Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A12 F56 I0 R1
|
312 |
170.3 |
8276235 |
93.7% |
7754832 |
99.8 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,712,306:1 |
(T)7→8 |
100% |
intergenic (+148/‑463) |
nth → / → dtpA |
DNA glycosylase and apyrimidinic (AP) lyase (endonuclease III)/dipeptide and tripeptide permease A |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,712,299 | 1 | . | T | 90.6%
| 304.3
/ 24.5
| 96 | intergenic (+141/‑470) | nth/dtpA | DNA glycosylase and apyrimidinic (AP) lyase (endonuclease III)/dipeptide and tripeptide permease A |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (6/3); new base T (46/41); total (52/44) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.01e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 106 total aligned reads displayed.
ATCCTCTTTTAAAACATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAA‑TTG‑TTTTT‑TTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAATCAGGTTAAAATCATTT > NC_000913/1712202‑1712393
|
aTCCTCTTTTAAAACATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAA‑TTG‑tt > 2:3679542/1‑100 (MQ=255)
tCCTCTTTTAAAACATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAA‑TTG‑ttt > 1:3492563/1‑100 (MQ=255)
ccTCTTTTAAAACATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAA‑TTG‑tttt < 1:373789/100‑1 (MQ=255)
ttttAAAACATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAA‑TTG‑ttttt‑ttt > 1:1762325/1‑99 (MQ=255)
ttttAAAACATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGAGGATAACCAAAAATGCAGGCTAA‑TTG‑ttttt‑ttt > 2:3260830/1‑99 (MQ=255)
tttAAAACATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAA‑TTG‑ttttt‑ttta < 1:2675223/100‑3 (MQ=255)
tttAAAACATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGATAA‑TTG‑ttttt‑ttta > 1:4071871/1‑98 (MQ=255)
tAAAACATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAA‑TTG‑ttttt‑tttaa < 1:3000001/99‑4 (MQ=255)
aaaaCATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAA‑TTG‑ttttt‑tttaata > 1:736411/1‑95 (MQ=255)
aaaCATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAA‑TTGTTTTTT‑TTAATAg > 1:3383835/1‑100 (MQ=255)
aaaCATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAA‑TTGTTTTTT‑TTAATAg > 2:664002/1‑100 (MQ=255)
aaaCATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAA‑TTGTTTTTT‑TTAATAg < 1:3679566/100‑1 (MQ=255)
aaCATCTTTTTGACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCTGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAA‑TTG‑ttttt‑tttaata < 2:3838133/98‑6 (MQ=255)
aCATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAA‑TTGTTTTTT‑TTAATAGCg > 1:4112777/1‑100 (MQ=255)
tCTTTTTAACGTCAATAATGACATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAAGAAAAAATGCAGGTTAA‑TTGTTTTTT‑TTAATAGCGaa > 2:1883612/1‑99 (MQ=255)
ttAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAA‑TTGTTTTTT‑TTAATAGCGAAATTTTc < 2:3610673/100‑1 (MQ=255)
ttAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAAGGGGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAA‑TTGTTTTTT‑TTAATAGCGAAATTTTc < 1:1348230/100‑1 (MQ=255)
aaaggcAATGATACCAAAGATTAGCTTTATTATCATGTAATCCGTTTAAAAAAAAAAAAAAATGCAGGTTAA‑TTGTTTTTT‑TTAATAGCGAAATTTTCTa < 2:1658448/95‑1 (MQ=255)
aaCGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATTATCAGGTAATCTGTTTGCGGAAAACCAAAAATGCAGGTTAA‑TTGTTTTTT‑TTAATAGCGAAATTTTc < 2:3942748/98‑1 (MQ=255)
aaCGTCAATGATGCAATTGCTAATCGTCATGAGATGTTAATTTGTTTACGAATAACCAAAAATGCAGGTTAA‑TTGTTTTTT‑TTAATAGCGAAATTTTCTa < 2:1658538/100‑1 (MQ=255)
cGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTACCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCTGGTTAA‑TTGTTTTTT‑TTAATACCGAAATTTTATatt > 2:2717435/1‑100 (MQ=255)
gTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAA‑TTGTTTTTT‑TTAATAGCGAAATTTTCTattc < 1:1300882/100‑1 (MQ=255)
gTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAA‑TTGTTTTTT‑TTAATAGCGAAATTTTCTattc > 1:3794292/1‑100 (MQ=255)
tCAATGATACCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAA‑TTGTTTTTT‑TTAATAGCGAAATTTTCTatt < 1:3663028/98‑1 (MQ=255)
cAATGATGCCATTGTTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAACAGTGCAGGTTGA‑TTG‑TTTTTATTAATAGTGTATTTTTCTatgt > 2:3612959/1‑96 (MQ=255)
tgctgCGATTGCTTTGTGTTATCATCAGTTATTCCGTTCGCGGTTATCCAAATATGCATGTTAATTTT‑TTTTT‑TTAATAGCGAAATGTTCTATTCATTCg < 2:3778392/97‑1 (MQ=255)
tgatgCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAA‑TTGTTTTTT‑TTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCg < 2:3786360/100‑1 (MQ=255)
tgatgCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAA‑TTGTTTTTT‑TTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCg < 2:3741025/100‑1 (MQ=255)
tgatgCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAA‑TTGTTTTTT‑TTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCg < 1:3421010/100‑1 (MQ=255)
tgCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAA‑TTGTTTTTT‑TTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGa < 1:4009298/100‑1 (MQ=255)
tgCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAA‑TTGTTTTTT‑TTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGa > 1:3099247/1‑100 (MQ=255)
ccATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAA‑TTGTTTTTT‑TTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATc > 1:3996912/1‑100 (MQ=255)
ccATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAA‑TTGTTTTTT‑TTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATc < 2:2890946/100‑1 (MQ=255)
cATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAA‑TTGTTTTTT‑TTAATATCTAAATTTTCTATTCATTCGTGATCa > 2:1742609/1‑100 (MQ=255)
cATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAA‑TTGTTTTTT‑TTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCa < 2:1509141/100‑1 (MQ=255)
taattAGAGTTATAACTAGGTAACTCGTTTGAAGATAACCAAAACTGCTGGTTAA‑TTGTTTTTT‑TTAATAGCGAAATTTGCGATTCATTCGTGATCAAg < 2:3445358/96‑1 (MQ=255)
tGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAA‑TTGTTTTTT‑TTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGa < 1:2021676/100‑1 (MQ=255)
gCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAA‑TTGTTTTTT‑TTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGAt > 1:3259337/1‑100 (MQ=255)
gCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAA‑TTGTTTTTT‑TTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGAt > 1:4049778/1‑100 (MQ=255)
gCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAA‑TTGTTTTTT‑TTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGAt < 1:1880073/100‑1 (MQ=255)
cTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAA‑TTGTTTTTT‑TTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATc > 2:2952409/1‑100 (MQ=255)
cTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAA‑TTGTTTTTT‑TTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATc > 2:4054378/1‑100 (MQ=255)
ttAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAA‑TTGTTTTTT‑TTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCa < 1:214549/100‑1 (MQ=255)
ttAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAA‑TTGTTTTTT‑TTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCa < 1:1925268/100‑1 (MQ=255)
tAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAA‑TTGTTTTTT‑TTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCAc > 1:1286577/1‑100 (MQ=255)
tAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAA‑TTGTTTTTT‑TTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCAc < 2:3920023/100‑1 (MQ=255)
tAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAA‑TTGTTTTTT‑TTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCAc > 1:1619424/1‑100 (MQ=255)
tAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAA‑TTGTTTTTT‑TTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATAAc > 2:2475289/1‑100 (MQ=255)
tAGCGTTATCACCAGGTAATCCGTTTGCGGATAAGCAAAGATGCACGTTAA‑TTGTTTTTT‑TTAATAGCGAAATTTTCTATTCATCCGTGATCAAGATCAc < 2:3400309/100‑1 (MQ=255)
gCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAA‑TTGTTTTTT‑TTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGa < 1:2957424/100‑1 (MQ=255)
cGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAA‑TTGTTTTTT‑TTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGAt < 1:2887955/100‑1 (MQ=255)
ggtATCATCAGGTAATCCGTTTGCGTATAACCAAAAATGCAGGTTAA‑TTGTTTTTT‑TTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGa < 1:176707/96‑1 (MQ=255)
gTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAA‑TTGTTTTTT‑TTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCTTGATCACGaat < 1:3593195/100‑3 (MQ=255)
atcaGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAA‑TTGTTTTTT‑TTTTTTTTTTTATTTTCTATTCATTCGTTATCAATATCACGATTCTGt > 2:933322/1‑98 (MQ=255)
atcaGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAA‑TTGTTTTTT‑TTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTc > 2:3209228/1‑99 (MQ=255)
tcaGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAA‑TTGTTTTTT‑TTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGc > 1:3651169/1‑100 (MQ=255)
caGGTAATCCTTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAA‑TTGTTTTTT‑TTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCa < 2:1648757/100‑1 (MQ=255)
nggTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAA‑TTGTTTTTT‑TTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCaa > 2:531440/2‑100 (MQ=255)
aGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAA‑TTGTTTTTT‑TTAATAGCGACATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCaa > 2:1888876/1‑100 (MQ=255)
aGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAA‑TTGTTTTTT‑TTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCaa < 1:2008710/100‑1 (MQ=255)
ggTAATCCGTTTGCGGATAATCAAAAATGCAGGTTAA‑TTGTTTTTT‑TTAATAGCGAAATTTTCTATTCATGCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAAt < 2:3889934/100‑1 (MQ=255)
ggTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAA‑TTGTTTTTT‑TTAATAGCGAAATTTTCTATTAATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAAt > 2:875777/1‑100 (MQ=255)
gTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAA‑TTGTTTTTT‑TTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATg < 1:1107545/100‑1 (MQ=255)
gTAATCCGTTTGCGGATAAACAAAAATGCAGGTTAA‑TTGTTTTTT‑TTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATg < 2:1767758/100‑1 (MQ=255)
aaTCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAA‑TTGTTTTTT‑TTATTATTTAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTa > 2:1804321/1‑100 (MQ=255)
aaTCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGATTAA‑TTGTTTTTT‑TTAATAGCGAAATTTTCTATTCACTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTa < 2:2488776/100‑1 (MQ=255)
aTCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAA‑TTGTTTTTT‑TTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTaa > 1:838014/1‑100 (MQ=255)
aTCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAA‑TTGTTTTTT‑TTAATAGCGAAATTGTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGTAATGTaa > 2:4017096/1‑100 (MQ=255)
tCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAA‑TTGTTTTTT‑TTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTaaa > 1:1720329/1‑100 (MQ=255)
tCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAA‑TTGTTTTTT‑TTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTaaa > 1:1802592/1‑100 (MQ=255)
cGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAA‑TTGTTTTTT‑TTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTaaaaa > 1:3067922/1‑100 (MQ=255)
tttGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAA‑TTGTTTTTT‑TTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTaaaa < 2:397671/97‑1 (MQ=255)
ttGCGGATAACCAAAAATGCAGG‑‑AA‑TTGTTTTTT‑TTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTg < 1:2001551/100‑1 (MQ=255)
gCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAA‑TTGTTTTTT‑TTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTg < 1:2912212/100‑1 (MQ=255)
gCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAA‑TTG‑TTTTT‑TTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGc < 1:1383209/100‑1 (MQ=255)
tccgatctcAAAAATGCAGGTTAA‑TTG‑TTTTT‑TTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCa < 1:1991557/92‑1 (MQ=255)
cGGATAACCAAAAATGAAGGATAA‑ATG‑TTTTTATTAATAGCAAAAATTTCTAATCATTCGTGATCAAGATAACGATGCTGTAGCAATGTAAAAACATAGc > 2:2459265/1‑100 (MQ=255)
ggATAACCAAAAATGCAGGTTAA‑TTGTTTTTT‑TTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCa > 1:3165861/1‑100 (MQ=255)
aCCAAAAATGCAGGTTAA‑TTGTTTTTT‑TTAATCGCGAAAATATCTATTCATTCGTGATCAACAGCGCGATTGTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAAt > 2:571607/1‑100 (MQ=255)
aCCAAAAATGCAGGTTAA‑TTGTTTTTT‑TTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAAt > 1:2761972/1‑100 (MQ=255)
aCCAAAAATGCAGGTTAA‑TTGTTTTTT‑TTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAAt > 1:2235159/1‑100 (MQ=255)
ccAAAAATGCAGGTTAA‑TTGTTTTTT‑TTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAATc < 2:2058945/100‑1 (MQ=255)
ccAAAAATGCAGGTTAA‑TTGTTTTTT‑TTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAATc > 1:3840618/1‑100 (MQ=255)
ccAAAAATGCAGGTTAA‑TTGTTTTTT‑TTAATAGCGAAATTTTCTATCCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAATc > 2:2295417/1‑100 (MQ=255)
cAAAAATGCAGGTTAA‑TTGTTTTTT‑TTATTTGCGAAATTTTCTATTCATTCATGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAAt > 2:353332/1‑98 (MQ=255)
cAAAAATGCAGGTTAA‑TTGTTTTTT‑TTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAATCa < 2:2891703/100‑1 (MQ=255)
cAAAAATGCAGGTTAA‑TTGTTTTTT‑TTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAATCa > 1:2295490/1‑100 (MQ=255)
cAAAAATGCAGGTTAA‑TTGTTTTTT‑TTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAATCa < 1:2150679/100‑1 (MQ=255)
cAAAAATGCAGGTTAA‑TTG‑TTTTT‑TTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGatcgga > 2:1991544/1‑95 (MQ=255)
aaaaaTGCAGGTTAA‑TTGTTTTTT‑TTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAATCAg < 1:1690397/100‑1 (MQ=255)
aaaTGCAGGTTAA‑TTGTTTTTT‑TTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAATCAGGt < 2:451774/100‑1 (MQ=255)
tGCAGGTTAA‑TTGTTTTTT‑TTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAATCAGGTTaa > 1:3037092/1‑100 (MQ=255)
tGCAGGTAAA‑TTGTTTTTT‑TTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAATCAGGTTaa > 1:2161359/1‑100 (MQ=255)
gCAGGTTAA‑TTGTTTTTT‑TTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAATCAGGTTa > 2:2975728/1‑98 (MQ=255)
gCAGGTTAA‑TTG‑TTTTT‑TTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAATCAGGTTaaaa > 2:1473203/1‑100 (MQ=255)
cAGGTTAA‑TTGTTTTTT‑TTAATAGCGAAATGTTCTATTCATTCGTTATTAAGATCACGATACTTTCGCAATATAAAAAAATTGCACGACGTAGGTTaaaa > 2:2722239/1‑100 (MQ=255)
ggTTAA‑TTGTTTTTT‑TTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAATCAGGTTAAAATc > 1:3435946/1‑100 (MQ=255)
gTTAA‑TTGTTTTTT‑TTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAATCAGGTTAAAAt < 1:2221839/98‑1 (MQ=255)
tAA‑TTGTTTTTT‑TTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAATCAGGTTAAAATCAtt > 2:1184196/1‑100 (MQ=255)
aa‑TTGTTTTTT‑TTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAATCAGGTTAAAATCAttt > 1:652845/1‑100 (MQ=255)
|
ATCCTCTTTTAAAACATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAA‑TTG‑TTTTT‑TTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAATCAGGTTAAAATCATTT > NC_000913/1712202‑1712393
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
