Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A29 F11 I0 R1
|
249 |
11230.8 |
10274356 |
98.4% |
10109966 |
135.6 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP022686 |
1,632,501 |
T→G |
9.1% |
V166G (GTT→GGT) |
arcC → |
carbamate kinase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP022686 | 1,632,501 | 0 | T | G | 9.1%
| 465.6
/ 8.4
| 264 | V166G (GTT→GGT) | arcC | carbamate kinase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (71/160); new base G (28/3); total (101/163) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.50e-10 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 266 total aligned reads displayed.
CCGGCATTCCTCAACCCGACCAAGCCGATCGGTTCGTTCTTTACCGAGCAAGAAGCAGAGCTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAG‑AAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCA‑CCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGTTATTCGTGAAGGTAACCATCTGCGTGGTGCCAGCGCGGTTATCGATAAAGACTG > NZ_CP022686/1632362‑1632639
|
ccGGCATTCCTCAACCCGACCAAGCCGATCGGTTCGTTCTTTACCGAGCAAGAAGCAGAGCTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCGTCGCCAAAACCGGt > 6:5116/1‑140 (MQ=255)
cTCAACCCGACCAAGCCGATCGGTTCGTTCTTTACCGAGCAAGAAGCAGAGCTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGGCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGataac > 4:779230/1‑136 (MQ=255)
cccGACCAAGCCGATCGGTTCGTTCTTTACCGAGCAAGAAGCAGAGCTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGGTATCAGTGaaa > 2:341906/1‑140 (MQ=255)
gACCAAGCCGATCGGTTCGTTCTTTACCGAGCAAGAAGCAGAGCTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGGTTCGCCAAAACCGGGTGATATCATTGaaaaat > 7:829133/1‑139 (MQ=255)
aCCAAGCCGATCGGTTCGTTCTTTACCGAGAAAGAAGCAGAGCTACTGCCAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCAAAAACAGGTTGTTATCATTTataaata > 6:118086/1‑138 (MQ=255)
ccAAGCCGATCGGTTCGTTCTTTACCGAGCAAGAAGCAGAGCTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCGTGGCCAAAACCGGGTGATATAGTTGAAAAAG‑aa > 5:798227/1‑140 (MQ=255)
ccAAGCCGATCGGTGCGATCTTTACCGAGCAAGAAGCAGAGCTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGGAGTTTATTAGGCAAAACCCGTTGAAATAAATTAAAAAG‑ac > 8:1130178/1‑139 (MQ=255)
ccAAGCCGATCGGGTCGTTCTTTACCGAGCAAGAAGCAGAGCTACTGACATAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAg < 3:1227236/138‑1 (MQ=255)
cAAGCCGATCGGTTCGTTCTTTACCGAGCAAGAAGCAGAGCTACTGACAAAACAGGGTTACTCTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTGGTTGCTTAGGCAAAAACGGTTGATATCATTGAAAAAG‑a > 3:99780/1‑138 (MQ=255)
cAAGCCGATCGGTTCGTTCTTTACCGAGCAAGAAGCAGAGCTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATAATTGAAAAAG‑a > 4:631496/1‑138 (MQ=255)
aGCCGATCGGTTCGTTCTTTACCGAGCAAGAAGCAGAGCTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTTCTTAGCCAAAACCGGTTGATATAATTTAAAAAG‑aaaaa > 5:1095126/1‑138 (MQ=255)
gctCGGTTCGTTCTTTACCGAGCAAGAAGCAGAGCTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAG‑AAACGGTTa < 1:1314056/138‑1 (MQ=255)
gATCGGTTCGTTCTTTACCGAGCAAGAAGCAGAGCTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAG‑AAACGGt < 3:593228/138‑1 (MQ=255)
gATCGGTTCGTTCTTTACCGAGCAAGAAGCAGAGCTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAG‑AAACGGTTa < 1:1049732/140‑1 (MQ=255)
aTCGGTTCGTTCTTTACCTAGAATGAAGCAGAGCTACTGACAAAAGAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTTAAAAAG‑AAACGGTTaa < 7:180873/140‑1 (MQ=255)
aTCGGTTCGTTCTTTACCGAGCAAGAAGCAGAGCTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAG‑AAACGGTTaa > 2:756690/1‑140 (MQ=255)
gttctttcTTTATCGAGCAAGAAGCAGAGCTACTGACAAATCAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGAGGGTCGCGGCTATAGTCGTGTAGTTGCTTCGCCAAAACCGTTTGATATCATTGAAAAAG‑AAACGGTTAAAg < 3:314240/138‑1 (MQ=255)
gttcgttcTTTACCGAGCAAGAAGCAGAGCTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAG‑AAACGGTTAAAg < 3:1081639/138‑1 (MQ=255)
ttcgttcTTTACCGAGCAAGAAGCAGAGCTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTTAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGGAGTTTCATCGCCAAATCCGGTTGATAAAATTGTAAAAG‑CAACCGTTtaatcat > 5:185152/1‑136 (MQ=255)
cgttcTTTACCGAGCAAGAAGCAGAGCTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGGCGTTGCTTCGCCAAAAACGGTTGATATCATTGAAAAAG‑AAACGGTTAAAGCTCTg > 1:1290687/1‑140 (MQ=255)
ttcTTTACCGAGCAAGCAGCAGAGCTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATTCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAG‑AAACGGTTAAAGCTCTg < 4:315659/138‑1 (MQ=255)
ttcTTTACCGAGCAAGAAGCAGAGCTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAG‑AAACGGTTAAAGCTCTGGt < 6:1068735/140‑1 (MQ=255)
ttcTTTACCGAGCAAGAAGCAGAGCTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGGTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAG‑AAACGGTTAAAGCTCTGGt < 6:1133981/140‑1 (MQ=255)
accgtccAAGAAGCAGAGCTACTGACAAAACAGGCTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAG‑AAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGc < 1:804684/134‑1 (MQ=255)
aCCGAGCAAGAAGCAGAGCTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAG‑AAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGc > 2:865938/1‑140 (MQ=255)
aCCGAGCAAGAAGCAGAGCTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGGCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAG‑AAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGc < 8:453612/140‑1 (MQ=255)
ccGAGCAAGAAGCAGAGCTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTGGTTGCGTAGCCAAAAACCGGTGATATAAATGAAAAAA‑AAACGGTTAAATCTCTGGtttatt > 3:211190/1‑133 (MQ=255)
gAGCAAGAAGCAGAGCTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCGTCGCCCAAACCGGTTGCTTTCATTGAAAAAG‑AAACGGTGAAAGCGCTGGGAGATGCCgg > 8:507442/1‑140 (MQ=255)
aGCAAGAAGCTGAGCTACTGACAAAACAGGTTTACACTCGGAAACAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCTGTTGATATCATTGAAAAAG‑AAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGa < 6:1004049/140‑1 (MQ=255)
aGCAAGAAGCAGAGCTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATTCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGGCGGTGGATCCCCAAAACCGGGTGTGATCATTGTAAAAT‑CAACGGGTAAATCTTTGGGATATTCCggc > 5:704724/1‑139 (MQ=255)
aGCAAGAAGCAGAGCTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAG‑AAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGa < 1:1133568/140‑1 (MQ=255)
aGCAAGAAGCAGAGCTACTGACAAAAAAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCGTGGCCAAAACCCGGTGAGATGATTGAAAAAG‑AAAAGGGGAAAGCTCGGGTAGATTCCggg > 5:272168/1‑139 (MQ=255)
gaaataagCAGAGCTACTTACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGTTGCGGGTCGCGGCTATCGTGGTGTCGTTGCTTCGCAAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAG‑AACCGTTTAAAGCTCTGGTAGATGCCgg < 4:211190/133‑1 (MQ=255)
gCAAGAAGCAGAGCTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAG‑AAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGAc < 5:908790/140‑1 (MQ=255)
gCAAGAAGCAGAGCTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAG‑AAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGAc < 1:732778/140‑1 (MQ=255)
gCAAGAAGCAGAGCTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGGCGTGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAG‑AAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCgg < 3:474964/138‑1 (MQ=255)
cAAGAAGCAGAGCTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGGTTCGCCAAAACCGGTTGATATCAATGAAAAAG‑AAAAGGGTAAAGCTCTTGTAGATGCCGGa > 3:933176/1‑138 (MQ=255)
cAAGAAGCAGAGCTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATAATTTAAAAAG‑AAACCGTTAAAGCTATGGTAGATGCCggg > 3:1139744/1‑137 (MQ=255)
aagaagCAGAGCTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAG‑AAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAg < 6:597702/140‑1 (MQ=255)
aagCAGAGCTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAG‑AAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAggtg < 1:1116109/140‑1 (MQ=255)
aagCAGAGCTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAG‑AAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAgg < 3:1280364/138‑1 (MQ=255)
atcTACTGACAAAACAGGGATACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGGCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAG‑AAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATc < 2:600576/138‑1 (MQ=255)
agCTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAG‑AAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATc < 6:479634/140‑1 (MQ=255)
cTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTAGCGGCTATCGTCGTGTCGTTTCTTCGCCAAAACCGTTTTAAATAATTGAAAAAT‑CAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCAGGACAGGTGGTGATc > 3:700727/1‑138 (MQ=255)
tACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAACAAG‑AAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCA‑cc < 8:317643/140‑1 (MQ=255)
aCTGACAAAACAGGGTTACAATCTGAAAGAAGATGCGGGGCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTAGCAAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAG‑AAACGGTTAAAGCTCTTGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCA‑CCg < 1:86160/140‑1 (MQ=255)
cTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTTCTTCGCCAAAACCCGTTTATATGATTTCAAAAA‑AAAAGGTTAAAGCTCAGGTATATGCCGGACAGGGGGTGATAA‑CCgg > 8:643631/1‑139 (MQ=255)
cTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCGTCGCCAAAACCGGTTTATATCATTGAAAAAG‑AAACGGTTTAAACTCTTGTAGATGCCGGACAGGTGGGTATCA‑CCgg > 8:688549/1‑139 (MQ=255)
tGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGGCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAG‑AAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCA‑CCGtt < 1:198846/140‑1 (MQ=255)
aCAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAG‑AAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCA‑CCGTTgg < 7:472658/140‑1 (MQ=255)
aCAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAG‑AAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCA‑CCGTTgg < 2:1035109/140‑1 (MQ=255)
aCAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTAGCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAG‑AAACGTTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCA‑CCGTTgg < 2:909933/140‑1 (MQ=255)
aaaaCAGGGTTACACTCTGAAAGAAGAGGCGGGGCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAG‑AAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCA‑CCGTTGGCg < 7:959441/140‑1 (MQ=255)
aaaCAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATGGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGTTTGATATCATTGAAAAAT‑AAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCA‑CCGTTGGCgg < 2:224557/140‑1 (MQ=255)
aaaCAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAG‑AAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCA‑CCGTTGGCgg < 6:281092/140‑1 (MQ=255)
gggtACACTCTGAAAGAAGATGCGGGGCGCGGCTATCGTCGTGGCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAG‑AAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCA‑CCGTTGGCggtggtgg < 2:827964/137‑1 (MQ=255)
tctGAAAGTTGATGCGGGTCGAGTCTAGCGTCTGTTCTTTTCTTCTCAAAAAACTTTTTATATCATTGAAAAAG‑AAAATTTTAATGCTATTGTATATGCCTGACATGTGTTGATCA‑ACGTTGTCTGTGGTGGTATCACTg < 7:1011754/140‑1 (MQ=255)
tctGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGGTGATATCATTGAAAAAG‑AAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCA‑CCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTg < 1:702590/140‑1 (MQ=255)
tgaccgaagaTGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAG‑AAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCA‑CCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGtt < 2:1182021/135‑1 (MQ=255)
tGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTGGTTTCTTCGCCAAAACCGGGTGCTATAATTTAAAAAGAAAACGGTT‑AAGCTCTGGTATATGCCGGACCGGGGGGGATGA‑CCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGtt > 7:371410/1‑140 (MQ=255)
tGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAT‑AAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCA‑CCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGtt > 1:972011/1‑140 (MQ=255)
tGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAG‑AAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCA‑CCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGtt < 5:650250/140‑1 (MQ=255)
tGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGGTGATAACAATGAAAAAG‑AAACTGTTAAAACTCAGGTAGCTGCCGGACAGGTGGTGAAAA‑ACGGTGGCGGGGGTGGTATccccggt > 2:666055/1‑136 (MQ=255)
tGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTAGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAG‑AAACGGTTAAAGCGCTGGTAGATGGCGGCCAGGTGGTGATCA‑CCGGTGGCGGTGGTGGTGTCCCGGtt > 8:346692/1‑140 (MQ=255)
tGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCGTCGCCAAAAACCGGTGATATCATTTTAAAAG‑AAACGGTTAAAGCGCTGGTAGATTGCGGCCAGGTGGTGGTCA‑CCCTTGGCGGGGGGGGTATCCCGGtt > 7:722171/1‑140 (MQ=255)
agAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAG‑AAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCA‑CCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGtt < 5:520564/139‑1 (MQ=255)
aaaGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAG‑AAACGGTTAAAGCTCTGGTATATGCCGGACAGGTGGTGATAA‑CCGTTGGCGGTGGTGGTTTCCCTGtt > 3:780986/1‑138 (MQ=255)
aaaGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGGTGATATAATTGAAAAAG‑AAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGGTGGGATCC‑ACGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGtt > 4:1139325/1‑138 (MQ=255)
aaaGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTAGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTTAAAAAG‑AAACGGTTTAAGCTCTGGTAGATGCCGGCCAGGTGGTGATAA‑CCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGtt > 3:171356/1‑138 (MQ=255)
aagaTGCGGGGCGCGGATTTCGTCGTGTCGTTGCTTCGACAAAACATGTTTATATCTTTGAAAAAT‑AAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCGGGACTGGTGGTGATCA‑CCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGTTATTCGt < 8:241110/140‑1 (MQ=255)
taTGCGGTTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGAATCGCCAAAACCGGGTGATATAAATTAAAAAC‑AAACGTTTAAATCACAGGGTGAAACCGGACCCGTTGTTATCACCCGTTGAC‑GTGGTTGTGTACCTGTTATTGGttt > 6:1103912/2‑138 (MQ=255)
gaTGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAGACCGGTTGATATCATTGAAAAAG‑AAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCA‑CCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGTTATTCGTGa < 2:1124344/140‑1 (MQ=255)
gaTGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAG‑AAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCA‑CCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGTTATTCGt < 4:1069016/138‑1 (MQ=255)
cGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCCAAACCGGTTGGTATCATTGAAAAAG‑CAACGGTTAAAGCTCTGGTTGATGCCGGACAGGTGGGGATCA‑CCGTTGGCGGTGGTGGTTTCCCTGTTATTCGTGAAGGt > 2:1065254/1‑140 (MQ=255)
cGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCCAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAG‑AAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGCTGGTGATCA‑CCGTTGGCGGTGGTGGGTTCCCGGTTATTAGTGAAg > 4:455214/1‑138 (MQ=255)
cGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGGTGATATAAATGAAAAAG‑AAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATAA‑CCGGTGGCGGTGGTGGTATCCCTGTTTTTCGTGAAg > 4:855935/1‑138 (MQ=255)
gggTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAG‑AAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCA‑CCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGTTATTCGTGAAGGTa < 1:499111/140‑1 (MQ=255)
gggTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAG‑AAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCA‑CCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGTTATTCGTGAAGGTa < 7:542363/140‑1 (MQ=255)
ggTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCCAAACCCGGTGATATCATTGAAAAAG‑AAACCGGTAAATCACGGGGAGCTGCCGGCCAGGGGGGGATCA‑CCGTTGGCGGGGGTGGTTTCCCTGTGATTAGTTAAGGTaa > 5:534367/1‑140 (MQ=255)
gcgGCTATCGTCTTTTAGTTTCTTAGACAAAACATGTATATATCATTGAAAAAT‑AAAATGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCA‑CCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGTTATTCGTGAAGGTAACCAt < 8:279142/140‑1 (MQ=255)
tATCGTCGTGGCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAG‑AAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCA‑CCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGTTATTCGTGAAGGTAACCATCTGCg < 8:767638/140‑1 (MQ=255)
gtcgtggagtTGCTTAGCCCAAAACGGTTGATATCATTGAAAAAT‑CAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATTCCGGACAGGTGGTGGTAA‑CCGGTGGGGGTGGTGGTATGCCTGTTATTAGTGAAGGTAACCATATGCggggg > 6:81866/1‑139 (MQ=255)
cgtgtcgtTTCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAG‑AAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCA‑CCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGTTATTCGTGAAGGTAACCATCTGCGTGGTGc < 6:945112/140‑1 (MQ=255)
gggtcggTGCTTCGCCAAAACCTGTTGATATCATTGAAAAAG‑AAACGGTTAAAGATCTTGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCA‑CCGTTGGCGGGGGTGGTATCCCTGTTATTCGTGAAGGTAACCATCTGCGTGGTGcc < 1:347205/138‑1 (MQ=255)
gtcgtTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAG‑AAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGCCAGGTGGTGATCA‑CCGTTTGCGGTGGTGGTATCCCGGTTATTCGTGAAGGTAACCATCTGCGTGGTGCCac > 8:1082994/1‑139 (MQ=255)
cgtTGCTTCGCCATAACCGGTTGATATCATTGAAAAAG‑AAACGGTTAATGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCA‑CCGTTGGCGGTGGTGGTTTCCCTGTTATTCGTGTAGGTAACGATCTGCGTGGTGCCAgcg < 7:224431/140‑1 (MQ=255)
cgtTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAG‑AAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCA‑CCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGTTATTCGTGAAGGTAACCATCTGCGTGGTGCCAgcg < 2:1290687/140‑1 (MQ=255)
cgtTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAG‑AAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCA‑CCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGTTATTCGTGAAGGTAACCATCTGCGTGGTGCCAg < 4:1213904/138‑1 (MQ=255)
gtTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAG‑AAAAGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCA‑CCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGTTATTCGTGAAGGTAACCATATGCGTGGTGCCAgcgc > 1:917728/1‑140 (MQ=255)
gCTTCGCCAAAACCGGGTGATATCATTGAAAAAG‑AAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCA‑CCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGGTATTCGTGAAGGTAACCCTCTGCGTGGTGCCAGCGCGGt > 2:973801/1‑140 (MQ=255)
ttCGCCAACACCGGTTGATATCATTGAAAAAG‑AAACGGTTAAAGCTCTGGGAGATGCCGGACAGGTGGTGATCA‑CCGGTGGCGGTGGTGGTCTCCCTGTTATTCGTGAAGGTAACCATCTGCGTGGTGCCAGCGCGGt < 3:901990/138‑1 (MQ=255)
ttCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAG‑AAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCA‑CCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGTTATTCGTGAAGGTAACCATCTGCGTGGTGCCAGCGCGGTTa < 1:1192089/140‑1 (MQ=255)
cacacaCCGGTTGATATCATTGAAAAAT‑AAACGGTTAAAACTATGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCA‑CCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCGGTTATTCGTGAAGGTAACCATCTGCGTGGTGCCAGCGCGGTTATCGa > 2:425257/6‑140 (MQ=255)
aataCCGGTTGATATCATTGAAATAG‑TATCTGTTATAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCA‑CCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGTTATTCGTGAAGGTAACCATCTGCGTGGTGCCAGCGCGGTTATCGATa < 1:768744/137‑1 (MQ=255)
aaaaCCGGTTGATATCATTGCAAAAG‑AAACGGGTAAAGCTCTGGGAGATGCCGGACAGGGGGTGATCA‑CCGTTGGCTGTTGTGGTATCCCTGTTATTCGTGAAGGTAACCATCTGCGTTGTGCCAGCGCGGTTATCGATa < 2:695238/140‑1 (MQ=255)
aaaaCCGGTTGATATCATTGAAAAAG‑AAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCA‑CCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGTTATTCGTGAAGGTAACCATCTGCGTGGTGCCAGCGCGGTTATCGa < 4:560939/138‑1 (MQ=255)
aaaaCCGGTTGATATCATTGAAAAAG‑AAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCA‑CCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGTTATTCGTGAAGGTAACCATCTGCGTGGTGCCAGCGCGGTTATCGATa < 8:867886/140‑1 (MQ=255)
aaaaCCGGTTGATATCATTGAAAAAG‑AAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATAA‑CCGTTGGCGGTGGTGGTATACCTGTTATTCGTGAAGGTAACCATCAGCGTGGTGCCACCGCGGTTATCGa > 3:537586/1‑138 (MQ=255)
gggTTGATATCATTGAAATAG‑AAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCA‑CGGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGTTATTCGTGAAGGTAACCATCTGCGTGGTGCCAGCGCGGTTATCGATAAAGAc < 1:173512/139‑1 (MQ=255)
ggTTGATATCATTGAAAAAG‑AAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCA‑CCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGTTATTCGTGAAGGTAACCATCTGCGTGGTGCCAGCGCGGTTATCGATAAAGACt < 8:174938/140‑1 (MQ=255)
|
CCGGCATTCCTCAACCCGACCAAGCCGATCGGTTCGTTCTTTACCGAGCAAGAAGCAGAGCTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAG‑AAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCA‑CCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGTTATTCGTGAAGGTAACCATCTGCGTGGTGCCAGCGCGGTTATCGATAAAGACTG > NZ_CP022686/1632362‑1632639
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
