Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A28 F35 I0 R1
|
174 |
9808.2 |
8488800 |
98.4% |
8352979 |
135.6 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP022686 |
1,632,501 |
T→G |
9.7% |
V166G (GTT→GGT) |
arcC → |
carbamate kinase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP022686 | 1,632,501 | 0 | T | G | 9.7%
| 316.2
/ 6.2
| 182 | V166G (GTT→GGT) | arcC | carbamate kinase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (55/102); new base G (20/2); total (76/106) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.35e-07 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 184 total aligned reads displayed.
CCGGCATTCCTCAACCCGACCAAGCCGATCGGTTCGTTCTTTACCGAGCAAGAAGCAGAGCTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCACCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGTTATTCGTGAAGGTAACCATCTGCGTGGTGCCAGCGCGGTTATCGATAAAGACTG > NZ_CP022686/1632362‑1632639
|
ccGGCATTCCTCAACCCGACCAAGCCGATCGGTTCGTTCTTTACCGAGCAAGAACCAGAGCTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGt < 6:364259/140‑1 (MQ=255)
caggCATTCCTCAACCCGAACAAGCCGTTCGGTTCGTTCTTTACCGAGCTAGAAGCAGAGCTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGGCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGt < 6:418299/138‑1 (MQ=255)
tCCTCAACCCGACCAAGCCGATCGGTTCGTTCTTTACCGAGCAAGAAGCAGAGCTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCGTCGGCAAAACCGGGTGatata > 5:877080/1‑139 (MQ=255)
cTCAACCCGACCAAGCCGATCGGTTCGTTCTTTACCGAGCAAGAAGCAGAGCTACTGACAAAACAGGGTTACAATCTGAAAGAAGATGCGCGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCGTCGCCAATACCGGTTGATATAAt > 4:255837/1‑140 (MQ=255)
cAACCCGACCAAGCCGATCGGTTCGTTCTTTACCGAGCAAGAAGCAGAGCTACTGACAAAACAGGGTTAAACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGGCGTTGCGTCGCCAAAACCGGGTGATATCAt > 1:468498/1‑138 (MQ=255)
cccGACCAAGCCGATCGGTTCGTTCTTTACCGAGCAAGAAGCAGAGCTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTACTTGCTTAGCCAACAACGGGTGATAACATTGaaa > 3:699518/1‑140 (MQ=255)
aCCAAGCCGATCGGTTCGTTCTTTACCGAGCAAGAAGCAGCGCTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGGCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGatacgtg > 5:260265/1‑134 (MQ=255)
aCCAAGCCGATCGGTTCGTTCTTTACCGAGCAAGAAGCAGAGCTACTGACAAAACAGGGTAACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTAGTGGCGATGCGAAGCCAAAAACGGTTTATATAATTGtaaaaaa > 4:369275/1‑138 (MQ=255)
ccAAGCCGATCGGTTCGTTCTTTACCGAGCAAGAAGCAGAGCTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAg < 2:22772/138‑1 (MQ=255)
ccAAGCCGATCGGTTCGTTCTTTACCGAGCAAGAAGCAGAGCTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGaa < 8:185051/140‑1 (MQ=255)
ccAAGCCGATCGGTTCGTTCTTTACCGAGCAAGAAGCAGAGCGACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGGTGCGTTTCTTCGGCAAAACCGGTTGATATAATTGAAAAATaa > 4:646227/1‑140 (MQ=255)
caaaGCAGATCGGTTCGTTCTTTAACGAGAAAGAAGCAGAGATACTGACAAAAAAGGTTTACACTCTGAAAGAAGATGCTTCTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCCAGAAAAAAGGTTGTTAACAATTAAAAAGaa > 4:486303/3‑140 (MQ=255)
cAAGCCGATCGGTTCGTTCTTTACCGAGCAAGAAGCAGAGCTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGaaa < 4:340999/140‑1 (MQ=255)
ccGATCGGTTCGTTCTTTACCGAGCAAGAAGCATAGCTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGt < 7:794322/140‑1 (MQ=255)
gATCGGTTCTTTCTTTACCTAGCAATAAGCAGAGCTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGACAAAACCGGATGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTa < 6:921180/140‑1 (MQ=255)
gATCGGTTCGTTCTTTACCGAGCAAGAAGCAGAGCTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTa < 8:222206/140‑1 (MQ=255)
aTCGGTTCGTTCTTTACCGAGCAAGCAGCAGAGCTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGtt < 1:1180/138‑1 (MQ=255)
aTCGGTTCGTTCTTTACCGAGCAAGCAGCAGAGCTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTaa < 5:491799/140‑1 (MQ=255)
aTCGGTTCGTTCTTTACCGAGCAAGAAGCAGAGCTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGtt < 2:804562/138‑1 (MQ=255)
aTCGGTGTGTTCTTTACCGAGCAAGAAGCAGAGCTACTGACAAAACAGGGTTACACTGTGATAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCTTTGAAAAAGAAACGGTTaa < 6:515948/140‑1 (MQ=255)
gttcgttcTTTACCGAGCAAGAAGCAGAGCTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGct < 3:55590/140‑1 (MQ=255)
ttcTTTACCGAGCAAGAAGCAGAGCTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGt < 3:207495/140‑1 (MQ=255)
ttACCGAGCAATAAGCAGAGCTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAg < 1:444459/138‑1 (MQ=255)
tACCGAGCAAGAAGCAGAGCTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCCTTGCGTCGGCAAAACCCGTTGATATAATTTAAAAAAAAACGGTTAACGCTATGGTTGAtt > 3:506491/1‑139 (MQ=255)
tACCGAGCAAGAAGCAGAGCTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATAGTCGTGTCGTTTCTTCGCCCAAACCGGTTTATTTAATTTTAAAATAAACGGTTAAAGCAATGGTatttg > 7:962806/1‑136 (MQ=255)
cGAGCAAGAAGCAGAGCTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCCAAACCGGGTGATATCATTGAAAAATAAACGGTTTAAGCGCTGGTAGAttc > 1:1063938/1‑136 (MQ=255)
cGAGCAAGAAGCAGAGCTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGGCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCg < 8:344989/140‑1 (MQ=255)
cAAGAAGCAGAGCTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTGGTTGCGTCGCCAAAAACGGTTGTTATCAATGAAAAAGAAACGGTTTAAGCTCTGGTAGAAGCCggg > 2:1000365/1‑137 (MQ=255)
cAAGAAGCAGAGCTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTGGCCAAAACCGGGTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTTAAGCTATGGTAGATGCCggc > 2:915504/1‑137 (MQ=255)
aagCAGAGCTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTTAAAGAAGATGAGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCTCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAggtg < 6:893172/140‑1 (MQ=255)
agCAGAGCTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGGTTCGCCAAAACCGGGTTATATAATTGAAAAAGCAACGGTGAAAGCTGTGGTAGATGCCGGCCAggtgg > 3:123480/1‑140 (MQ=255)
gagCTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGAt < 4:332690/140‑1 (MQ=255)
tACTGACAAAACAGGGTTACACTCTTAAATAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCa < 2:600767/138‑1 (MQ=255)
tACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGGCGCGGCTATCGTCGTGGCGTTGCGTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCAcc < 5:442014/140‑1 (MQ=255)
aatGACAACACATGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCTGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACTGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCACCg < 4:954546/138‑1 (MQ=255)
cTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCTGCTATCGTCGTTTCGTATCTTAGCCAAAAACAGTTTAAATAATTGAAAAATAAACGTTTAAAGCTCTGGTGTATTCAGGACAGGTGGTGATCACAGt > 7:65768/1‑140 (MQ=255)
tGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCTCCAAAACCGGTTGATCTCATTTAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCACCg < 2:989717/138‑1 (MQ=255)
gACAAAACAGGGTTACACTCTGACAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGGCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCACCGTTg < 5:282036/140‑1 (MQ=255)
aaaaCAGTGTTAAACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTAGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCACCGTTGGCg < 4:837026/140‑1 (MQ=255)
aaCAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCTTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGaa < 6:706989/89‑1 (MQ=255)
aaCAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCACAGGTATAAGCCGGACCGGTGGTGATCACCGATGGCg > 1:557558/1‑138 (MQ=255)
aaCAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGGCGTTGCATCGCCAAAACCCGTTGATATCATTTAAAAAGAAACGGATAAAGCTCATGTAGATGCCAGCCCCGTGGTTAACACCCGTTGCggt > 8:413629/1‑140 (MQ=255)
aaCAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCATCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGaa > 5:706989/1‑89 (MQ=255)
cAGGGTTACACTCTTAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAATACCGGGTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCACCGTTGGCggt < 1:673848/138‑1 (MQ=255)
cAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTTCTATCCTTGAAAAAGAAACGGGTAAAGCTCTGGGAGATGGAGGACAGGTGGGGATCCCCGGTGGCggg > 2:63752/1‑137 (MQ=255)
cAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGGCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCACCGTTGGCggtgg < 7:3483/140‑1 (MQ=255)
gTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCCGTTGATATCATTGAAAAAGAAACCGTTAAAGCTCTGGTAGATGACGGACAGGTGGTGATAACCGTTGGCggtggtggg > 6:135344/1‑139 (MQ=255)
ttACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCACCGTTGGCGGTGGTGGTa < 3:277858/140‑1 (MQ=255)
ttACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCACCGTTGGCGGTGGTGGTa < 3:653892/140‑1 (MQ=255)
cacTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGGGTCGGCAAAACCGGGTGATATCATTGAAAAATAAACGGTTAAAACTATGGTTGATTCCGGACAGGTGGTGATAACCGTTGGCGGTGGTGGTATcc > 4:653892/1‑140 (MQ=255)
cacTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATAATTGAAAAACACACCGTTTAATCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGCTCACCGGTGGGGGTGGTGGTAt > 1:1028469/1‑138 (MQ=255)
cacTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGGCGTTGCTTAGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAATAACAAACGGTTAAAGCTCTGGGTGGTGCCGGACAGGAGGTGTTAACCGGTGGCGGGGGGGGGATcc > 7:86688/1‑140 (MQ=255)
acTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCACCGTTGGCGGTGGTGGTATccc < 8:1047/140‑1 (MQ=255)
ctGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCACCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGt < 3:548440/140‑1 (MQ=255)
tGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGGTTAGCCAAAACCGGGTGAATTCATAGAAAAAGAAAACGTTAAAGAGGTTGTAGAAGCCGGGCACGGGGTGATCACCGTTGGCGGGGGTGGTTTGCCTggt > 7:1019370/1‑138 (MQ=255)
tGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGt > 7:58702/1‑79 (MQ=255)
tGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGt < 8:58702/79‑1 (MQ=255)
tGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATAATTGAAAAAGAAACGGTTAAATCTCTGGTAGATGCCGGCCAGGTGGTGATAACCGTTGGCGGGGGGGGTATCCCTggt > 6:185794/1‑138 (MQ=255)
tGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACAGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCACCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGtt < 8:1015983/140‑1 (MQ=255)
tGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCCTTGGTTCGCCAAAACCCGGTGATTTAATATATAAAAAAAAGGTTTAAGCTCTGGGAGATGCAGGCAAGGTGGTGATAACAGGTTGCGGGGGTGGGATGCCTGtt > 6:829829/1‑140 (MQ=255)
aaaGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTTCTTAGCCAAAACCCGTTAATATAAATGTAAAATAAAAGGTTAAAACACAGTTAGAAGCCGGACACGGTGTGATCCACCTTTGCGGTGGTGGTTTCCCTGtt > 2:141851/1‑138 (MQ=255)
aaaGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGGCAAAACCGGTTTATATCATTGTAAAAGAAAAGGTTAAAGCTCAGGTTGATTGCGGCCAGGTGTTGATAGCCGTTTGGGGGGGTGGTATccgggtt > 2:342611/1‑133 (MQ=255)
aaaGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTAGCCAAAAACGGGTGATATAATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCACCGGTGGCGGTGGTGGTATCCCTGGTAt > 6:649688/1‑140 (MQ=255)
aaaGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCGTCGCCCAAAACGGGTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTATGGTAGATGCCGGCCAGGTGGTGATCACCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGtt > 2:85962/1‑138 (MQ=255)
aaaGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTAGTTGCATCCCCCAAAACGGTTTCAAACAAAGAAAAAGAAACGGTTTAACAACTGGTATATGCCGGCCAGGTGGTGAACACCCTTTGCGGGGGTGGTCTACCTGtttt > 8:23008/1‑138 (MQ=255)
aagaTGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAACCGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCACCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGTTATTCGt < 3:373493/140‑1 (MQ=255)
aagaTGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCACCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGTTATTCGt < 8:876062/140‑1 (MQ=255)
gaTGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCACCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGTTATTCGTGa < 6:874309/140‑1 (MQ=255)
tGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATAATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTTATCACCGTTGGCGGTGGTGGTATACCTGGTATTCGTggat > 3:787701/1‑137 (MQ=255)
cGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTGGGTGCTTCGCCAAAAGCGGGTTATATAATTGAAAAAGAAAAGGTGAACGGGCTGGTAGTTGGCGGACAGGGTGAGTTCACCGGTGGCGGTGGTGGTGTGCCGGTTATTctttatg > 2:139480/1‑132 (MQ=255)
cGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGGTGATATCATTGAAAAAGTAACGGTTTAAGCTCTTGTAGATGCCGGGCAGGTGGTTATCAACGTTTGCGGTGGTGGTATGCCAGTTATTCGTGAAggg > 8:141465/1‑139 (MQ=255)
cGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGACAAAACCAGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCACCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGTTATTCGTGAAGGt < 5:367006/140‑1 (MQ=255)
cGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTAGCCCAAACCGGGGGATATCATTTTAAAAGAAACGGTTAAATCTCTGGTAGGTGCCGGTCAGGTGGTGTTAACCCGTGGCGGGGGGGGTATGCCGGGTATTAGTGTAgtg > 7:125705/1‑138 (MQ=255)
cGGGGCGCGGCTCTCGTCGTGTCGATGCTTCGCCAAATCCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGTACAGGAGGTGATCACCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGTTATTCGTGAATGt < 4:227636/140‑1 (MQ=255)
gcgGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATAATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCACCGTTGGCGGTTGTTGTATCCCTGTTATTCGTGAAGGTAACCAt < 6:970328/140‑1 (MQ=255)
gcgGCTATCGTCGTGGCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGACACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCACCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGTTATTCGTGAAGGTAACCAt < 3:811915/140‑1 (MQ=255)
tATCTTCGTGTAGTTGCTGCGCCAAAACCTGTTTATATAATTGAAACAGAAACGGTTAAAGCTATGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCACCGTTGGCGGGGGTGGTATCCCTGTTATTCGTGAAGGTAACCATCTGCg < 8:647791/140‑1 (MQ=255)
tATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGACACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCACCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGTTATTCGTGAAGGTAACCATCTGCg < 5:419139/140‑1 (MQ=255)
tATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAACCGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCACCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGTTATTCGTGAAGGTAACCATCTGCg < 4:355077/140‑1 (MQ=255)
tATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGCAGATGCCGGACAGGTGGTGATCACCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGTTATTCGTGAAGGTAACCATCTGCg < 4:891139/140‑1 (MQ=255)
tATCGTCGTGTCGTTGATTCGCCAAAAGCGGTTGATATAATTGATAAAGAAACGGTTAAATCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCACCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGTTATTCGTGAAGGTAACCATCTGCg < 8:451792/140‑1 (MQ=255)
cgtTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGACAAAGAAACGGTTAAAGCGCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCACCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGTTATTCGTGAAGGTAACCATCTGCGTGGTGCCAg < 1:1093061/138‑1 (MQ=255)
cgtTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAACAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGGGGTGATCACCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGTTATTCGTGAAGGTAACCATCTGCGTGGTGCCAg < 1:73075/138‑1 (MQ=255)
cgtTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAACAGAAACGGTTAAAGCGCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCACCGTTTGCGGTGGTGGTATCCCTGTTATTCGTGAAGGTAACCATCTGCGTGGTGCCAgcg < 5:107507/140‑1 (MQ=255)
cgtTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCACCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGTTATTCGTGAAGGTAACCATCTGCGTGGTGCCAgcg < 5:781784/140‑1 (MQ=255)
cgtTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCACCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGTTATTCGTGAAGGTAACCATCTGCGTGGTGCCAg < 1:10426/138‑1 (MQ=255)
cgtTGCTTAGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAATCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTTATCACCCTTGGCGGTGAAGGTATCCCTGTTATTCGTGAAGGTAACCATCTGCGTTGTGCCAg > 2:283923/1‑138 (MQ=255)
ggCTGCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTACAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCACCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGTTATTCGTGAAGGTAACCATCTGCGTGGTGCCAgcgc < 2:651048/137‑1 (MQ=255)
gCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACATGTGGTGATCACCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGTTATTCGTGAATGTAACCATCTGCGTGGTGCCAGCGCGGt > 4:265992/1‑140 (MQ=255)
gCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCACCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGTTATTCGTGAAGGTAACCATCTGCGTTGTGCCAGCGCGGt > 7:173981/1‑140 (MQ=255)
ccAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCACCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGTTATTCGTGAAGGTAACCATCTGCGTGGTGCCAGCGCGGTTATc > 1:318194/1‑138 (MQ=255)
cAAATCCTGTTGATATCATTTAAAAAGAATCGTTTAACGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCACCGTTGGCGGTGGTGGTATACCTGTTATTCGTGAAGGTAACCATCTGCGTGGTGCCAGCGCGGTTATCGAt < 7:837513/140‑1 (MQ=255)
aaaaaCCGGTTTATATCAATGAAAAAGTAACGGTTTAAGCTCTGGTAGATGCCGGTCAGGTGGTGATCACCGGTGGCGGTGGTGGTATCCCTGTTATTCGTGAAGGTAACCATCTGCGTGGTGCCAGCGCGGTTATCGAt < 7:413629/139‑1 (MQ=255)
aaaaCCGGTTTATATGATTGAAAAAGACACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCTCCGTTGGCGGTGGTGGTTGCCCTGTTATTCGTGTAGGTTAGCATCTGCGTGGTGCGAGCGCGGTTATCGATa < 4:1008100/140‑1 (MQ=255)
aaaaCCGGTTGATATCATTTAAAAAGAAACGGGTAAAGCTCTTGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCACCGTTGTCGGTGGTGGTATCCCTGTTATTCGTGAAGGTAACCATCTGCGTGGTGCCAGCGCGGTTATCGa < 2:639712/138‑1 (MQ=255)
aaaaCCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGAGCACCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGTTATTCGTGAAGGTAACCATCTGCGTGGTGCCAGCGCGGTTATCGa < 2:708822/138‑1 (MQ=255)
cGGTTGATATCATTGAATAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCACCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGTTATTCGTGAATGTAACCATCTGCGTGGTGCCAGCGCGGTTATCGATAAAGAc < 6:1030460/140‑1 (MQ=255)
gTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCACCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGTTATTCGTGAAGGTAACCATCTGCGTGGTGCCAGCGCGGTTATCGATAAAGACTg > 3:999582/1‑140 (MQ=255)
gTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCACCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGTTATTCGTGAAGGTAACCATCTGCGTGGTGCCAGCGCGGTTATCGATAAAGACTg > 8:290390/1‑140 (MQ=255)
gTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCACCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGTTATTCGTGAAGGTAACCATCTGCGTGGTGCCAGCGCGGTTATCGATAAAGACTg > 5:854170/1‑140 (MQ=255)
|
CCGGCATTCCTCAACCCGACCAAGCCGATCGGTTCGTTCTTTACCGAGCAAGAAGCAGAGCTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCACCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGTTATTCGTGAAGGTAACCATCTGCGTGGTGCCAGCGCGGTTATCGATAAAGACTG > NZ_CP022686/1632362‑1632639
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
