Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A30 F36 I0 R1
|
275 |
10897.2 |
10515506 |
98.4% |
10347257 |
135.1 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP022686 |
1,632,501 |
T→G |
7.9% |
V166G (GTT→GGT) |
arcC → |
carbamate kinase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP022686 | 1,632,501 | 0 | T | G | 7.9%
| 409.7
/ 2.6
| 226 | V166G (GTT→GGT) | arcC | carbamate kinase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (56/143); new base G (18/7); total (76/150) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.85e-05 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 226 total aligned reads displayed.
CATTCCTCAACCCGACCAAGCCGATCGGTTCGTTCTTTACCGAGCAAGAAGCAGAGCTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCACCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGTTATTCGTGAAGGTAACCATCTGCGTGGTGCCAGCGCGGTTATCGATAAAGACTG > NZ_CP022686/1632366‑1632639
|
cATTCCTCAACCCGACCAAGCCGATCGGTTCGTTCTTTACCGAGCAAGAAGCAGAGCTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTg < 2:750262/138‑1 (MQ=255)
cTCAACCCGACCAAGCCGATCGGTTCGTTCTTTACCGAGCAAGAAGCAGAGCTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCAt < 5:944767/140‑1 (MQ=255)
cTCAACCCGACCAAGCCGATCGGTTCGTTCTTTACCGAGCAAGAAGCAGAGCTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGGCGTTTCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCaa > 8:1185304/1‑139 (MQ=255)
cGACCAAGCCGATCGGTTCGTTCTTTACCGAGCAAGAAGCAGAGCTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTTAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTAGTTTGGGAGCCAAAAACGGTTTAAAAGATTGaaa > 1:690684/1‑138 (MQ=255)
gACCAAGCCGATCGGTTCGTTCTTTACCGAGCAAGAAGCAGAGCTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGGCGGGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTGTGTATCAGTGAAAAAg > 8:534370/1‑140 (MQ=255)
cccaGCCGATCGGTTCGTTCTTTACCGAGCAAGAAGCAGAGATACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAg < 3:1145536/135‑1 (MQ=255)
ccAAGCCGATCGGTTCGTTCTTTACCGAGCAAGAAGCAGAGCTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCGTCGCCCAAACCCGTTGTTATCATTGAAAAAGaa > 6:876308/1‑140 (MQ=255)
aaGCCGATCGGTTCGTTCTTTACCGAGCAAGAAGCAGAGCTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAAc < 7:1185304/140‑1 (MQ=255)
aGCCGATCGGTTCGTTCTTTACCGAGCAAGAAGCAGAGCTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTGGTTTCTTCGGCAAAACCGGTTGATAAAATTGAAAAATAAAcc > 5:605291/1‑139 (MQ=255)
gATCGGTTCGTTCTTTACCGAGCAAGAAGCAGAGCTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGt < 4:677917/138‑1 (MQ=255)
gATCGGTTCGTTCTTTACCGAGCAAGAAGCAGAGCTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATCGAAAAAGAAACGGTTa < 8:1164318/140‑1 (MQ=255)
ctCGGTTCGTTCTTTACCGAGCAAGAAGCAGAGCTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTaa < 6:1278125/139‑1 (MQ=255)
atgggTTCGTTCTTTACCGTGCAATAATCAGAGCTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCTGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAACCGGtt < 4:193617/135‑1 (MQ=255)
aTCGGTTCGTTCTTTACCGAGCAAGAAGCAGAGCTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCCAAACCCGTTGAGATCATTGAAAAATCAACGGTTaa > 6:291170/1‑140 (MQ=255)
aTCGGTTCGTTCTTTACCGAGCAAGAAGCAGAGCTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTAGTTGCGTCGCCAAAACCGGGTGATATAATTTAAAAAGAAACGGTGaa > 7:1137527/1‑140 (MQ=255)
aTCGGATCGTTCTTTACCTATCAAGAATCAGAGCTACTGACAAAACAGTGTTACACTCTGTAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTTTCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCTGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGtt < 3:441415/138‑1 (MQ=255)
gttcgttcTATACCGAGCAAGAAGCAGAGCTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAg < 4:604152/138‑1 (MQ=255)
gtgcgttcTTTACCGAGCAAGAAGCAGAGCTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGGTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGct < 7:1154543/137‑1 (MQ=255)
ttcTTTACCGAGCAAGAAGCAGAGCTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTg < 4:1165941/138‑1 (MQ=255)
ttcTTTACCGAGCAAGAAGCAGAGCTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGt < 6:1035815/140‑1 (MQ=255)
ttcTTTACCGAGCAAGAAGCAGAGCTACTGACAAAACAGGGGTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGt < 5:375152/140‑1 (MQ=255)
ttcTTTACAGTTCAATAAGCAGAGCTACAGACAAAACAGGGTTACACTCTTAAAGAAGATGCGGGTCGCTGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCAAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTg < 4:313470/138‑1 (MQ=255)
tcTTTACCGAGCAAGAAGCAGAGCTACTGACAAAACAGGTTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTAACGTCGTGTAGGTGCTTCACCAAAACAGGTTGATTTCATTTAAAAAAAAACGGTAAAAGcactcgga > 7:806580/1‑136 (MQ=255)
tttACCGAGCAAGAAGCAGAGCTACTGACAAAACAGGTTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGGCGTGTCGTTGCTTCGCCAAACCCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGa < 5:649382/140‑1 (MQ=255)
aCCGCGCAAGAAGCAGAGATACTGACAACACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAACCGGTTAAAGCTCTGGTAGATGc < 7:600153/140‑1 (MQ=255)
gatcAAGAAGCAGAGCTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGcc < 4:495510/135‑1 (MQ=255)
gaaagaagCAGTGCTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCTGGTCGCGGCTATCGTCGTTTCGTTGCTGCGCCTAAACCGTTAGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGAc < 5:829074/138‑1 (MQ=255)
gCATGAAGAAGAGCTACTGACTAACCAGGTTTACACTCTGTAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGGCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCgg < 3:128413/138‑1 (MQ=255)
gCAAGAAGCAGATCTACTGACAAAACAGTGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGGCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCgg < 1:926100/138‑1 (MQ=255)
gCAAGAAGCAGAGCTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCgg < 4:14368/138‑1 (MQ=255)
gCAAGAAGCAGAGATACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCgg < 1:1009945/138‑1 (MQ=255)
cAAGAAGCAGAGCTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGGAGATGCCggg > 2:762799/1‑137 (MQ=255)
aagaagCAGAGCTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGGCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAg < 5:597424/140‑1 (MQ=255)
aagCATAGCTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGTCTATCGGCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAggtg < 7:323214/140‑1 (MQ=255)
agagCTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGGTGATATCAATGAAAAAGAAACGGGTAACGCTCTGGGAGATGCCCGACAGgtggtgc > 6:582753/1‑139 (MQ=255)
agCTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGa < 2:86606/138‑1 (MQ=255)
agCTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGGCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTGGATGCCGGACAGGTGGTGa < 2:1127702/138‑1 (MQ=255)
agCTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGGCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGagc < 5:1072070/140‑3 (MQ=255)
cTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGGTTCGCCCAAACCCGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCGATGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGAta > 3:514189/1‑137 (MQ=255)
gACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCgg < 3:191191/120‑1 (MQ=255)
aCAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCACCGTTgg < 5:707695/140‑1 (MQ=255)
aaaaCAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTTGGTTCGTAGCCCAAACCGGTGGATATCAGTGAAAAAGAAACGGTTTAAGCTCGGGTTGATGCCGGACAGGTGGTGATACCCGTTGGCg > 6:230317/1‑140 (MQ=255)
ataCAGTGTAACACTCTGTAAGAAGTTGCTGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCACCGTTGGCgg < 5:198516/138‑1 (MQ=255)
aaaCAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCACCGTTGGc < 2:1330670/138‑1 (MQ=255)
aaaCAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCACCGTTGGc < 2:1188015/138‑1 (MQ=255)
aaaCAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCACCGTTGGCgg < 7:893052/140‑1 (MQ=255)
aaaCAGGGGTACAATCTGAAAGAAGATGCGGGGCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAATAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCACCGTTGGCgg < 7:683750/140‑1 (MQ=255)
caCAGGGTTACACTCTGAAAGACGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGGTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCACCGTTGGCggt < 7:428123/139‑1 (MQ=255)
aaCAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCTCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTGCTCCAAAACCGGTTGATCTCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTTGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCACCGTTGGCg < 1:276240/138‑1 (MQ=255)
aaCAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCTGCTATCGTCGTGTAGTTGATTGTACAAAACAGGTTGAAATAATTTAAAAAGAAACTGTTAAAGAACTTGTATATGCAGGACAGGTTGTGTTCAACGTTGGGggt > 6:153719/1‑140 (MQ=255)
aaCAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTTGTTCGCCAAAACCGGTTGATTTCATTGTAAAATAAACGGTTAAAGCTCGGGGAGATGCCGGCCAGGGGGTGATCACCGGTGGCg > 2:452672/1‑138 (MQ=255)
aaCAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTTTTATCAATGAAAAAAAAAACGGTAAAGCGCAGGTAGAAGACGGACAGGGGGTGATAAACGTTGGCg > 3:615383/1‑138 (MQ=255)
aaCAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCACCGTTGGCggt < 8:476292/140‑1 (MQ=255)
aaCAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCACCGTTGGCg < 3:1183498/138‑1 (MQ=255)
ctggtttACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGGGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTTGTGATCACCGTTGGCggt < 3:302913/133‑1 (MQ=255)
cAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCACCGTTGGCggt < 2:293979/138‑1 (MQ=255)
cAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGGCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATAATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCACCGTTGGCggtgg < 6:443793/140‑1 (MQ=255)
aGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCGTCTCCAAAAACGGTTGATAAAAATTAAAAATAAACGGTTAAAGATCTGGTAGATTCCGGACAGGGGGTGATCACCGGTGGCgggggg > 5:1198836/1‑139 (MQ=255)
ggTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGCAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCACCGTTGGCggtggt < 4:646644/138‑1 (MQ=255)
gTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCACCGTTGGCggtggtggt < 7:265042/140‑1 (MQ=255)
ttACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCACCGTTGGCggtggtgg < 1:774270/138‑1 (MQ=255)
cacTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGATTAGACAAAACCCGTTGATATCATTTAAAAAGCAACGGGTATAGCTCTGGGATATGCCGGCCAGGTGGTGATCACCGTTGGCGGGGGTGGTAtag > 8:93359/1‑138 (MQ=255)
tGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGGTTCGCCAAAAACCGTTGATATAATTTAAAAAGAAACGGTTAAATCTCTGGGTGATGCCGGACAGGGGGTGATAACCCTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGtt > 8:897153/1‑140 (MQ=255)
tGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTTAAGCTCTGGTAGATGCCGGCCAGGTGGGGATCACCGTTGGCGGTGGTGGTATcccgggt > 8:614013/1‑136 (MQ=255)
tGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCGTCGCCAAAACCGGTTGATATGATTGAAAAATAAACGGTGAAAGCTGGGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCACCGGTGGCGGTGGTGGTATCCCGGtt > 6:184747/1‑140 (MQ=255)
tGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGGGGTTGCGTCGCCAAAACCCGTGGATATCATTGAAAAAGAAACGGGTAAAGCTCTTGTAGAGGGCGGCCCGGGGGTGATCACCGGTTGCGGTGGTGGGATcacgggt > 7:345584/1‑134 (MQ=255)
tGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGGCGTTTCTTCGCCAAAACCGGGTGATATCATTTAAAAAGAAACGGTTTAAGCGCGGGTTGATGCCGGGCAGGTGGTGATCCCCGTTGGCGGTGGTGGTATcccgggt > 8:869840/1‑136 (MQ=255)
aaaGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTTCGTCGCCAACACCGGTTGATATGATTGGAAAAGAAACGGGTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGCCAGGTGGTGATCACCGTTGGCGGTGGTGGGATCCCGGtt > 4:194824/1‑138 (MQ=255)
aaaGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAg > 2:618876/1‑70 (MQ=255)
aaaGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCCGTTGTTATCAATGAAAAAAAAACGATTTAATCTCTGGTAGATGCCGGACAAGTGGTTATCACCCTTGGCGGTGGTGGTTTACCTGtt > 1:1154983/1‑138 (MQ=255)
aaaGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGGTTCTTAGCCAAAACCCGTGGATATAATTGAAAAAGTAACGGTTTAAGCTCTTGTGGATGCCGGTCAGGTGGTGCTCTCCGGTGGCGGGGGTGGGATGCCGGtt > 4:931971/1‑138 (MQ=255)
aaaGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTAGTTGCTTAGCCAAAACCGGGTGGTATCATTGTAAAAGAAACGGGTAAAGCTATGGTTGTGTACGGCCAGGTGGTGTACAACGTTGTCGGTTGGGGTATACCTGtt > 2:594150/1‑138 (MQ=255)
aagaTGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCAAAATCCGGGTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGGAGATGCCGGACAGGTGGTGATCACCGTTGGCGGTGGTTGTATCCCTGTTATTCGt < 7:1037685/140‑1 (MQ=255)
gttGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGACACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGAGCACCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGTTATTCGTGa < 5:742834/138‑1 (MQ=255)
gaTGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGGTTCGCCAAAACCGGGTGATTTAATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTATGGGTGCTGCCGGACAGGTGGTGATAACCGGTGGCGGTGGTGGTATGCCTGTTATTAGTgt > 8:343893/1‑139 (MQ=255)
gaTGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTTATATAATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGGCGGGCAGGTGGTGATAACCGGTGGCGGTGGTGGGTTCCCTGTTATTCGt > 1:1069401/1‑138 (MQ=255)
tGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGGTGCTTCGCCAAAACCGGGTGGTATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGGCAGGTGGTGATGACCGGTGGCGGGGGTGGTATGCCGGGTATTAGTGTAg > 6:789378/1‑140 (MQ=255)
ggggTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGACAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAACAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCACCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGTTATTCGTGAAg < 1:473619/137‑1 (MQ=255)
gcgcgGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCGCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCACCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGTTATTCGTGAAGGTaa < 4:16483/137‑1 (MQ=255)
gcgGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCACCGTTGGCGGTGGTTGTATCCCTGTTATTCGTGAAGGTAAcc < 3:657494/138‑1 (MQ=255)
tATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCACCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGTTATTCGTGAAGGTAACCATCTg < 4:614062/138‑1 (MQ=255)
tATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCACCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGTTATTCGTGAAGGTAACCATCTg < 1:554133/138‑1 (MQ=255)
tATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCACCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGTTATTCGTGAAGGTAACCATCTg < 3:1309348/138‑1 (MQ=255)
tATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCACCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGTTATTCGTGAAGGTAACCATCTGCg < 7:944506/140‑1 (MQ=255)
tATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCACCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGTTATTCGTGAAGGTAACCATCTGCg < 5:173950/140‑1 (MQ=255)
tATCGTCGTGTCGTTGCGTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCGGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGAGCACCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGTTATTCGTGAAGGTAACCATCTg < 1:121409/138‑1 (MQ=255)
cgtcgtGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCACCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGTTATTCGTGAAGGTAACCATCTGCgt < 3:979332/138‑1 (MQ=255)
gtcgtgtcgtTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCACCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGTTATTCGTGAAGGTAACCATCTGCgtggt < 6:1198836/140‑1 (MQ=255)
gtcggTGCTTCGCCAAAACCGGGTGATATCATTGAAAAACAAACGGGTAAAGCTCTGGTAGATGCCCGACAGGTGGTGATCACCGGTGGCGGTGGTGGTAACCCTGTTATTAGTGAAGGGAACCCTCAGCGGGGTGcc > 2:815034/1‑138 (MQ=255)
cgtTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCACCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGTTATTCGTGAAGGTAACCATCTGCGTGGTGCCAg < 1:1129719/138‑1 (MQ=255)
gtTGATTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAAGGTATAACGCTCATGTAGATGCCGGACAGCTGGTGAAAACAGTAGGCGGTGGTGGTAAACCAGGTTATAGAGAATGTACCCAACTGAGTGGAGCCAgcgg > 8:1032219/1‑139 (MQ=255)
gCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCACCGTTGGCGGTGGTGGGATCCCTGTTATTCGTGAAGGTAACCATCTGCGTGGTGCCAGCGCGGt > 6:747392/1‑140 (MQ=255)
ttCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCACCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGTTATTCGTGAAGGTAACCATCTGCGTGGTGCCAGCGCGGt < 4:1083302/138‑1 (MQ=255)
ttCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCACCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGTTATTCGTGAAGGTAACCATCTGCGTGGTGCCAGCGCGGTTa < 6:610377/140‑1 (MQ=255)
aaaaaCCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCACCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGTTATTCGTGAAGGTAACCATCTGCGTGGTGCCAGCGCGGTTATCg < 2:1354455/137‑1 (MQ=255)
aataCCTGTTTATATAATTGAAAAATAAACGGTTAAATCTCTGGTAGATTCCGGACAGGTGGTGATCACCGTTGTCGGTGGTGGTATCCCTGTTATTCGTGAAGGTAACCATCTGCGTGGTGCCAGCGCGGTTATCGa < 1:879260/135‑1 (MQ=255)
aaaaCGGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGTTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCACCGTTGGCGGGGGTGGTATCCCTGTTATTCGTGAAGGTAACCATCTGCGTGGTGCCAGCGCGGTTATCGATa < 5:976176/140‑1 (MQ=255)
aaaaCCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCACCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGTTATTCGTGAAGGTAACCATCTGCGTGGTGCCAGCGCGGTTATCGa < 3:967995/138‑1 (MQ=255)
cGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCACCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGTTATTCGTGAAGGTAACCATCTGCGTGGTGCCAGCGCGGTTATCGATAAAg < 3:1080933/138‑1 (MQ=255)
gTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCACCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCAGTTATTCGTGAAGGTAACCATCTGCGTGGTGCCAGCGAGGTTATCGATAAAGACTg > 5:806069/1‑140 (MQ=255)
|
CATTCCTCAACCCGACCAAGCCGATCGGTTCGTTCTTTACCGAGCAAGAAGCAGAGCTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCACCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGTTATTCGTGAAGGTAACCATCTGCGTGGTGCCAGCGCGGTTATCGATAAAGACTG > NZ_CP022686/1632366‑1632639
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
