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAATCAGGTTaaaa < 1:2983884/100‑1 (MQ=255)
ggTTAATTGTTTTTT‑TT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAATCAGGTTAAAATc > 1:2650393/1‑100 (MQ=255)
ttAATTGTTTTTT‑TT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAATCAGGTTAAAATCa < 2:880790/99‑1 (MQ=255)
tAATTGTTTTTT‑TT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAATCAGGTTAAAATCAtt < 1:1967310/100‑1 (MQ=255)
tAATTG‑TTTTT‑TT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAATCAGGTTAAAATCAttt < 1:3987073/100‑1 (MQ=255)
aaTTGTTTTTT‑TT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAATCAGGTTAAAATCAttt < 2:442897/100‑1 (MQ=255)
|
TTATCCTCTTTTAAAACATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTG‑TTTTT‑TT‑AATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAATCAGGTTAAAATCATTT > NC_000913/1712200‑1712393
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
